MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
127001	NC_018000	GCC	2	6	6307919	6307924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355842
127002	NC_018000	GCCC	2	8	6307945	6307952	0 %	0 %	25 %	75 %	398355842
127003	NC_018000	CAC	2	6	6308008	6308013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398355842
127004	NC_018000	CTC	2	6	6308092	6308097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398355842
127005	NC_018000	GCG	3	9	6308175	6308183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355842
127006	NC_018000	CGAAGA	2	12	6308202	6308213	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	398355842
127007	NC_018000	GCTT	2	8	6308293	6308300	0 %	50 %	25 %	25 %	398355842
127008	NC_018000	GCC	2	6	6308332	6308337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355842
127009	NC_018000	TCGCC	2	10	6308343	6308352	0 %	20 %	20 %	60 %	398355842
127010	NC_018000	GCC	2	6	6308356	6308361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355842
127011	NC_018000	GCC	2	6	6308366	6308371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355842
127012	NC_018000	AG	3	6	6308394	6308399	50 %	0 %	50 %	0 %	398355842
127013	NC_018000	GC	3	6	6308409	6308414	0 %	0 %	50 %	50 %	398355842
127014	NC_018000	GGCGA	2	10	6308438	6308447	20 %	0 %	60 %	20 %	398355842
127015	NC_018000	GAC	2	6	6308468	6308473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355842
127016	NC_018000	GCC	2	6	6308540	6308545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355842
127017	NC_018000	TCCG	2	8	6308561	6308568	0 %	25 %	25 %	50 %	398355842
127018	NC_018000	GC	4	8	6308576	6308583	0 %	0 %	50 %	50 %	398355842
127019	NC_018000	CGA	2	6	6308589	6308594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355842
127020	NC_018000	TTC	2	6	6308599	6308604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355842
127021	NC_018000	GC	3	6	6308650	6308655	0 %	0 %	50 %	50 %	398355842
127022	NC_018000	CCG	2	6	6308684	6308689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355842
127023	NC_018000	GCA	2	6	6308739	6308744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355842
127024	NC_018000	TCG	2	6	6308826	6308831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355842
127025	NC_018000	GCA	2	6	6308871	6308876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355842
127026	NC_018000	CCG	2	6	6308939	6308944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355842
127027	NC_018000	GCC	2	6	6309213	6309218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355843
127028	NC_018000	ACC	2	6	6309221	6309226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398355843
127029	NC_018000	TGC	2	6	6309248	6309253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355843
127030	NC_018000	CCG	2	6	6309274	6309279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355843
127031	NC_018000	CTT	2	6	6309347	6309352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355843
127032	NC_018000	CTT	2	6	6309389	6309394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355843
127033	NC_018000	GGT	2	6	6309418	6309423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398355843
127034	NC_018000	GCC	2	6	6309443	6309448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355843
127035	NC_018000	CGG	2	6	6309469	6309474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355843
127036	NC_018000	TGA	2	6	6309511	6309516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355843
127037	NC_018000	GCA	3	9	6309603	6309611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355843
127038	NC_018000	AGC	2	6	6309624	6309629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355843
127039	NC_018000	GGCTT	2	10	6309645	6309654	0 %	40 %	40 %	20 %	398355843
127040	NC_018000	CGC	2	6	6309658	6309663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355843
127041	NC_018000	CGA	2	6	6309697	6309702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355843
127042	NC_018000	CCTT	2	8	6309711	6309718	0 %	50 %	0 %	50 %	398355843
127043	NC_018000	TCA	2	6	6309766	6309771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355843
127044	NC_018000	CAA	2	6	6309788	6309793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398355843
127045	NC_018000	CACCCA	2	12	6309796	6309807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398355843
127046	NC_018000	GAT	2	6	6309979	6309984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355844
127047	NC_018000	GC	3	6	6310025	6310030	0 %	0 %	50 %	50 %	398355844
127048	NC_018000	GAT	2	6	6310084	6310089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355844
127049	NC_018000	CGC	2	6	6310108	6310113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355844
127050	NC_018000	TCG	3	9	6310134	6310142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355844
127051	NC_018000	AG	3	6	6310154	6310159	50 %	0 %	50 %	0 %	398355844
127052	NC_018000	CG	3	6	6310203	6310208	0 %	0 %	50 %	50 %	398355844
127053	NC_018000	TCA	2	6	6310284	6310289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355844
127054	NC_018000	CGA	2	6	6310359	6310364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355844
127055	NC_018000	CGA	2	6	6310396	6310401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355844
127056	NC_018000	CGT	2	6	6310423	6310428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355844
127057	NC_018000	GTC	2	6	6310433	6310438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355844
127058	NC_018000	CGC	2	6	6310443	6310448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355844
127059	NC_018000	GC	3	6	6310465	6310470	0 %	0 %	50 %	50 %	398355844
127060	NC_018000	CG	3	6	6310484	6310489	0 %	0 %	50 %	50 %	398355844
127061	NC_018000	ACC	2	6	6310518	6310523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398355844
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127063	NC_018000	CGC	2	6	6310709	6310714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355844
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127065	NC_018000	GCCG	2	8	6310923	6310930	0 %	0 %	50 %	50 %	398355845
127066	NC_018000	TCA	2	6	6310943	6310948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355845
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127068	NC_018000	TCG	2	6	6310975	6310980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355845
127069	NC_018000	ATG	2	6	6311035	6311040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355845
127070	NC_018000	TCG	2	6	6311119	6311124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355845
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127457	NC_018000	GATG	2	8	6328405	6328412	25 %	25 %	50 %	0 %	398355864
127458	NC_018000	GC	3	6	6328455	6328460	0 %	0 %	50 %	50 %	398355864
127459	NC_018000	CAT	2	6	6328471	6328476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355864
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