MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae INV104

Total Repeats: 34394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017591	GAAA	2	8	188	195	75 %	0 %	25 %	0 %	387625544
2	NC_017591	AAGA	2	8	229	236	75 %	0 %	25 %	0 %	387625544
3	NC_017591	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625544
4	NC_017591	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387625544
5	NC_017591	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625544
6	NC_017591	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625544
7	NC_017591	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625544
8	NC_017591	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	387625544
9	NC_017591	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387625544
10	NC_017591	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625544
11	NC_017591	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	387625544
12	NC_017591	A	6	6	704	709	100 %	0 %	0 %	0 %	387625544
13	NC_017591	AT	3	6	731	736	50 %	50 %	0 %	0 %	387625544
14	NC_017591	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625544
15	NC_017591	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625544
16	NC_017591	A	7	7	860	866	100 %	0 %	0 %	0 %	387625544
17	NC_017591	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625544
18	NC_017591	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387625544
19	NC_017591	A	8	8	1184	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	387625544
20	NC_017591	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625544
21	NC_017591	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625544
22	NC_017591	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	387625544
23	NC_017591	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	387625544
24	NC_017591	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	387625544
25	NC_017591	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	387625544
26	NC_017591	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	387625544
27	NC_017591	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625544
28	NC_017591	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625545
29	NC_017591	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	387625545
30	NC_017591	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625545
31	NC_017591	AG	3	6	1761	1766	50 %	0 %	50 %	0 %	387625545
32	NC_017591	A	7	7	1884	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	387625545
33	NC_017591	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625545
34	NC_017591	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625545
35	NC_017591	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625545
36	NC_017591	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625545
37	NC_017591	AGCA	2	8	2095	2102	50 %	0 %	25 %	25 %	387625545
38	NC_017591	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625545
39	NC_017591	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625545
40	NC_017591	AG	3	6	2173	2178	50 %	0 %	50 %	0 %	387625545
41	NC_017591	A	6	6	2267	2272	100 %	0 %	0 %	0 %	387625545
42	NC_017591	A	7	7	2283	2289	100 %	0 %	0 %	0 %	387625545
43	NC_017591	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625545
44	NC_017591	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625545
45	NC_017591	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625545
46	NC_017591	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625545
47	NC_017591	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	387625545
48	NC_017591	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625545
49	NC_017591	ACTT	2	8	2699	2706	25 %	50 %	0 %	25 %	387625545
50	NC_017591	GATT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	25 %	0 %	387625545
51	NC_017591	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625545
52	NC_017591	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625546
53	NC_017591	A	6	6	2937	2942	100 %	0 %	0 %	0 %	387625546
54	NC_017591	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	387625546
55	NC_017591	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625546
56	NC_017591	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625546
57	NC_017591	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625546
58	NC_017591	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
59	NC_017591	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
60	NC_017591	CGA	2	6	3288	3293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
61	NC_017591	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387625547
62	NC_017591	AACT	2	8	3342	3349	50 %	25 %	0 %	25 %	387625547
63	NC_017591	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625547
64	NC_017591	AATT	2	8	3588	3595	50 %	50 %	0 %	0 %	387625547
65	NC_017591	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625547
66	NC_017591	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
67	NC_017591	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
68	NC_017591	CAAA	2	8	3865	3872	75 %	0 %	0 %	25 %	387625547
69	NC_017591	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625547
70	NC_017591	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
71	NC_017591	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625547
72	NC_017591	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	387625547
73	NC_017591	CTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	387625547
74	NC_017591	ACTT	2	8	4049	4056	25 %	50 %	0 %	25 %	387625547
75	NC_017591	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
76	NC_017591	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387625547
77	NC_017591	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
78	NC_017591	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625547
79	NC_017591	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
80	NC_017591	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
81	NC_017591	AT	3	6	4252	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	387625547
82	NC_017591	CAT	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625547
83	NC_017591	AAAT	2	8	4365	4372	75 %	25 %	0 %	0 %	387625548
84	NC_017591	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	387625548
85	NC_017591	TTGA	2	8	4446	4453	25 %	50 %	25 %	0 %	387625548
86	NC_017591	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625548
87	NC_017591	AC	3	6	4485	4490	50 %	0 %	0 %	50 %	387625548
88	NC_017591	A	6	6	4537	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	387625548
89	NC_017591	ATGA	2	8	4569	4576	50 %	25 %	25 %	0 %	387625548
90	NC_017591	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625548
91	NC_017591	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625548
92	NC_017591	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625548
93	NC_017591	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625548
94	NC_017591	ATTGGA	2	12	4767	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625548
95	NC_017591	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625548
96	NC_017591	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625548
97	NC_017591	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625548
98	NC_017591	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
99	NC_017591	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	387625549
100	NC_017591	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625549
101	NC_017591	TTGCAA	2	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625549
102	NC_017591	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
103	NC_017591	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
104	NC_017591	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387625549
105	NC_017591	A	6	6	5227	5232	100 %	0 %	0 %	0 %	387625549
106	NC_017591	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	387625549
107	NC_017591	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625549
108	NC_017591	GATT	2	8	5314	5321	25 %	50 %	25 %	0 %	387625549
109	NC_017591	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
110	NC_017591	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387625549
111	NC_017591	T	6	6	5523	5528	0 %	100 %	0 %	0 %	387625549
112	NC_017591	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
113	NC_017591	GAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	25 %	0 %	387625549
114	NC_017591	GA	3	6	5630	5635	50 %	0 %	50 %	0 %	387625549
115	NC_017591	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
116	NC_017591	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
117	NC_017591	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
118	NC_017591	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
119	NC_017591	A	6	6	5973	5978	100 %	0 %	0 %	0 %	387625549
120	NC_017591	TCAAT	2	10	6047	6056	40 %	40 %	0 %	20 %	387625549
121	NC_017591	TTTTC	2	10	6087	6096	0 %	80 %	0 %	20 %	387625549
122	NC_017591	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
123	NC_017591	A	7	7	6120	6126	100 %	0 %	0 %	0 %	387625549
124	NC_017591	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
125	NC_017591	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387625549
126	NC_017591	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625549
127	NC_017591	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387625549
128	NC_017591	AG	3	6	6380	6385	50 %	0 %	50 %	0 %	387625549
129	NC_017591	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625549
130	NC_017591	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625549
131	NC_017591	AT	3	6	6569	6574	50 %	50 %	0 %	0 %	387625549
132	NC_017591	TAAAT	2	10	6605	6614	60 %	40 %	0 %	0 %	387625549
133	NC_017591	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
134	NC_017591	ACTCT	2	10	6686	6695	20 %	40 %	0 %	40 %	387625549
135	NC_017591	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
136	NC_017591	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
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269	NC_017591	ATG	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625556
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