MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 12892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018420	CTAAT	2	10	357368	357377	40 %	40 %	0 %	20 %	400406174
4002	NC_018420	TCT	2	6	357472	357477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406174
4003	NC_018420	CAC	2	6	357479	357484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406174
4004	NC_018420	TCC	2	6	357519	357524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406174
4005	NC_018420	T	6	6	357614	357619	0 %	100 %	0 %	0 %	400406174
4006	NC_018420	AGT	2	6	357633	357638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406174
4007	NC_018420	GTT	2	6	357749	357754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406174
4008	NC_018420	TAA	2	6	357788	357793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406174
4009	NC_018420	CTT	2	6	357794	357799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406174
4010	NC_018420	GT	3	6	357801	357806	0 %	50 %	50 %	0 %	400406174
4011	NC_018420	AGT	2	6	357850	357855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406174
4012	NC_018420	TAA	2	6	357870	357875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406174
4013	NC_018420	ATT	2	6	357942	357947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406174
4014	NC_018420	CTT	2	6	357950	357955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406174
4015	NC_018420	GTA	2	6	357980	357985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406174
4016	NC_018420	TGA	2	6	358060	358065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406174
4017	NC_018420	GAA	2	6	359625	359630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406175
4018	NC_018420	CCG	2	6	359642	359647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400406175
4019	NC_018420	ACG	2	6	359661	359666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406175
4020	NC_018420	ATT	2	6	359677	359682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406175
4021	NC_018420	GCT	2	6	359752	359757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406175
4022	NC_018420	AC	3	6	359784	359789	50 %	0 %	0 %	50 %	400406175
4023	NC_018420	TGGA	2	8	359800	359807	25 %	25 %	50 %	0 %	400406175
4024	NC_018420	AG	3	6	359819	359824	50 %	0 %	50 %	0 %	400406175
4025	NC_018420	TAC	2	6	359835	359840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406175
4026	NC_018420	A	7	7	359863	359869	100 %	0 %	0 %	0 %	400406175
4027	NC_018420	AATC	2	8	359874	359881	50 %	25 %	0 %	25 %	400406175
4028	NC_018420	TTG	2	6	359946	359951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406175
4029	NC_018420	TGAT	2	8	359960	359967	25 %	50 %	25 %	0 %	400406175
4030	NC_018420	AG	3	6	359985	359990	50 %	0 %	50 %	0 %	400406175
4031	NC_018420	ATT	2	6	360156	360161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406175
4032	NC_018420	AT	3	6	360169	360174	50 %	50 %	0 %	0 %	400406175
4033	NC_018420	AT	3	6	360176	360181	50 %	50 %	0 %	0 %	400406175
4034	NC_018420	ATT	2	6	360321	360326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406175
4035	NC_018420	G	6	6	360329	360334	0 %	0 %	100 %	0 %	400406175
4036	NC_018420	TCAT	2	8	360339	360346	25 %	50 %	0 %	25 %	400406175
4037	NC_018420	AAGA	2	8	360352	360359	75 %	0 %	25 %	0 %	400406175
4038	NC_018420	T	8	8	360386	360393	0 %	100 %	0 %	0 %	400406175
4039	NC_018420	T	6	6	360573	360578	0 %	100 %	0 %	0 %	400406175
4040	NC_018420	AAG	2	6	360601	360606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406175
4041	NC_018420	ATA	2	6	360646	360651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406175
4042	NC_018420	AAG	2	6	360695	360700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406175
4043	NC_018420	ATT	2	6	360715	360720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406175
4044	NC_018420	TA	3	6	360725	360730	50 %	50 %	0 %	0 %	400406175
4045	NC_018420	TCG	2	6	360819	360824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406175
4046	NC_018420	AAACAA	2	12	360847	360858	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	400406175
4047	NC_018420	AGA	2	6	360885	360890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406175
4048	NC_018420	TAA	3	9	360921	360929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406175
4049	NC_018420	GAA	2	6	361015	361020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406175
4050	NC_018420	AGA	2	6	361071	361076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406175
4051	NC_018420	A	6	6	361086	361091	100 %	0 %	0 %	0 %	400406175
4052	NC_018420	ATA	2	6	361118	361123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406175
4053	NC_018420	TAA	2	6	362740	362745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406176
4054	NC_018420	T	6	6	362805	362810	0 %	100 %	0 %	0 %	400406176
4055	NC_018420	TAG	2	6	362812	362817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406176
4056	NC_018420	T	7	7	362818	362824	0 %	100 %	0 %	0 %	400406176
4057	NC_018420	TGC	2	6	362863	362868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406176
4058	NC_018420	AAC	2	6	362921	362926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406176
4059	NC_018420	GTT	2	6	363010	363015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406176
4060	NC_018420	GAT	2	6	363060	363065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406176
4061	NC_018420	CCA	2	6	363251	363256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406176
4062	NC_018420	ATG	2	6	363280	363285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406176
4063	NC_018420	T	8	8	363317	363324	0 %	100 %	0 %	0 %	400406176
4064	NC_018420	GTC	2	6	363354	363359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406176
4065	NC_018420	TAAT	2	8	363429	363436	50 %	50 %	0 %	0 %	400406176
4066	NC_018420	TCA	2	6	363458	363463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406176
4067	NC_018420	TTA	2	6	363470	363475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406176
4068	NC_018420	TTC	2	6	363499	363504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406176
4069	NC_018420	TCT	2	6	363536	363541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406176
4070	NC_018420	TCT	2	6	363545	363550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406176
4071	NC_018420	GTC	2	6	363597	363602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406176
4072	NC_018420	GAT	2	6	363630	363635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406176
4073	NC_018420	AGT	2	6	363647	363652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406176
4074	NC_018420	GAA	2	6	363654	363659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406176
4075	NC_018420	TCT	2	6	363704	363709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406176
4076	NC_018420	ATA	2	6	363728	363733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406176
4077	NC_018420	T	7	7	365018	365024	0 %	100 %	0 %	0 %	400406177
4078	NC_018420	TCA	2	6	365067	365072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406177
4079	NC_018420	GAT	2	6	365092	365097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406177
4080	NC_018420	CTT	2	6	365156	365161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406177
4081	NC_018420	TAG	2	6	365216	365221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406177
4082	NC_018420	TGG	2	6	365236	365241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406177
4083	NC_018420	ATC	2	6	365261	365266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406177
4084	NC_018420	ATCA	2	8	365272	365279	50 %	25 %	0 %	25 %	400406177
4085	NC_018420	TCATG	2	10	365310	365319	20 %	40 %	20 %	20 %	400406177
4086	NC_018420	TGG	2	6	365322	365327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406177
4087	NC_018420	CAG	2	6	365342	365347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406177
4088	NC_018420	GTC	2	6	365357	365362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406177
4089	NC_018420	CTC	2	6	365378	365383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406177
4090	NC_018420	TCTT	2	8	365399	365406	0 %	75 %	0 %	25 %	400406177
4091	NC_018420	TA	3	6	365573	365578	50 %	50 %	0 %	0 %	400406177
4092	NC_018420	T	7	7	365598	365604	0 %	100 %	0 %	0 %	400406177
4093	NC_018420	GAA	2	6	365618	365623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406177
4094	NC_018420	T	6	6	365670	365675	0 %	100 %	0 %	0 %	400406177
4095	NC_018420	CAC	2	6	365683	365688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406177
4096	NC_018420	GAT	2	6	365703	365708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406177
4097	NC_018420	TGG	2	6	365733	365738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406177
4098	NC_018420	ATC	2	6	365750	365755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406177
4099	NC_018420	TAT	2	6	365801	365806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406177
4100	NC_018420	GTT	2	6	365987	365992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406177
4101	NC_018420	GCT	3	9	366034	366042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406177
4102	NC_018420	TCTT	2	8	366051	366058	0 %	75 %	0 %	25 %	400406177
4103	NC_018420	AGA	2	6	366063	366068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406177
4104	NC_018420	GGC	2	6	366090	366095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400406177
4105	NC_018420	TTC	2	6	366099	366104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406177
4106	NC_018420	GTT	2	6	366181	366186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406177
4107	NC_018420	CCT	2	6	366283	366288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406177
4108	NC_018420	TATAT	2	10	366289	366298	40 %	60 %	0 %	0 %	400406177
4109	NC_018420	TTG	2	6	366332	366337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406177
4110	NC_018420	ATTGTG	2	12	366366	366377	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	400406177
4111	NC_018420	ATT	2	6	366971	366976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406178
4112	NC_018420	T	7	7	366975	366981	0 %	100 %	0 %	0 %	400406178
4113	NC_018420	TTAA	2	8	366991	366998	50 %	50 %	0 %	0 %	400406178
4114	NC_018420	T	7	7	367008	367014	0 %	100 %	0 %	0 %	400406178
4115	NC_018420	TAG	2	6	367023	367028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406178
4116	NC_018420	ATTG	2	8	367034	367041	25 %	50 %	25 %	0 %	400406178
4117	NC_018420	T	6	6	367086	367091	0 %	100 %	0 %	0 %	400406178
4118	NC_018420	ATT	2	6	367117	367122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406178
4119	NC_018420	TTG	2	6	367173	367178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406178
4120	NC_018420	ATT	2	6	367182	367187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406178
4121	NC_018420	ATC	2	6	367239	367244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406178
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4123	NC_018420	TGG	2	6	367280	367285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406178
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4248	NC_018420	ATA	2	6	375817	375822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406182
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4250	NC_018420	GT	3	6	375973	375978	0 %	50 %	50 %	0 %	400406182
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4252	NC_018420	ATA	2	6	376055	376060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406182
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4276	NC_018420	TTTA	2	8	378944	378951	25 %	75 %	0 %	0 %	400406185
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4321	NC_018420	GAAT	2	8	380813	380820	50 %	25 %	25 %	0 %	400406186
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4350	NC_018420	T	8	8	383020	383027	0 %	100 %	0 %	0 %	400406187
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4359	NC_018420	TTA	2	6	384882	384887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406188
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4363	NC_018420	AAT	2	6	385052	385057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406188
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4367	NC_018420	TAT	2	6	385149	385154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406188
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4369	NC_018420	ATTT	2	8	385687	385694	25 %	75 %	0 %	0 %	400406189
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4482	NC_018420	TGGA	2	8	392736	392743	25 %	25 %	50 %	0 %	400406196
4483	NC_018420	GAA	2	6	392818	392823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406196
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4486	NC_018420	T	6	6	392939	392944	0 %	100 %	0 %	0 %	400406196
4487	NC_018420	TTG	2	6	393002	393007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406196
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4490	NC_018420	A	6	6	393040	393045	100 %	0 %	0 %	0 %	400406196
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4492	NC_018420	TAT	2	6	393174	393179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406196
4493	NC_018420	A	6	6	393235	393240	100 %	0 %	0 %	0 %	400406196
4494	NC_018420	ATA	2	6	393395	393400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406196
4495	NC_018420	TAA	2	6	393449	393454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406196
4496	NC_018420	TTAA	2	8	393484	393491	50 %	50 %	0 %	0 %	400406196
4497	NC_018420	A	7	7	393515	393521	100 %	0 %	0 %	0 %	400406196
4498	NC_018420	TTC	2	6	397097	397102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406197
4499	NC_018420	CAAG	2	8	397147	397154	50 %	0 %	25 %	25 %	400406197
4500	NC_018420	CTT	2	6	399327	399332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406198

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