MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018294	GCG	2	6	212068	212073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995238
3502	NC_018294	GAC	2	6	212097	212102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995238
3503	NC_018294	CAC	2	6	212108	212113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995238
3504	NC_018294	GC	3	6	212116	212121	0 %	0 %	50 %	50 %	399995238
3505	NC_018294	AAG	2	6	212122	212127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995238
3506	NC_018294	CGGC	2	8	212157	212164	0 %	0 %	50 %	50 %	399995238
3507	NC_018294	GAT	2	6	212231	212236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995238
3508	NC_018294	GCG	2	6	212248	212253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995239
3509	NC_018294	CTGG	2	8	212261	212268	0 %	25 %	50 %	25 %	399995239
3510	NC_018294	GGC	2	6	212382	212387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995239
3511	NC_018294	ACG	2	6	212407	212412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995239
3512	NC_018294	TGCC	2	8	212420	212427	0 %	25 %	25 %	50 %	399995239
3513	NC_018294	GAA	2	6	212435	212440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995239
3514	NC_018294	GGT	2	6	212486	212491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995239
3515	NC_018294	A	6	6	212548	212553	100 %	0 %	0 %	0 %	399995239
3516	NC_018294	CTG	2	6	212569	212574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995239
3517	NC_018294	CGA	2	6	212651	212656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3518	NC_018294	GC	3	6	212665	212670	0 %	0 %	50 %	50 %	399995240
3519	NC_018294	GAT	2	6	212675	212680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995240
3520	NC_018294	GC	3	6	212690	212695	0 %	0 %	50 %	50 %	399995240
3521	NC_018294	TGC	2	6	212720	212725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3522	NC_018294	CTT	2	6	212838	212843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995240
3523	NC_018294	GCCA	2	8	212883	212890	25 %	0 %	25 %	50 %	399995240
3524	NC_018294	GGC	2	6	212912	212917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995240
3525	NC_018294	CG	3	6	212986	212991	0 %	0 %	50 %	50 %	399995240
3526	NC_018294	CGT	2	6	212996	213001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3527	NC_018294	CAA	2	6	213013	213018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995240
3528	NC_018294	TGC	2	6	213027	213032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3529	NC_018294	CGC	2	6	213184	213189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3530	NC_018294	CTG	2	6	213210	213215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3531	NC_018294	GAT	2	6	213218	213223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995240
3532	NC_018294	CCG	2	6	213385	213390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3533	NC_018294	CGC	2	6	213499	213504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3534	NC_018294	GCC	2	6	213507	213512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3535	NC_018294	CTA	2	6	213515	213520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995240
3536	NC_018294	CGG	2	6	213534	213539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995240
3537	NC_018294	GGC	2	6	213600	213605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995240
3538	NC_018294	TTC	2	6	213684	213689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995240
3539	NC_018294	CCA	2	6	213706	213711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995240
3540	NC_018294	ACGCC	2	10	213730	213739	20 %	0 %	20 %	60 %	399995240
3541	NC_018294	CGT	2	6	213855	213860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3542	NC_018294	GCCGA	2	10	213927	213936	20 %	0 %	40 %	40 %	399995240
3543	NC_018294	TCCT	2	8	213972	213979	0 %	50 %	0 %	50 %	399995240
3544	NC_018294	CAA	2	6	214004	214009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995240
3545	NC_018294	GCC	2	6	214011	214016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3546	NC_018294	GTG	2	6	214078	214083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995240
3547	NC_018294	CGC	2	6	214091	214096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3548	NC_018294	CGA	2	6	214105	214110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3549	NC_018294	ACG	2	6	214132	214137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3550	NC_018294	GGCTT	2	10	214148	214157	0 %	40 %	40 %	20 %	399995240
3551	NC_018294	CG	3	6	214169	214174	0 %	0 %	50 %	50 %	399995240
3552	NC_018294	ACA	2	6	214191	214196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995240
3553	NC_018294	GCT	2	6	214208	214213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3554	NC_018294	ATG	2	6	214242	214247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995240
3555	NC_018294	CAT	2	6	214255	214260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995240
3556	NC_018294	ATCGC	2	10	214269	214278	20 %	20 %	20 %	40 %	399995241
3557	NC_018294	CGA	2	6	214297	214302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3558	NC_018294	ATC	2	6	214401	214406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995241
3559	NC_018294	GTTCGA	2	12	214408	214419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	399995241
3560	NC_018294	TGG	2	6	214423	214428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995241
3561	NC_018294	AGA	2	6	214453	214458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995241
3562	NC_018294	TGC	2	6	214480	214485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3563	NC_018294	GGC	2	6	214563	214568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995241
3564	NC_018294	GGA	2	6	214591	214596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995241
3565	NC_018294	GCC	2	6	214648	214653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995241
3566	NC_018294	GCA	2	6	214665	214670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3567	NC_018294	GCA	2	6	214720	214725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3568	NC_018294	TGG	2	6	214747	214752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995241
3569	NC_018294	AGA	2	6	214765	214770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995241
3570	NC_018294	CCG	2	6	214813	214818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995241
3571	NC_018294	CAG	2	6	214859	214864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3572	NC_018294	CAT	2	6	214896	214901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995242
3573	NC_018294	CGC	2	6	214941	214946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995242
3574	NC_018294	TGA	2	6	214953	214958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995242
3575	NC_018294	CTT	2	6	214968	214973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995242
3576	NC_018294	GCT	2	6	215009	215014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995242
3577	NC_018294	ATG	2	6	215024	215029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995242
3578	NC_018294	CAT	2	6	215058	215063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995242
3579	NC_018294	AGAA	2	8	215151	215158	75 %	0 %	25 %	0 %	399995242
3580	NC_018294	GAT	2	6	215237	215242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995243
3581	NC_018294	AAG	2	6	215277	215282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995243
3582	NC_018294	CG	3	6	215296	215301	0 %	0 %	50 %	50 %	399995243
3583	NC_018294	TGC	2	6	215371	215376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995243
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3585	NC_018294	AT	3	6	216303	216308	50 %	50 %	0 %	0 %	399995244
3586	NC_018294	GAC	2	6	216315	216320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995244
3587	NC_018294	CGA	2	6	216330	216335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995244
3588	NC_018294	CAA	2	6	216389	216394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995244
3589	NC_018294	GTC	2	6	216418	216423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995244
3590	NC_018294	GAA	2	6	216432	216437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995244
3591	NC_018294	GAG	2	6	216492	216497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995244
3592	NC_018294	CTA	2	6	216513	216518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995244
3593	NC_018294	TGG	2	6	216627	216632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995244
3594	NC_018294	CATA	2	8	216651	216658	50 %	25 %	0 %	25 %	399995244
3595	NC_018294	GGT	2	6	216663	216668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995244
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3597	NC_018294	ATC	2	6	216706	216711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995244
3598	NC_018294	GCGA	2	8	216722	216729	25 %	0 %	50 %	25 %	399995244
3599	NC_018294	GAA	2	6	216738	216743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995244
3600	NC_018294	A	6	6	216772	216777	100 %	0 %	0 %	0 %	399995244
3601	NC_018294	GAC	2	6	216820	216825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995244
3602	NC_018294	AAACA	2	10	216863	216872	80 %	0 %	0 %	20 %	399995244
3603	NC_018294	GCG	2	6	216920	216925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995245
3604	NC_018294	TCG	2	6	216934	216939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995245
3605	NC_018294	GGC	2	6	217000	217005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995245
3606	NC_018294	TGG	2	6	217067	217072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995245
3607	NC_018294	GCG	2	6	217169	217174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995246
3608	NC_018294	GGCGC	2	10	217175	217184	0 %	0 %	60 %	40 %	399995246
3609	NC_018294	GAA	2	6	217196	217201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995246
3610	NC_018294	GCCG	2	8	217224	217231	0 %	0 %	50 %	50 %	399995246
3611	NC_018294	CGA	2	6	217265	217270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995246
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3614	NC_018294	CGG	2	6	217726	217731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995247
3615	NC_018294	CGA	3	9	217738	217746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995247
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3619	NC_018294	GGC	2	6	217841	217846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995247
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3621	NC_018294	GGC	2	6	217889	217894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995247
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3982	NC_018294	GTC	2	6	241258	241263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3983	NC_018294	ACC	2	6	241265	241270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995274
3984	NC_018294	CAGCG	2	10	241318	241327	20 %	0 %	40 %	40 %	399995274
3985	NC_018294	TCC	2	6	241337	241342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995274
3986	NC_018294	GC	3	6	241356	241361	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
3987	NC_018294	GC	3	6	241376	241381	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
3988	NC_018294	CGG	2	6	241485	241490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995274
3989	NC_018294	CCGC	2	8	241494	241501	0 %	0 %	25 %	75 %	399995274
3990	NC_018294	CGT	3	9	241653	241661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3991	NC_018294	GTC	2	6	241675	241680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3992	NC_018294	CAT	2	6	241702	241707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995274
3993	NC_018294	CGT	2	6	241725	241730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3994	NC_018294	CAGA	2	8	241771	241778	50 %	0 %	25 %	25 %	399995274
3995	NC_018294	CGC	2	6	241825	241830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
3996	NC_018294	CGT	2	6	241848	241853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3997	NC_018294	AGA	2	6	241865	241870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995274
3998	NC_018294	GCA	2	6	241923	241928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3999	NC_018294	GCC	3	9	241942	241950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
4000	NC_018294	GTC	2	6	241972	241977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274

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