MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 34509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018526	TCTT	2	8	58462	58469	0 %	75 %	0 %	25 %	403060753
1002	NC_018526	GAT	2	6	58490	58495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060753
1003	NC_018526	GGAA	2	8	58528	58535	50 %	0 %	50 %	0 %	403060753
1004	NC_018526	TTC	2	6	58541	58546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060753
1005	NC_018526	AGCG	2	8	58669	58676	25 %	0 %	50 %	25 %	403060753
1006	NC_018526	CTTC	2	8	58696	58703	0 %	50 %	0 %	50 %	403060753
1007	NC_018526	AAT	2	6	58807	58812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060753
1008	NC_018526	TG	3	6	58937	58942	0 %	50 %	50 %	0 %	403060753
1009	NC_018526	GTT	2	6	58984	58989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060753
1010	NC_018526	GTTT	2	8	59001	59008	0 %	75 %	25 %	0 %	403060753
1011	NC_018526	TCA	2	6	59034	59039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060753
1012	NC_018526	ACGAAT	2	12	59093	59104	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403060753
1013	NC_018526	TTTC	2	8	59118	59125	0 %	75 %	0 %	25 %	403060753
1014	NC_018526	AGA	2	6	59192	59197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060753
1015	NC_018526	GCT	2	6	59220	59225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060753
1016	NC_018526	TCA	2	6	59229	59234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060753
1017	NC_018526	T	6	6	59270	59275	0 %	100 %	0 %	0 %	403060753
1018	NC_018526	TCAT	2	8	59605	59612	25 %	50 %	0 %	25 %	403060754
1019	NC_018526	C	6	6	59701	59706	0 %	0 %	0 %	100 %	403060754
1020	NC_018526	CAGC	2	8	59741	59748	25 %	0 %	25 %	50 %	403060754
1021	NC_018526	CAA	2	6	59880	59885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060754
1022	NC_018526	TAG	2	6	59899	59904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060754
1023	NC_018526	GGA	2	6	59916	59921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060754
1024	NC_018526	TTA	2	6	59994	59999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060754
1025	NC_018526	AGCAG	2	10	60020	60029	40 %	0 %	40 %	20 %	403060754
1026	NC_018526	GTC	2	6	60060	60065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060754
1027	NC_018526	CTGG	2	8	60216	60223	0 %	25 %	50 %	25 %	403060754
1028	NC_018526	AAG	2	6	60232	60237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060754
1029	NC_018526	CAA	2	6	60315	60320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060754
1030	NC_018526	TGGA	2	8	60385	60392	25 %	25 %	50 %	0 %	403060754
1031	NC_018526	AAG	2	6	60442	60447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060754
1032	NC_018526	ATT	2	6	60506	60511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060754
1033	NC_018526	AGA	2	6	60512	60517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060754
1034	NC_018526	ATG	2	6	60559	60564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060754
1035	NC_018526	AGA	2	6	60626	60631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060754
1036	NC_018526	AGCA	2	8	60642	60649	50 %	0 %	25 %	25 %	403060754
1037	NC_018526	CT	4	8	60671	60678	0 %	50 %	0 %	50 %	403060754
1038	NC_018526	TCG	2	6	60695	60700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060754
1039	NC_018526	A	6	6	60708	60713	100 %	0 %	0 %	0 %	403060754
1040	NC_018526	ATGGCA	2	12	61147	61158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403060755
1041	NC_018526	TTA	2	6	61201	61206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060755
1042	NC_018526	TACT	2	8	61210	61217	25 %	50 %	0 %	25 %	403060755
1043	NC_018526	GGA	2	6	61237	61242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060755
1044	NC_018526	TCC	2	6	61262	61267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060755
1045	NC_018526	AGTC	2	8	61324	61331	25 %	25 %	25 %	25 %	403060755
1046	NC_018526	TATT	2	8	61370	61377	25 %	75 %	0 %	0 %	403060755
1047	NC_018526	GT	3	6	61439	61444	0 %	50 %	50 %	0 %	403060755
1048	NC_018526	TGA	2	6	61479	61484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060755
1049	NC_018526	TATT	2	8	61574	61581	25 %	75 %	0 %	0 %	403060755
1050	NC_018526	ATT	2	6	61623	61628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060755
1051	NC_018526	TCT	2	6	61647	61652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060755
1052	NC_018526	TTA	2	6	61671	61676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060755
1053	NC_018526	CAA	2	6	61711	61716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060755
1054	NC_018526	CTAT	2	8	61755	61762	25 %	50 %	0 %	25 %	403060755
1055	NC_018526	TTTC	2	8	61835	61842	0 %	75 %	0 %	25 %	403060755
1056	NC_018526	TAT	2	6	61877	61882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060755
1057	NC_018526	TAT	2	6	61908	61913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060755
1058	NC_018526	TTC	2	6	61946	61951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060755
1059	NC_018526	TGA	2	6	61992	61997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060755
1060	NC_018526	AGA	2	6	62004	62009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060755
1061	NC_018526	CGT	2	6	62026	62031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060755
1062	NC_018526	TTCT	2	8	62035	62042	0 %	75 %	0 %	25 %	403060755
1063	NC_018526	TAT	2	6	62064	62069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060755
1064	NC_018526	TGA	2	6	62142	62147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060755
1065	NC_018526	ACAA	2	8	62148	62155	75 %	0 %	0 %	25 %	403060755
1066	NC_018526	ATA	2	6	62183	62188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060755
1067	NC_018526	ATCT	2	8	62197	62204	25 %	50 %	0 %	25 %	403060755
1068	NC_018526	CTG	2	6	62222	62227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060755
1069	NC_018526	TAC	2	6	62235	62240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060755
1070	NC_018526	GAC	2	6	62263	62268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060755
1071	NC_018526	GTC	2	6	62320	62325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060755
1072	NC_018526	GAAT	2	8	62421	62428	50 %	25 %	25 %	0 %	403060755
1073	NC_018526	T	6	6	62446	62451	0 %	100 %	0 %	0 %	403060756
1074	NC_018526	AGG	2	6	62471	62476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060756
1075	NC_018526	ATT	2	6	62522	62527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060756
1076	NC_018526	ATG	2	6	62545	62550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060756
1077	NC_018526	ATT	2	6	62557	62562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060756
1078	NC_018526	CCAG	2	8	62617	62624	25 %	0 %	25 %	50 %	403060757
1079	NC_018526	TGG	2	6	62639	62644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060757
1080	NC_018526	TGA	2	6	62745	62750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060757
1081	NC_018526	CCG	2	6	62766	62771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403060757
1082	NC_018526	CCA	2	6	62777	62782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403060757
1083	NC_018526	A	6	6	62790	62795	100 %	0 %	0 %	0 %	403060757
1084	NC_018526	GCCCT	2	10	62842	62851	0 %	20 %	20 %	60 %	403060757
1085	NC_018526	GTCA	2	8	62863	62870	25 %	25 %	25 %	25 %	403060757
1086	NC_018526	GGT	2	6	62929	62934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060757
1087	NC_018526	GTC	2	6	62960	62965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060757
1088	NC_018526	ATTT	2	8	62993	63000	25 %	75 %	0 %	0 %	403060757
1089	NC_018526	TTG	2	6	63059	63064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060757
1090	NC_018526	TGT	2	6	63066	63071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060757
1091	NC_018526	AATT	2	8	63131	63138	50 %	50 %	0 %	0 %	403060757
1092	NC_018526	CAGGGA	2	12	63146	63157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403060757
1093	NC_018526	A	7	7	63202	63208	100 %	0 %	0 %	0 %	403060757
1094	NC_018526	AGA	2	6	63225	63230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060757
1095	NC_018526	T	6	6	63330	63335	0 %	100 %	0 %	0 %	403060757
1096	NC_018526	AG	3	6	63619	63624	50 %	0 %	50 %	0 %	403060757
1097	NC_018526	TAT	2	6	63634	63639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060757
1098	NC_018526	CTT	3	9	63657	63665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060757
1099	NC_018526	TTG	2	6	63722	63727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060757
1100	NC_018526	AGA	2	6	63789	63794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060757
1101	NC_018526	GGA	2	6	63855	63860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060757
1102	NC_018526	TATT	2	8	63910	63917	25 %	75 %	0 %	0 %	403060757
1103	NC_018526	AG	3	6	63966	63971	50 %	0 %	50 %	0 %	403060757
1104	NC_018526	TAC	2	6	63985	63990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060757
1105	NC_018526	ATG	2	6	64064	64069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060757
1106	NC_018526	GAA	2	6	64123	64128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060757
1107	NC_018526	GAAG	2	8	64173	64180	50 %	0 %	50 %	0 %	403060757
1108	NC_018526	TCAA	2	8	64240	64247	50 %	25 %	0 %	25 %	403060757
1109	NC_018526	CAT	2	6	64269	64274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060757
1110	NC_018526	TCAA	2	8	64291	64298	50 %	25 %	0 %	25 %	403060757
1111	NC_018526	GAT	2	6	64315	64320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060757
1112	NC_018526	GCC	2	6	64385	64390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403060757
1113	NC_018526	A	6	6	64424	64429	100 %	0 %	0 %	0 %	403060757
1114	NC_018526	AAG	2	6	64648	64653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060758
1115	NC_018526	TCA	2	6	64667	64672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060758
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1117	NC_018526	TAT	2	6	64784	64789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060758
1118	NC_018526	TGA	2	6	64796	64801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060758
1119	NC_018526	ATG	2	6	64804	64809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060758
1120	NC_018526	TACC	2	8	64841	64848	25 %	25 %	0 %	50 %	403060758
1121	NC_018526	CAG	2	6	64884	64889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060758
1122	NC_018526	GAA	2	6	64926	64931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060758
1123	NC_018526	CAA	2	6	64944	64949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060758
1124	NC_018526	GAA	2	6	64980	64985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060758
1125	NC_018526	TGA	2	6	65104	65109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060758
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1127	NC_018526	CAA	2	6	65865	65870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060759
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