MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D9 chromosome

Total Repeats: 36698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_017620	TCC	2	6	1550628	1550633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584589
26003	NC_017620	CTAG	2	8	1550686	1550693	25 %	25 %	25 %	25 %	386584589
26004	NC_017620	AGG	2	6	1550870	1550875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386584589
26005	NC_017620	TAT	2	6	1550992	1550997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386584589
26006	NC_017620	AAG	2	6	1551150	1551155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386584590
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26008	NC_017620	TTTA	2	8	1551279	1551286	25 %	75 %	0 %	0 %	386584591
26009	NC_017620	CTT	2	6	1551322	1551327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584591
26010	NC_017620	AGCCTG	2	12	1551335	1551346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386584591
26011	NC_017620	TGA	2	6	1551381	1551386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584591
26012	NC_017620	GCT	2	6	1551432	1551437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584591
26013	NC_017620	CCA	2	6	1551459	1551464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386584591
26014	NC_017620	AG	3	6	1551598	1551603	50 %	0 %	50 %	0 %	386584591
26015	NC_017620	GAC	2	6	1551608	1551613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584591
26016	NC_017620	TTGCT	2	10	1551668	1551677	0 %	60 %	20 %	20 %	386584591
26017	NC_017620	T	6	6	1551701	1551706	0 %	100 %	0 %	0 %	386584591
26018	NC_017620	AGC	2	6	1551707	1551712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584591
26019	NC_017620	ACT	2	6	1551771	1551776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584591
26020	NC_017620	TCT	2	6	1551786	1551791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584591
26021	NC_017620	TAT	2	6	1552016	1552021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386584592
26022	NC_017620	GCA	2	6	1552286	1552291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584592
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26024	NC_017620	GTAA	2	8	1552414	1552421	50 %	25 %	25 %	0 %	386584592
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26028	NC_017620	GATA	2	8	1552618	1552625	50 %	25 %	25 %	0 %	386584593
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26035	NC_017620	ATA	2	6	1552768	1552773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584593
26036	NC_017620	CAGC	2	8	1552776	1552783	25 %	0 %	25 %	50 %	386584593
26037	NC_017620	TCC	2	6	1552816	1552821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584593
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26039	NC_017620	CAT	2	6	1552920	1552925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584593
26040	NC_017620	TAG	2	6	1552960	1552965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584593
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26048	NC_017620	ATG	2	6	1553267	1553272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584594
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26051	NC_017620	TC	3	6	1553552	1553557	0 %	50 %	0 %	50 %	386584595
26052	NC_017620	TTTTC	2	10	1553584	1553593	0 %	80 %	0 %	20 %	386584595
26053	NC_017620	T	6	6	1553615	1553620	0 %	100 %	0 %	0 %	386584595
26054	NC_017620	CGG	2	6	1553631	1553636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386584595
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26069	NC_017620	GAT	2	6	1554626	1554631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584595
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26085	NC_017620	TAG	2	6	1555901	1555906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584597
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26089	NC_017620	GAA	2	6	1556302	1556307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386584598
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26108	NC_017620	AT	3	6	1557247	1557252	50 %	50 %	0 %	0 %	386584599
26109	NC_017620	CTT	3	9	1557266	1557274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584599
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26115	NC_017620	TTTC	2	8	1557538	1557545	0 %	75 %	0 %	25 %	386584599
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26467	NC_017620	CTA	2	6	1581243	1581248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584620
26468	NC_017620	CTG	2	6	1581249	1581254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584620
26469	NC_017620	AAGCA	2	10	1581292	1581301	60 %	0 %	20 %	20 %	386584620
26470	NC_017620	T	6	6	1581358	1581363	0 %	100 %	0 %	0 %	386584620
26471	NC_017620	TAGA	2	8	1581366	1581373	50 %	25 %	25 %	0 %	386584620
26472	NC_017620	TGCAAT	2	12	1581391	1581402	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386584620
26473	NC_017620	AAT	2	6	1581406	1581411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584620
26474	NC_017620	CCT	2	6	1581505	1581510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584621
26475	NC_017620	GAT	2	6	1581548	1581553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584621
26476	NC_017620	TCA	2	6	1581562	1581567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584621
26477	NC_017620	ATG	2	6	1581775	1581780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584621
26478	NC_017620	TCC	2	6	1581810	1581815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584621
26479	NC_017620	CT	3	6	1581879	1581884	0 %	50 %	0 %	50 %	386584621
26480	NC_017620	TTC	2	6	1581900	1581905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584621
26481	NC_017620	TTTCA	2	10	1581918	1581927	20 %	60 %	0 %	20 %	386584621
26482	NC_017620	CTG	2	6	1581978	1581983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584621
26483	NC_017620	A	8	8	1582047	1582054	100 %	0 %	0 %	0 %	386584621
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26485	NC_017620	AATC	2	8	1582220	1582227	50 %	25 %	0 %	25 %	386584621
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26487	NC_017620	TCC	2	6	1582301	1582306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584622
26488	NC_017620	CCT	2	6	1582338	1582343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584622
26489	NC_017620	TTG	2	6	1582372	1582377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386584622
26490	NC_017620	CTC	2	6	1582381	1582386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386584622
26491	NC_017620	AATTT	2	10	1582391	1582400	40 %	60 %	0 %	0 %	386584622
26492	NC_017620	CTG	2	6	1582416	1582421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584622
26493	NC_017620	TCCA	2	8	1582447	1582454	25 %	25 %	0 %	50 %	386584622
26494	NC_017620	TCT	2	6	1582500	1582505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584622
26495	NC_017620	TAA	2	6	1582541	1582546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584622
26496	NC_017620	GAT	2	6	1583048	1583053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584623
26497	NC_017620	CAT	2	6	1583056	1583061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584623
26498	NC_017620	TCT	3	9	1583109	1583117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584623
26499	NC_017620	T	6	6	1583200	1583205	0 %	100 %	0 %	0 %	386584623
26500	NC_017620	TCT	2	6	1583259	1583264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584623

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