MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Solibacillus silvestris StLB046 plasmid pSSIL1

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018069	CTT	2	6	40	45	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	393202539
2	NC_018069	GGT	2	6	47	52	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	393202539
3	NC_018069	ATTA	2	8	56	63	50 %	50 %	0 %	0 %	393202539
4	NC_018069	CTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	393202539
5	NC_018069	AT	3	6	111	116	50 %	50 %	0 %	0 %	393202539
6	NC_018069	TTC	2	6	134	139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	393202539
7	NC_018069	TAAT	2	8	223	230	50 %	50 %	0 %	0 %	393202539
8	NC_018069	TTG	2	6	257	262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	393202539
9	NC_018069	TTTC	2	8	282	289	0 %	75 %	0 %	25 %	393202539
10	NC_018069	TCCA	2	8	325	332	25 %	25 %	0 %	50 %	393202539
11	NC_018069	ATT	2	6	365	370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202539
12	NC_018069	AAAAG	2	10	385	394	80 %	0 %	20 %	0 %	393202539
13	NC_018069	TTTAT	2	10	405	414	20 %	80 %	0 %	0 %	393202539
14	NC_018069	CTT	2	6	457	462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	393202539
15	NC_018069	T	6	6	548	553	0 %	100 %	0 %	0 %	393202539
16	NC_018069	TCA	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	393202540
17	NC_018069	AGG	2	6	889	894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	393202540
18	NC_018069	TC	3	6	990	995	0 %	50 %	0 %	50 %	393202540
19	NC_018069	AAT	2	6	1003	1008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202540
20	NC_018069	A	6	6	1036	1041	100 %	0 %	0 %	0 %	393202540
21	NC_018069	TAA	2	6	1069	1074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202540
22	NC_018069	A	7	7	1073	1079	100 %	0 %	0 %	0 %	393202540
23	NC_018069	ACTT	2	8	1763	1770	25 %	50 %	0 %	25 %	393202541
24	NC_018069	ATCA	2	8	1784	1791	50 %	25 %	0 %	25 %	393202541
25	NC_018069	ATA	2	6	1829	1834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202541
26	NC_018069	TTCT	2	8	1859	1866	0 %	75 %	0 %	25 %	393202541
27	NC_018069	CAA	2	6	1898	1903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	393202541
28	NC_018069	CA	3	6	1917	1922	50 %	0 %	0 %	50 %	393202541
29	NC_018069	TTAAA	2	10	1961	1970	60 %	40 %	0 %	0 %	393202541
30	NC_018069	TTC	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	393202541
31	NC_018069	ACA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	393202541
32	NC_018069	ATT	2	6	2082	2087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202541
33	NC_018069	TTA	2	6	2102	2107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202541
34	NC_018069	A	6	6	2116	2121	100 %	0 %	0 %	0 %	393202541
35	NC_018069	TAA	2	6	2195	2200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202541
36	NC_018069	A	6	6	2248	2253	100 %	0 %	0 %	0 %	393202541
37	NC_018069	TAA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202541
38	NC_018069	AT	3	6	2292	2297	50 %	50 %	0 %	0 %	393202541
39	NC_018069	TTA	2	6	2337	2342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202541
40	NC_018069	CAA	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	393202541
41	NC_018069	TTA	2	6	2377	2382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202541
42	NC_018069	ACTG	2	8	2394	2401	25 %	25 %	25 %	25 %	393202541
43	NC_018069	CAA	2	6	2458	2463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	393202541
44	NC_018069	AAG	2	6	2474	2479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202541
45	NC_018069	A	6	6	2503	2508	100 %	0 %	0 %	0 %	393202541
46	NC_018069	AAC	2	6	2600	2605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	393202541
47	NC_018069	ACCTT	2	10	2712	2721	20 %	40 %	0 %	40 %	393202541
48	NC_018069	TCA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	393202542
49	NC_018069	ATGG	2	8	2941	2948	25 %	25 %	50 %	0 %	393202542
50	NC_018069	ATG	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	393202542
51	NC_018069	TCC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	393202542
52	NC_018069	T	7	7	3224	3230	0 %	100 %	0 %	0 %	393202542
53	NC_018069	TAA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202542
54	NC_018069	CCTTT	2	10	3251	3260	0 %	60 %	0 %	40 %	393202542
55	NC_018069	TCAC	2	8	3289	3296	25 %	25 %	0 %	50 %	393202542
56	NC_018069	TTCTT	2	10	3412	3421	0 %	80 %	0 %	20 %	393202542
57	NC_018069	A	6	6	3843	3848	100 %	0 %	0 %	0 %	393202543
58	NC_018069	AGA	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202543
59	NC_018069	GAT	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	393202543
60	NC_018069	ATT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202543
61	NC_018069	TTC	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	393202543
62	NC_018069	TCA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	393202543
63	NC_018069	AAG	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202543
64	NC_018069	GAT	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	393202543
65	NC_018069	AAG	2	6	4179	4184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202543
66	NC_018069	CAA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	393202544
67	NC_018069	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202544
68	NC_018069	CAA	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	393202544
69	NC_018069	GAA	2	6	4539	4544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202544
70	NC_018069	CAA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	393202544
71	NC_018069	GCA	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	393202544
72	NC_018069	TGG	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	393202544
73	NC_018069	GCT	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	393202544
74	NC_018069	AAG	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202544
75	NC_018069	GAA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202544
76	NC_018069	GATG	2	8	4907	4914	25 %	25 %	50 %	0 %	393202544
77	NC_018069	TTA	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202544
78	NC_018069	ATG	2	6	4993	4998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	393202544
79	NC_018069	GAA	2	6	5022	5027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202544
80	NC_018069	GCTT	2	8	5029	5036	0 %	50 %	25 %	25 %	393202544
81	NC_018069	AAGTAA	2	12	5038	5049	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	393202544
82	NC_018069	ACG	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	393202544
83	NC_018069	ATT	2	6	5082	5087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202544
84	NC_018069	AGA	2	6	5096	5101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202544
85	NC_018069	AGCG	2	8	5113	5120	25 %	0 %	50 %	25 %	393202544
86	NC_018069	TTC	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	393202544
87	NC_018069	CAC	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	393202544
88	NC_018069	TGG	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	393202544
89	NC_018069	TGGT	2	8	5260	5267	0 %	50 %	50 %	0 %	393202544
90	NC_018069	GTT	2	6	5283	5288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	393202544
91	NC_018069	TGT	2	6	5303	5308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	393202544
92	NC_018069	GCA	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	393202544
93	NC_018069	A	6	6	5330	5335	100 %	0 %	0 %	0 %	393202544
94	NC_018069	TTAA	2	8	5343	5350	50 %	50 %	0 %	0 %	393202544
95	NC_018069	CATC	2	8	5357	5364	25 %	25 %	0 %	50 %	393202544
96	NC_018069	AGA	2	6	5366	5371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202544
97	NC_018069	CTG	2	6	5431	5436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	393202544
98	NC_018069	ATT	2	6	5474	5479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202544
99	NC_018069	CAG	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	393202544
100	NC_018069	GAA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202544
101	NC_018069	AAT	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202544
102	NC_018069	TTTG	2	8	5660	5667	0 %	75 %	25 %	0 %	393202544
103	NC_018069	GA	3	6	5801	5806	50 %	0 %	50 %	0 %	393202544
104	NC_018069	TCA	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	393202544
105	NC_018069	CAG	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	393202544
106	NC_018069	A	6	6	5964	5969	100 %	0 %	0 %	0 %	393202544
107	NC_018069	GCA	2	6	6033	6038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	393202544
108	NC_018069	GTG	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	393202544
109	NC_018069	CTG	2	6	6091	6096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	393202544
110	NC_018069	TGA	2	6	6113	6118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	393202544
111	NC_018069	ATTAA	2	10	6141	6150	60 %	40 %	0 %	0 %	393202544
112	NC_018069	AATTA	2	10	6200	6209	60 %	40 %	0 %	0 %	393202544
113	NC_018069	GTTA	2	8	6221	6228	25 %	50 %	25 %	0 %	393202544
114	NC_018069	TGGT	2	8	6233	6240	0 %	50 %	50 %	0 %	393202544
115	NC_018069	TTA	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202545
116	NC_018069	TAT	3	9	6635	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202545
117	NC_018069	CTT	2	6	6678	6683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	393202545
118	NC_018069	TTTC	2	8	6792	6799	0 %	75 %	0 %	25 %	393202545
119	NC_018069	AGA	2	6	6823	6828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	393202545
120	NC_018069	ATA	2	6	6888	6893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202545
121	NC_018069	T	6	6	7022	7027	0 %	100 %	0 %	0 %	393202545
122	NC_018069	A	7	7	7035	7041	100 %	0 %	0 %	0 %	393202545
123	NC_018069	TAA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202545
124	NC_018069	TAA	2	6	7127	7132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202545
125	NC_018069	T	7	7	7499	7505	0 %	100 %	0 %	0 %	393202546
126	NC_018069	GA	3	6	7506	7511	50 %	0 %	50 %	0 %	393202546
127	NC_018069	TTA	2	6	7533	7538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202546
128	NC_018069	GTT	2	6	7544	7549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	393202546
129	NC_018069	TGT	2	6	7563	7568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	393202546
130	NC_018069	ATT	2	6	7575	7580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202546
131	NC_018069	TAT	2	6	7591	7596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202546
132	NC_018069	TAA	2	6	7687	7692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202546
133	NC_018069	ATT	3	9	7701	7709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202546
134	NC_018069	TTA	2	6	7717	7722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	393202546
135	NC_018069	TCTTTT	2	12	7730	7741	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	393202546
136	NC_018069	A	7	7	7745	7751	100 %	0 %	0 %	0 %	393202546
137	NC_018069	AAT	2	6	8550	8555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	393202547
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.