MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D9 chromosome

Total Repeats: 36698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25119	NC_017620	CTT	2	6	1502380	1502385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584539
25120	NC_017620	GAA	2	6	1502420	1502425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386584539
25121	NC_017620	GTC	2	6	1502426	1502431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584539
25122	NC_017620	ACCA	2	8	1502432	1502439	50 %	0 %	0 %	50 %	386584539
25123	NC_017620	TGA	2	6	1502518	1502523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584539
25124	NC_017620	TTC	2	6	1502543	1502548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584539
25125	NC_017620	CAG	2	6	1502581	1502586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584539
25126	NC_017620	ATG	2	6	1502670	1502675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584539
25127	NC_017620	CAG	2	6	1502698	1502703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584539
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25130	NC_017620	TTC	2	6	1502814	1502819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584539
25131	NC_017620	CTT	2	6	1502854	1502859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584539
25132	NC_017620	TGAA	2	8	1502860	1502867	50 %	25 %	25 %	0 %	386584539
25133	NC_017620	TGAG	2	8	1502918	1502925	25 %	25 %	50 %	0 %	386584539
25134	NC_017620	ACC	2	6	1502927	1502932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386584539
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25141	NC_017620	GTT	2	6	1503167	1503172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386584539
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25143	NC_017620	ACTTCA	2	12	1503312	1503323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584539
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25145	NC_017620	AAG	2	6	1503437	1503442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386584540
25146	NC_017620	A	6	6	1503455	1503460	100 %	0 %	0 %	0 %	386584540
25147	NC_017620	GAAA	2	8	1503475	1503482	75 %	0 %	25 %	0 %	386584540
25148	NC_017620	CCTT	2	8	1503494	1503501	0 %	50 %	0 %	50 %	386584540
25149	NC_017620	TAC	2	6	1503549	1503554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584541
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25152	NC_017620	AGT	2	6	1503664	1503669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584541
25153	NC_017620	GTC	2	6	1503673	1503678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584541
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25203	NC_017620	GCTAT	2	10	1505889	1505898	20 %	40 %	20 %	20 %	386584544
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25214	NC_017620	TCGA	2	8	1506449	1506456	25 %	25 %	25 %	25 %	386584545
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25216	NC_017620	CTG	2	6	1506526	1506531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584545
25217	NC_017620	T	7	7	1506550	1506556	0 %	100 %	0 %	0 %	386584545
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25219	NC_017620	CTT	2	6	1506619	1506624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584545
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25221	NC_017620	CTT	2	6	1506712	1506717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584545
25222	NC_017620	TAA	2	6	1506749	1506754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584545
25223	NC_017620	TAG	2	6	1506819	1506824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584546
25224	NC_017620	T	6	6	1506841	1506846	0 %	100 %	0 %	0 %	386584546
25225	NC_017620	TTC	2	6	1506908	1506913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584546
25226	NC_017620	TGC	2	6	1506917	1506922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584546
25227	NC_017620	TCATA	2	10	1507078	1507087	40 %	40 %	0 %	20 %	386584546
25228	NC_017620	CAA	2	6	1507100	1507105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386584546
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25230	NC_017620	AAG	2	6	1507182	1507187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386584546
25231	NC_017620	TTG	2	6	1507257	1507262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386584546
25232	NC_017620	GCT	2	6	1507336	1507341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584546
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25352	NC_017620	TGA	2	6	1514709	1514714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584551
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25468	NC_017620	TTA	2	6	1521421	1521426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386584558
25469	NC_017620	ACCA	2	8	1521480	1521487	50 %	0 %	0 %	50 %	386584558
25470	NC_017620	CTG	3	9	1521533	1521541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584558
25471	NC_017620	TTC	2	6	1521543	1521548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584558
25472	NC_017620	ATC	2	6	1521564	1521569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584558
25473	NC_017620	GCT	2	6	1522051	1522056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584559
25474	NC_017620	AAG	2	6	1522096	1522101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386584559
25475	NC_017620	TAA	2	6	1522141	1522146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584559
25476	NC_017620	GT	3	6	1522199	1522204	0 %	50 %	50 %	0 %	386584559
25477	NC_017620	CTT	2	6	1522238	1522243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584559
25478	NC_017620	AAC	2	6	1522248	1522253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386584559
25479	NC_017620	GTT	2	6	1522282	1522287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386584559
25480	NC_017620	GCT	2	6	1522288	1522293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584559
25481	NC_017620	CTT	2	6	1522304	1522309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386584559
25482	NC_017620	CTG	2	6	1522346	1522351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584559
25483	NC_017620	CTG	2	6	1522358	1522363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584559
25484	NC_017620	T	6	6	1522373	1522378	0 %	100 %	0 %	0 %	386584559
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25487	NC_017620	TGC	2	6	1522524	1522529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584559
25488	NC_017620	GTG	2	6	1522566	1522571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386584559
25489	NC_017620	CGTATG	2	12	1522613	1522624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386584559
25490	NC_017620	AAT	2	6	1522638	1522643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584559
25491	NC_017620	TAA	2	6	1522780	1522785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584560
25492	NC_017620	CAAAT	2	10	1522789	1522798	60 %	20 %	0 %	20 %	386584560
25493	NC_017620	AAT	2	6	1522800	1522805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584560
25494	NC_017620	GAC	2	6	1522858	1522863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386584560
25495	NC_017620	T	6	6	1522864	1522869	0 %	100 %	0 %	0 %	386584560
25496	NC_017620	TACTT	2	10	1522910	1522919	20 %	60 %	0 %	20 %	386584560
25497	NC_017620	ATA	2	6	1522943	1522948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386584560
25498	NC_017620	CTA	2	6	1522962	1522967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386584560
25499	NC_017620	CTG	2	6	1522969	1522974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386584560
25500	NC_017620	TAG	2	6	1522993	1522998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386584560

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