MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 37167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017621	TAA	2	6	183038	183043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585368
3002	NC_017621	GTA	2	6	183048	183053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585368
3003	NC_017621	TTCT	2	8	183111	183118	0 %	75 %	0 %	25 %	386585368
3004	NC_017621	TTC	2	6	183126	183131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585368
3005	NC_017621	ATTT	2	8	183168	183175	25 %	75 %	0 %	0 %	386585368
3006	NC_017621	AGG	2	6	183302	183307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585368
3007	NC_017621	CTT	2	6	183355	183360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585368
3008	NC_017621	CTGG	2	8	183362	183369	0 %	25 %	50 %	25 %	386585368
3009	NC_017621	CTA	2	6	183401	183406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585368
3010	NC_017621	AGT	2	6	183410	183415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585368
3011	NC_017621	ATG	2	6	183426	183431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585368
3012	NC_017621	CCT	2	6	183443	183448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585368
3013	NC_017621	AAC	2	6	183457	183462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585368
3014	NC_017621	CCG	2	6	183473	183478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386585368
3015	NC_017621	TCA	2	6	183491	183496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585368
3016	NC_017621	TCTGG	2	10	183522	183531	0 %	40 %	40 %	20 %	386585368
3017	NC_017621	CTCAA	2	10	183658	183667	40 %	20 %	0 %	40 %	386585368
3018	NC_017621	GATG	2	8	183683	183690	25 %	25 %	50 %	0 %	386585368
3019	NC_017621	CATG	2	8	183722	183729	25 %	25 %	25 %	25 %	386585368
3020	NC_017621	CTT	2	6	183838	183843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585368
3021	NC_017621	TGA	2	6	183845	183850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585368
3022	NC_017621	ATT	2	6	183884	183889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585368
3023	NC_017621	A	7	7	183944	183950	100 %	0 %	0 %	0 %	386585368
3024	NC_017621	TAT	2	6	184007	184012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585368
3025	NC_017621	CTT	2	6	184046	184051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585368
3026	NC_017621	TTC	2	6	184054	184059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585368
3027	NC_017621	CTAT	2	8	184069	184076	25 %	50 %	0 %	25 %	386585368
3028	NC_017621	CGA	2	6	184078	184083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585368
3029	NC_017621	GAA	2	6	184185	184190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585368
3030	NC_017621	TGC	2	6	184210	184215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585368
3031	NC_017621	ATC	2	6	184230	184235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585368
3032	NC_017621	ACA	2	6	184240	184245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585368
3033	NC_017621	GACC	2	8	184247	184254	25 %	0 %	25 %	50 %	386585368
3034	NC_017621	GGA	2	6	184268	184273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585368
3035	NC_017621	A	7	7	184345	184351	100 %	0 %	0 %	0 %	386585368
3036	NC_017621	T	6	6	184417	184422	0 %	100 %	0 %	0 %	386585369
3037	NC_017621	GTC	2	6	184495	184500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585369
3038	NC_017621	AGC	2	6	184603	184608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585369
3039	NC_017621	CAT	2	6	184660	184665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585369
3040	NC_017621	TCA	2	6	184677	184682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585369
3041	NC_017621	AGA	2	6	184977	184982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585370
3042	NC_017621	TAT	2	6	185001	185006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585370
3043	NC_017621	GGAA	2	8	185042	185049	50 %	0 %	50 %	0 %	386585370
3044	NC_017621	A	6	6	185078	185083	100 %	0 %	0 %	0 %	386585370
3045	NC_017621	ATCA	2	8	185100	185107	50 %	25 %	0 %	25 %	386585370
3046	NC_017621	GTT	2	6	185131	185136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585370
3047	NC_017621	TTG	2	6	185162	185167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585370
3048	NC_017621	GTC	2	6	185252	185257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585370
3049	NC_017621	GCA	2	6	185335	185340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585370
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3051	NC_017621	TCT	2	6	185531	185536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585370
3052	NC_017621	GCCA	2	8	185538	185545	25 %	0 %	25 %	50 %	386585370
3053	NC_017621	AAG	2	6	185549	185554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585370
3054	NC_017621	GGT	2	6	185671	185676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585370
3055	NC_017621	CAG	2	6	185723	185728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585370
3056	NC_017621	CAC	2	6	185753	185758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585370
3057	NC_017621	TCA	2	6	185786	185791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585370
3058	NC_017621	AC	3	6	185834	185839	50 %	0 %	0 %	50 %	386585370
3059	NC_017621	ATG	2	6	185846	185851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585370
3060	NC_017621	CAT	2	6	186000	186005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585370
3061	NC_017621	TAT	2	6	186024	186029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585370
3062	NC_017621	CAA	2	6	186045	186050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585370
3063	NC_017621	GTG	2	6	186091	186096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585370
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3070	NC_017621	TAA	3	9	186698	186706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585371
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3080	NC_017621	ACTCCA	2	12	187014	187025	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386585371
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3486	NC_017621	GTA	2	6	210130	210135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585389
3487	NC_017621	ACA	2	6	210184	210189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585389
3488	NC_017621	ATG	2	6	210203	210208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585389
3489	NC_017621	AGC	2	6	210228	210233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585389
3490	NC_017621	AGCTC	2	10	210346	210355	20 %	20 %	20 %	40 %	386585389
3491	NC_017621	CAT	2	6	210414	210419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585389
3492	NC_017621	TGGT	2	8	212778	212785	0 %	50 %	50 %	0 %	386585390
3493	NC_017621	CAA	2	6	212806	212811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585390
3494	NC_017621	CAG	2	6	212815	212820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585390
3495	NC_017621	AGC	2	6	213149	213154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585390
3496	NC_017621	CAA	2	6	213163	213168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585390
3497	NC_017621	CTT	2	6	213190	213195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585390
3498	NC_017621	TCT	2	6	213204	213209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585390
3499	NC_017621	T	7	7	213209	213215	0 %	100 %	0 %	0 %	386585390
3500	NC_017621	ACA	2	6	213261	213266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585390

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