MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115001	NC_018000	CTT	2	6	5750147	5750152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355344
115002	NC_018000	GTCG	2	8	5750180	5750187	0 %	25 %	50 %	25 %	398355344
115003	NC_018000	GAT	3	9	5750198	5750206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355344
115004	NC_018000	GCCG	2	8	5750246	5750253	0 %	0 %	50 %	50 %	398355344
115005	NC_018000	TTG	3	9	5750322	5750330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398355344
115006	NC_018000	GC	3	6	5750340	5750345	0 %	0 %	50 %	50 %	398355344
115007	NC_018000	CGA	2	6	5750387	5750392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355344
115008	NC_018000	GCC	2	6	5750399	5750404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355344
115009	NC_018000	ATACTG	2	12	5750420	5750431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	398355344
115010	NC_018000	CGG	2	6	5750436	5750441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355344
115011	NC_018000	CTC	2	6	5750630	5750635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398355344
115012	NC_018000	AGC	2	6	5750659	5750664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355344
115013	NC_018000	CGC	2	6	5750668	5750673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355344
115014	NC_018000	GGT	2	6	5750684	5750689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398355344
115015	NC_018000	GAC	2	6	5750690	5750695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355344
115016	NC_018000	GGA	2	6	5750789	5750794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398355344
115017	NC_018000	CGG	2	6	5750815	5750820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355344
115018	NC_018000	GCAC	2	8	5750886	5750893	25 %	0 %	25 %	50 %	398355344
115019	NC_018000	GGATT	2	10	5750940	5750949	20 %	40 %	40 %	0 %	398355344
115020	NC_018000	TTG	2	6	5750985	5750990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398355344
115021	NC_018000	CAT	2	6	5751013	5751018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355344
115022	NC_018000	GGC	2	6	5751083	5751088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355344
115023	NC_018000	CGC	2	6	5751136	5751141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355344
115024	NC_018000	CTGCGT	2	12	5751161	5751172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355344
115025	NC_018000	CGT	2	6	5751200	5751205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355344
115026	NC_018000	AGG	2	6	5751208	5751213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398355344
115027	NC_018000	GCCC	2	8	5751225	5751232	0 %	0 %	25 %	75 %	398355344
115028	NC_018000	CCA	2	6	5751241	5751246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398355344
115029	NC_018000	CAT	2	6	5751275	5751280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355344
115030	NC_018000	CGC	2	6	5751323	5751328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355344
115031	NC_018000	CCCG	2	8	5751364	5751371	0 %	0 %	25 %	75 %	398355344
115032	NC_018000	GCG	2	6	5751522	5751527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355345
115033	NC_018000	CCG	2	6	5751671	5751676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
115034	NC_018000	CGA	2	6	5751681	5751686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355346
115035	NC_018000	TCC	2	6	5751691	5751696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398355346
115036	NC_018000	TCA	2	6	5751716	5751721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355346
115037	NC_018000	GCC	2	6	5751738	5751743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
115038	NC_018000	GC	3	6	5751746	5751751	0 %	0 %	50 %	50 %	398355346
115039	NC_018000	GCCG	2	8	5751819	5751826	0 %	0 %	50 %	50 %	398355346
115040	NC_018000	CGC	2	6	5751848	5751853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
115041	NC_018000	GTC	2	6	5751948	5751953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355346
115042	NC_018000	GAC	2	6	5751957	5751962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355346
115043	NC_018000	CGC	2	6	5751993	5751998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
115044	NC_018000	C	7	7	5752059	5752065	0 %	0 %	0 %	100 %	398355346
115045	NC_018000	GCC	3	9	5752101	5752109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
115046	NC_018000	TCG	2	6	5752114	5752119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355346
115047	NC_018000	CG	3	6	5752205	5752210	0 %	0 %	50 %	50 %	398355346
115048	NC_018000	GGC	2	6	5752239	5752244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355346
115049	NC_018000	GCGA	2	8	5752273	5752280	25 %	0 %	50 %	25 %	398355346
115050	NC_018000	GTT	2	6	5752287	5752292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398355346
115051	NC_018000	GCG	2	6	5752334	5752339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355346
115052	NC_018000	GC	3	6	5752345	5752350	0 %	0 %	50 %	50 %	398355346
115053	NC_018000	CGC	2	6	5752397	5752402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
115054	NC_018000	GGCGCC	2	12	5752410	5752421	0 %	0 %	50 %	50 %	398355346
115055	NC_018000	CGG	2	6	5752481	5752486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355346
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115057	NC_018000	TCGG	2	8	5752635	5752642	0 %	25 %	50 %	25 %	398355346
115058	NC_018000	TCG	2	6	5752663	5752668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355346
115059	NC_018000	CCG	2	6	5752747	5752752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
115060	NC_018000	GCC	2	6	5752833	5752838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
115061	NC_018000	GTC	2	6	5752851	5752856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355346
115062	NC_018000	CTG	2	6	5752905	5752910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355346
115063	NC_018000	AAGG	2	8	5752914	5752921	50 %	0 %	50 %	0 %	398355346
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115065	NC_018000	CG	3	6	5753000	5753005	0 %	0 %	50 %	50 %	398355346
115066	NC_018000	CGC	2	6	5753034	5753039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355346
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115068	NC_018000	CG	3	6	5753078	5753083	0 %	0 %	50 %	50 %	398355346
115069	NC_018000	ACGA	2	8	5753091	5753098	50 %	0 %	25 %	25 %	398355346
115070	NC_018000	CG	3	6	5753114	5753119	0 %	0 %	50 %	50 %	398355346
115071	NC_018000	TGC	2	6	5753172	5753177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355346
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115082	NC_018000	ATG	2	6	5754044	5754049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355348
115083	NC_018000	ATC	2	6	5754089	5754094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355348
115084	NC_018000	ATTCG	2	10	5754097	5754106	20 %	40 %	20 %	20 %	398355348
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115087	NC_018000	GTTC	2	8	5754312	5754319	0 %	50 %	25 %	25 %	398355348
115088	NC_018000	AGC	2	6	5754359	5754364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355348
115089	NC_018000	GGT	2	6	5754382	5754387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398355348
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115093	NC_018000	CG	3	6	5754511	5754516	0 %	0 %	50 %	50 %	398355348
115094	NC_018000	GC	3	6	5754535	5754540	0 %	0 %	50 %	50 %	398355348
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115099	NC_018000	CGC	2	6	5754684	5754689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355348
115100	NC_018000	TCC	2	6	5754692	5754697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398355348
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115102	NC_018000	TGCC	2	8	5754759	5754766	0 %	25 %	25 %	50 %	398355348
115103	NC_018000	GCGAG	2	10	5754989	5754998	20 %	0 %	60 %	20 %	398355349
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115107	NC_018000	CG	3	6	5755163	5755168	0 %	0 %	50 %	50 %	398355349
115108	NC_018000	CGA	2	6	5755190	5755195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355349
115109	NC_018000	TGG	2	6	5755202	5755207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398355349
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115112	NC_018000	GC	3	6	5755242	5755247	0 %	0 %	50 %	50 %	398355349
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115114	NC_018000	CGA	2	6	5755322	5755327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355349
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115228	NC_018000	CAT	2	6	5759581	5759586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355353
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115340	NC_018000	CGG	2	6	5764055	5764060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355357
115341	NC_018000	TGG	2	6	5764149	5764154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398355357
115342	NC_018000	CTT	2	6	5764171	5764176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355357
115343	NC_018000	TGC	2	6	5764234	5764239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355357
115344	NC_018000	GAG	2	6	5764290	5764295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398355357
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115348	NC_018000	CTT	2	6	5764722	5764727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355358
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115351	NC_018000	TCA	2	6	5764765	5764770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355358
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115449	NC_018000	CGC	3	9	5768807	5768815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355362
115450	NC_018000	ATG	2	6	5768839	5768844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355362
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115453	NC_018000	TCG	2	6	5769026	5769031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355363
115454	NC_018000	CGC	2	6	5769057	5769062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355363
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115457	NC_018000	CGT	2	6	5769135	5769140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355363
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115459	NC_018000	CTG	2	6	5769313	5769318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355363
115460	NC_018000	TCG	2	6	5769410	5769415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355363
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