MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 36708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017619	TGGT	2	8	319120	319127	0 %	50 %	50 %	0 %	386581351
5502	NC_017619	ATT	2	6	319183	319188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581351
5503	NC_017619	AC	3	6	319289	319294	50 %	0 %	0 %	50 %	386581351
5504	NC_017619	GAA	2	6	319359	319364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581351
5505	NC_017619	TTG	2	6	319399	319404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581351
5506	NC_017619	AAT	2	6	319527	319532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581351
5507	NC_017619	TAAAA	2	10	319585	319594	80 %	20 %	0 %	0 %	386581351
5508	NC_017619	A	6	6	319621	319626	100 %	0 %	0 %	0 %	386581352
5509	NC_017619	GAA	2	6	319628	319633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5510	NC_017619	A	6	6	319632	319637	100 %	0 %	0 %	0 %	386581352
5511	NC_017619	GTT	2	6	319641	319646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581352
5512	NC_017619	GCC	2	6	319656	319661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386581352
5513	NC_017619	A	7	7	319723	319729	100 %	0 %	0 %	0 %	386581352
5514	NC_017619	GT	3	6	319732	319737	0 %	50 %	50 %	0 %	386581352
5515	NC_017619	ACT	2	6	319888	319893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581352
5516	NC_017619	CAT	2	6	319976	319981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581352
5517	NC_017619	CTATCT	2	12	320027	320038	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386581352
5518	NC_017619	AGA	2	6	320075	320080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5519	NC_017619	TCT	2	6	320103	320108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581352
5520	NC_017619	GCA	2	6	320127	320132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581352
5521	NC_017619	ACAGA	2	10	320155	320164	60 %	0 %	20 %	20 %	386581352
5522	NC_017619	A	6	6	320256	320261	100 %	0 %	0 %	0 %	386581352
5523	NC_017619	GCT	2	6	320286	320291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581352
5524	NC_017619	ATA	2	6	320356	320361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581352
5525	NC_017619	GGAT	2	8	320462	320469	25 %	25 %	50 %	0 %	386581352
5526	NC_017619	GAA	2	6	320495	320500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5527	NC_017619	GCA	2	6	320505	320510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581352
5528	NC_017619	AGA	2	6	320573	320578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5529	NC_017619	TCT	2	6	320619	320624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581352
5530	NC_017619	CAAG	2	8	320631	320638	50 %	0 %	25 %	25 %	386581352
5531	NC_017619	TGA	2	6	320873	320878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581352
5532	NC_017619	AAG	2	6	321085	321090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5533	NC_017619	GTT	2	6	321150	321155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581352
5534	NC_017619	TGA	2	6	321211	321216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581352
5535	NC_017619	AGCC	2	8	321301	321308	25 %	0 %	25 %	50 %	386581352
5536	NC_017619	TAT	2	6	321377	321382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581352
5537	NC_017619	CA	3	6	321385	321390	50 %	0 %	0 %	50 %	386581352
5538	NC_017619	CA	3	6	321597	321602	50 %	0 %	0 %	50 %	386581352
5539	NC_017619	AGA	2	6	321605	321610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5540	NC_017619	ATG	2	6	321649	321654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581352
5541	NC_017619	TCT	2	6	321661	321666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581352
5542	NC_017619	CGG	2	6	321667	321672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386581352
5543	NC_017619	AGG	2	6	321734	321739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581352
5544	NC_017619	AAGA	2	8	321759	321766	75 %	0 %	25 %	0 %	386581352
5545	NC_017619	AGA	2	6	321776	321781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5546	NC_017619	CTT	2	6	321801	321806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581352
5547	NC_017619	GAA	2	6	321822	321827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5548	NC_017619	CAG	2	6	321892	321897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581352
5549	NC_017619	GCA	2	6	321918	321923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581352
5550	NC_017619	ACA	2	6	321933	321938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581352
5551	NC_017619	CAG	2	6	322084	322089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581352
5552	NC_017619	TGG	2	6	322096	322101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581352
5553	NC_017619	ACA	2	6	322176	322181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581352
5554	NC_017619	CAG	2	6	322213	322218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581352
5555	NC_017619	GAA	2	6	322244	322249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5556	NC_017619	ATCACT	2	12	322333	322344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581352
5557	NC_017619	AAG	2	6	322379	322384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5558	NC_017619	AGA	2	6	322403	322408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5559	NC_017619	TAC	2	6	322428	322433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581352
5560	NC_017619	AGA	2	6	322511	322516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5561	NC_017619	GAA	2	6	322527	322532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5562	NC_017619	TGA	2	6	322535	322540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581352
5563	NC_017619	ATT	2	6	322545	322550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581352
5564	NC_017619	GAA	2	6	322554	322559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5565	NC_017619	AGA	2	6	322583	322588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5566	NC_017619	AGA	2	6	322604	322609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5567	NC_017619	ATG	2	6	322693	322698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581352
5568	NC_017619	AGCA	2	8	322700	322707	50 %	0 %	25 %	25 %	386581352
5569	NC_017619	GTT	2	6	322710	322715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581352
5570	NC_017619	AGA	2	6	322766	322771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581352
5571	NC_017619	A	6	6	322936	322941	100 %	0 %	0 %	0 %	386581353
5572	NC_017619	GAA	2	6	322980	322985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581353
5573	NC_017619	TGGA	2	8	323104	323111	25 %	25 %	50 %	0 %	386581353
5574	NC_017619	CGA	2	6	323174	323179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581353
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5576	NC_017619	GAT	2	6	323202	323207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581353
5577	NC_017619	AAG	2	6	323226	323231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581353
5578	NC_017619	TGA	3	9	323258	323266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581353
5579	NC_017619	ATG	2	6	323284	323289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581353
5580	NC_017619	ATC	2	6	323324	323329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581353
5581	NC_017619	GAT	2	6	323337	323342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581353
5582	NC_017619	GAC	2	6	323451	323456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581353
5583	NC_017619	GTC	2	6	323475	323480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581353
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5585	NC_017619	AGC	2	6	323741	323746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581354
5586	NC_017619	GAA	2	6	323765	323770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581354
5587	NC_017619	ACA	2	6	323949	323954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581354
5588	NC_017619	TCC	2	6	323974	323979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386581354
5589	NC_017619	CA	3	6	324028	324033	50 %	0 %	0 %	50 %	386581354
5590	NC_017619	TAC	2	6	324074	324079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581354
5591	NC_017619	TCA	3	9	324091	324099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581354
5592	NC_017619	GTGG	2	8	324105	324112	0 %	25 %	75 %	0 %	386581354
5593	NC_017619	ACA	2	6	324204	324209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581354
5594	NC_017619	AGC	2	6	324227	324232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581354
5595	NC_017619	CAACA	2	10	324253	324262	60 %	0 %	0 %	40 %	386581354
5596	NC_017619	AGC	2	6	324322	324327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581354
5597	NC_017619	CTG	2	6	324328	324333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581354
5598	NC_017619	CAG	2	6	324493	324498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581354
5599	NC_017619	A	6	6	324546	324551	100 %	0 %	0 %	0 %	386581354
5600	NC_017619	ATG	2	6	324640	324645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581354
5601	NC_017619	CAG	2	6	324685	324690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581354
5602	NC_017619	TGG	2	6	324737	324742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581354
5603	NC_017619	CACGT	2	10	324856	324865	20 %	20 %	20 %	40 %	386581354
5604	NC_017619	ATT	2	6	324921	324926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581354
5605	NC_017619	CAT	2	6	324929	324934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581354
5606	NC_017619	AGG	2	6	324962	324967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581354
5607	NC_017619	CAAG	2	8	324991	324998	50 %	0 %	25 %	25 %	386581354
5608	NC_017619	GCT	2	6	325023	325028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581354
5609	NC_017619	AAG	2	6	325039	325044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581354
5610	NC_017619	CATCGT	2	12	325059	325070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386581354
5611	NC_017619	TAA	2	6	325079	325084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581354
5612	NC_017619	GTTTT	2	10	325114	325123	0 %	80 %	20 %	0 %	386581354
5613	NC_017619	TTG	2	6	325159	325164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581354
5614	NC_017619	TTC	2	6	325182	325187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581354
5615	NC_017619	TGCC	2	8	325190	325197	0 %	25 %	25 %	50 %	386581354
5616	NC_017619	CAG	2	6	325261	325266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581354
5617	NC_017619	CAG	2	6	325900	325905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581355
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5619	NC_017619	TGG	2	6	325946	325951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581355
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