MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 12892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018420	CAA	2	6	19	24	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406008
2	NC_018420	ATC	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
3	NC_018420	CAAT	2	8	129	136	50 %	25 %	0 %	25 %	400406008
4	NC_018420	CAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406008
5	NC_018420	TTA	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
6	NC_018420	TAA	2	6	237	242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406008
7	NC_018420	TGC	2	6	260	265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406008
8	NC_018420	ATC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
9	NC_018420	CA	3	6	273	278	50 %	0 %	0 %	50 %	400406008
10	NC_018420	ACA	3	9	276	284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406008
11	NC_018420	CA	3	6	297	302	50 %	0 %	0 %	50 %	400406008
12	NC_018420	TAC	3	9	315	323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
13	NC_018420	CT	3	6	342	347	0 %	50 %	0 %	50 %	400406008
14	NC_018420	A	7	7	372	378	100 %	0 %	0 %	0 %	400406008
15	NC_018420	GTA	2	6	491	496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406008
16	NC_018420	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
17	NC_018420	TGG	2	6	519	524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406008
18	NC_018420	TAC	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
19	NC_018420	TA	3	6	602	607	50 %	50 %	0 %	0 %	400406008
20	NC_018420	AAAT	2	8	651	658	75 %	25 %	0 %	0 %	400406008
21	NC_018420	AGA	2	6	663	668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406008
22	NC_018420	ATT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
23	NC_018420	GAT	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406008
24	NC_018420	T	6	6	721	726	0 %	100 %	0 %	0 %	400406008
25	NC_018420	TAA	2	6	729	734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406008
26	NC_018420	GAA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406008
27	NC_018420	T	6	6	754	759	0 %	100 %	0 %	0 %	400406008
28	NC_018420	TTA	2	6	775	780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
29	NC_018420	CAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406008
30	NC_018420	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406008
31	NC_018420	TTGG	2	8	863	870	0 %	50 %	50 %	0 %	400406008
32	NC_018420	CCA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406008
33	NC_018420	A	7	7	927	933	100 %	0 %	0 %	0 %	400406008
34	NC_018420	TGA	2	6	936	941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406008
35	NC_018420	TATT	2	8	974	981	25 %	75 %	0 %	0 %	400406008
36	NC_018420	TGCTAA	2	12	1038	1049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	400406008
37	NC_018420	TTA	2	6	1102	1107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
38	NC_018420	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406008
39	NC_018420	A	6	6	1145	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	400406008
40	NC_018420	TAC	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
41	NC_018420	AAATT	2	10	1169	1178	60 %	40 %	0 %	0 %	400406008
42	NC_018420	ACG	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406008
43	NC_018420	CGG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400406008
44	NC_018420	CA	3	6	1306	1311	50 %	0 %	0 %	50 %	400406008
45	NC_018420	GAAAA	2	10	1349	1358	80 %	0 %	20 %	0 %	400406008
46	NC_018420	AGA	2	6	1371	1376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406008
47	NC_018420	TC	3	6	1379	1384	0 %	50 %	0 %	50 %	400406008
48	NC_018420	CAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406009
49	NC_018420	AGC	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406009
50	NC_018420	TAGAAA	2	12	1558	1569	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	400406009
51	NC_018420	GAA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406009
52	NC_018420	T	6	6	1635	1640	0 %	100 %	0 %	0 %	400406009
53	NC_018420	TCA	2	6	1853	1858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406009
54	NC_018420	TTA	2	6	1868	1873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406009
55	NC_018420	AGGAG	2	10	1901	1910	40 %	0 %	60 %	0 %	400406009
56	NC_018420	AGT	2	6	2009	2014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406009
57	NC_018420	A	6	6	2042	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	400406009
58	NC_018420	A	6	6	2069	2074	100 %	0 %	0 %	0 %	400406009
59	NC_018420	T	6	6	2152	2157	0 %	100 %	0 %	0 %	400406009
60	NC_018420	A	6	6	2159	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	400406009
61	NC_018420	TTCT	2	8	2227	2234	0 %	75 %	0 %	25 %	400406009
62	NC_018420	GTG	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406009
63	NC_018420	TAA	2	6	2294	2299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406009
64	NC_018420	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406009
65	NC_018420	TTAT	2	8	2335	2342	25 %	75 %	0 %	0 %	400406009
66	NC_018420	GGTT	2	8	2360	2367	0 %	50 %	50 %	0 %	400406009
67	NC_018420	CCT	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406009
68	NC_018420	T	8	8	3388	3395	0 %	100 %	0 %	0 %	400406010
69	NC_018420	T	6	6	3428	3433	0 %	100 %	0 %	0 %	400406010
70	NC_018420	A	6	6	3456	3461	100 %	0 %	0 %	0 %	400406010
71	NC_018420	ACC	2	6	3611	3616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406010
72	NC_018420	CTT	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406010
73	NC_018420	GTTA	2	8	3793	3800	25 %	50 %	25 %	0 %	400406010
74	NC_018420	ATTT	2	8	5827	5834	25 %	75 %	0 %	0 %	400406011
75	NC_018420	ATA	4	12	5849	5860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
76	NC_018420	TGA	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
77	NC_018420	CTT	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406011
78	NC_018420	AAT	2	6	5972	5977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
79	NC_018420	TTC	2	6	5983	5988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406011
80	NC_018420	TCA	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406011
81	NC_018420	CAA	2	6	6086	6091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406011
82	NC_018420	CCA	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406011
83	NC_018420	ACC	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406011
84	NC_018420	AGT	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
85	NC_018420	TCA	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406011
86	NC_018420	TAA	2	6	6398	6403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
87	NC_018420	GAA	2	6	6462	6467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406011
88	NC_018420	ATT	2	6	6482	6487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406011
89	NC_018420	TGA	2	6	6528	6533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
90	NC_018420	ACC	2	6	6555	6560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406011
91	NC_018420	ATT	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406011
92	NC_018420	GCAA	2	8	6626	6633	50 %	0 %	25 %	25 %	400406011
93	NC_018420	CAAAAA	2	12	6700	6711	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	400406011
94	NC_018420	AAGAT	2	10	6727	6736	60 %	20 %	20 %	0 %	400406011
95	NC_018420	ATA	2	6	6760	6765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
96	NC_018420	AGC	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406011
97	NC_018420	TAA	2	6	6872	6877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
98	NC_018420	ATA	2	6	6884	6889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
99	NC_018420	AGT	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
100	NC_018420	A	6	6	7077	7082	100 %	0 %	0 %	0 %	400406011
101	NC_018420	GAGAC	2	10	7176	7185	40 %	0 %	40 %	20 %	400406011
102	NC_018420	TAG	3	9	7219	7227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
103	NC_018420	AAT	2	6	7337	7342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
104	NC_018420	TGC	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406011
105	NC_018420	GCA	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406011
106	NC_018420	GCT	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406011
107	NC_018420	GAAA	2	8	7422	7429	75 %	0 %	25 %	0 %	400406011
108	NC_018420	GCT	2	6	7454	7459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406011
109	NC_018420	TAA	2	6	7463	7468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
110	NC_018420	TAA	2	6	7471	7476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
111	NC_018420	AAT	2	6	7497	7502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
112	NC_018420	ACGC	2	8	7543	7550	25 %	0 %	25 %	50 %	400406011
113	NC_018420	AAG	2	6	7575	7580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406012
114	NC_018420	AGC	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406012
115	NC_018420	TTG	2	6	7633	7638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406012
116	NC_018420	CAAAT	2	10	7664	7673	60 %	20 %	0 %	20 %	400406012
117	NC_018420	TAA	2	6	7683	7688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406012
118	NC_018420	TGA	2	6	7697	7702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406012
119	NC_018420	TAA	2	6	7704	7709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406012
120	NC_018420	GAC	2	6	7722	7727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406012
121	NC_018420	TCA	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406012
122	NC_018420	TCT	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406012
123	NC_018420	TA	3	6	7933	7938	50 %	50 %	0 %	0 %	400406012
124	NC_018420	AT	3	6	7995	8000	50 %	50 %	0 %	0 %	400406012
125	NC_018420	CTGA	2	8	8035	8042	25 %	25 %	25 %	25 %	400406012
126	NC_018420	TAAGT	2	10	8065	8074	40 %	40 %	20 %	0 %	400406012
127	NC_018420	CGTA	2	8	8080	8087	25 %	25 %	25 %	25 %	400406012
128	NC_018420	ATTA	2	8	8098	8105	50 %	50 %	0 %	0 %	400406012
129	NC_018420	A	6	6	8126	8131	100 %	0 %	0 %	0 %	400406012
130	NC_018420	CAA	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406012
131	NC_018420	CT	3	6	8190	8195	0 %	50 %	0 %	50 %	400406012
132	NC_018420	ATA	2	6	8250	8255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406012
133	NC_018420	ATT	2	6	8263	8268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406012
134	NC_018420	ATT	2	6	8332	8337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406012
135	NC_018420	A	6	6	8342	8347	100 %	0 %	0 %	0 %	400406012
136	NC_018420	CAG	2	6	8361	8366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406012
137	NC_018420	A	6	6	8422	8427	100 %	0 %	0 %	0 %	400406012
138	NC_018420	A	6	6	8450	8455	100 %	0 %	0 %	0 %	400406012
139	NC_018420	CTA	2	6	8532	8537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406012
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141	NC_018420	A	7	7	8556	8562	100 %	0 %	0 %	0 %	400406012
142	NC_018420	AGA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406012
143	NC_018420	AGTC	2	8	8625	8632	25 %	25 %	25 %	25 %	400406012
144	NC_018420	A	8	8	8668	8675	100 %	0 %	0 %	0 %	400406012
145	NC_018420	A	6	6	8738	8743	100 %	0 %	0 %	0 %	400406012
146	NC_018420	CAG	2	6	8760	8765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406012
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150	NC_018420	CAT	2	6	8863	8868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406012
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169	NC_018420	TGGT	2	8	11542	11549	0 %	50 %	50 %	0 %	400406013
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259	NC_018420	CAA	2	6	18429	18434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406016
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261	NC_018420	TAA	2	6	18536	18541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406016
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265	NC_018420	A	9	9	23194	23202	100 %	0 %	0 %	0 %	400406017
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267	NC_018420	TTA	3	9	23559	23567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406018
268	NC_018420	TTGG	2	8	23610	23617	0 %	50 %	50 %	0 %	400406018
269	NC_018420	AAAGT	2	10	23625	23634	60 %	20 %	20 %	0 %	400406018
270	NC_018420	GCA	2	6	30152	30157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406019
271	NC_018420	TGC	2	6	30195	30200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406019
272	NC_018420	TGG	2	6	30289	30294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406019
273	NC_018420	TGC	2	6	30345	30350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406019
274	NC_018420	TC	4	8	30450	30457	0 %	50 %	0 %	50 %	400406019
275	NC_018420	G	6	6	30494	30499	0 %	0 %	100 %	0 %	400406019
276	NC_018420	TAA	2	6	30523	30528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406019
277	NC_018420	ATT	2	6	30578	30583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406019
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279	NC_018420	AAAT	2	8	30624	30631	75 %	25 %	0 %	0 %	400406019
280	NC_018420	TTG	2	6	30642	30647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406019
281	NC_018420	TAAC	2	8	30684	30691	50 %	25 %	0 %	25 %	400406019
282	NC_018420	TTTA	2	8	30711	30718	25 %	75 %	0 %	0 %	400406019
283	NC_018420	AAG	2	6	30744	30749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406019
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286	NC_018420	ACT	2	6	30862	30867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406019
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294	NC_018420	A	7	7	31484	31490	100 %	0 %	0 %	0 %	400406019
295	NC_018420	A	8	8	31494	31501	100 %	0 %	0 %	0 %	400406019
296	NC_018420	TG	3	6	31649	31654	0 %	50 %	50 %	0 %	400406020
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303	NC_018420	ATA	2	6	31948	31953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406020
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332	NC_018420	TAT	2	6	35024	35029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406021
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357	NC_018420	A	7	7	35702	35708	100 %	0 %	0 %	0 %	400406021
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368	NC_018420	ATCCT	2	10	36146	36155	20 %	40 %	0 %	40 %	400406021
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371	NC_018420	T	7	7	37289	37295	0 %	100 %	0 %	0 %	400406022
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375	NC_018420	ACC	2	6	37457	37462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406022
376	NC_018420	T	6	6	37466	37471	0 %	100 %	0 %	0 %	400406022
377	NC_018420	ATT	2	6	37513	37518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406023
378	NC_018420	ATT	3	9	37671	37679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406023
379	NC_018420	CAT	2	6	37689	37694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406023
380	NC_018420	TGT	2	6	37774	37779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406023
381	NC_018420	CATA	2	8	37802	37809	50 %	25 %	0 %	25 %	400406023
382	NC_018420	CACT	2	8	39050	39057	25 %	25 %	0 %	50 %	400406024
383	NC_018420	CAT	2	6	39060	39065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406024
384	NC_018420	ACG	2	6	39106	39111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406024
385	NC_018420	GCT	2	6	39149	39154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406024
386	NC_018420	AT	3	6	39221	39226	50 %	50 %	0 %	0 %	400406024
387	NC_018420	TACCA	2	10	39397	39406	40 %	20 %	0 %	40 %	400406024
388	NC_018420	TAG	2	6	39411	39416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406024
389	NC_018420	CTA	2	6	39432	39437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406024
390	NC_018420	TC	3	6	39449	39454	0 %	50 %	0 %	50 %	400406024
391	NC_018420	TCA	2	6	39518	39523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406024
392	NC_018420	ATA	2	6	39530	39535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406024
393	NC_018420	TTTC	2	8	39564	39571	0 %	75 %	0 %	25 %	400406024
394	NC_018420	TCT	2	6	39575	39580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406024
395	NC_018420	GCT	2	6	39596	39601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406024
396	NC_018420	TCT	3	9	39602	39610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406024
397	NC_018420	AAT	2	6	39614	39619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406024
398	NC_018420	CTT	2	6	39627	39632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406024
399	NC_018420	TTCCA	2	10	39709	39718	20 %	40 %	0 %	40 %	400406024
400	NC_018420	GCC	2	6	39749	39754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400406024
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402	NC_018420	T	7	7	39802	39808	0 %	100 %	0 %	0 %	400406024
403	NC_018420	TCT	2	6	39845	39850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406024
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