MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 34189

< Previous12...57585960616263646566676869Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_017950	GTT	2	6	2025513	2025518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857689
34002	NC_017950	ATG	2	6	2025577	2025582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857689
34003	NC_017950	TCGCT	2	10	2025691	2025700	0 %	40 %	20 %	40 %	389857690
34004	NC_017950	ATT	2	6	2025714	2025719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857690
34005	NC_017950	CAG	2	6	2025743	2025748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857690
34006	NC_017950	TAC	2	6	2025872	2025877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857690
34007	NC_017950	GTT	2	6	2025919	2025924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857690
34008	NC_017950	CAT	2	6	2025951	2025956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857690
34009	NC_017950	GAAA	2	8	2025957	2025964	75 %	0 %	25 %	0 %	389857690
34010	NC_017950	GAAG	2	8	2025981	2025988	50 %	0 %	50 %	0 %	389857690
34011	NC_017950	TGA	2	6	2025996	2026001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857690
34012	NC_017950	TGC	2	6	2026014	2026019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857690
34013	NC_017950	TGG	2	6	2026047	2026052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857690
34014	NC_017950	AGA	2	6	2026104	2026109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857690
34015	NC_017950	TTC	2	6	2026196	2026201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857690
34016	NC_017950	CCAA	2	8	2026213	2026220	50 %	0 %	0 %	50 %	389857690
34017	NC_017950	TTGA	2	8	2026261	2026268	25 %	50 %	25 %	0 %	389857690
34018	NC_017950	TCG	2	6	2026286	2026291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857690
34019	NC_017950	CTT	2	6	2026308	2026313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857690
34020	NC_017950	AGC	2	6	2026407	2026412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857690
34021	NC_017950	AGA	2	6	2026443	2026448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857690
34022	NC_017950	A	6	6	2026448	2026453	100 %	0 %	0 %	0 %	389857690
34023	NC_017950	AAGC	2	8	2026507	2026514	50 %	0 %	25 %	25 %	389857690
34024	NC_017950	GGA	2	6	2026551	2026556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857690
34025	NC_017950	ATT	2	6	2026558	2026563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857690
34026	NC_017950	GTT	2	6	2026648	2026653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857690
34027	NC_017950	AAC	2	6	2026740	2026745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857690
34028	NC_017950	ACT	2	6	2026807	2026812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857690
34029	NC_017950	GAA	2	6	2026900	2026905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857690
34030	NC_017950	CTT	2	6	2026917	2026922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857690
34031	NC_017950	TGA	2	6	2026956	2026961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857690
34032	NC_017950	TGT	2	6	2027012	2027017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857690
34033	NC_017950	CTC	2	6	2027029	2027034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857690
34034	NC_017950	GAT	2	6	2027056	2027061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857690
34035	NC_017950	CCAA	2	8	2027062	2027069	50 %	0 %	0 %	50 %	389857690
34036	NC_017950	ACTTGG	2	12	2027072	2027083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389857690
34037	NC_017950	CAT	2	6	2027130	2027135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857690
34038	NC_017950	GCCA	2	8	2027140	2027147	25 %	0 %	25 %	50 %	389857690
34039	NC_017950	ATC	2	6	2027182	2027187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857690
34040	NC_017950	CGA	2	6	2027220	2027225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857690
34041	NC_017950	ATG	2	6	2027231	2027236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857690
34042	NC_017950	ATA	2	6	2027289	2027294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857690
34043	NC_017950	A	7	7	2027332	2027338	100 %	0 %	0 %	0 %	389857691
34044	NC_017950	TAT	2	6	2027359	2027364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857691
34045	NC_017950	TAT	2	6	2027391	2027396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857691
34046	NC_017950	TGG	2	6	2027425	2027430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857691
34047	NC_017950	ACA	2	6	2027440	2027445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857691
34048	NC_017950	TCC	2	6	2027572	2027577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857691
34049	NC_017950	AGA	2	6	2027727	2027732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857691
34050	NC_017950	CTA	2	6	2027750	2027755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857691
34051	NC_017950	TGA	2	6	2027765	2027770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857691
34052	NC_017950	AAC	2	6	2027797	2027802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857691
34053	NC_017950	CTC	2	6	2027821	2027826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857691
34054	NC_017950	TTC	2	6	2027834	2027839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857691
34055	NC_017950	ATT	2	6	2027853	2027858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857691
34056	NC_017950	A	7	7	2027859	2027865	100 %	0 %	0 %	0 %	389857691
34057	NC_017950	CTA	2	6	2027880	2027885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857691
34058	NC_017950	TAACAT	2	12	2027888	2027899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	389857691
34059	NC_017950	TGG	2	6	2027933	2027938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857691
34060	NC_017950	GATA	2	8	2027979	2027986	50 %	25 %	25 %	0 %	389857691
34061	NC_017950	AGC	2	6	2028043	2028048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857691
34062	NC_017950	TGT	2	6	2028056	2028061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857691
34063	NC_017950	ACCT	2	8	2028067	2028074	25 %	25 %	0 %	50 %	389857691
34064	NC_017950	CTT	2	6	2028147	2028152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857691
34065	NC_017950	A	6	6	2028156	2028161	100 %	0 %	0 %	0 %	389857691
34066	NC_017950	ACA	2	6	2028181	2028186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857691
34067	NC_017950	TAT	2	6	2028242	2028247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857691
34068	NC_017950	ATT	2	6	2028310	2028315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857691
34069	NC_017950	CTAC	2	8	2028324	2028331	25 %	25 %	0 %	50 %	389857691
34070	NC_017950	T	6	6	2028344	2028349	0 %	100 %	0 %	0 %	389857691
34071	NC_017950	ATGC	2	8	2028358	2028365	25 %	25 %	25 %	25 %	389857691
34072	NC_017950	AGC	2	6	2028423	2028428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857691
34073	NC_017950	AAGT	2	8	2028452	2028459	50 %	25 %	25 %	0 %	389857691
34074	NC_017950	ATC	2	6	2028621	2028626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857691
34075	NC_017950	TTC	2	6	2028655	2028660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857691
34076	NC_017950	TGA	2	6	2028711	2028716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857691
34077	NC_017950	GAA	2	6	2028745	2028750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857691
34078	NC_017950	TCC	2	6	2028883	2028888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857691
34079	NC_017950	AAT	2	6	2028970	2028975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857691
34080	NC_017950	CTA	2	6	2029019	2029024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857691
34081	NC_017950	AGTC	2	8	2029060	2029067	25 %	25 %	25 %	25 %	389857691
34082	NC_017950	CAAA	2	8	2029168	2029175	75 %	0 %	0 %	25 %	389857691
34083	NC_017950	TAC	2	6	2029210	2029215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857691
34084	NC_017950	CAA	2	6	2029275	2029280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857691
34085	NC_017950	TGC	2	6	2029296	2029301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857691
34086	NC_017950	A	7	7	2029385	2029391	100 %	0 %	0 %	0 %	389857691
34087	NC_017950	AAT	2	6	2029408	2029413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857691
34088	NC_017950	CTTTCT	2	12	2029442	2029453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857691
34089	NC_017950	TAC	2	6	2029470	2029475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857691
34090	NC_017950	AAT	2	6	2029513	2029518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857691
34091	NC_017950	TTA	2	6	2029558	2029563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857691
34092	NC_017950	AGT	2	6	2029602	2029607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857691
34093	NC_017950	TAA	2	6	2029623	2029628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857691
34094	NC_017950	AAG	2	6	2029655	2029660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857691
34095	NC_017950	CTC	2	6	2029666	2029671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857691
34096	NC_017950	AAG	2	6	2029742	2029747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857691
34097	NC_017950	TCTA	2	8	2029814	2029821	25 %	50 %	0 %	25 %	389857691
34098	NC_017950	TAT	2	6	2029882	2029887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857691
34099	NC_017950	TCTA	2	8	2030242	2030249	25 %	50 %	0 %	25 %	389857692
34100	NC_017950	TAT	2	6	2030310	2030315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857692
34101	NC_017950	ACCT	2	8	2030745	2030752	25 %	25 %	0 %	50 %	389857693
34102	NC_017950	T	6	6	2030763	2030768	0 %	100 %	0 %	0 %	389857693
34103	NC_017950	TAAT	2	8	2030783	2030790	50 %	50 %	0 %	0 %	389857693
34104	NC_017950	AT	3	6	2030789	2030794	50 %	50 %	0 %	0 %	389857693
34105	NC_017950	TTC	2	6	2030827	2030832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857693
34106	NC_017950	ATG	2	6	2030858	2030863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857693
34107	NC_017950	AGC	2	6	2030959	2030964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857693
34108	NC_017950	TCA	3	9	2030982	2030990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857693
34109	NC_017950	GA	3	6	2031092	2031097	50 %	0 %	50 %	0 %	389857693
34110	NC_017950	TAGT	2	8	2031102	2031109	25 %	50 %	25 %	0 %	389857693
34111	NC_017950	CAT	2	6	2031124	2031129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857693
34112	NC_017950	ACT	2	6	2031133	2031138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857693
34113	NC_017950	TGTT	2	8	2031157	2031164	0 %	75 %	25 %	0 %	389857693
34114	NC_017950	CTT	2	6	2031176	2031181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857693
34115	NC_017950	A	6	6	2031193	2031198	100 %	0 %	0 %	0 %	389857693
34116	NC_017950	A	6	6	2031211	2031216	100 %	0 %	0 %	0 %	389857693
34117	NC_017950	A	6	6	2031266	2031271	100 %	0 %	0 %	0 %	389857693
34118	NC_017950	ACC	2	6	2031316	2031321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857693
34119	NC_017950	ACT	2	6	2031444	2031449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857694
34120	NC_017950	CTG	2	6	2031466	2031471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857694
34121	NC_017950	TCA	2	6	2031549	2031554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857694
34122	NC_017950	T	7	7	2031567	2031573	0 %	100 %	0 %	0 %	389857694
34123	NC_017950	ACC	2	6	2031598	2031603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857694
34124	NC_017950	GAT	2	6	2031604	2031609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857694
34125	NC_017950	TTC	2	6	2031664	2031669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857694
34126	NC_017950	CTT	2	6	2031747	2031752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857694
34127	NC_017950	T	7	7	2031751	2031757	0 %	100 %	0 %	0 %	389857694
34128	NC_017950	T	6	6	2031798	2031803	0 %	100 %	0 %	0 %	389857694
34129	NC_017950	CTT	2	6	2031870	2031875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857694
34130	NC_017950	TTTC	2	8	2031885	2031892	0 %	75 %	0 %	25 %	389857694
34131	NC_017950	ATTTT	2	10	2031912	2031921	20 %	80 %	0 %	0 %	389857694
34132	NC_017950	A	6	6	2032119	2032124	100 %	0 %	0 %	0 %	389857695
34133	NC_017950	T	6	6	2032158	2032163	0 %	100 %	0 %	0 %	389857695
34134	NC_017950	TTC	2	6	2032194	2032199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857695
34135	NC_017950	CAA	2	6	2032212	2032217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857695
34136	NC_017950	ATA	2	6	2032255	2032260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857695
34137	NC_017950	CCA	2	6	2032270	2032275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857695
34138	NC_017950	TGT	2	6	2032304	2032309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857695
34139	NC_017950	TTA	2	6	2032315	2032320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
34140	NC_017950	CAA	2	6	2032337	2032342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857695
34141	NC_017950	ATC	2	6	2032373	2032378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857695
34142	NC_017950	A	6	6	2032422	2032427	100 %	0 %	0 %	0 %	389857695
34143	NC_017950	TTA	2	6	2032465	2032470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
34144	NC_017950	A	6	6	2032510	2032515	100 %	0 %	0 %	0 %	389857695
34145	NC_017950	TTG	2	6	2032528	2032533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857695
34146	NC_017950	CAG	2	6	2032573	2032578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857695
34147	NC_017950	CTG	2	6	2032588	2032593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857695
34148	NC_017950	TAT	2	6	2032694	2032699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
34149	NC_017950	ACAA	2	8	2032742	2032749	75 %	0 %	0 %	25 %	389857695
34150	NC_017950	ATG	2	6	2032921	2032926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857695
34151	NC_017950	TAT	2	6	2032934	2032939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
34152	NC_017950	A	6	6	2032951	2032956	100 %	0 %	0 %	0 %	389857695
34153	NC_017950	GAC	2	6	2033003	2033008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857695
34154	NC_017950	GTA	2	6	2033067	2033072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857695
34155	NC_017950	TTA	2	6	2033128	2033133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
34156	NC_017950	CT	3	6	2033182	2033187	0 %	50 %	0 %	50 %	389857695
34157	NC_017950	TTA	2	6	2033222	2033227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
34158	NC_017950	AAT	2	6	2033232	2033237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857695
34159	NC_017950	AAAC	2	8	2033241	2033248	75 %	0 %	0 %	25 %	389857695
34160	NC_017950	AGA	2	6	2033276	2033281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857695
34161	NC_017950	AAT	2	6	2033290	2033295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857695
34162	NC_017950	AT	3	6	2033351	2033356	50 %	50 %	0 %	0 %	389857696
34163	NC_017950	GAA	2	6	2033358	2033363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857696
34164	NC_017950	ATCC	2	8	2033388	2033395	25 %	25 %	0 %	50 %	389857696
34165	NC_017950	TGA	2	6	2033423	2033428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857696
34166	NC_017950	GCTC	2	8	2033444	2033451	0 %	25 %	25 %	50 %	389857696
34167	NC_017950	ATT	2	6	2033484	2033489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857696
34168	NC_017950	TCT	2	6	2033499	2033504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857696
34169	NC_017950	ATT	2	6	2033519	2033524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857696
34170	NC_017950	AAG	2	6	2033534	2033539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857696
34171	NC_017950	GACT	2	8	2033563	2033570	25 %	25 %	25 %	25 %	389857696
34172	NC_017950	CAG	2	6	2033578	2033583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857696
34173	NC_017950	AACT	2	8	2033593	2033600	50 %	25 %	0 %	25 %	389857696
34174	NC_017950	GAT	3	9	2033601	2033609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857696
34175	NC_017950	AGA	2	6	2033663	2033668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857696
34176	NC_017950	AGC	2	6	2033669	2033674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857696
34177	NC_017950	TAG	2	6	2033693	2033698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857696
34178	NC_017950	ATG	2	6	2033710	2033715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857696
34179	NC_017950	AT	3	6	2033747	2033752	50 %	50 %	0 %	0 %	389857696
34180	NC_017950	CTA	2	6	2033769	2033774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857696
34181	NC_017950	ATC	2	6	2033780	2033785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857696
34182	NC_017950	AGA	2	6	2033804	2033809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857696
34183	NC_017950	CG	3	6	2033831	2033836	0 %	0 %	50 %	50 %	389857696
34184	NC_017950	AGA	2	6	2033855	2033860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857696
34185	NC_017950	AAGC	2	8	2033862	2033869	50 %	0 %	25 %	25 %	389857696
34186	NC_017950	A	6	6	2033943	2033948	100 %	0 %	0 %	0 %	389857696
34187	NC_017950	AAC	2	6	2033962	2033967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857696
34188	NC_017950	AAG	2	6	2034036	2034041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857696
34189	NC_017950	CAA	2	6	2034104	2034109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857696

< Previous12...57585960616263646566676869Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.