MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 12892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018420	GA	3	6	232810	232815	50 %	0 %	50 %	0 %	400406117
2502	NC_018420	ATTTC	2	10	232923	232932	20 %	60 %	0 %	20 %	400406117
2503	NC_018420	GAC	2	6	232947	232952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406117
2504	NC_018420	CTT	2	6	232962	232967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406117
2505	NC_018420	TAA	2	6	232978	232983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406117
2506	NC_018420	TGATT	2	10	233103	233112	20 %	60 %	20 %	0 %	400406117
2507	NC_018420	TTC	2	6	233119	233124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406117
2508	NC_018420	TCA	2	6	233132	233137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406117
2509	NC_018420	TTC	2	6	233143	233148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406117
2510	NC_018420	CGCTA	2	10	233176	233185	20 %	20 %	20 %	40 %	400406117
2511	NC_018420	TAA	2	6	233212	233217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406117
2512	NC_018420	A	6	6	233237	233242	100 %	0 %	0 %	0 %	400406117
2513	NC_018420	GTATTA	2	12	233264	233275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	400406117
2514	NC_018420	AT	3	6	233308	233313	50 %	50 %	0 %	0 %	400406117
2515	NC_018420	CAA	2	6	233338	233343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406117
2516	NC_018420	CTG	2	6	233400	233405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406117
2517	NC_018420	T	6	6	233551	233556	0 %	100 %	0 %	0 %	400406117
2518	NC_018420	AATA	2	8	233566	233573	75 %	25 %	0 %	0 %	400406117
2519	NC_018420	ATG	2	6	233653	233658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406117
2520	NC_018420	CT	3	6	233713	233718	0 %	50 %	0 %	50 %	400406117
2521	NC_018420	GCC	2	6	233758	233763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400406117
2522	NC_018420	ATA	2	6	233788	233793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406117
2523	NC_018420	ACA	2	6	233807	233812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406117
2524	NC_018420	T	6	6	233824	233829	0 %	100 %	0 %	0 %	400406117
2525	NC_018420	AATC	2	8	235828	235835	50 %	25 %	0 %	25 %	400406118
2526	NC_018420	TAT	2	6	235871	235876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406118
2527	NC_018420	ATAGAA	2	12	235924	235935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	400406118
2528	NC_018420	AAC	2	6	235937	235942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406118
2529	NC_018420	GA	3	6	235973	235978	50 %	0 %	50 %	0 %	400406118
2530	NC_018420	A	8	8	236010	236017	100 %	0 %	0 %	0 %	400406118
2531	NC_018420	GCT	2	6	236062	236067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406118
2532	NC_018420	ATA	2	6	236075	236080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406118
2533	NC_018420	TAC	2	6	236153	236158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406118
2534	NC_018420	AATG	2	8	236170	236177	50 %	25 %	25 %	0 %	400406118
2535	NC_018420	AC	3	6	236208	236213	50 %	0 %	0 %	50 %	400406118
2536	NC_018420	A	8	8	236295	236302	100 %	0 %	0 %	0 %	400406118
2537	NC_018420	CTC	2	6	236321	236326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406118
2538	NC_018420	TTAT	2	8	236330	236337	25 %	75 %	0 %	0 %	400406118
2539	NC_018420	CGT	2	6	236356	236361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406118
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2541	NC_018420	T	7	7	236403	236409	0 %	100 %	0 %	0 %	400406118
2542	NC_018420	TAT	2	6	236418	236423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406118
2543	NC_018420	AAC	2	6	236441	236446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406118
2544	NC_018420	TAAAA	2	10	236493	236502	80 %	20 %	0 %	0 %	400406118
2545	NC_018420	GGTT	2	8	236512	236519	0 %	50 %	50 %	0 %	400406118
2546	NC_018420	GGA	2	6	236554	236559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400406118
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2549	NC_018420	TAA	2	6	236601	236606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406118
2550	NC_018420	CAC	2	6	236625	236630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406118
2551	NC_018420	TA	3	6	236641	236646	50 %	50 %	0 %	0 %	400406118
2552	NC_018420	A	6	6	236650	236655	100 %	0 %	0 %	0 %	400406118
2553	NC_018420	A	8	8	236660	236667	100 %	0 %	0 %	0 %	400406118
2554	NC_018420	ATA	2	6	236737	236742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406118
2555	NC_018420	TTA	2	6	236752	236757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406119
2556	NC_018420	TTA	2	6	236778	236783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406119
2557	NC_018420	CATT	2	8	236795	236802	25 %	50 %	0 %	25 %	400406119
2558	NC_018420	CTT	2	6	236926	236931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406119
2559	NC_018420	TACT	2	8	236960	236967	25 %	50 %	0 %	25 %	400406119
2560	NC_018420	TTG	2	6	236998	237003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406119
2561	NC_018420	TTA	2	6	237022	237027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406119
2562	NC_018420	A	8	8	237158	237165	100 %	0 %	0 %	0 %	400406119
2563	NC_018420	AAT	2	6	237276	237281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406119
2564	NC_018420	AGG	2	6	237323	237328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400406119
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2571	NC_018420	T	7	7	239109	239115	0 %	100 %	0 %	0 %	400406120
2572	NC_018420	AGT	2	6	239160	239165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406120
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2574	NC_018420	AGAA	2	8	239190	239197	75 %	0 %	25 %	0 %	400406120
2575	NC_018420	T	8	8	239199	239206	0 %	100 %	0 %	0 %	400406120
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2579	NC_018420	TTTTA	2	10	239346	239355	20 %	80 %	0 %	0 %	400406120
2580	NC_018420	TGC	2	6	239391	239396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406120
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2583	NC_018420	ATT	2	6	239638	239643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406120
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2589	NC_018420	T	7	7	240036	240042	0 %	100 %	0 %	0 %	400406120
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2593	NC_018420	ATT	2	6	240298	240303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406121
2594	NC_018420	T	6	6	240302	240307	0 %	100 %	0 %	0 %	400406121
2595	NC_018420	CTT	2	6	240316	240321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406121
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2602	NC_018420	ATTT	2	8	240469	240476	25 %	75 %	0 %	0 %	400406121
2603	NC_018420	T	6	6	240501	240506	0 %	100 %	0 %	0 %	400406121
2604	NC_018420	AGA	2	6	240536	240541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406121
2605	NC_018420	TCT	2	6	240558	240563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406121
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2608	NC_018420	TGTTC	2	10	240718	240727	0 %	60 %	20 %	20 %	400406121
2609	NC_018420	TGT	2	6	240859	240864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406121
2610	NC_018420	AGA	2	6	240866	240871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406121
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2614	NC_018420	GTA	2	6	240963	240968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406121
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2624	NC_018420	TCT	2	6	241281	241286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406121
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2870	NC_018420	ATC	2	6	261233	261238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406132
2871	NC_018420	T	8	8	261255	261262	0 %	100 %	0 %	0 %	400406132
2872	NC_018420	TCA	2	6	266262	266267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406133
2873	NC_018420	GCT	2	6	266329	266334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406133
2874	NC_018420	GAT	2	6	266413	266418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406133
2875	NC_018420	AATT	2	8	266425	266432	50 %	50 %	0 %	0 %	400406133
2876	NC_018420	AATG	2	8	266468	266475	50 %	25 %	25 %	0 %	400406133
2877	NC_018420	AAAG	2	8	266565	266572	75 %	0 %	25 %	0 %	400406133
2878	NC_018420	T	9	9	266603	266611	0 %	100 %	0 %	0 %	400406133
2879	NC_018420	ATG	2	6	266636	266641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406133
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2882	NC_018420	AATCAC	2	12	266677	266688	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	400406133
2883	NC_018420	TCA	2	6	266719	266724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406133
2884	NC_018420	CTT	2	6	266794	266799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406133
2885	NC_018420	CAG	2	6	266842	266847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406133
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2887	NC_018420	TAAA	2	8	266885	266892	75 %	25 %	0 %	0 %	400406133
2888	NC_018420	T	6	6	266971	266976	0 %	100 %	0 %	0 %	400406133
2889	NC_018420	A	6	6	267020	267025	100 %	0 %	0 %	0 %	400406133
2890	NC_018420	T	7	7	267034	267040	0 %	100 %	0 %	0 %	400406133
2891	NC_018420	TAA	2	6	267059	267064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406133
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2893	NC_018420	T	6	6	267112	267117	0 %	100 %	0 %	0 %	400406133
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2899	NC_018420	CAG	2	6	268703	268708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406134
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2903	NC_018420	GCCA	2	8	268798	268805	25 %	0 %	25 %	50 %	400406134
2904	NC_018420	A	7	7	268923	268929	100 %	0 %	0 %	0 %	400406134
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2924	NC_018420	GCT	2	6	271029	271034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406135
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2951	NC_018420	A	6	6	272247	272252	100 %	0 %	0 %	0 %	400406135
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2989	NC_018420	TCCC	2	8	274034	274041	0 %	25 %	0 %	75 %	400406136
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2991	NC_018420	CAAA	2	8	274142	274149	75 %	0 %	0 %	25 %	400406136
2992	NC_018420	GAT	2	6	274247	274252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406136
2993	NC_018420	TTA	2	6	274300	274305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406136
2994	NC_018420	TCC	2	6	274370	274375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406136
2995	NC_018420	A	7	7	274479	274485	100 %	0 %	0 %	0 %	400406136
2996	NC_018420	CTT	2	6	274526	274531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406136
2997	NC_018420	A	7	7	274581	274587	100 %	0 %	0 %	0 %	400406136
2998	NC_018420	TATCT	2	10	274668	274677	20 %	60 %	0 %	20 %	400406136
2999	NC_018420	A	7	7	277330	277336	100 %	0 %	0 %	0 %	400406137
3000	NC_018420	TCA	2	6	277449	277454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406137

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