MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 34189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_017950	TCA	2	6	1818343	1818348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857488
30503	NC_017950	CTT	2	6	1818427	1818432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857488
30504	NC_017950	T	7	7	1818431	1818437	0 %	100 %	0 %	0 %	389857488
30505	NC_017950	GCA	2	6	1818522	1818527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857488
30506	NC_017950	CGA	2	6	1818528	1818533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857488
30507	NC_017950	ACC	2	6	1818573	1818578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857488
30508	NC_017950	GTA	2	6	1818668	1818673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857488
30509	NC_017950	CAG	2	6	1818691	1818696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857488
30510	NC_017950	CTT	2	6	1818722	1818727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857489
30511	NC_017950	CAC	2	6	1818826	1818831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857489
30512	NC_017950	TGTCC	2	10	1818904	1818913	0 %	40 %	20 %	40 %	389857489
30513	NC_017950	AG	3	6	1819031	1819036	50 %	0 %	50 %	0 %	389857489
30514	NC_017950	TCT	3	9	1819066	1819074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857489
30515	NC_017950	GCT	2	6	1819075	1819080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857489
30516	NC_017950	GAA	2	6	1819134	1819139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857489
30517	NC_017950	TAAGA	2	10	1819177	1819186	60 %	20 %	20 %	0 %	389857489
30518	NC_017950	T	6	6	1819428	1819433	0 %	100 %	0 %	0 %	389857489
30519	NC_017950	GTT	2	6	1819511	1819516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857489
30520	NC_017950	TCC	2	6	1819525	1819530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857490
30521	NC_017950	GATA	2	8	1819541	1819548	50 %	25 %	25 %	0 %	389857490
30522	NC_017950	GTA	2	6	1819815	1819820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857490
30523	NC_017950	GTA	2	6	1819824	1819829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857490
30524	NC_017950	GACCA	2	10	1819863	1819872	40 %	0 %	20 %	40 %	389857490
30525	NC_017950	TCA	3	9	1819954	1819962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857490
30526	NC_017950	GTA	2	6	1819983	1819988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857490
30527	NC_017950	ACAGG	2	10	1820008	1820017	40 %	0 %	40 %	20 %	389857490
30528	NC_017950	AAT	2	6	1820018	1820023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857490
30529	NC_017950	ACC	2	6	1820074	1820079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857490
30530	NC_017950	CGG	2	6	1820101	1820106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389857490
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30532	NC_017950	CCA	2	6	1820276	1820281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857490
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30534	NC_017950	TCG	2	6	1820371	1820376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857490
30535	NC_017950	TGA	2	6	1820428	1820433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857490
30536	NC_017950	GAC	2	6	1820463	1820468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857490
30537	NC_017950	ACTGCT	2	12	1820548	1820559	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389857490
30538	NC_017950	GGA	2	6	1820803	1820808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857491
30539	NC_017950	CGA	2	6	1820811	1820816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857491
30540	NC_017950	GGGC	2	8	1820820	1820827	0 %	0 %	75 %	25 %	389857491
30541	NC_017950	CTT	2	6	1820848	1820853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857491
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30550	NC_017950	TTG	2	6	1821285	1821290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857491
30551	NC_017950	CTT	2	6	1821316	1821321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857491
30552	NC_017950	GGA	2	6	1821339	1821344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857491
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30554	NC_017950	TCA	2	6	1821417	1821422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857491
30555	NC_017950	GCG	2	6	1821533	1821538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389857491
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30557	NC_017950	TCTG	2	8	1821627	1821634	0 %	50 %	25 %	25 %	389857491
30558	NC_017950	TCT	3	9	1821687	1821695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857491
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30602	NC_017950	GCACC	2	10	1824432	1824441	20 %	0 %	20 %	60 %	389857494
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