MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Ctenarytaina eucalypti chromosome

Total Repeats: 14508

< Previous12...678910111213141516...2930Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018419	CTG	2	6	512994	512999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405313
5002	NC_018419	AGT	2	6	513026	513031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405313
5003	NC_018419	A	7	7	513034	513040	100 %	0 %	0 %	0 %	400405313
5004	NC_018419	TCA	2	6	513095	513100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405313
5005	NC_018419	AAG	2	6	513148	513153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400405313
5006	NC_018419	T	6	6	513171	513176	0 %	100 %	0 %	0 %	400405313
5007	NC_018419	A	7	7	513238	513244	100 %	0 %	0 %	0 %	400405313
5008	NC_018419	TAG	2	6	513271	513276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405313
5009	NC_018419	CTTT	2	8	513334	513341	0 %	75 %	0 %	25 %	400405313
5010	NC_018419	GAA	2	6	513411	513416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400405313
5011	NC_018419	TC	4	8	513561	513568	0 %	50 %	0 %	50 %	400405314
5012	NC_018419	GAA	2	6	513729	513734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400405314
5013	NC_018419	TTA	2	6	513741	513746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400405314
5014	NC_018419	CAT	2	6	513772	513777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405314
5015	NC_018419	A	7	7	513815	513821	100 %	0 %	0 %	0 %	400405314
5016	NC_018419	GAC	2	6	513840	513845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405314
5017	NC_018419	CTGTCT	2	12	513860	513871	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	400405314
5018	NC_018419	GGA	2	6	513876	513881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400405314
5019	NC_018419	TGC	2	6	513908	513913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405314
5020	NC_018419	GGC	2	6	513929	513934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405314
5021	NC_018419	AGG	2	6	515074	515079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400405315
5022	NC_018419	CCT	2	6	515137	515142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400405315
5023	NC_018419	AAT	2	6	515163	515168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405315
5024	NC_018419	GC	4	8	515408	515415	0 %	0 %	50 %	50 %	400405315
5025	NC_018419	CAG	2	6	515440	515445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405315
5026	NC_018419	T	6	6	515594	515599	0 %	100 %	0 %	0 %	400405315
5027	NC_018419	CTC	2	6	515612	515617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400405315
5028	NC_018419	CGA	2	6	515856	515861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405315
5029	NC_018419	GAT	2	6	515864	515869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405315
5030	NC_018419	A	6	6	516104	516109	100 %	0 %	0 %	0 %	400405316
5031	NC_018419	AAT	2	6	516123	516128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405316
5032	NC_018419	CTG	2	6	516174	516179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405316
5033	NC_018419	A	6	6	516201	516206	100 %	0 %	0 %	0 %	400405316
5034	NC_018419	TAA	2	6	516237	516242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405316
5035	NC_018419	TGA	2	6	516287	516292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405316
5036	NC_018419	CCA	2	6	516312	516317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400405316
5037	NC_018419	TCA	2	6	516380	516385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405316
5038	NC_018419	CAGA	2	8	516480	516487	50 %	0 %	25 %	25 %	400405316
5039	NC_018419	CAG	2	6	516499	516504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405316
5040	NC_018419	CTG	2	6	516525	516530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405316
5041	NC_018419	CTT	2	6	516531	516536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400405316
5042	NC_018419	CAT	2	6	516571	516576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405316
5043	NC_018419	TCA	2	6	516627	516632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405316
5044	NC_018419	TCAGC	2	10	516648	516657	20 %	20 %	20 %	40 %	400405316
5045	NC_018419	GGC	2	6	516691	516696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405316
5046	NC_018419	AGA	2	6	516710	516715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400405316
5047	NC_018419	TAG	2	6	516739	516744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405316
5048	NC_018419	AG	3	6	516784	516789	50 %	0 %	50 %	0 %	400405316
5049	NC_018419	T	7	7	516823	516829	0 %	100 %	0 %	0 %	400405316
5050	NC_018419	C	10	10	516925	516934	0 %	0 %	0 %	100 %	400405316
5051	NC_018419	GCG	2	6	516941	516946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405316
5052	NC_018419	TCC	2	6	516995	517000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400405316
5053	NC_018419	CGT	2	6	517087	517092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405316
5054	NC_018419	GAA	2	6	517126	517131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400405316
5055	NC_018419	CAC	2	6	517179	517184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400405316
5056	NC_018419	CGC	2	6	517185	517190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405316
5057	NC_018419	TAA	2	6	517206	517211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405316
5058	NC_018419	AAT	2	6	517313	517318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405317
5059	NC_018419	ACC	2	6	517417	517422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400405317
5060	NC_018419	CAG	3	9	517437	517445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405317
5061	NC_018419	AAT	2	6	517449	517454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405317
5062	NC_018419	CAT	2	6	517467	517472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405317
5063	NC_018419	GGCC	2	8	517496	517503	0 %	0 %	50 %	50 %	400405317
5064	NC_018419	GCT	2	6	517541	517546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405317
5065	NC_018419	CGC	2	6	517561	517566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405317
5066	NC_018419	GCC	2	6	517567	517572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405317
5067	NC_018419	CGG	2	6	517587	517592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405317
5068	NC_018419	GCC	2	6	517725	517730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405317
5069	NC_018419	CTC	2	6	517759	517764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400405317
5070	NC_018419	ACT	2	6	517772	517777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405317
5071	NC_018419	GTTA	2	8	517855	517862	25 %	50 %	25 %	0 %	400405317
5072	NC_018419	C	7	7	517905	517911	0 %	0 %	0 %	100 %	400405317
5073	NC_018419	AC	4	8	517955	517962	50 %	0 %	0 %	50 %	400405317
5074	NC_018419	TCT	2	6	517979	517984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400405317
5075	NC_018419	T	6	6	518144	518149	0 %	100 %	0 %	0 %	400405317
5076	NC_018419	AATC	2	8	518163	518170	50 %	25 %	0 %	25 %	400405317
5077	NC_018419	AAC	2	6	518239	518244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400405317
5078	NC_018419	CTT	2	6	518271	518276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400405317
5079	NC_018419	GC	3	6	518387	518392	0 %	0 %	50 %	50 %	400405317
5080	NC_018419	CA	3	6	518395	518400	50 %	0 %	0 %	50 %	400405317
5081	NC_018419	ACCAT	2	10	518480	518489	40 %	20 %	0 %	40 %	400405317
5082	NC_018419	GCA	2	6	518493	518498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405317
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5084	NC_018419	CTA	2	6	518544	518549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405317
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5086	NC_018419	ATT	2	6	518576	518581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400405317
5087	NC_018419	TCTT	2	8	519150	519157	0 %	75 %	0 %	25 %	400405318
5088	NC_018419	TAG	2	6	519210	519215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405318
5089	NC_018419	GAG	2	6	519222	519227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400405318
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5091	NC_018419	TCC	2	6	519583	519588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400405319
5092	NC_018419	CAA	2	6	519735	519740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400405319
5093	NC_018419	TA	3	6	519776	519781	50 %	50 %	0 %	0 %	400405319
5094	NC_018419	TGC	2	6	519852	519857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405319
5095	NC_018419	GCA	2	6	519868	519873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405319
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5097	NC_018419	GCG	2	6	519969	519974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405319
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5101	NC_018419	ATC	2	6	520207	520212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405319
5102	NC_018419	GTC	2	6	520214	520219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405319
5103	NC_018419	TCG	2	6	520252	520257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405319
5104	NC_018419	GAA	2	6	520295	520300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400405319
5105	NC_018419	TAA	2	6	520304	520309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405319
5106	NC_018419	AAG	2	6	520402	520407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400405319
5107	NC_018419	TCG	2	6	520420	520425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405319
5108	NC_018419	GC	3	6	520466	520471	0 %	0 %	50 %	50 %	400405319
5109	NC_018419	GGCC	2	8	520514	520521	0 %	0 %	50 %	50 %	400405319
5110	NC_018419	GTA	2	6	520552	520557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405319
5111	NC_018419	CGG	2	6	520679	520684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405319
5112	NC_018419	ACC	2	6	520699	520704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400405319
5113	NC_018419	GC	3	6	520776	520781	0 %	0 %	50 %	50 %	400405319
5114	NC_018419	TCAGA	2	10	520796	520805	40 %	20 %	20 %	20 %	400405319
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5118	NC_018419	AC	3	6	520986	520991	50 %	0 %	0 %	50 %	400405319
5119	NC_018419	ACA	2	6	521106	521111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400405320
5120	NC_018419	CTCG	2	8	521148	521155	0 %	25 %	25 %	50 %	400405320
5121	NC_018419	GCTG	2	8	521165	521172	0 %	25 %	50 %	25 %	400405320
5122	NC_018419	CAA	2	6	521175	521180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400405320
5123	NC_018419	CGC	2	6	521185	521190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405320
5124	NC_018419	GAG	2	6	521203	521208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400405320
5125	NC_018419	CTG	2	6	521224	521229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405320
5126	NC_018419	GCG	2	6	521276	521281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405320
5127	NC_018419	CTCA	2	8	521284	521291	25 %	25 %	0 %	50 %	400405320
5128	NC_018419	GACA	2	8	521310	521317	50 %	0 %	25 %	25 %	400405320
5129	NC_018419	GCG	2	6	521339	521344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405320
5130	NC_018419	TCA	2	6	521351	521356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405320
5131	NC_018419	GAT	2	6	521403	521408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405320
5132	NC_018419	CCT	2	6	521412	521417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400405320
5133	NC_018419	CAAC	2	8	521475	521482	50 %	0 %	0 %	50 %	400405320
5134	NC_018419	CCA	2	6	521519	521524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400405320
5135	NC_018419	CTA	2	6	521613	521618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405320
5136	NC_018419	GTA	2	6	521652	521657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405320
5137	NC_018419	TTAG	2	8	521687	521694	25 %	50 %	25 %	0 %	400405320
5138	NC_018419	GCT	2	6	521747	521752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405320
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5140	NC_018419	GCC	2	6	522037	522042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405320
5141	NC_018419	GCC	2	6	522066	522071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405320
5142	NC_018419	CAC	2	6	523262	523267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400405321
5143	NC_018419	ACTGA	2	10	523281	523290	40 %	20 %	20 %	20 %	400405321
5144	NC_018419	GCG	2	6	523478	523483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405321
5145	NC_018419	T	6	6	523495	523500	0 %	100 %	0 %	0 %	400405321
5146	NC_018419	AGA	2	6	523516	523521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400405321
5147	NC_018419	TGC	2	6	523565	523570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405321
5148	NC_018419	CGC	2	6	523607	523612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405321
5149	NC_018419	GTC	2	6	523614	523619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405321
5150	NC_018419	GGC	2	6	523742	523747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405321
5151	NC_018419	TAA	2	6	523773	523778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405321
5152	NC_018419	ATA	2	6	523827	523832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405321
5153	NC_018419	ATC	2	6	523899	523904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405321
5154	NC_018419	CAT	2	6	523928	523933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405321
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5157	NC_018419	GCT	2	6	524093	524098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405321
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5161	NC_018419	GCTA	2	8	524328	524335	25 %	25 %	25 %	25 %	400405321
5162	NC_018419	GGC	2	6	524346	524351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405321
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5165	NC_018419	AAGA	2	8	524483	524490	75 %	0 %	25 %	0 %	400405321
5166	NC_018419	GCCCAA	2	12	524498	524509	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	400405321
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5172	NC_018419	GTA	2	6	524776	524781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405322
5173	NC_018419	CGA	2	6	524887	524892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405322
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5179	NC_018419	CGT	2	6	525155	525160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405322
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5191	NC_018419	CTTC	2	8	525630	525637	0 %	50 %	0 %	50 %	400405323
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5200	NC_018419	GC	3	6	526107	526112	0 %	0 %	50 %	50 %	400405323
5201	NC_018419	AGC	2	6	526114	526119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405323
5202	NC_018419	AC	5	10	526198	526207	50 %	0 %	0 %	50 %	400405323
5203	NC_018419	ATA	2	6	526220	526225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405323
5204	NC_018419	A	7	7	526234	526240	100 %	0 %	0 %	0 %	400405323
5205	NC_018419	GTT	2	6	526246	526251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400405323
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5210	NC_018419	CGG	2	6	526587	526592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405323
5211	NC_018419	CTG	2	6	526693	526698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405323
5212	NC_018419	CAG	2	6	526786	526791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405323
5213	NC_018419	GCT	2	6	526793	526798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405323
5214	NC_018419	A	7	7	526864	526870	100 %	0 %	0 %	0 %	400405323
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5216	NC_018419	CAT	2	6	526992	526997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405324
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5218	NC_018419	TGA	2	6	527038	527043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405324
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5220	NC_018419	CTCGG	2	10	527136	527145	0 %	20 %	40 %	40 %	400405324
5221	NC_018419	TAA	2	6	527198	527203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405324
5222	NC_018419	ATC	2	6	527232	527237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405324
5223	NC_018419	TAA	2	6	527240	527245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405324
5224	NC_018419	AC	4	8	527324	527331	50 %	0 %	0 %	50 %	400405324
5225	NC_018419	GAC	2	6	527420	527425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405324
5226	NC_018419	AAT	2	6	527454	527459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405324
5227	NC_018419	A	8	8	527600	527607	100 %	0 %	0 %	0 %	400405324
5228	NC_018419	C	6	6	527618	527623	0 %	0 %	0 %	100 %	400405324
5229	NC_018419	GC	3	6	527647	527652	0 %	0 %	50 %	50 %	400405324
5230	NC_018419	CGA	2	6	527731	527736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405324
5231	NC_018419	GAT	2	6	527765	527770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405324
5232	NC_018419	CGG	2	6	527870	527875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405324
5233	NC_018419	TGC	2	6	527899	527904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405324
5234	NC_018419	GTA	2	6	527998	528003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405324
5235	NC_018419	GGAT	2	8	528013	528020	25 %	25 %	50 %	0 %	400405324
5236	NC_018419	TAA	2	6	528072	528077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400405324
5237	NC_018419	GTA	3	9	528103	528111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400405324
5238	NC_018419	GCT	2	6	528161	528166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405324
5239	NC_018419	AGAT	2	8	528214	528221	50 %	25 %	25 %	0 %	400405324
5240	NC_018419	CTT	2	6	528254	528259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400405324
5241	NC_018419	TA	3	6	528318	528323	50 %	50 %	0 %	0 %	400405324
5242	NC_018419	GCC	2	6	528326	528331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400405324
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5244	NC_018419	GATCA	2	10	528444	528453	40 %	20 %	20 %	20 %	400405324
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5489	NC_018419	GAC	2	6	551359	551364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405342
5490	NC_018419	AGC	2	6	551377	551382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405342
5491	NC_018419	TGT	2	6	551487	551492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400405342
5492	NC_018419	TCA	2	6	551502	551507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405342
5493	NC_018419	TTA	2	6	551558	551563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400405342
5494	NC_018419	TCA	2	6	551571	551576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405342
5495	NC_018419	TCG	2	6	551633	551638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405342
5496	NC_018419	CAT	2	6	551670	551675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405342
5497	NC_018419	TCA	2	6	551706	551711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405342
5498	NC_018419	CGT	2	6	551777	551782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400405342
5499	NC_018419	GGC	2	6	551824	551829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400405342
5500	NC_018419	ATC	2	6	551888	551893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405342

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