MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 37167

< Previous12...63646566676869707172737475Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_017621	TAT	2	6	2174746	2174751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587272
37002	NC_017621	TAT	2	6	2174775	2174780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587272
37003	NC_017621	TAC	2	6	2174847	2174852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587272
37004	NC_017621	TA	3	6	2174958	2174963	50 %	50 %	0 %	0 %	386587272
37005	NC_017621	TAT	2	6	2175001	2175006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587272
37006	NC_017621	TGA	2	6	2175010	2175015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587272
37007	NC_017621	AAC	2	6	2175083	2175088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587272
37008	NC_017621	TACC	2	8	2175136	2175143	25 %	25 %	0 %	50 %	386587272
37009	NC_017621	AAC	2	6	2175167	2175172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587272
37010	NC_017621	TAT	2	6	2175176	2175181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587272
37011	NC_017621	GAAAT	2	10	2175221	2175230	60 %	20 %	20 %	0 %	386587273
37012	NC_017621	ATT	2	6	2175264	2175269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587273
37013	NC_017621	TCT	2	6	2175270	2175275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587273
37014	NC_017621	TAG	2	6	2175312	2175317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587273
37015	NC_017621	T	7	7	2175354	2175360	0 %	100 %	0 %	0 %	386587273
37016	NC_017621	CA	3	6	2175372	2175377	50 %	0 %	0 %	50 %	386587273
37017	NC_017621	T	6	6	2175433	2175438	0 %	100 %	0 %	0 %	386587273
37018	NC_017621	GATG	2	8	2175440	2175447	25 %	25 %	50 %	0 %	386587273
37019	NC_017621	ATG	2	6	2175468	2175473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587273
37020	NC_017621	GTA	2	6	2175548	2175553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587273
37021	NC_017621	TGA	2	6	2175562	2175567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587273
37022	NC_017621	AAG	2	6	2175596	2175601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587273
37023	NC_017621	CAG	2	6	2175680	2175685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587273
37024	NC_017621	TGA	2	6	2175784	2175789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587273
37025	NC_017621	CAT	2	6	2175799	2175804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587273
37026	NC_017621	AT	3	6	2175829	2175834	50 %	50 %	0 %	0 %	386587273
37027	NC_017621	AG	3	6	2175850	2175855	50 %	0 %	50 %	0 %	386587273
37028	NC_017621	CAT	2	6	2175862	2175867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587273
37029	NC_017621	TAA	3	9	2176166	2176174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587274
37030	NC_017621	TTA	2	6	2176192	2176197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587274
37031	NC_017621	AGA	2	6	2176238	2176243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587274
37032	NC_017621	ATA	2	6	2176299	2176304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587274
37033	NC_017621	TAA	2	6	2176307	2176312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587274
37034	NC_017621	CAG	2	6	2176363	2176368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587274
37035	NC_017621	TAT	2	6	2176448	2176453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587274
37036	NC_017621	CAT	2	6	2176661	2176666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587274
37037	NC_017621	AT	3	6	2176690	2176695	50 %	50 %	0 %	0 %	386587274
37038	NC_017621	TAA	2	6	2176787	2176792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587274
37039	NC_017621	CTA	2	6	2176911	2176916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587274
37040	NC_017621	AAT	2	6	2177076	2177081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587274
37041	NC_017621	CAA	2	6	2177092	2177097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587274
37042	NC_017621	TAT	2	6	2177098	2177103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587274
37043	NC_017621	TCA	3	9	2177182	2177190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587274
37044	NC_017621	CT	3	6	2177268	2177273	0 %	50 %	0 %	50 %	386587274
37045	NC_017621	T	6	6	2177314	2177319	0 %	100 %	0 %	0 %	386587274
37046	NC_017621	A	7	7	2177323	2177329	100 %	0 %	0 %	0 %	386587274
37047	NC_017621	ATG	2	6	2177368	2177373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587274
37048	NC_017621	AAAT	3	12	2177451	2177462	75 %	25 %	0 %	0 %	386587275
37049	NC_017621	ATT	2	6	2177510	2177515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587275
37050	NC_017621	GAA	2	6	2177542	2177547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587275
37051	NC_017621	ATGA	2	8	2177576	2177583	50 %	25 %	25 %	0 %	386587275
37052	NC_017621	CT	3	6	2177597	2177602	0 %	50 %	0 %	50 %	386587275
37053	NC_017621	TA	3	6	2177634	2177639	50 %	50 %	0 %	0 %	386587275
37054	NC_017621	ATT	2	6	2177645	2177650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587275
37055	NC_017621	CAAA	2	8	2177653	2177660	75 %	0 %	0 %	25 %	386587275
37056	NC_017621	GAG	2	6	2177709	2177714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587275
37057	NC_017621	CTA	2	6	2177733	2177738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587275
37058	NC_017621	AAT	2	6	2177781	2177786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587275
37059	NC_017621	A	6	6	2177875	2177880	100 %	0 %	0 %	0 %	386587276
37060	NC_017621	TGA	2	6	2177901	2177906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587276
37061	NC_017621	A	6	6	2177947	2177952	100 %	0 %	0 %	0 %	386587276
37062	NC_017621	TAAA	2	8	2178071	2178078	75 %	25 %	0 %	0 %	386587276
37063	NC_017621	A	6	6	2178076	2178081	100 %	0 %	0 %	0 %	386587276
37064	NC_017621	CAA	2	6	2178093	2178098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587276
37065	NC_017621	ATCA	2	8	2178184	2178191	50 %	25 %	0 %	25 %	386587276
37066	NC_017621	AGA	2	6	2178339	2178344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587276
37067	NC_017621	A	6	6	2178373	2178378	100 %	0 %	0 %	0 %	386587276
37068	NC_017621	TAA	2	6	2178396	2178401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587276
37069	NC_017621	TCT	2	6	2178432	2178437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587276
37070	NC_017621	TACA	2	8	2178439	2178446	50 %	25 %	0 %	25 %	386587276
37071	NC_017621	AAAACA	2	12	2178571	2178582	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386587276
37072	NC_017621	TGA	2	6	2178603	2178608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587276
37073	NC_017621	TCT	2	6	2178678	2178683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587276
37074	NC_017621	TCA	2	6	2178750	2178755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587276
37075	NC_017621	TTA	2	6	2178905	2178910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587276
37076	NC_017621	GAA	3	9	2178922	2178930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587276
37077	NC_017621	A	6	6	2178935	2178940	100 %	0 %	0 %	0 %	386587276
37078	NC_017621	ACCT	2	8	2179483	2179490	25 %	25 %	0 %	50 %	386587277
37079	NC_017621	T	6	6	2179501	2179506	0 %	100 %	0 %	0 %	386587277
37080	NC_017621	TAAT	2	8	2179521	2179528	50 %	50 %	0 %	0 %	386587277
37081	NC_017621	AT	3	6	2179527	2179532	50 %	50 %	0 %	0 %	386587277
37082	NC_017621	TTC	2	6	2179565	2179570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587277
37083	NC_017621	ATG	2	6	2179596	2179601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587277
37084	NC_017621	AGC	2	6	2179697	2179702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587277
37085	NC_017621	TCA	3	9	2179720	2179728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587277
37086	NC_017621	ATA	2	6	2179821	2179826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587277
37087	NC_017621	GA	3	6	2179830	2179835	50 %	0 %	50 %	0 %	386587277
37088	NC_017621	TAGT	2	8	2179840	2179847	25 %	50 %	25 %	0 %	386587277
37089	NC_017621	CAT	2	6	2179862	2179867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587277
37090	NC_017621	ACT	2	6	2179871	2179876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587277
37091	NC_017621	TGTT	2	8	2179895	2179902	0 %	75 %	25 %	0 %	386587277
37092	NC_017621	CTT	2	6	2179914	2179919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587277
37093	NC_017621	A	6	6	2179931	2179936	100 %	0 %	0 %	0 %	386587277
37094	NC_017621	A	6	6	2179949	2179954	100 %	0 %	0 %	0 %	386587277
37095	NC_017621	A	6	6	2180004	2180009	100 %	0 %	0 %	0 %	386587277
37096	NC_017621	ACC	2	6	2180054	2180059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587277
37097	NC_017621	ACT	2	6	2180182	2180187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587278
37098	NC_017621	CTG	2	6	2180204	2180209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587278
37099	NC_017621	TCA	2	6	2180287	2180292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587278
37100	NC_017621	T	7	7	2180305	2180311	0 %	100 %	0 %	0 %	386587278
37101	NC_017621	ACC	2	6	2180336	2180341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587278
37102	NC_017621	GAT	2	6	2180342	2180347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587278
37103	NC_017621	TTC	2	6	2180402	2180407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587278
37104	NC_017621	CTT	2	6	2180485	2180490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587278
37105	NC_017621	T	7	7	2180489	2180495	0 %	100 %	0 %	0 %	386587278
37106	NC_017621	T	6	6	2180536	2180541	0 %	100 %	0 %	0 %	386587278
37107	NC_017621	CTT	2	6	2180608	2180613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587278
37108	NC_017621	TTTC	2	8	2180623	2180630	0 %	75 %	0 %	25 %	386587278
37109	NC_017621	ATTTT	2	10	2180650	2180659	20 %	80 %	0 %	0 %	386587278
37110	NC_017621	A	6	6	2180857	2180862	100 %	0 %	0 %	0 %	386587279
37111	NC_017621	T	6	6	2180896	2180901	0 %	100 %	0 %	0 %	386587279
37112	NC_017621	TTC	2	6	2180932	2180937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587279
37113	NC_017621	CAA	2	6	2180950	2180955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587279
37114	NC_017621	ATA	2	6	2180993	2180998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587279
37115	NC_017621	CTA	2	6	2181008	2181013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587279
37116	NC_017621	TGT	2	6	2181042	2181047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587279
37117	NC_017621	TTA	2	6	2181053	2181058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587279
37118	NC_017621	CAA	2	6	2181075	2181080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587279
37119	NC_017621	ATC	2	6	2181111	2181116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587279
37120	NC_017621	GGGA	2	8	2181137	2181144	25 %	0 %	75 %	0 %	386587279
37121	NC_017621	A	6	6	2181160	2181165	100 %	0 %	0 %	0 %	386587279
37122	NC_017621	TTA	2	6	2181203	2181208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587279
37123	NC_017621	A	6	6	2181248	2181253	100 %	0 %	0 %	0 %	386587279
37124	NC_017621	TTG	2	6	2181266	2181271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587279
37125	NC_017621	CAG	2	6	2181311	2181316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587279
37126	NC_017621	CTG	2	6	2181326	2181331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587279
37127	NC_017621	TAT	2	6	2181432	2181437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587279
37128	NC_017621	ACAA	2	8	2181480	2181487	75 %	0 %	0 %	25 %	386587279
37129	NC_017621	CAAC	2	8	2181491	2181498	50 %	0 %	0 %	50 %	386587279
37130	NC_017621	ATG	2	6	2181659	2181664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587279
37131	NC_017621	TAT	2	6	2181672	2181677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587279
37132	NC_017621	A	6	6	2181689	2181694	100 %	0 %	0 %	0 %	386587279
37133	NC_017621	GAC	2	6	2181741	2181746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587279
37134	NC_017621	GTA	2	6	2181805	2181810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587279
37135	NC_017621	CT	3	6	2181920	2181925	0 %	50 %	0 %	50 %	386587279
37136	NC_017621	CTA	2	6	2181960	2181965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587279
37137	NC_017621	AAT	2	6	2181970	2181975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587279
37138	NC_017621	AAAC	2	8	2181979	2181986	75 %	0 %	0 %	25 %	386587279
37139	NC_017621	AGA	2	6	2182014	2182019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587279
37140	NC_017621	AAT	2	6	2182028	2182033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587279
37141	NC_017621	GAA	2	6	2182096	2182101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587280
37142	NC_017621	ATCC	2	8	2182126	2182133	25 %	25 %	0 %	50 %	386587280
37143	NC_017621	TGA	2	6	2182161	2182166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587280
37144	NC_017621	GCTC	2	8	2182182	2182189	0 %	25 %	25 %	50 %	386587280
37145	NC_017621	ATT	2	6	2182222	2182227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587280
37146	NC_017621	TCT	2	6	2182237	2182242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587280
37147	NC_017621	ATT	2	6	2182257	2182262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587280
37148	NC_017621	AAG	2	6	2182272	2182277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587280
37149	NC_017621	GACT	2	8	2182301	2182308	25 %	25 %	25 %	25 %	386587280
37150	NC_017621	CAG	2	6	2182316	2182321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587280
37151	NC_017621	AACT	2	8	2182331	2182338	50 %	25 %	0 %	25 %	386587280
37152	NC_017621	GAT	3	9	2182339	2182347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587280
37153	NC_017621	AGA	2	6	2182401	2182406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587280
37154	NC_017621	AGC	2	6	2182407	2182412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587280
37155	NC_017621	TAG	2	6	2182431	2182436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587280
37156	NC_017621	ATG	2	6	2182448	2182453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587280
37157	NC_017621	AT	3	6	2182485	2182490	50 %	50 %	0 %	0 %	386587280
37158	NC_017621	CTA	2	6	2182507	2182512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587280
37159	NC_017621	ATC	2	6	2182518	2182523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587280
37160	NC_017621	AGA	2	6	2182542	2182547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587280
37161	NC_017621	CG	3	6	2182569	2182574	0 %	0 %	50 %	50 %	386587280
37162	NC_017621	AGA	2	6	2182593	2182598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587280
37163	NC_017621	AAGC	2	8	2182600	2182607	50 %	0 %	25 %	25 %	386587280
37164	NC_017621	A	6	6	2182681	2182686	100 %	0 %	0 %	0 %	386587280
37165	NC_017621	AAC	2	6	2182700	2182705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587280
37166	NC_017621	AAG	2	6	2182774	2182779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587280
37167	NC_017621	CAA	2	6	2182842	2182847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587280

< Previous12...63646566676869707172737475Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.