MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 chromosome

Total Repeats: 251656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017765	CGT	2	6	933	938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836098
2	NC_017765	CGC	2	6	1020	1025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836098
3	NC_017765	GAC	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836098
4	NC_017765	CAGC	2	8	1045	1052	25 %	0 %	25 %	50 %	386836098
5	NC_017765	GC	3	6	1057	1062	0 %	0 %	50 %	50 %	386836098
6	NC_017765	TTC	3	9	1090	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836098
7	NC_017765	GAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836098
8	NC_017765	TGG	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836098
9	NC_017765	GC	3	6	1257	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	386836098
10	NC_017765	CGGC	2	8	1287	1294	0 %	0 %	50 %	50 %	386836098
11	NC_017765	GAG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836098
12	NC_017765	GAG	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836098
13	NC_017765	CGG	2	6	1334	1339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836098
14	NC_017765	AGC	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836098
15	NC_017765	GCC	2	6	1381	1386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836098
16	NC_017765	GTC	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836098
17	NC_017765	CGG	2	6	1557	1562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836098
18	NC_017765	GCT	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836098
19	NC_017765	GAC	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836098
20	NC_017765	AGG	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836098
21	NC_017765	GCTG	2	8	1706	1713	0 %	25 %	50 %	25 %	386836098
22	NC_017765	GCC	2	6	1887	1892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836099
23	NC_017765	GC	3	6	1897	1902	0 %	0 %	50 %	50 %	386836099
24	NC_017765	GGCG	2	8	1978	1985	0 %	0 %	75 %	25 %	386836099
25	NC_017765	CT	3	6	2018	2023	0 %	50 %	0 %	50 %	386836099
26	NC_017765	CAC	2	6	2060	2065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836099
27	NC_017765	CT	3	6	2132	2137	0 %	50 %	0 %	50 %	386836099
28	NC_017765	CGA	2	6	2156	2161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
29	NC_017765	TCGC	2	8	2250	2257	0 %	25 %	25 %	50 %	386836099
30	NC_017765	CCG	2	6	2281	2286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836099
31	NC_017765	GCG	2	6	2307	2312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836099
32	NC_017765	CCG	2	6	2335	2340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836099
33	NC_017765	GC	3	6	2399	2404	0 %	0 %	50 %	50 %	386836099
34	NC_017765	CGA	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
35	NC_017765	TGGC	2	8	2466	2473	0 %	25 %	50 %	25 %	386836099
36	NC_017765	GAG	2	6	2574	2579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836099
37	NC_017765	CGC	3	9	2630	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836099
38	NC_017765	CCA	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836099
39	NC_017765	GGA	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836099
40	NC_017765	ACG	2	6	2737	2742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
41	NC_017765	GAC	3	9	2748	2756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
42	NC_017765	GGC	2	6	2759	2764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836099
43	NC_017765	GTC	2	6	2783	2788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836099
44	NC_017765	GGCC	2	8	2816	2823	0 %	0 %	50 %	50 %	386836099
45	NC_017765	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836099
46	NC_017765	ACC	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836099
47	NC_017765	TGC	2	6	2896	2901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836099
48	NC_017765	CGG	2	6	2934	2939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836099
49	NC_017765	CG	3	6	2946	2951	0 %	0 %	50 %	50 %	386836099
50	NC_017765	CG	3	6	3072	3077	0 %	0 %	50 %	50 %	386836099
51	NC_017765	CAC	2	6	3098	3103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836099
52	NC_017765	CAT	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836099
53	NC_017765	TCC	2	6	3133	3138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836099
54	NC_017765	CGAC	2	8	3154	3161	25 %	0 %	25 %	50 %	386836099
55	NC_017765	ATG	2	6	3220	3225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836099
56	NC_017765	AGC	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
57	NC_017765	TCG	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836099
58	NC_017765	CGG	2	6	3320	3325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836099
59	NC_017765	ACG	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
60	NC_017765	GCT	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836099
61	NC_017765	CTTCT	2	10	3389	3398	0 %	60 %	0 %	40 %	386836099
62	NC_017765	CCA	2	6	3412	3417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836099
63	NC_017765	CCGG	2	8	3446	3453	0 %	0 %	50 %	50 %	386836099
64	NC_017765	GGCG	2	8	3496	3503	0 %	0 %	75 %	25 %	386836099
65	NC_017765	ACG	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
66	NC_017765	GAGGTC	2	12	3546	3557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386836099
67	NC_017765	GGTG	2	8	3586	3593	0 %	25 %	75 %	0 %	386836099
68	NC_017765	CAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
69	NC_017765	GC	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	386836099
70	NC_017765	GCT	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836099
71	NC_017765	CGC	2	6	3713	3718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836099
72	NC_017765	CGG	2	6	3732	3737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836099
73	NC_017765	GCGAGG	2	12	3778	3789	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386836099
74	NC_017765	GCA	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
75	NC_017765	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836099
76	NC_017765	GAGC	2	8	3864	3871	25 %	0 %	50 %	25 %	386836099
77	NC_017765	GC	3	6	3878	3883	0 %	0 %	50 %	50 %	386836099
78	NC_017765	GGACTG	2	12	3908	3919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386836099
79	NC_017765	TCG	2	6	3967	3972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836099
80	NC_017765	CGA	2	6	4022	4027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
81	NC_017765	AGC	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
82	NC_017765	CGA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
83	NC_017765	GCA	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
84	NC_017765	GTGG	2	8	4223	4230	0 %	25 %	75 %	0 %	386836099
85	NC_017765	AGC	2	6	4369	4374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836099
86	NC_017765	TGG	2	6	4514	4519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836100
87	NC_017765	GCC	2	6	4611	4616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836100
88	NC_017765	CGA	2	6	4729	4734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836100
89	NC_017765	GGC	2	6	4766	4771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836100
90	NC_017765	CGA	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836100
91	NC_017765	GTC	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836100
92	NC_017765	C	6	6	5120	5125	0 %	0 %	0 %	100 %	386836101
93	NC_017765	CGA	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836101
94	NC_017765	CCT	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836101
95	NC_017765	GGC	2	6	5405	5410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836101
96	NC_017765	GGT	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836101
97	NC_017765	TGCT	2	8	5462	5469	0 %	50 %	25 %	25 %	386836101
98	NC_017765	CTG	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836101
99	NC_017765	TGG	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836101
100	NC_017765	TCC	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836101
101	NC_017765	CATC	2	8	5658	5665	25 %	25 %	0 %	50 %	386836101
102	NC_017765	TTC	2	6	5697	5702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836101
103	NC_017765	CCA	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836101
104	NC_017765	CGTC	2	8	5761	5768	0 %	25 %	25 %	50 %	386836101
105	NC_017765	CGG	2	6	5776	5781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836101
106	NC_017765	GCC	2	6	5798	5803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836101
107	NC_017765	GGC	2	6	5819	5824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836101
108	NC_017765	GCAC	2	8	5833	5840	25 %	0 %	25 %	50 %	386836101
109	NC_017765	G	6	6	5846	5851	0 %	0 %	100 %	0 %	386836101
110	NC_017765	AGC	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836101
111	NC_017765	CGT	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836101
112	NC_017765	CGT	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836101
113	NC_017765	GC	4	8	5914	5921	0 %	0 %	50 %	50 %	386836101
114	NC_017765	CCT	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836101
115	NC_017765	CGC	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836102
116	NC_017765	GGCC	2	8	6252	6259	0 %	0 %	50 %	50 %	386836102
117	NC_017765	CGT	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836102
118	NC_017765	GTC	2	6	6302	6307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836102
119	NC_017765	GTC	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836102
120	NC_017765	GCG	2	6	6342	6347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836102
121	NC_017765	GCT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836102
122	NC_017765	CTGG	2	8	6368	6375	0 %	25 %	50 %	25 %	386836102
123	NC_017765	GCTCC	2	10	6406	6415	0 %	20 %	20 %	60 %	386836102
124	NC_017765	GAT	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836103
125	NC_017765	CCGC	2	8	6571	6578	0 %	0 %	25 %	75 %	386836103
126	NC_017765	GAC	3	9	6583	6591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836103
127	NC_017765	CGA	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836103
128	NC_017765	GCA	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836103
129	NC_017765	GCCA	2	8	6661	6668	25 %	0 %	25 %	50 %	386836103
130	NC_017765	GAC	2	6	6676	6681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836103
131	NC_017765	CCA	2	6	6690	6695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836103
132	NC_017765	CT	3	6	6712	6717	0 %	50 %	0 %	50 %	386836103
133	NC_017765	GGT	2	6	6744	6749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836103
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253	NC_017765	AGA	2	6	15410	15415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836109
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257	NC_017765	GCGCA	2	10	15603	15612	20 %	0 %	40 %	40 %	386836109
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