MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 35518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_018073	GTA	2	6	1632660	1632665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429320
30003	NC_018073	AGC	2	6	1632670	1632675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392429320
30004	NC_018073	CTT	2	6	1632681	1632686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429320
30005	NC_018073	ACG	2	6	1632707	1632712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392429320
30006	NC_018073	CTCTG	2	10	1632794	1632803	0 %	40 %	20 %	40 %	392429320
30007	NC_018073	AG	3	6	1632897	1632902	50 %	0 %	50 %	0 %	392429320
30008	NC_018073	TAA	2	6	1632933	1632938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429320
30009	NC_018073	CTC	2	6	1633012	1633017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392429320
30010	NC_018073	CTG	2	6	1633033	1633038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429320
30011	NC_018073	AGCC	2	8	1633057	1633064	25 %	0 %	25 %	50 %	392429320
30012	NC_018073	CAT	2	6	1633074	1633079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429320
30013	NC_018073	CAAC	2	8	1633158	1633165	50 %	0 %	0 %	50 %	392429320
30014	NC_018073	CTG	2	6	1633195	1633200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429320
30015	NC_018073	ACC	2	6	1633207	1633212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392429321
30016	NC_018073	CATTC	2	10	1633254	1633263	20 %	40 %	0 %	40 %	392429321
30017	NC_018073	CTG	2	6	1633296	1633301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429321
30018	NC_018073	CTG	2	6	1633305	1633310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429321
30019	NC_018073	AAT	2	6	1633339	1633344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429321
30020	NC_018073	GATG	2	8	1633401	1633408	25 %	25 %	50 %	0 %	392429321
30021	NC_018073	CAA	2	6	1633431	1633436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392429321
30022	NC_018073	GAA	2	6	1633464	1633469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429321
30023	NC_018073	AG	4	8	1633584	1633591	50 %	0 %	50 %	0 %	392429321
30024	NC_018073	GTC	2	6	1633685	1633690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429321
30025	NC_018073	TCT	2	6	1633737	1633742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429321
30026	NC_018073	CAG	2	6	1633746	1633751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392429321
30027	NC_018073	AGTCA	2	10	1633783	1633792	40 %	20 %	20 %	20 %	392429321
30028	NC_018073	TTC	2	6	1633820	1633825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429321
30029	NC_018073	GTA	2	6	1633963	1633968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429321
30030	NC_018073	CGCT	2	8	1633985	1633992	0 %	25 %	25 %	50 %	392429321
30031	NC_018073	CTT	2	6	1634106	1634111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429321
30032	NC_018073	CTTCA	2	10	1634122	1634131	20 %	40 %	0 %	40 %	392429321
30033	NC_018073	CAT	2	6	1634155	1634160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429321
30034	NC_018073	TGA	2	6	1634365	1634370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429322
30035	NC_018073	CCA	2	6	1634393	1634398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392429322
30036	NC_018073	TGG	2	6	1634441	1634446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392429322
30037	NC_018073	CTG	2	6	1634534	1634539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429322
30038	NC_018073	TCT	2	6	1634579	1634584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429322
30039	NC_018073	CGT	2	6	1634585	1634590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429322
30040	NC_018073	ATA	2	6	1634601	1634606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429322
30041	NC_018073	CTC	2	6	1634652	1634657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392429322
30042	NC_018073	CTCG	2	8	1634707	1634714	0 %	25 %	25 %	50 %	392429322
30043	NC_018073	AAT	2	6	1634724	1634729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429322
30044	NC_018073	CCCG	2	8	1634749	1634756	0 %	0 %	25 %	75 %	392429322
30045	NC_018073	TC	3	6	1634790	1634795	0 %	50 %	0 %	50 %	392429323
30046	NC_018073	CATC	2	8	1634848	1634855	25 %	25 %	0 %	50 %	392429323
30047	NC_018073	CCA	2	6	1634920	1634925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392429323
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30049	NC_018073	CCTCGC	2	12	1635052	1635063	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	392429323
30050	NC_018073	ATC	2	6	1635113	1635118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429323
30051	NC_018073	CAG	2	6	1635131	1635136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392429323
30052	NC_018073	ATC	2	6	1635140	1635145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429323
30053	NC_018073	CCA	2	6	1635214	1635219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392429323
30054	NC_018073	CCT	2	6	1635226	1635231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392429324
30055	NC_018073	GGATAA	2	12	1635240	1635251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	392429324
30056	NC_018073	CTG	2	6	1635319	1635324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429324
30057	NC_018073	AAG	2	6	1635339	1635344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429324
30058	NC_018073	CTT	2	6	1635425	1635430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429324
30059	NC_018073	AGGGC	2	10	1635439	1635448	20 %	0 %	60 %	20 %	392429324
30060	NC_018073	TCA	3	9	1635543	1635551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429324
30061	NC_018073	TTC	2	6	1635612	1635617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429324
30062	NC_018073	A	6	6	1635681	1635686	100 %	0 %	0 %	0 %	392429324
30063	NC_018073	CAG	2	6	1635845	1635850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392429325
30064	NC_018073	ATC	2	6	1635872	1635877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429325
30065	NC_018073	GAT	2	6	1635910	1635915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429325
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30067	NC_018073	GAA	2	6	1636040	1636045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429325
30068	NC_018073	CGG	2	6	1636057	1636062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392429325
30069	NC_018073	CAAG	2	8	1636105	1636112	50 %	0 %	25 %	25 %	392429325
30070	NC_018073	CTG	2	6	1636118	1636123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429325
30071	NC_018073	TCA	2	6	1636146	1636151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429325
30072	NC_018073	CGA	2	6	1636161	1636166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392429325
30073	NC_018073	ACG	2	6	1636242	1636247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392429325
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30075	NC_018073	CT	3	6	1636397	1636402	0 %	50 %	0 %	50 %	392429325
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30080	NC_018073	GCTCG	2	10	1636574	1636583	0 %	20 %	40 %	40 %	392429325
30081	NC_018073	GCCTA	2	10	1636600	1636609	20 %	20 %	20 %	40 %	392429325
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30085	NC_018073	CAAG	2	8	1636936	1636943	50 %	0 %	25 %	25 %	392429325
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30087	NC_018073	CCAAA	2	10	1636985	1636994	60 %	0 %	0 %	40 %	392429325
30088	NC_018073	CGAG	2	8	1637005	1637012	25 %	0 %	50 %	25 %	392429325
30089	NC_018073	AAGAT	2	10	1637028	1637037	60 %	20 %	20 %	0 %	392429325
30090	NC_018073	A	6	6	1637048	1637053	100 %	0 %	0 %	0 %	392429325
30091	NC_018073	A	6	6	1637058	1637063	100 %	0 %	0 %	0 %	392429325
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30101	NC_018073	TAA	2	6	1638281	1638286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429326
30102	NC_018073	CTA	2	6	1638723	1638728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429327
30103	NC_018073	TCA	2	6	1638768	1638773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429327
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30105	NC_018073	AGA	2	6	1638882	1638887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429327
30106	NC_018073	TA	3	6	1638902	1638907	50 %	50 %	0 %	0 %	392429327
30107	NC_018073	ACA	2	6	1638984	1638989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392429328
30108	NC_018073	A	7	7	1638989	1638995	100 %	0 %	0 %	0 %	392429328
30109	NC_018073	AGA	2	6	1639004	1639009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429328
30110	NC_018073	TAC	2	6	1639029	1639034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429328
30111	NC_018073	ACAA	2	8	1639094	1639101	75 %	0 %	0 %	25 %	392429328
30112	NC_018073	TC	3	6	1639151	1639156	0 %	50 %	0 %	50 %	392429328
30113	NC_018073	GTG	2	6	1639157	1639162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392429328
30114	NC_018073	GAT	2	6	1639170	1639175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429328
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30116	NC_018073	GCT	2	6	1639381	1639386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429328
30117	NC_018073	CAT	2	6	1639407	1639412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429328
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30231	NC_018073	ATTT	2	8	1646371	1646378	25 %	75 %	0 %	0 %	392429333
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30472	NC_018073	GTT	2	6	1657117	1657122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392429339
30473	NC_018073	ATT	2	6	1657134	1657139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429339
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30479	NC_018073	ATTG	2	8	1658569	1658576	25 %	50 %	25 %	0 %	392429340
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30500	NC_018073	TTCTGT	2	12	1659916	1659927	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	392429341

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