MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 35165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017622	AGA	2	6	1107444	1107449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588333
19003	NC_017622	CTG	2	6	1107493	1107498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588333
19004	NC_017622	ATCTT	2	10	1107500	1107509	20 %	60 %	0 %	20 %	386588333
19005	NC_017622	TCA	2	6	1107593	1107598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588333
19006	NC_017622	CCT	2	6	1107636	1107641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386588334
19007	NC_017622	TAA	3	9	1107689	1107697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386588334
19008	NC_017622	GAC	2	6	1107768	1107773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588334
19009	NC_017622	ATCA	2	8	1107802	1107809	50 %	25 %	0 %	25 %	386588334
19010	NC_017622	GCATA	2	10	1107828	1107837	40 %	20 %	20 %	20 %	386588334
19011	NC_017622	TCA	2	6	1107857	1107862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588334
19012	NC_017622	AGA	2	6	1107919	1107924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588334
19013	NC_017622	CAT	2	6	1107945	1107950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588334
19014	NC_017622	AGT	2	6	1108002	1108007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588334
19015	NC_017622	TCA	2	6	1108112	1108117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588334
19016	NC_017622	CAT	2	6	1108194	1108199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588334
19017	NC_017622	CAT	2	6	1108245	1108250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588334
19018	NC_017622	CAAT	2	8	1108310	1108317	50 %	25 %	0 %	25 %	386588334
19019	NC_017622	TCT	2	6	1108331	1108336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588334
19020	NC_017622	CAG	2	6	1108404	1108409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588334
19021	NC_017622	TAC	2	6	1108437	1108442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588334
19022	NC_017622	ATG	2	6	1108495	1108500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588334
19023	NC_017622	AATTC	2	10	1108505	1108514	40 %	40 %	0 %	20 %	386588334
19024	NC_017622	TTTG	2	8	1108515	1108522	0 %	75 %	25 %	0 %	386588334
19025	NC_017622	AAGA	2	8	1108532	1108539	75 %	0 %	25 %	0 %	386588334
19026	NC_017622	T	6	6	1108550	1108555	0 %	100 %	0 %	0 %	386588334
19027	NC_017622	TTTCA	2	10	1108564	1108573	20 %	60 %	0 %	20 %	386588334
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19029	NC_017622	TAT	2	6	1108638	1108643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588334
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19031	NC_017622	CTT	2	6	1108752	1108757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588334
19032	NC_017622	CT	3	6	1108786	1108791	0 %	50 %	0 %	50 %	386588334
19033	NC_017622	T	7	7	1108791	1108797	0 %	100 %	0 %	0 %	386588334
19034	NC_017622	TCAA	2	8	1108808	1108815	50 %	25 %	0 %	25 %	386588334
19035	NC_017622	TCA	2	6	1108867	1108872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588335
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19037	NC_017622	ACCA	2	8	1108938	1108945	50 %	0 %	0 %	50 %	386588335
19038	NC_017622	ATC	2	6	1108956	1108961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588335
19039	NC_017622	ATC	2	6	1108990	1108995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588335
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19043	NC_017622	ACT	2	6	1109562	1109567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588336
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19047	NC_017622	CAT	2	6	1110009	1110014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588336
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19050	NC_017622	CTT	2	6	1110129	1110134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588336
19051	NC_017622	ACA	2	6	1110155	1110160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588336
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19053	NC_017622	T	6	6	1110204	1110209	0 %	100 %	0 %	0 %	386588336
19054	NC_017622	TAA	2	6	1110242	1110247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386588337
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19057	NC_017622	CAA	2	6	1110379	1110384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588337
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19059	NC_017622	CAA	2	6	1110438	1110443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588337
19060	NC_017622	TCA	2	6	1110447	1110452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588337
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19065	NC_017622	ATC	2	6	1110699	1110704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588337
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19101	NC_017622	TCA	2	6	1113835	1113840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588340
19102	NC_017622	T	6	6	1113903	1113908	0 %	100 %	0 %	0 %	386588340
19103	NC_017622	TCT	2	6	1113932	1113937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588340
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19106	NC_017622	CGC	2	6	1114120	1114125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386588340
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19109	NC_017622	ACC	2	6	1114199	1114204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386588340
19110	NC_017622	A	6	6	1114255	1114260	100 %	0 %	0 %	0 %	386588340
19111	NC_017622	GA	3	6	1114264	1114269	50 %	0 %	50 %	0 %	386588340
19112	NC_017622	CAT	2	6	1114315	1114320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588340
19113	NC_017622	CTA	2	6	1114336	1114341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588340
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19115	NC_017622	TTC	2	6	1114503	1114508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588340
19116	NC_017622	AT	3	6	1114539	1114544	50 %	50 %	0 %	0 %	386588340
19117	NC_017622	TGAGC	2	10	1114615	1114624	20 %	20 %	40 %	20 %	386588340
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19230	NC_017622	TG	3	6	1120414	1120419	0 %	50 %	50 %	0 %	386588351
19231	NC_017622	CAA	2	6	1120464	1120469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588351
19232	NC_017622	ACC	2	6	1120513	1120518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386588351
19233	NC_017622	AGG	2	6	1120553	1120558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386588351
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19235	NC_017622	AGC	2	6	1120666	1120671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588351
19236	NC_017622	ACC	2	6	1120699	1120704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386588351
19237	NC_017622	GCACGG	2	12	1120718	1120729	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386588351
19238	NC_017622	TTG	2	6	1120732	1120737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588351
19239	NC_017622	TTC	2	6	1120798	1120803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588351
19240	NC_017622	CTG	2	6	1120878	1120883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588351
19241	NC_017622	CTT	2	6	1120947	1120952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588351
19242	NC_017622	TCT	2	6	1120965	1120970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588351
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19257	NC_017622	GATT	2	8	1121818	1121825	25 %	50 %	25 %	0 %	386588351
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19331	NC_017622	AGT	2	6	1126074	1126079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588357
19332	NC_017622	TCT	2	6	1126097	1126102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588357
19333	NC_017622	TGC	3	9	1126138	1126146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588357
19334	NC_017622	TTC	2	6	1126228	1126233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588357
19335	NC_017622	GACCT	2	10	1126300	1126309	20 %	20 %	20 %	40 %	386588357
19336	NC_017622	TCT	2	6	1126424	1126429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588357
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19338	NC_017622	CCT	2	6	1126640	1126645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386588357
19339	NC_017622	CTTC	2	8	1126707	1126714	0 %	50 %	0 %	50 %	386588357
19340	NC_017622	AAT	2	6	1126725	1126730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386588357
19341	NC_017622	T	6	6	1126762	1126767	0 %	100 %	0 %	0 %	386588357
19342	NC_017622	GT	3	6	1126812	1126817	0 %	50 %	50 %	0 %	386588357
19343	NC_017622	TCA	2	6	1126838	1126843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588357
19344	NC_017622	CTT	2	6	1126855	1126860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588357
19345	NC_017622	TTG	2	6	1126898	1126903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588357
19346	NC_017622	GCC	2	6	1126907	1126912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386588357
19347	NC_017622	GTAT	2	8	1127038	1127045	25 %	50 %	25 %	0 %	386588357
19348	NC_017622	CTT	2	6	1127085	1127090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588357
19349	NC_017622	CGC	2	6	1127248	1127253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386588357
19350	NC_017622	CTT	2	6	1127259	1127264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588357
19351	NC_017622	GCT	2	6	1127294	1127299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588357
19352	NC_017622	TTC	2	6	1127489	1127494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588357
19353	NC_017622	CATAGA	2	12	1127502	1127513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386588357
19354	NC_017622	T	6	6	1127607	1127612	0 %	100 %	0 %	0 %	386588357
19355	NC_017622	TTC	2	6	1127695	1127700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588357
19356	NC_017622	GTT	2	6	1127712	1127717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588357
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19358	NC_017622	TTC	2	6	1128117	1128122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588358
19359	NC_017622	CTGC	2	8	1128164	1128171	0 %	25 %	25 %	50 %	386588358
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19367	NC_017622	AAAT	2	8	1128606	1128613	75 %	25 %	0 %	0 %	386588358
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19373	NC_017622	T	6	6	1128956	1128961	0 %	100 %	0 %	0 %	386588359
19374	NC_017622	CTGA	2	8	1129047	1129054	25 %	25 %	25 %	25 %	386588359
19375	NC_017622	CAT	2	6	1129062	1129067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588359
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19383	NC_017622	CTG	2	6	1129574	1129579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588359
19384	NC_017622	CTG	2	6	1129595	1129600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588359
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19451	NC_017622	A	6	6	1133161	1133166	100 %	0 %	0 %	0 %	386588363
19452	NC_017622	GAA	2	6	1133177	1133182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588363
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19455	NC_017622	CT	3	6	1133282	1133287	0 %	50 %	0 %	50 %	386588363
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19457	NC_017622	CTG	2	6	1133481	1133486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588363
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19462	NC_017622	GTG	2	6	1133748	1133753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386588363
19463	NC_017622	ACT	3	9	1133784	1133792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588363
19464	NC_017622	ACCA	2	8	1133864	1133871	50 %	0 %	0 %	50 %	386588363
19465	NC_017622	A	6	6	1133884	1133889	100 %	0 %	0 %	0 %	386588363
19466	NC_017622	CGTC	2	8	1133911	1133918	0 %	25 %	25 %	50 %	386588363
19467	NC_017622	TCA	2	6	1133925	1133930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588363
19468	NC_017622	A	6	6	1134060	1134065	100 %	0 %	0 %	0 %	386588363
19469	NC_017622	TCA	2	6	1134088	1134093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588363
19470	NC_017622	TGC	2	6	1134175	1134180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588364
19471	NC_017622	GTT	2	6	1134182	1134187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588364
19472	NC_017622	TTCA	2	8	1134218	1134225	25 %	50 %	0 %	25 %	386588364
19473	NC_017622	GATAT	2	10	1134321	1134330	40 %	40 %	20 %	0 %	386588364
19474	NC_017622	CTGA	2	8	1134389	1134396	25 %	25 %	25 %	25 %	386588364
19475	NC_017622	TCAT	2	8	1134429	1134436	25 %	50 %	0 %	25 %	386588364
19476	NC_017622	ATA	2	6	1134459	1134464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386588364
19477	NC_017622	TTC	2	6	1134479	1134484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588364
19478	NC_017622	CAA	2	6	1134520	1134525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588364
19479	NC_017622	GGT	4	12	1134542	1134553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386588364
19480	NC_017622	CAA	2	6	1134620	1134625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588364
19481	NC_017622	TGA	2	6	1134700	1134705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588364
19482	NC_017622	TAC	2	6	1134714	1134719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588364
19483	NC_017622	ATGG	2	8	1134770	1134777	25 %	25 %	50 %	0 %	386588364
19484	NC_017622	TTA	2	6	1134863	1134868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588364
19485	NC_017622	AGC	2	6	1134928	1134933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588364
19486	NC_017622	CTGGA	2	10	1134949	1134958	20 %	20 %	40 %	20 %	386588364
19487	NC_017622	GACT	2	8	1134970	1134977	25 %	25 %	25 %	25 %	386588364
19488	NC_017622	AG	3	6	1135017	1135022	50 %	0 %	50 %	0 %	386588364
19489	NC_017622	TGA	2	6	1135029	1135034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588365
19490	NC_017622	ATT	2	6	1135145	1135150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588365
19491	NC_017622	A	6	6	1135255	1135260	100 %	0 %	0 %	0 %	386588365
19492	NC_017622	A	6	6	1135297	1135302	100 %	0 %	0 %	0 %	386588365
19493	NC_017622	CGG	2	6	1135336	1135341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386588365
19494	NC_017622	TTC	2	6	1135438	1135443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588365
19495	NC_017622	TGG	2	6	1135488	1135493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386588365
19496	NC_017622	GCCA	2	8	1135503	1135510	25 %	0 %	25 %	50 %	386588365
19497	NC_017622	ATTG	2	8	1135561	1135568	25 %	50 %	25 %	0 %	386588365
19498	NC_017622	GAT	2	6	1135604	1135609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588365
19499	NC_017622	TAT	2	6	1135678	1135683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588365
19500	NC_017622	GTT	2	6	1135712	1135717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588365

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