MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 1164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730447
2	NC_017675	CTGAA	2	10	2429	2438	40 %	20 %	20 %	20 %	386730448
3	NC_017675	GCA	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730448
4	NC_017675	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730448
5	NC_017675	ATG	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730448
6	NC_017675	GCCA	2	8	2688	2695	25 %	0 %	25 %	50 %	386730449
7	NC_017675	CAGC	2	8	2776	2783	25 %	0 %	25 %	50 %	386730449
8	NC_017675	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730450
9	NC_017675	CCA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730450
10	NC_017675	TGG	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
11	NC_017675	ACA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730450
12	NC_017675	GCTG	2	8	3200	3207	0 %	25 %	50 %	25 %	386730450
13	NC_017675	GGCA	2	8	3262	3269	25 %	0 %	50 %	25 %	386730450
14	NC_017675	ATA	2	6	3325	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730450
15	NC_017675	GGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
16	NC_017675	GCC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730450
17	NC_017675	CT	3	6	3454	3459	0 %	50 %	0 %	50 %	386730450
18	NC_017675	GCG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730450
19	NC_017675	CAT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730450
20	NC_017675	GACC	2	8	3513	3520	25 %	0 %	25 %	50 %	386730450
21	NC_017675	CTG	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
22	NC_017675	CTGG	2	8	3596	3603	0 %	25 %	50 %	25 %	386730450
23	NC_017675	GCTG	2	8	3632	3639	0 %	25 %	50 %	25 %	386730450
24	NC_017675	CCA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730450
25	NC_017675	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
26	NC_017675	GGCA	2	8	3721	3728	25 %	0 %	50 %	25 %	386730450
27	NC_017675	GGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
28	NC_017675	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
29	NC_017675	ATC	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730450
30	NC_017675	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
31	NC_017675	T	7	7	3978	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	386730451
32	NC_017675	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730451
33	NC_017675	TGC	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730451
34	NC_017675	CGATCC	2	12	4156	4167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386730451
35	NC_017675	GTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730451
36	NC_017675	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730451
37	NC_017675	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	386730451
38	NC_017675	GCC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730451
39	NC_017675	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	386730451
40	NC_017675	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
41	NC_017675	TGC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
42	NC_017675	GCT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
43	NC_017675	GTTG	2	8	4608	4615	0 %	50 %	50 %	0 %	386730452
44	NC_017675	GGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730452
45	NC_017675	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730452
46	NC_017675	ATTT	2	8	4695	4702	25 %	75 %	0 %	0 %	386730452
47	NC_017675	GA	3	6	4744	4749	50 %	0 %	50 %	0 %	386730452
48	NC_017675	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730453
49	NC_017675	ATC	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730453
50	NC_017675	ATC	3	9	5159	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730453
51	NC_017675	T	6	6	5175	5180	0 %	100 %	0 %	0 %	386730454
52	NC_017675	TTC	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730454
53	NC_017675	CTG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730454
54	NC_017675	CCCG	2	8	5306	5313	0 %	0 %	25 %	75 %	386730454
55	NC_017675	AAG	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730454
56	NC_017675	AAG	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730454
57	NC_017675	GAAA	2	8	5449	5456	75 %	0 %	25 %	0 %	386730454
58	NC_017675	GTA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730454
59	NC_017675	ATA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730454
60	NC_017675	A	7	7	5569	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	386730454
61	NC_017675	TA	3	6	5576	5581	50 %	50 %	0 %	0 %	386730454
62	NC_017675	TCT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730454
63	NC_017675	CA	3	6	5651	5656	50 %	0 %	0 %	50 %	386730454
64	NC_017675	CTG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730455
65	NC_017675	CGG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730455
66	NC_017675	CCA	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730455
67	NC_017675	T	6	6	6045	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
68	NC_017675	GGGA	2	8	6084	6091	25 %	0 %	75 %	0 %	386730455
69	NC_017675	TCTTT	2	10	6106	6115	0 %	80 %	0 %	20 %	386730455
70	NC_017675	TTC	3	9	6116	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730455
71	NC_017675	CTGG	2	8	6125	6132	0 %	25 %	50 %	25 %	386730455
72	NC_017675	CGG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730455
73	NC_017675	ATA	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730455
74	NC_017675	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
75	NC_017675	ACG	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730455
76	NC_017675	T	6	6	6265	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
77	NC_017675	CAC	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730455
78	NC_017675	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730455
79	NC_017675	T	6	6	6305	6310	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
80	NC_017675	AGA	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730456
81	NC_017675	GCA	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730456
82	NC_017675	TCA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
83	NC_017675	ATC	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
84	NC_017675	ATGCTC	2	12	7603	7614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730456
85	NC_017675	AAAG	2	8	7702	7709	75 %	0 %	25 %	0 %	386730456
86	NC_017675	GCA	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730456
87	NC_017675	ATC	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
88	NC_017675	GAT	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
89	NC_017675	A	6	6	8505	8510	100 %	0 %	0 %	0 %	386730457
90	NC_017675	GCA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
91	NC_017675	TGC	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
92	NC_017675	AC	3	6	8634	8639	50 %	0 %	0 %	50 %	386730457
93	NC_017675	GCAG	2	8	8704	8711	25 %	0 %	50 %	25 %	386730457
94	NC_017675	GA	3	6	8716	8721	50 %	0 %	50 %	0 %	386730457
95	NC_017675	ATG	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
96	NC_017675	AG	3	6	8773	8778	50 %	0 %	50 %	0 %	386730457
97	NC_017675	TGCTGA	2	12	8791	8802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730457
98	NC_017675	AAG	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730457
99	NC_017675	TGCT	2	8	8901	8908	0 %	50 %	25 %	25 %	386730457
100	NC_017675	A	7	7	8958	8964	100 %	0 %	0 %	0 %	386730457
101	NC_017675	GCA	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
102	NC_017675	AAC	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730457
103	NC_017675	TCA	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730457
104	NC_017675	TTG	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730457
105	NC_017675	GTG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730457
106	NC_017675	TCT	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730457
107	NC_017675	GGT	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730457
108	NC_017675	CTG	2	6	9459	9464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
109	NC_017675	ATG	2	6	9528	9533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
110	NC_017675	AGAAA	2	10	9609	9618	80 %	0 %	20 %	0 %	386730457
111	NC_017675	AAAT	2	8	9627	9634	75 %	25 %	0 %	0 %	386730457
112	NC_017675	AT	3	6	9680	9685	50 %	50 %	0 %	0 %	386730457
113	NC_017675	GAT	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
114	NC_017675	TAA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730457
115	NC_017675	ATG	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
116	NC_017675	T	6	6	9992	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	386730457
117	NC_017675	GCA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
118	NC_017675	GCT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
119	NC_017675	CAG	2	6	10035	10040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
120	NC_017675	ATT	2	6	10100	10105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730457
121	NC_017675	GGC	2	6	10108	10113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730457
122	NC_017675	AAT	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730458
123	NC_017675	AAG	2	6	10313	10318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730458
124	NC_017675	TTA	2	6	10350	10355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730458
125	NC_017675	TAT	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730458
126	NC_017675	A	6	6	10467	10472	100 %	0 %	0 %	0 %	386730458
127	NC_017675	AAT	2	6	10480	10485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730458
128	NC_017675	AT	3	6	10524	10529	50 %	50 %	0 %	0 %	386730458
129	NC_017675	TCC	2	6	11623	11628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730459
130	NC_017675	CATT	2	8	11690	11697	25 %	50 %	0 %	25 %	386730459
131	NC_017675	AGA	2	6	11729	11734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730459
132	NC_017675	CGT	2	6	11809	11814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730459
133	NC_017675	GTT	2	6	11831	11836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730459
134	NC_017675	CATC	2	8	11864	11871	25 %	25 %	0 %	50 %	386730459
135	NC_017675	GAAAA	2	10	12417	12426	80 %	0 %	20 %	0 %	386730460
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139	NC_017675	G	6	6	12593	12598	0 %	0 %	100 %	0 %	386730460
140	NC_017675	TCA	3	9	12608	12616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730460
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142	NC_017675	AGGG	2	8	12737	12744	25 %	0 %	75 %	0 %	386730460
143	NC_017675	TGT	2	6	12750	12755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730460
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147	NC_017675	ATG	2	6	12960	12965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730461
148	NC_017675	CTG	2	6	12980	12985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730461
149	NC_017675	TGC	2	6	13038	13043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730461
150	NC_017675	GC	3	6	13067	13072	0 %	0 %	50 %	50 %	386730461
151	NC_017675	G	6	6	13098	13103	0 %	0 %	100 %	0 %	386730461
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159	NC_017675	TAA	2	6	13297	13302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730461
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167	NC_017675	AT	3	6	14684	14689	50 %	50 %	0 %	0 %	386730462
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253	NC_017675	ACCGT	2	10	21637	21646	20 %	20 %	20 %	40 %	386730470
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258	NC_017675	TTG	2	6	22393	22398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730471
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261	NC_017675	GCA	2	6	22465	22470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730471
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264	NC_017675	GGC	2	6	22703	22708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730472
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270	NC_017675	GCA	2	6	22918	22923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730473
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377	NC_017675	TGA	2	6	31358	31363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730483
378	NC_017675	CA	3	6	31637	31642	50 %	0 %	0 %	50 %	386730484
379	NC_017675	TGA	2	6	31680	31685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730484
380	NC_017675	GCA	2	6	31716	31721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730484
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382	NC_017675	TGA	2	6	32465	32470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730485
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