MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D9 chromosome

Total Repeats: 36698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_017620	TCA	2	6	1875028	1875033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584911
31503	NC_017620	AGCTAC	2	12	1875036	1875047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386584911
31504	NC_017620	TCA	2	6	1875223	1875228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584911
31505	NC_017620	CTGC	2	8	1875353	1875360	0 %	25 %	25 %	50 %	386584911
31506	NC_017620	TCTTT	2	10	1875380	1875389	0 %	80 %	0 %	20 %	386584911
31507	NC_017620	TCT	2	6	1875422	1875427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584912
31508	NC_017620	CTG	2	6	1875447	1875452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584912
31509	NC_017620	CTT	2	6	1875468	1875473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584912
31510	NC_017620	CAT	2	6	1875526	1875531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584912
31511	NC_017620	ACA	2	6	1875539	1875544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386584912
31512	NC_017620	TAA	2	6	1875582	1875587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584912
31513	NC_017620	CAC	2	6	1875606	1875611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386584912
31514	NC_017620	TCA	2	6	1875674	1875679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584912
31515	NC_017620	T	6	6	1875730	1875735	0 %	100 %	0 %	0 %	386584912
31516	NC_017620	CAC	2	6	1875738	1875743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386584912
31517	NC_017620	GTCTTC	2	12	1875847	1875858	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386584912
31518	NC_017620	GAA	2	6	1875882	1875887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386584912
31519	NC_017620	TTCTAA	2	12	1875967	1875978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386584912
31520	NC_017620	ATG	2	6	1876037	1876042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584912
31521	NC_017620	GCT	2	6	1876043	1876048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584912
31522	NC_017620	ATG	2	6	1876082	1876087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584912
31523	NC_017620	T	7	7	1876673	1876679	0 %	100 %	0 %	0 %	386584913
31524	NC_017620	T	6	6	1876709	1876714	0 %	100 %	0 %	0 %	386584913
31525	NC_017620	ACT	2	6	1876725	1876730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584913
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31527	NC_017620	CAAT	2	8	1876787	1876794	50 %	25 %	0 %	25 %	386584913
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31529	NC_017620	AAGA	2	8	1876891	1876898	75 %	0 %	25 %	0 %	386584913
31530	NC_017620	AG	4	8	1876942	1876949	50 %	0 %	50 %	0 %	386584913
31531	NC_017620	GAT	2	6	1876955	1876960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584913
31532	NC_017620	T	6	6	1876988	1876993	0 %	100 %	0 %	0 %	386584913
31533	NC_017620	CGA	2	6	1877008	1877013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584913
31534	NC_017620	ATG	2	6	1877014	1877019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584913
31535	NC_017620	CTA	2	6	1877021	1877026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584913
31536	NC_017620	AAT	2	6	1877052	1877057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584913
31537	NC_017620	CAA	2	6	1877195	1877200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386584913
31538	NC_017620	A	7	7	1877233	1877239	100 %	0 %	0 %	0 %	386584913
31539	NC_017620	AAT	2	6	1877292	1877297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584913
31540	NC_017620	ATCA	2	8	1877328	1877335	50 %	25 %	0 %	25 %	386584913
31541	NC_017620	AG	3	6	1877385	1877390	50 %	0 %	50 %	0 %	386584913
31542	NC_017620	TCC	2	6	1877415	1877420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584913
31543	NC_017620	TCG	2	6	1877471	1877476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584913
31544	NC_017620	CAT	2	6	1877525	1877530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584913
31545	NC_017620	AAGT	2	8	1877590	1877597	50 %	25 %	25 %	0 %	386584913
31546	NC_017620	TTAT	2	8	1877701	1877708	25 %	75 %	0 %	0 %	386584913
31547	NC_017620	TAA	2	6	1877798	1877803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584913
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31549	NC_017620	GA	3	6	1877952	1877957	50 %	0 %	50 %	0 %	386584914
31550	NC_017620	AGT	3	9	1878010	1878018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584914
31551	NC_017620	CCAT	2	8	1878021	1878028	25 %	25 %	0 %	50 %	386584914
31552	NC_017620	TA	3	6	1878031	1878036	50 %	50 %	0 %	0 %	386584914
31553	NC_017620	TTC	2	6	1878044	1878049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584914
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31555	NC_017620	GCTCCT	2	12	1878127	1878138	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386584914
31556	NC_017620	CTT	2	6	1878148	1878153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584914
31557	NC_017620	CTG	2	6	1878184	1878189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584914
31558	NC_017620	TCA	2	6	1878294	1878299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584914
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31560	NC_017620	CTC	2	6	1878440	1878445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584914
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31562	NC_017620	ATC	2	6	1878500	1878505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584914
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31592	NC_017620	AACA	2	8	1880151	1880158	75 %	0 %	0 %	25 %	386584916
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31598	NC_017620	TTC	2	6	1880475	1880480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584916
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31600	NC_017620	AAC	2	6	1880505	1880510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386584916
31601	NC_017620	CAA	2	6	1880514	1880519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386584916
31602	NC_017620	AGC	2	6	1880621	1880626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584916
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31604	NC_017620	TGAG	2	8	1880818	1880825	25 %	25 %	50 %	0 %	386584916
31605	NC_017620	GGT	2	6	1880835	1880840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386584916
31606	NC_017620	GCT	2	6	1880871	1880876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584916
31607	NC_017620	TCA	2	6	1880971	1880976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584916
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31612	NC_017620	ATC	2	6	1881313	1881318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584917
31613	NC_017620	TCC	2	6	1881347	1881352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584917
31614	NC_017620	GAC	2	6	1881435	1881440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584917
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