MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018188	GTT	2	6	37	42	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356081
2	NC_018188	GGC	2	6	57	62	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356081
3	NC_018188	ACG	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356081
4	NC_018188	GA	3	6	115	120	50 %	0 %	50 %	0 %	398356081
5	NC_018188	GCG	2	6	182	187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356081
6	NC_018188	GC	3	6	232	237	0 %	0 %	50 %	50 %	398356081
7	NC_018188	CT	3	6	289	294	0 %	50 %	0 %	50 %	398356081
8	NC_018188	TGAGC	2	10	502	511	20 %	20 %	40 %	20 %	398356082
9	NC_018188	CAG	2	6	536	541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356082
10	NC_018188	TCG	2	6	564	569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356082
11	NC_018188	GAA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356082
12	NC_018188	GAC	2	6	603	608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356082
13	NC_018188	GC	4	8	666	673	0 %	0 %	50 %	50 %	398356082
14	NC_018188	CTT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356082
15	NC_018188	TCG	3	9	1025	1033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356082
16	NC_018188	AGA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356083
17	NC_018188	AG	3	6	1534	1539	50 %	0 %	50 %	0 %	398356083
18	NC_018188	GCG	2	6	1570	1575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356083
19	NC_018188	CGG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356083
20	NC_018188	GCAC	2	8	1643	1650	25 %	0 %	25 %	50 %	398356083
21	NC_018188	GCC	2	6	1787	1792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356084
22	NC_018188	TTGC	2	8	1866	1873	0 %	50 %	25 %	25 %	398356084
23	NC_018188	GC	3	6	1917	1922	0 %	0 %	50 %	50 %	398356084
24	NC_018188	AGA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356085
25	NC_018188	GAT	2	6	2528	2533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356085
26	NC_018188	CTTC	2	8	2669	2676	0 %	50 %	0 %	50 %	398356086
27	NC_018188	AAGG	2	8	2677	2684	50 %	0 %	50 %	0 %	398356086
28	NC_018188	GAG	2	6	2688	2693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356086
29	NC_018188	CAG	2	6	2724	2729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356086
30	NC_018188	CA	3	6	2730	2735	50 %	0 %	0 %	50 %	398356086

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.