MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 12892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018420	ACC	2	6	542152	542157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406261
6002	NC_018420	GTT	2	6	542184	542189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406261
6003	NC_018420	GAT	2	6	542201	542206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6004	NC_018420	GAT	2	6	542269	542274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6005	NC_018420	AGA	2	6	542293	542298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406261
6006	NC_018420	GTGCAT	2	12	542334	542345	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	400406261
6007	NC_018420	TTA	2	6	542382	542387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406261
6008	NC_018420	TAAA	2	8	542409	542416	75 %	25 %	0 %	0 %	400406261
6009	NC_018420	A	6	6	542430	542435	100 %	0 %	0 %	0 %	400406261
6010	NC_018420	TGA	2	6	542485	542490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6011	NC_018420	AGT	2	6	542686	542691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6012	NC_018420	TCG	2	6	542695	542700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406261
6013	NC_018420	TTA	2	6	542765	542770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406261
6014	NC_018420	ATT	2	6	542783	542788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406261
6015	NC_018420	CAG	2	6	542814	542819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406261
6016	NC_018420	A	6	6	542824	542829	100 %	0 %	0 %	0 %	400406261
6017	NC_018420	ACTA	2	8	543001	543008	50 %	25 %	0 %	25 %	400406261
6018	NC_018420	TAT	2	6	543027	543032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406261
6019	NC_018420	ATT	2	6	543046	543051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406261
6020	NC_018420	TCG	2	6	543154	543159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406261
6021	NC_018420	AGA	2	6	543196	543201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406261
6022	NC_018420	TAA	2	6	543204	543209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406261
6023	NC_018420	GAA	2	6	543278	543283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406261
6024	NC_018420	GTG	2	6	543291	543296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406261
6025	NC_018420	CAG	2	6	543309	543314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406261
6026	NC_018420	AGA	3	9	543325	543333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406261
6027	NC_018420	T	6	6	543381	543386	0 %	100 %	0 %	0 %	400406261
6028	NC_018420	TAG	2	6	543388	543393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6029	NC_018420	AT	3	6	543401	543406	50 %	50 %	0 %	0 %	400406261
6030	NC_018420	GAG	2	6	543441	543446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400406261
6031	NC_018420	TTA	2	6	543470	543475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406261
6032	NC_018420	AACG	2	8	543488	543495	50 %	0 %	25 %	25 %	400406261
6033	NC_018420	A	7	7	543572	543578	100 %	0 %	0 %	0 %	400406261
6034	NC_018420	TTG	2	6	543585	543590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406261
6035	NC_018420	GTC	2	6	543597	543602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406261
6036	NC_018420	GTA	2	6	543675	543680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6037	NC_018420	ATG	2	6	543681	543686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6038	NC_018420	GTG	2	6	543716	543721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406261
6039	NC_018420	AAG	2	6	543742	543747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406261
6040	NC_018420	GAA	2	6	543753	543758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406261
6041	NC_018420	AATT	2	8	543778	543785	50 %	50 %	0 %	0 %	400406261
6042	NC_018420	TGAA	2	8	543936	543943	50 %	25 %	25 %	0 %	400406261
6043	NC_018420	AGT	2	6	543955	543960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6044	NC_018420	ATA	2	6	543978	543983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406261
6045	NC_018420	TAA	2	6	543999	544004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406261
6046	NC_018420	GTAC	2	8	544022	544029	25 %	25 %	25 %	25 %	400406261
6047	NC_018420	TAT	2	6	544048	544053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406261
6048	NC_018420	AAG	2	6	544095	544100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406261
6049	NC_018420	TGGT	2	8	544107	544114	0 %	50 %	50 %	0 %	400406261
6050	NC_018420	TGA	2	6	544129	544134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406261
6051	NC_018420	AT	3	6	544268	544273	50 %	50 %	0 %	0 %	400406262
6052	NC_018420	ACC	2	6	544327	544332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406262
6053	NC_018420	TTA	2	6	544361	544366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406262
6054	NC_018420	AAT	2	6	544367	544372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406262
6055	NC_018420	TTA	2	6	544449	544454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406262
6056	NC_018420	CAA	2	6	544461	544466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406262
6057	NC_018420	GCG	2	6	544468	544473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400406262
6058	NC_018420	TAT	2	6	544504	544509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406262
6059	NC_018420	AG	4	8	544525	544532	50 %	0 %	50 %	0 %	400406262
6060	NC_018420	ATTTA	2	10	544573	544582	40 %	60 %	0 %	0 %	400406262
6061	NC_018420	ATT	2	6	544604	544609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406262
6062	NC_018420	T	6	6	544736	544741	0 %	100 %	0 %	0 %	400406263
6063	NC_018420	GAAC	2	8	544833	544840	50 %	0 %	25 %	25 %	400406263
6064	NC_018420	ATC	2	6	544853	544858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406263
6065	NC_018420	TCT	2	6	544896	544901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406263
6066	NC_018420	CAA	2	6	544933	544938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406263
6067	NC_018420	TGC	2	6	544967	544972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406263
6068	NC_018420	CTT	2	6	544984	544989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406263
6069	NC_018420	TAAT	2	8	545023	545030	50 %	50 %	0 %	0 %	400406263
6070	NC_018420	GTT	2	6	545047	545052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406263
6071	NC_018420	GCT	2	6	545061	545066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406263
6072	NC_018420	GCAT	2	8	545102	545109	25 %	25 %	25 %	25 %	400406263
6073	NC_018420	GAT	2	6	545134	545139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406263
6074	NC_018420	CGT	2	6	545140	545145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406263
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6077	NC_018420	TAAGT	2	10	545378	545387	40 %	40 %	20 %	0 %	400406263
6078	NC_018420	TCT	2	6	545403	545408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406263
6079	NC_018420	CTT	2	6	545416	545421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406263
6080	NC_018420	ACG	2	6	545498	545503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406263
6081	NC_018420	GT	3	6	545518	545523	0 %	50 %	50 %	0 %	400406263
6082	NC_018420	GT	3	6	545564	545569	0 %	50 %	50 %	0 %	400406263
6083	NC_018420	TGAT	2	8	545580	545587	25 %	50 %	25 %	0 %	400406263
6084	NC_018420	CTA	2	6	545590	545595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406263
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6086	NC_018420	CAGC	2	8	545792	545799	25 %	0 %	25 %	50 %	400406264
6087	NC_018420	T	7	7	545826	545832	0 %	100 %	0 %	0 %	400406264
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6092	NC_018420	TAA	2	6	545997	546002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406264
6093	NC_018420	TAA	2	6	546006	546011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406264
6094	NC_018420	TGC	2	6	546039	546044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406264
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6096	NC_018420	TTTAG	2	10	546250	546259	20 %	60 %	20 %	0 %	400406264
6097	NC_018420	T	6	6	546278	546283	0 %	100 %	0 %	0 %	400406264
6098	NC_018420	GAC	2	6	546331	546336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406265
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6100	NC_018420	GCA	2	6	546510	546515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406265
6101	NC_018420	GTT	2	6	546611	546616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406265
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6104	NC_018420	T	6	6	546722	546727	0 %	100 %	0 %	0 %	400406266
6105	NC_018420	GATG	2	8	547284	547291	25 %	25 %	50 %	0 %	400406267
6106	NC_018420	ATC	2	6	547371	547376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406268
6107	NC_018420	T	7	7	547399	547405	0 %	100 %	0 %	0 %	400406268
6108	NC_018420	CAT	2	6	547429	547434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406268
6109	NC_018420	AAC	2	6	547484	547489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406268
6110	NC_018420	AT	3	6	547562	547567	50 %	50 %	0 %	0 %	400406268
6111	NC_018420	AT	3	6	547607	547612	50 %	50 %	0 %	0 %	400406268
6112	NC_018420	CTG	2	6	547674	547679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406268
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6114	NC_018420	TA	3	6	547740	547745	50 %	50 %	0 %	0 %	400406268
6115	NC_018420	TAAA	2	8	547774	547781	75 %	25 %	0 %	0 %	400406268
6116	NC_018420	ATG	2	6	547853	547858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406268
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6118	NC_018420	TTG	2	6	547945	547950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406268
6119	NC_018420	TAC	2	6	547966	547971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406268
6120	NC_018420	CAA	2	6	547992	547997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406268
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6122	NC_018420	AGG	2	6	548101	548106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400406268
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6237	NC_018420	CGTA	2	8	554205	554212	25 %	25 %	25 %	25 %	400406282
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6246	NC_018420	CTT	2	6	554675	554680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406283
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6248	NC_018420	ATT	2	6	554702	554707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406283
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6274	NC_018420	TCC	2	6	555832	555837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406285
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6282	NC_018420	CGA	2	6	556047	556052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406286
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6326	NC_018420	TTA	2	6	560054	560059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406290
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6334	NC_018420	GAA	2	6	560272	560277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406290
6335	NC_018420	GATT	2	8	560346	560353	25 %	50 %	25 %	0 %	400406290
6336	NC_018420	ACA	2	6	560354	560359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406290
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6340	NC_018420	A	6	6	560408	560413	100 %	0 %	0 %	0 %	400406290
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6343	NC_018420	ATG	2	6	560518	560523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406290
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6347	NC_018420	TCCT	2	8	564468	564475	0 %	50 %	0 %	50 %	400406291
6348	NC_018420	AAT	2	6	564531	564536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406291
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6350	NC_018420	TTG	2	6	564602	564607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406291
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6352	NC_018420	GTA	2	6	564812	564817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406291
6353	NC_018420	CTG	2	6	564863	564868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406291
6354	NC_018420	GAG	2	6	564869	564874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400406291
6355	NC_018420	GGT	2	6	564877	564882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406291
6356	NC_018420	TTA	2	6	564890	564895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406291
6357	NC_018420	TTC	2	6	564926	564931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406291
6358	NC_018420	ACCG	2	8	564943	564950	25 %	0 %	25 %	50 %	400406291
6359	NC_018420	GCT	2	6	565030	565035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406291
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6361	NC_018420	ACGCT	2	10	565098	565107	20 %	20 %	20 %	40 %	400406291
6362	NC_018420	TTTA	2	8	565181	565188	25 %	75 %	0 %	0 %	400406291
6363	NC_018420	AGAGA	2	10	565237	565246	60 %	0 %	40 %	0 %	400406291
6364	NC_018420	CAG	2	6	565286	565291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406291
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6492	NC_018420	TTC	2	6	572711	572716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406298
6493	NC_018420	A	7	7	572771	572777	100 %	0 %	0 %	0 %	400406298
6494	NC_018420	GTT	2	6	572805	572810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406298
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6496	NC_018420	TGTT	2	8	572828	572835	0 %	75 %	25 %	0 %	400406298
6497	NC_018420	T	6	6	572840	572845	0 %	100 %	0 %	0 %	400406298
6498	NC_018420	AAG	2	6	572860	572865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406298
6499	NC_018420	AT	3	6	572936	572941	50 %	50 %	0 %	0 %	400406298
6500	NC_018420	TTGA	2	8	572960	572967	25 %	50 %	25 %	0 %	400406298

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