MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 35165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31053	NC_017622	A	7	7	1800362	1800368	100 %	0 %	0 %	0 %	386589035
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31117	NC_017622	TCG	2	6	1804162	1804167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589039
31118	NC_017622	TCT	2	6	1804204	1804209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589039
31119	NC_017622	CTG	2	6	1804220	1804225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589039
31120	NC_017622	CCAAG	2	10	1804317	1804326	40 %	0 %	20 %	40 %	386589039
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31122	NC_017622	ACC	2	6	1804458	1804463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589039
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31124	NC_017622	ATA	2	6	1804483	1804488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589039
31125	NC_017622	GCC	2	6	1804531	1804536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589039
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31147	NC_017622	TGC	2	6	1805872	1805877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589040
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31184	NC_017622	TCA	2	6	1807739	1807744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589042
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31213	NC_017622	CGTAC	2	10	1809136	1809145	20 %	20 %	20 %	40 %	386589044
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31225	NC_017622	GT	3	6	1809905	1809910	0 %	50 %	50 %	0 %	386589044
31226	NC_017622	CAC	2	6	1809921	1809926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589044
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31230	NC_017622	ACT	2	6	1810016	1810021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589044
31231	NC_017622	TTC	2	6	1810425	1810430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589045
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31351	NC_017622	ACA	2	6	1817735	1817740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589050
31352	NC_017622	CGA	2	6	1817769	1817774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589050
31353	NC_017622	CGG	2	6	1817805	1817810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589050
31354	NC_017622	AGA	2	6	1817849	1817854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589050
31355	NC_017622	CAA	2	6	1817898	1817903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589050
31356	NC_017622	TTA	2	6	1817906	1817911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589050
31357	NC_017622	CAT	2	6	1817961	1817966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589050
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31361	NC_017622	ATCA	2	8	1818301	1818308	50 %	25 %	0 %	25 %	386589050
31362	NC_017622	GAC	2	6	1818349	1818354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589050
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31364	NC_017622	CAG	2	6	1818461	1818466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589050
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31370	NC_017622	GGA	2	6	1818826	1818831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589051
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31374	NC_017622	CTT	2	6	1819213	1819218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589051
31375	NC_017622	T	7	7	1819217	1819223	0 %	100 %	0 %	0 %	386589051
31376	NC_017622	GCA	2	6	1819308	1819313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589051
31377	NC_017622	CGA	2	6	1819314	1819319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589051
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31385	NC_017622	TCT	3	9	1819852	1819860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589052
31386	NC_017622	GCT	2	6	1819861	1819866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589052
31387	NC_017622	GAA	2	6	1819920	1819925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589052
31388	NC_017622	TAAGA	2	10	1819963	1819972	60 %	20 %	20 %	0 %	386589052
31389	NC_017622	T	6	6	1820214	1820219	0 %	100 %	0 %	0 %	386589052
31390	NC_017622	GTT	2	6	1820297	1820302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589052
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31397	NC_017622	GTA	2	6	1820769	1820774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589053
31398	NC_017622	ACAGG	2	10	1820794	1820803	40 %	0 %	40 %	20 %	386589053
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31403	NC_017622	CCA	2	6	1821062	1821067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589053
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31406	NC_017622	TGA	2	6	1821214	1821219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589053
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31408	NC_017622	ACTGCT	2	12	1821334	1821345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386589053
31409	NC_017622	GGA	2	6	1821589	1821594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589054
31410	NC_017622	CGA	2	6	1821597	1821602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589054
31411	NC_017622	GGGC	2	8	1821606	1821613	0 %	0 %	75 %	25 %	386589054
31412	NC_017622	CTT	2	6	1821634	1821639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589054
31413	NC_017622	GCC	2	6	1821693	1821698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589054
31414	NC_017622	CAAT	2	8	1821703	1821710	50 %	25 %	0 %	25 %	386589054
31415	NC_017622	TCA	2	6	1821777	1821782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589054
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31418	NC_017622	ATC	2	6	1821893	1821898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589054
31419	NC_017622	ATG	2	6	1821933	1821938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589054
31420	NC_017622	TCA	2	6	1822044	1822049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589054
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31422	NC_017622	CTT	2	6	1822102	1822107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589054
31423	NC_017622	GGA	2	6	1822125	1822130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589054
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31435	NC_017622	GCA	2	6	1822947	1822952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589054
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31450	NC_017622	TGA	2	6	1823809	1823814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589054
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31452	NC_017622	ACT	2	6	1823852	1823857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589054
31453	NC_017622	CAAT	2	8	1823869	1823876	50 %	25 %	0 %	25 %	386589054
31454	NC_017622	ACT	2	6	1823925	1823930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589055
31455	NC_017622	CAT	2	6	1823965	1823970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589055
31456	NC_017622	TAG	2	6	1824018	1824023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589055
31457	NC_017622	CAA	2	6	1824025	1824030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589055
31458	NC_017622	TCA	2	6	1824051	1824056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589055
31459	NC_017622	TTC	2	6	1824122	1824127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589055
31460	NC_017622	CCA	2	6	1824188	1824193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589055
31461	NC_017622	C	7	7	1824194	1824200	0 %	0 %	0 %	100 %	386589055
31462	NC_017622	CTGG	2	8	1824262	1824269	0 %	25 %	50 %	25 %	386589055
31463	NC_017622	CAC	2	6	1824271	1824276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589055
31464	NC_017622	GCTC	2	8	1824294	1824301	0 %	25 %	25 %	50 %	386589055
31465	NC_017622	TTC	2	6	1824349	1824354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589055
31466	NC_017622	CAAG	2	8	1824692	1824699	50 %	0 %	25 %	25 %	386589056
31467	NC_017622	CCT	2	6	1824785	1824790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589056
31468	NC_017622	ACC	2	6	1824960	1824965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589057
31469	NC_017622	ATCT	2	8	1824974	1824981	25 %	50 %	0 %	25 %	386589057
31470	NC_017622	AGC	2	6	1825020	1825025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589057
31471	NC_017622	CTC	2	6	1825078	1825083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589057
31472	NC_017622	CAAG	2	8	1825162	1825169	50 %	0 %	25 %	25 %	386589057
31473	NC_017622	GCACC	2	10	1825218	1825227	20 %	0 %	20 %	60 %	386589057
31474	NC_017622	CCA	2	6	1825273	1825278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589057
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31478	NC_017622	GCT	2	6	1825849	1825854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589058
31479	NC_017622	GTC	2	6	1825983	1825988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589058
31480	NC_017622	ATG	2	6	1825990	1825995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589058
31481	NC_017622	AAG	2	6	1826007	1826012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589058
31482	NC_017622	CAAG	2	8	1826042	1826049	50 %	0 %	25 %	25 %	386589058
31483	NC_017622	GAT	2	6	1826070	1826075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589058
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31485	NC_017622	CTG	2	6	1826105	1826110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589058
31486	NC_017622	CTT	2	6	1826129	1826134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589058
31487	NC_017622	GCT	2	6	1826137	1826142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589058
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31489	NC_017622	CAA	2	6	1826184	1826189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589058
31490	NC_017622	AAGA	2	8	1826297	1826304	75 %	0 %	25 %	0 %	386589058
31491	NC_017622	CAC	2	6	1826360	1826365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589058
31492	NC_017622	CAA	2	6	1826369	1826374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589058
31493	NC_017622	GCC	2	6	1826394	1826399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589058
31494	NC_017622	T	6	6	1826435	1826440	0 %	100 %	0 %	0 %	386589058
31495	NC_017622	CAAAG	2	10	1826445	1826454	60 %	0 %	20 %	20 %	386589058
31496	NC_017622	TTG	2	6	1826480	1826485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589058
31497	NC_017622	CTT	2	6	1826504	1826509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589058
31498	NC_017622	GCT	2	6	1826545	1826550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589058
31499	NC_017622	AGT	2	6	1826589	1826594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589058
31500	NC_017622	CAA	2	6	1826654	1826659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589058

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