MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 12892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018420	ATG	2	6	438197	438202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406216
5002	NC_018420	T	8	8	438252	438259	0 %	100 %	0 %	0 %	400406216
5003	NC_018420	TGA	2	6	438265	438270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406216
5004	NC_018420	TAA	2	6	438279	438284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406216
5005	NC_018420	AG	5	10	438305	438314	50 %	0 %	50 %	0 %	400406216
5006	NC_018420	TC	3	6	438326	438331	0 %	50 %	0 %	50 %	400406216
5007	NC_018420	T	9	9	438334	438342	0 %	100 %	0 %	0 %	400406216
5008	NC_018420	ATT	2	6	438364	438369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406216
5009	NC_018420	GTT	2	6	438403	438408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406216
5010	NC_018420	TTGC	2	8	440082	440089	0 %	50 %	25 %	25 %	400406217
5011	NC_018420	GGT	2	6	440097	440102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406217
5012	NC_018420	ATG	3	9	440159	440167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406217
5013	NC_018420	ATT	2	6	440228	440233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406217
5014	NC_018420	CAA	2	6	440237	440242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406217
5015	NC_018420	AAAT	2	8	440298	440305	75 %	25 %	0 %	0 %	400406217
5016	NC_018420	ATTTT	2	10	440482	440491	20 %	80 %	0 %	0 %	400406218
5017	NC_018420	TAA	2	6	440498	440503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406218
5018	NC_018420	GTT	2	6	440600	440605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406218
5019	NC_018420	CAACG	2	10	440684	440693	40 %	0 %	20 %	40 %	400406218
5020	NC_018420	TTA	2	6	440710	440715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406218
5021	NC_018420	CAC	2	6	440720	440725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406218
5022	NC_018420	A	6	6	440729	440734	100 %	0 %	0 %	0 %	400406218
5023	NC_018420	ATA	2	6	440765	440770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406218
5024	NC_018420	T	6	6	440785	440790	0 %	100 %	0 %	0 %	400406218
5025	NC_018420	T	7	7	440868	440874	0 %	100 %	0 %	0 %	400406218
5026	NC_018420	CAA	2	6	441011	441016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406218
5027	NC_018420	CAT	2	6	441170	441175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406218
5028	NC_018420	GCC	2	6	441187	441192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400406218
5029	NC_018420	CTT	2	6	441200	441205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406218
5030	NC_018420	TGT	2	6	441267	441272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406218
5031	NC_018420	TAA	2	6	441314	441319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406218
5032	NC_018420	T	6	6	441362	441367	0 %	100 %	0 %	0 %	400406218
5033	NC_018420	A	8	8	441387	441394	100 %	0 %	0 %	0 %	400406218
5034	NC_018420	CAG	2	6	441406	441411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406218
5035	NC_018420	TTTAGT	2	12	441420	441431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	400406218
5036	NC_018420	ATG	2	6	441433	441438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406218
5037	NC_018420	GGTA	2	8	441488	441495	25 %	25 %	50 %	0 %	400406219
5038	NC_018420	TAAG	2	8	441498	441505	50 %	25 %	25 %	0 %	400406219
5039	NC_018420	AAGC	2	8	441588	441595	50 %	0 %	25 %	25 %	400406219
5040	NC_018420	A	6	6	441646	441651	100 %	0 %	0 %	0 %	400406219
5041	NC_018420	TA	3	6	441666	441671	50 %	50 %	0 %	0 %	400406219
5042	NC_018420	TTG	2	6	441676	441681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406219
5043	NC_018420	TA	3	6	441712	441717	50 %	50 %	0 %	0 %	400406219
5044	NC_018420	TTA	2	6	441753	441758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406219
5045	NC_018420	GTT	2	6	441762	441767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406219
5046	NC_018420	ATA	2	6	441801	441806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406219
5047	NC_018420	CAA	2	6	441873	441878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406219
5048	NC_018420	TCT	2	6	441883	441888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406219
5049	NC_018420	TCG	2	6	441920	441925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406219
5050	NC_018420	AGT	2	6	441932	441937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406219
5051	NC_018420	TAGA	2	8	441978	441985	50 %	25 %	25 %	0 %	400406219
5052	NC_018420	T	6	6	442027	442032	0 %	100 %	0 %	0 %	400406219
5053	NC_018420	ATG	2	6	442126	442131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406219
5054	NC_018420	TGA	2	6	442196	442201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406219
5055	NC_018420	A	7	7	442203	442209	100 %	0 %	0 %	0 %	400406219
5056	NC_018420	T	7	7	442212	442218	0 %	100 %	0 %	0 %	400406219
5057	NC_018420	TTC	2	6	442267	442272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406219
5058	NC_018420	T	7	7	442276	442282	0 %	100 %	0 %	0 %	400406219
5059	NC_018420	AT	3	6	442318	442323	50 %	50 %	0 %	0 %	400406219
5060	NC_018420	TTTG	2	8	442328	442335	0 %	75 %	25 %	0 %	400406219
5061	NC_018420	A	7	7	442354	442360	100 %	0 %	0 %	0 %	400406219
5062	NC_018420	AT	3	6	442408	442413	50 %	50 %	0 %	0 %	400406219
5063	NC_018420	TTA	2	6	442448	442453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406219
5064	NC_018420	TAT	2	6	442459	442464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406219
5065	NC_018420	TG	3	6	442466	442471	0 %	50 %	50 %	0 %	400406219
5066	NC_018420	TTTC	2	8	442475	442482	0 %	75 %	0 %	25 %	400406219
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5068	NC_018420	GGT	2	6	442531	442536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406219
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5070	NC_018420	A	6	6	442590	442595	100 %	0 %	0 %	0 %	400406219
5071	NC_018420	CTG	2	6	442632	442637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406219
5072	NC_018420	GATA	2	8	442731	442738	50 %	25 %	25 %	0 %	400406219
5073	NC_018420	CTTC	2	8	442754	442761	0 %	50 %	0 %	50 %	400406219
5074	NC_018420	AAC	2	6	442764	442769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406219
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5076	NC_018420	TGGA	2	8	442786	442793	25 %	25 %	50 %	0 %	400406219
5077	NC_018420	TCG	2	6	442879	442884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406219
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5080	NC_018420	AT	3	6	443021	443026	50 %	50 %	0 %	0 %	400406219
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5089	NC_018420	GT	3	6	443232	443237	0 %	50 %	50 %	0 %	400406219
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5099	NC_018420	TTG	2	6	443950	443955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406220
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5103	NC_018420	AGT	2	6	444209	444214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406220
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5107	NC_018420	TGT	2	6	444332	444337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406220
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5109	NC_018420	AG	3	6	444532	444537	50 %	0 %	50 %	0 %	400406220
5110	NC_018420	GCA	2	6	444575	444580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406220
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5112	NC_018420	AGT	2	6	444704	444709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406220
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5114	NC_018420	T	7	7	444743	444749	0 %	100 %	0 %	0 %	400406220
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5120	NC_018420	T	6	6	445009	445014	0 %	100 %	0 %	0 %	400406220
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5123	NC_018420	TG	3	6	445078	445083	0 %	50 %	50 %	0 %	400406220
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5125	NC_018420	TCAAT	2	10	445164	445173	40 %	40 %	0 %	20 %	400406220
5126	NC_018420	TGC	2	6	445189	445194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406220
5127	NC_018420	GTA	2	6	445236	445241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406220
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5140	NC_018420	TTG	2	6	448737	448742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406222
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5142	NC_018420	TTG	2	6	448756	448761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406222
5143	NC_018420	GCT	2	6	448829	448834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406222
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5146	NC_018420	AT	3	6	449190	449195	50 %	50 %	0 %	0 %	400406223
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5167	NC_018420	A	6	6	453274	453279	100 %	0 %	0 %	0 %	400406226
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5241	NC_018420	TATGAT	2	12	457623	457634	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	400406230
5242	NC_018420	A	6	6	457668	457673	100 %	0 %	0 %	0 %	400406230
5243	NC_018420	ATTT	2	8	457699	457706	25 %	75 %	0 %	0 %	400406230
5244	NC_018420	TGA	2	6	457800	457805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406230
5245	NC_018420	TAC	2	6	457815	457820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406230
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5247	NC_018420	GTG	3	9	457862	457870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406230
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5495	NC_018420	TATT	2	8	480302	480309	25 %	75 %	0 %	0 %	400406239
5496	NC_018420	ACT	2	6	480357	480362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406239
5497	NC_018420	ATTA	2	8	480369	480376	50 %	50 %	0 %	0 %	400406239
5498	NC_018420	T	6	6	480406	480411	0 %	100 %	0 %	0 %	400406239
5499	NC_018420	A	7	7	480458	480464	100 %	0 %	0 %	0 %	400406239
5500	NC_018420	TAA	2	6	480470	480475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406239

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