MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_018000	CCG	2	6	5641476	5641481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355240
113002	NC_018000	TAC	2	6	5641499	5641504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355240
113003	NC_018000	ATG	2	6	5641526	5641531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355240
113004	NC_018000	TTC	2	6	5641544	5641549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355240
113005	NC_018000	CGTC	2	8	5641578	5641585	0 %	25 %	25 %	50 %	398355240
113006	NC_018000	CTG	2	6	5641592	5641597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355240
113007	NC_018000	TCT	2	6	5641599	5641604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355240
113008	NC_018000	GCTGT	2	10	5641610	5641619	0 %	40 %	40 %	20 %	398355240
113009	NC_018000	CGG	2	6	5641629	5641634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355240
113010	NC_018000	CCT	2	6	5641689	5641694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398355240
113011	NC_018000	GC	3	6	5641751	5641756	0 %	0 %	50 %	50 %	398355240
113012	NC_018000	CAG	2	6	5641760	5641765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355240
113013	NC_018000	AAG	2	6	5641767	5641772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398355240
113014	NC_018000	CTG	2	6	5641793	5641798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355240
113015	NC_018000	ACT	2	6	5641866	5641871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355240
113016	NC_018000	AGA	2	6	5641884	5641889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398355240
113017	NC_018000	CGC	2	6	5641903	5641908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355240
113018	NC_018000	TTC	2	6	5641928	5641933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355240
113019	NC_018000	TCGA	2	8	5642009	5642016	25 %	25 %	25 %	25 %	398355240
113020	NC_018000	GGC	2	6	5642045	5642050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355240
113021	NC_018000	GC	3	6	5642069	5642074	0 %	0 %	50 %	50 %	398355240
113022	NC_018000	GGC	2	6	5642092	5642097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355240
113023	NC_018000	GCGAC	2	10	5642155	5642164	20 %	0 %	40 %	40 %	398355240
113024	NC_018000	CAG	2	6	5642203	5642208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355240
113025	NC_018000	CT	3	6	5642259	5642264	0 %	50 %	0 %	50 %	398355240
113026	NC_018000	CA	3	6	5642319	5642324	50 %	0 %	0 %	50 %	398355240
113027	NC_018000	CGC	2	6	5642347	5642352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355240
113028	NC_018000	CTG	2	6	5642354	5642359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355240
113029	NC_018000	TCC	2	6	5642482	5642487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398355240
113030	NC_018000	GAC	2	6	5642579	5642584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355240
113031	NC_018000	CGT	2	6	5642593	5642598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355240
113032	NC_018000	CGC	2	6	5642641	5642646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355240
113033	NC_018000	CGG	2	6	5642683	5642688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355240
113034	NC_018000	TGGAGA	2	12	5642718	5642729	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	398355240
113035	NC_018000	TCCT	2	8	5642867	5642874	0 %	50 %	0 %	50 %	398355240
113036	NC_018000	TGC	2	6	5642907	5642912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355240
113037	NC_018000	GATC	2	8	5643007	5643014	25 %	25 %	25 %	25 %	398355240
113038	NC_018000	GCC	2	6	5643036	5643041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355240
113039	NC_018000	CGGCGC	2	12	5643042	5643053	0 %	0 %	50 %	50 %	398355240
113040	NC_018000	CTT	2	6	5643328	5643333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355241
113041	NC_018000	TCA	2	6	5643347	5643352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355241
113042	NC_018000	TGGCT	2	10	5643389	5643398	0 %	40 %	40 %	20 %	398355241
113043	NC_018000	GCCG	2	8	5643514	5643521	0 %	0 %	50 %	50 %	398355241
113044	NC_018000	CTT	2	6	5643525	5643530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355241
113045	NC_018000	GGC	2	6	5643606	5643611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355241
113046	NC_018000	TTC	2	6	5643985	5643990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355242
113047	NC_018000	CAGGC	2	10	5644017	5644026	20 %	0 %	40 %	40 %	398355242
113048	NC_018000	GAT	2	6	5644110	5644115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355242
113049	NC_018000	AGCCC	2	10	5644146	5644155	20 %	0 %	20 %	60 %	398355242
113050	NC_018000	CGC	2	6	5644235	5644240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355242
113051	NC_018000	AAC	2	6	5644332	5644337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398355242
113052	NC_018000	GCC	2	6	5644497	5644502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355242
113053	NC_018000	CAC	2	6	5644631	5644636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398355243
113054	NC_018000	TTG	2	6	5644677	5644682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398355243
113055	NC_018000	GTC	2	6	5644685	5644690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355243
113056	NC_018000	ATC	2	6	5644710	5644715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355243
113057	NC_018000	GATC	2	8	5644717	5644724	25 %	25 %	25 %	25 %	398355243
113058	NC_018000	CGA	2	6	5644750	5644755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355243
113059	NC_018000	GCC	2	6	5644784	5644789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355243
113060	NC_018000	GCCGGC	2	12	5644853	5644864	0 %	0 %	50 %	50 %	398355243
113061	NC_018000	GAT	2	6	5644871	5644876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355243
113062	NC_018000	GCC	2	6	5644964	5644969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355243
113063	NC_018000	GTC	2	6	5645018	5645023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355243
113064	NC_018000	CCT	2	6	5645029	5645034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398355243
113065	NC_018000	GTT	2	6	5645087	5645092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398355243
113066	NC_018000	GAT	2	6	5645105	5645110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355243
113067	NC_018000	GCC	2	6	5645159	5645164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355243
113068	NC_018000	GGT	2	6	5645231	5645236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398355243
113069	NC_018000	CGC	2	6	5645239	5645244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355243
113070	NC_018000	AGC	2	6	5645335	5645340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355243
113071	NC_018000	GTG	2	6	5645348	5645353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398355243
113072	NC_018000	AGG	2	6	5645458	5645463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398355243
113073	NC_018000	CTT	2	6	5645510	5645515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355243
113074	NC_018000	CGA	3	9	5645542	5645550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355243
113075	NC_018000	GTC	2	6	5645618	5645623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355243
113076	NC_018000	TCA	2	6	5645695	5645700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355243
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113078	NC_018000	AGC	2	6	5645935	5645940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355244
113079	NC_018000	TTG	2	6	5645965	5645970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398355244
113080	NC_018000	TGA	2	6	5645990	5645995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355244
113081	NC_018000	GCGT	2	8	5646005	5646012	0 %	25 %	50 %	25 %	398355244
113082	NC_018000	TAG	2	6	5646127	5646132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355244
113083	NC_018000	CTG	2	6	5646173	5646178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355244
113084	NC_018000	ATC	2	6	5646190	5646195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398355244
113085	NC_018000	ACC	2	6	5646229	5646234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398355244
113086	NC_018000	GCC	3	9	5646268	5646276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355244
113087	NC_018000	CGA	2	6	5646323	5646328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355244
113088	NC_018000	TCCT	2	8	5646370	5646377	0 %	50 %	0 %	50 %	398355244
113089	NC_018000	AGG	2	6	5646392	5646397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398355244
113090	NC_018000	ATA	2	6	5646402	5646407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398355244
113091	NC_018000	ATG	3	9	5646451	5646459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355244
113092	NC_018000	GCT	2	6	5646547	5646552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355244
113093	NC_018000	CGC	2	6	5646584	5646589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355244
113094	NC_018000	GCG	2	6	5646661	5646666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355244
113095	NC_018000	GCGGCC	2	12	5646709	5646720	0 %	0 %	50 %	50 %	398355244
113096	NC_018000	AG	3	6	5646721	5646726	50 %	0 %	50 %	0 %	398355244
113097	NC_018000	C	6	6	5646770	5646775	0 %	0 %	0 %	100 %	398355245
113098	NC_018000	CTT	2	6	5646820	5646825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398355245
113099	NC_018000	GAC	2	6	5646831	5646836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355245
113100	NC_018000	GC	3	6	5646863	5646868	0 %	0 %	50 %	50 %	398355245
113101	NC_018000	GTAGAT	2	12	5646871	5646882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355245
113102	NC_018000	GTC	2	6	5646883	5646888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355245
113103	NC_018000	TTG	2	6	5646908	5646913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398355245
113104	NC_018000	GCC	2	6	5646943	5646948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355245
113105	NC_018000	GAC	2	6	5646949	5646954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355245
113106	NC_018000	CGA	2	6	5646972	5646977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355245
113107	NC_018000	GGGC	2	8	5647023	5647030	0 %	0 %	75 %	25 %	398355245
113108	NC_018000	GCG	2	6	5647087	5647092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355245
113109	NC_018000	CGA	2	6	5647116	5647121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398355245
113110	NC_018000	GCC	2	6	5647193	5647198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355245
113111	NC_018000	ATG	2	6	5647268	5647273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398355245
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113113	NC_018000	CGT	2	6	5647464	5647469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355246
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113445	NC_018000	GCC	2	6	5663547	5663552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355262
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113452	NC_018000	GCG	2	6	5663917	5663922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398355263
113453	NC_018000	CGC	2	6	5663982	5663987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398355263
113454	NC_018000	GC	3	6	5663993	5663998	0 %	0 %	50 %	50 %	398355263
113455	NC_018000	TCG	2	6	5664019	5664024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398355263
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