MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 12892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018420	ATA	2	6	319629	319634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406154
3502	NC_018420	ATA	2	6	319639	319644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406154
3503	NC_018420	GTT	2	6	319656	319661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406154
3504	NC_018420	GGT	2	6	319758	319763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406154
3505	NC_018420	CTT	2	6	319786	319791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406154
3506	NC_018420	GTA	2	6	319867	319872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406154
3507	NC_018420	TAT	2	6	320003	320008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406154
3508	NC_018420	AAT	2	6	320013	320018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406154
3509	NC_018420	ATT	2	6	320046	320051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406154
3510	NC_018420	ATA	2	6	320214	320219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406154
3511	NC_018420	ATCT	2	8	320222	320229	25 %	50 %	0 %	25 %	400406154
3512	NC_018420	ATG	2	6	320278	320283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406154
3513	NC_018420	AG	3	6	320315	320320	50 %	0 %	50 %	0 %	400406154
3514	NC_018420	T	8	8	320338	320345	0 %	100 %	0 %	0 %	400406154
3515	NC_018420	TAC	2	6	320363	320368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406154
3516	NC_018420	GAA	2	6	320376	320381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406154
3517	NC_018420	GCT	3	9	320382	320390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406154
3518	NC_018420	AAGATA	2	12	320431	320442	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	400406154
3519	NC_018420	ACG	2	6	320453	320458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406154
3520	NC_018420	TTG	2	6	320482	320487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406154
3521	NC_018420	TTGGT	2	10	320608	320617	0 %	60 %	40 %	0 %	400406154
3522	NC_018420	GAT	2	6	320619	320624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406154
3523	NC_018420	CTA	2	6	320644	320649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406154
3524	NC_018420	TTGAAC	2	12	320662	320673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	400406154
3525	NC_018420	ATT	2	6	320735	320740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406154
3526	NC_018420	GAA	2	6	320772	320777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406154
3527	NC_018420	TCG	2	6	320783	320788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406154
3528	NC_018420	CCT	2	6	320835	320840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406154
3529	NC_018420	AAG	2	6	320851	320856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406154
3530	NC_018420	T	6	6	320948	320953	0 %	100 %	0 %	0 %	400406154
3531	NC_018420	GGT	2	6	320982	320987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406154
3532	NC_018420	CAG	2	6	321070	321075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406154
3533	NC_018420	TTG	2	6	321087	321092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406154
3534	NC_018420	A	8	8	321102	321109	100 %	0 %	0 %	0 %	400406154
3535	NC_018420	A	6	6	321129	321134	100 %	0 %	0 %	0 %	400406154
3536	NC_018420	GAAA	2	8	321135	321142	75 %	0 %	25 %	0 %	400406154
3537	NC_018420	ATG	2	6	321145	321150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406154
3538	NC_018420	AATCC	2	10	321800	321809	40 %	20 %	0 %	40 %	400406155
3539	NC_018420	A	7	7	321833	321839	100 %	0 %	0 %	0 %	400406155
3540	NC_018420	A	8	8	321985	321992	100 %	0 %	0 %	0 %	400406155
3541	NC_018420	AAAG	2	8	322011	322018	75 %	0 %	25 %	0 %	400406155
3542	NC_018420	TAA	2	6	322060	322065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406155
3543	NC_018420	A	8	8	322114	322121	100 %	0 %	0 %	0 %	400406155
3544	NC_018420	A	6	6	322150	322155	100 %	0 %	0 %	0 %	400406155
3545	NC_018420	AGG	2	6	322210	322215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400406155
3546	NC_018420	TTA	2	6	322251	322256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406155
3547	NC_018420	TTTG	2	8	322272	322279	0 %	75 %	25 %	0 %	400406155
3548	NC_018420	TA	3	6	322356	322361	50 %	50 %	0 %	0 %	400406155
3549	NC_018420	CAA	2	6	322383	322388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406155
3550	NC_018420	CTA	2	6	322451	322456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406155
3551	NC_018420	GA	3	6	322481	322486	50 %	0 %	50 %	0 %	400406155
3552	NC_018420	TAAT	2	8	322487	322494	50 %	50 %	0 %	0 %	400406155
3553	NC_018420	TAT	2	6	323386	323391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406156
3554	NC_018420	GCTTTT	2	12	323392	323403	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	400406156
3555	NC_018420	T	6	6	323445	323450	0 %	100 %	0 %	0 %	400406156
3556	NC_018420	TAT	2	6	323458	323463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406156
3557	NC_018420	TCT	2	6	323518	323523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406156
3558	NC_018420	CAT	2	6	323532	323537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406156
3559	NC_018420	CAA	2	6	323559	323564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406156
3560	NC_018420	GTT	2	6	323600	323605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406156
3561	NC_018420	TACT	2	8	323621	323628	25 %	50 %	0 %	25 %	400406156
3562	NC_018420	AGC	2	6	323653	323658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406156
3563	NC_018420	T	8	8	323670	323677	0 %	100 %	0 %	0 %	400406156
3564	NC_018420	CTT	2	6	323696	323701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406156
3565	NC_018420	TCG	2	6	323776	323781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406156
3566	NC_018420	GGA	2	6	323798	323803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400406156
3567	NC_018420	ATTT	2	8	323865	323872	25 %	75 %	0 %	0 %	400406156
3568	NC_018420	TCC	2	6	324711	324716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406157
3569	NC_018420	ATTTAC	2	12	324728	324739	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	400406157
3570	NC_018420	A	7	7	324750	324756	100 %	0 %	0 %	0 %	400406157
3571	NC_018420	A	6	6	324792	324797	100 %	0 %	0 %	0 %	400406157
3572	NC_018420	AT	3	6	324813	324818	50 %	50 %	0 %	0 %	400406157
3573	NC_018420	TAAT	2	8	324872	324879	50 %	50 %	0 %	0 %	400406157
3574	NC_018420	AT	4	8	324883	324890	50 %	50 %	0 %	0 %	400406157
3575	NC_018420	TGG	2	6	324891	324896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406157
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3577	NC_018420	AAC	2	6	325091	325096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406157
3578	NC_018420	AGA	2	6	325125	325130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406157
3579	NC_018420	GCA	2	6	325153	325158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406157
3580	NC_018420	AATC	2	8	325207	325214	50 %	25 %	0 %	25 %	400406157
3581	NC_018420	AATT	2	8	325248	325255	50 %	50 %	0 %	0 %	400406157
3582	NC_018420	T	7	7	325309	325315	0 %	100 %	0 %	0 %	400406157
3583	NC_018420	A	6	6	325318	325323	100 %	0 %	0 %	0 %	400406157
3584	NC_018420	AT	3	6	325357	325362	50 %	50 %	0 %	0 %	400406157
3585	NC_018420	A	7	7	325372	325378	100 %	0 %	0 %	0 %	400406157
3586	NC_018420	ATC	2	6	325386	325391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406157
3587	NC_018420	ATT	2	6	325650	325655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406157
3588	NC_018420	AGT	2	6	325659	325664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406157
3589	NC_018420	A	6	6	325669	325674	100 %	0 %	0 %	0 %	400406157
3590	NC_018420	T	6	6	325684	325689	0 %	100 %	0 %	0 %	400406157
3591	NC_018420	AAT	2	6	325726	325731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406157
3592	NC_018420	TA	3	6	325747	325752	50 %	50 %	0 %	0 %	400406157
3593	NC_018420	A	7	7	325782	325788	100 %	0 %	0 %	0 %	400406157
3594	NC_018420	ATT	2	6	325809	325814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406157
3595	NC_018420	A	8	8	325829	325836	100 %	0 %	0 %	0 %	400406157
3596	NC_018420	TTG	2	6	325951	325956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406158
3597	NC_018420	AAAT	2	8	325979	325986	75 %	25 %	0 %	0 %	400406158
3598	NC_018420	T	6	6	326026	326031	0 %	100 %	0 %	0 %	400406158
3599	NC_018420	TAA	2	6	326079	326084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406158
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3601	NC_018420	TAAAT	2	10	326187	326196	60 %	40 %	0 %	0 %	400406158
3602	NC_018420	TAAT	2	8	326226	326233	50 %	50 %	0 %	0 %	400406158
3603	NC_018420	ATA	3	9	327506	327514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406159
3604	NC_018420	TAT	2	6	327567	327572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406159
3605	NC_018420	TA	3	6	327636	327641	50 %	50 %	0 %	0 %	400406159
3606	NC_018420	GAA	2	6	327649	327654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406159
3607	NC_018420	TGA	2	6	327735	327740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406159
3608	NC_018420	T	7	7	327769	327775	0 %	100 %	0 %	0 %	400406159
3609	NC_018420	A	6	6	327793	327798	100 %	0 %	0 %	0 %	400406159
3610	NC_018420	A	8	8	327955	327962	100 %	0 %	0 %	0 %	400406159
3611	NC_018420	GAT	2	6	327979	327984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406159
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3614	NC_018420	ATA	2	6	328038	328043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406159
3615	NC_018420	CAA	2	6	329723	329728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406160
3616	NC_018420	ATC	2	6	329882	329887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406160
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3618	NC_018420	GA	3	6	329933	329938	50 %	0 %	50 %	0 %	400406160
3619	NC_018420	A	7	7	329997	330003	100 %	0 %	0 %	0 %	400406160
3620	NC_018420	GAA	2	6	330040	330045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406160
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3622	NC_018420	TGG	2	6	330123	330128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406160
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3863	NC_018420	CAAAT	2	10	346612	346621	60 %	20 %	0 %	20 %	400406169
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3866	NC_018420	A	6	6	348556	348561	100 %	0 %	0 %	0 %	400406170
3867	NC_018420	TTC	2	6	348569	348574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406170
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3993	NC_018420	TCG	2	6	357157	357162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406174
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