MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 85956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017623	CGC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589257
2	NC_017623	TAA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589257
3	NC_017623	GCC	2	6	781	786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589257
4	NC_017623	TGC	2	6	792	797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589257
5	NC_017623	TCA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589258
6	NC_017623	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589258
7	NC_017623	GATT	2	8	1023	1030	25 %	50 %	25 %	0 %	386589258
8	NC_017623	GGT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589258
9	NC_017623	GAT	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589258
10	NC_017623	AGC	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589258
11	NC_017623	GTT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589258
12	NC_017623	A	7	7	1515	1521	100 %	0 %	0 %	0 %	386589259
13	NC_017623	AAC	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589259
14	NC_017623	TC	3	6	1576	1581	0 %	50 %	0 %	50 %	386589259
15	NC_017623	GGA	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589259
16	NC_017623	GTG	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589259
17	NC_017623	CT	3	6	1836	1841	0 %	50 %	0 %	50 %	386589259
18	NC_017623	TGT	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589259
19	NC_017623	CG	3	6	2079	2084	0 %	0 %	50 %	50 %	386589259
20	NC_017623	TGG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589259
21	NC_017623	ATG	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
22	NC_017623	CG	3	6	2160	2165	0 %	0 %	50 %	50 %	386589259
23	NC_017623	ATG	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
24	NC_017623	TGA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
25	NC_017623	GCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589259
26	NC_017623	GCG	2	6	2371	2376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
27	NC_017623	CGG	3	9	2393	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
28	NC_017623	TGC	3	9	2428	2436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589259
29	NC_017623	GCG	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
30	NC_017623	GCC	2	6	2523	2528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589260
31	NC_017623	CAG	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589260
32	NC_017623	ATG	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589260
33	NC_017623	CAC	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
34	NC_017623	ACC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
35	NC_017623	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589260
36	NC_017623	GCC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589260
37	NC_017623	ATA	2	6	2888	2893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589260
38	NC_017623	AGC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589260
39	NC_017623	TCC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589260
40	NC_017623	CG	3	6	3012	3017	0 %	0 %	50 %	50 %	386589260
41	NC_017623	GCT	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589260
42	NC_017623	TAC	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
43	NC_017623	CACGC	2	10	3066	3075	20 %	0 %	20 %	60 %	386589260
44	NC_017623	GAG	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589260
45	NC_017623	CGG	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
46	NC_017623	GGC	2	6	3170	3175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
47	NC_017623	ATC	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
48	NC_017623	T	6	6	3277	3282	0 %	100 %	0 %	0 %	386589260
49	NC_017623	GTT	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589260
50	NC_017623	GCG	2	6	3347	3352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
51	NC_017623	CAC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
52	NC_017623	GGC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
53	NC_017623	CTT	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589260
54	NC_017623	GTG	2	6	3545	3550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589260
55	NC_017623	A	7	7	3584	3590	100 %	0 %	0 %	0 %	386589260
56	NC_017623	GT	3	6	3593	3598	0 %	50 %	50 %	0 %	386589260
57	NC_017623	AG	3	6	3718	3723	50 %	0 %	50 %	0 %	386589260
58	NC_017623	CGG	2	6	3766	3771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
59	NC_017623	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
60	NC_017623	T	6	6	3839	3844	0 %	100 %	0 %	0 %	386589260
61	NC_017623	ATC	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
62	NC_017623	TTG	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589260
63	NC_017623	TGC	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
64	NC_017623	TGC	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
65	NC_017623	GCT	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
66	NC_017623	CAC	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589261
67	NC_017623	CGC	2	6	4274	4279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
68	NC_017623	GC	3	6	4301	4306	0 %	0 %	50 %	50 %	386589261
69	NC_017623	CGG	2	6	4395	4400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589261
70	NC_017623	CTT	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
71	NC_017623	TGC	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
72	NC_017623	CCG	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
73	NC_017623	CTG	3	9	4530	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
74	NC_017623	TCA	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589261
75	NC_017623	CGCGT	2	10	4647	4656	0 %	20 %	40 %	40 %	386589261
76	NC_017623	AAG	2	6	4663	4668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589261
77	NC_017623	TTC	2	6	4696	4701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
78	NC_017623	TTC	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
79	NC_017623	CTG	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
80	NC_017623	GCC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
81	NC_017623	CAG	2	6	5010	5015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589261
82	NC_017623	T	6	6	5027	5032	0 %	100 %	0 %	0 %	386589261
83	NC_017623	CGTT	2	8	5059	5066	0 %	50 %	25 %	25 %	386589261
84	NC_017623	AG	3	6	5199	5204	50 %	0 %	50 %	0 %	386589261
85	NC_017623	TCA	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589261
86	NC_017623	GC	3	6	5263	5268	0 %	0 %	50 %	50 %	386589261
87	NC_017623	GGC	2	6	5285	5290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589261
88	NC_017623	CGGG	2	8	5315	5322	0 %	0 %	75 %	25 %	386589261
89	NC_017623	CAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589261
90	NC_017623	CGC	2	6	5352	5357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
91	NC_017623	GCT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
92	NC_017623	TAA	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589261
93	NC_017623	ATA	2	6	5458	5463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589261
94	NC_017623	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589262
95	NC_017623	TCT	2	6	5973	5978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589262
96	NC_017623	GC	3	6	6025	6030	0 %	0 %	50 %	50 %	386589262
97	NC_017623	GC	3	6	6092	6097	0 %	0 %	50 %	50 %	386589262
98	NC_017623	GTTA	2	8	6109	6116	25 %	50 %	25 %	0 %	386589262
99	NC_017623	GGC	2	6	6131	6136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
100	NC_017623	GTG	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
101	NC_017623	CGC	2	6	6213	6218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589262
102	NC_017623	ATT	2	6	6248	6253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589262
103	NC_017623	TGT	2	6	6264	6269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
104	NC_017623	TAT	2	6	6367	6372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589262
105	NC_017623	T	6	6	6421	6426	0 %	100 %	0 %	0 %	386589262
106	NC_017623	GGT	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
107	NC_017623	CGT	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
108	NC_017623	ACT	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589262
109	NC_017623	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589262
110	NC_017623	GCT	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
111	NC_017623	GCT	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
112	NC_017623	GTT	2	6	6860	6865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
113	NC_017623	GGC	3	9	6895	6903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
114	NC_017623	TTCT	2	8	6945	6952	0 %	75 %	0 %	25 %	386589262
115	NC_017623	TTG	2	6	7061	7066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
116	NC_017623	CGG	2	6	7069	7074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
117	NC_017623	ACC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589262
118	NC_017623	AGCG	2	8	7130	7137	25 %	0 %	50 %	25 %	386589262
119	NC_017623	CGT	2	6	7151	7156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
120	NC_017623	GAT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589262
121	NC_017623	CCG	2	6	7211	7216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589262
122	NC_017623	CG	4	8	7248	7255	0 %	0 %	50 %	50 %	386589262
123	NC_017623	CAA	2	6	7297	7302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589262
124	NC_017623	GTG	2	6	7412	7417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
125	NC_017623	GAT	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589262
126	NC_017623	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
127	NC_017623	TGT	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
128	NC_017623	GCAAC	2	10	7591	7600	40 %	0 %	20 %	40 %	386589262
129	NC_017623	GC	4	8	7606	7613	0 %	0 %	50 %	50 %	386589262
130	NC_017623	GAA	2	6	7874	7879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589263
131	NC_017623	TCG	2	6	7905	7910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589263
132	NC_017623	CG	3	6	7982	7987	0 %	0 %	50 %	50 %	386589263
133	NC_017623	CTT	2	6	8017	8022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589263
134	NC_017623	GGT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589263
135	NC_017623	GGC	2	6	8066	8071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589263
136	NC_017623	ACA	2	6	8093	8098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589263
137	NC_017623	CTCA	2	8	8124	8131	25 %	25 %	0 %	50 %	386589263
138	NC_017623	GCA	2	6	8144	8149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589263
139	NC_017623	AC	3	6	8184	8189	50 %	0 %	0 %	50 %	386589263
140	NC_017623	A	6	6	8199	8204	100 %	0 %	0 %	0 %	386589263
141	NC_017623	CT	3	6	8354	8359	0 %	50 %	0 %	50 %	386589264
142	NC_017623	TGG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
143	NC_017623	CCA	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
144	NC_017623	TGA	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
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146	NC_017623	ACC	2	6	8500	8505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
147	NC_017623	ATT	2	6	8545	8550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589264
148	NC_017623	ACC	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
149	NC_017623	TGG	2	6	8711	8716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
150	NC_017623	CT	3	6	8722	8727	0 %	50 %	0 %	50 %	386589264
151	NC_017623	TGG	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
152	NC_017623	TCA	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589264
153	NC_017623	ACCG	2	8	8799	8806	25 %	0 %	25 %	50 %	386589264
154	NC_017623	CT	3	6	8832	8837	0 %	50 %	0 %	50 %	386589264
155	NC_017623	TGACG	2	10	8925	8934	20 %	20 %	40 %	20 %	386589264
156	NC_017623	ATG	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
157	NC_017623	ATG	2	6	9104	9109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
158	NC_017623	TGC	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589264
159	NC_017623	TGA	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
160	NC_017623	GTG	2	6	9244	9249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
161	NC_017623	AGC	2	6	9410	9415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589264
162	NC_017623	GGT	2	6	9490	9495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
163	NC_017623	TGA	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
164	NC_017623	CGA	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589264
165	NC_017623	AAGA	2	8	9589	9596	75 %	0 %	25 %	0 %	386589264
166	NC_017623	CAT	2	6	9639	9644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589264
167	NC_017623	CAT	2	6	9690	9695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589264
168	NC_017623	CATG	2	8	9699	9706	25 %	25 %	25 %	25 %	386589264
169	NC_017623	A	6	6	9803	9808	100 %	0 %	0 %	0 %	386589264
170	NC_017623	CTT	2	6	9858	9863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589265
171	NC_017623	CTG	2	6	9885	9890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
172	NC_017623	T	6	6	9927	9932	0 %	100 %	0 %	0 %	386589265
173	NC_017623	TAA	2	6	9938	9943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589265
174	NC_017623	TTC	2	6	9955	9960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589265
175	NC_017623	GATC	2	8	10022	10029	25 %	25 %	25 %	25 %	386589265
176	NC_017623	CTG	2	6	10044	10049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
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192	NC_017623	CGG	2	6	10552	10557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589265
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256	NC_017623	GGCT	2	8	13382	13389	0 %	25 %	50 %	25 %	386589268
257	NC_017623	GGC	3	9	13429	13437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589268
258	NC_017623	CGATG	2	10	13500	13509	20 %	20 %	40 %	20 %	386589268
259	NC_017623	ATG	2	6	13580	13585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589268
260	NC_017623	GC	3	6	13597	13602	0 %	0 %	50 %	50 %	386589268
261	NC_017623	CGC	3	9	13610	13618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589268
262	NC_017623	GAC	2	6	13620	13625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589268
263	NC_017623	CAA	2	6	13702	13707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589268
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266	NC_017623	CCG	2	6	13912	13917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589269
267	NC_017623	TGC	2	6	13950	13955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589269
268	NC_017623	GCT	2	6	13979	13984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589269
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270	NC_017623	GAAT	2	8	14059	14066	50 %	25 %	25 %	0 %	386589269
271	NC_017623	GCA	2	6	14071	14076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589269
272	NC_017623	ATC	2	6	14124	14129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589269
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279	NC_017623	TAG	2	6	14432	14437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589269
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282	NC_017623	GTG	2	6	14577	14582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589269
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284	NC_017623	CGC	2	6	14680	14685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589269
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292	NC_017623	ATA	2	6	14991	14996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589269
293	NC_017623	GTG	2	6	15013	15018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589269
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382	NC_017623	GC	3	6	26197	26202	0 %	0 %	50 %	50 %	386589275
383	NC_017623	CTAT	2	8	26238	26245	25 %	50 %	0 %	25 %	386589275
384	NC_017623	GTT	3	9	26251	26259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589275
385	NC_017623	GTG	2	6	26294	26299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589275
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