MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 60726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017583	GTA	2	6	153808	153813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345879
4002	NC_017583	GTC	2	6	153817	153822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345879
4003	NC_017583	CCGA	2	8	153953	153960	25 %	0 %	25 %	50 %	386345879
4004	NC_017583	ATG	2	6	153965	153970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345879
4005	NC_017583	CCG	2	6	154052	154057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345879
4006	NC_017583	GA	3	6	154103	154108	50 %	0 %	50 %	0 %	386345879
4007	NC_017583	CCT	2	6	154128	154133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345879
4008	NC_017583	AGG	3	9	154194	154202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345879
4009	NC_017583	AGGAG	2	10	154224	154233	40 %	0 %	60 %	0 %	386345879
4010	NC_017583	GAC	2	6	154234	154239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345879
4011	NC_017583	GAAG	2	8	154248	154255	50 %	0 %	50 %	0 %	386345879
4012	NC_017583	GAG	3	9	154270	154278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345879
4013	NC_017583	ATC	2	6	154304	154309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345879
4014	NC_017583	GCG	2	6	154453	154458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345880
4015	NC_017583	TGG	2	6	154466	154471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345880
4016	NC_017583	GAC	2	6	154491	154496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345880
4017	NC_017583	CCG	2	6	154502	154507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345880
4018	NC_017583	TGC	2	6	154514	154519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345880
4019	NC_017583	GAG	3	9	154522	154530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345880
4020	NC_017583	GAG	2	6	154597	154602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345880
4021	NC_017583	CTC	2	6	154639	154644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345880
4022	NC_017583	CCT	3	9	154653	154661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345880
4023	NC_017583	CTC	2	6	154705	154710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345880
4024	NC_017583	GAG	2	6	154711	154716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345880
4025	NC_017583	CTC	2	6	154753	154758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345880
4026	NC_017583	AGA	2	6	154776	154781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345880
4027	NC_017583	TC	3	6	154863	154868	0 %	50 %	0 %	50 %	386345880
4028	NC_017583	GAA	2	6	154869	154874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345880
4029	NC_017583	CAC	2	6	154902	154907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345880
4030	NC_017583	TGG	2	6	154934	154939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345880
4031	NC_017583	GGC	2	6	154989	154994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345880
4032	NC_017583	ACT	2	6	155144	155149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345880
4033	NC_017583	CG	3	6	155155	155160	0 %	0 %	50 %	50 %	386345880
4034	NC_017583	GGA	2	6	155199	155204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345880
4035	NC_017583	TC	3	6	155205	155210	0 %	50 %	0 %	50 %	386345880
4036	NC_017583	CG	3	6	155212	155217	0 %	0 %	50 %	50 %	386345880
4037	NC_017583	TCC	2	6	155219	155224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345880
4038	NC_017583	ACG	2	6	155270	155275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345880
4039	NC_017583	GAT	2	6	155283	155288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345880
4040	NC_017583	AGG	2	6	155291	155296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345880
4041	NC_017583	ACT	2	6	155336	155341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345880
4042	NC_017583	TCC	2	6	155453	155458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345880
4043	NC_017583	GAC	2	6	155488	155493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345880
4044	NC_017583	GAT	2	6	155496	155501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345880
4045	NC_017583	GGA	2	6	155519	155524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345880
4046	NC_017583	CTA	2	6	155550	155555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345880
4047	NC_017583	TAC	2	6	155569	155574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345880
4048	NC_017583	CTT	2	6	155652	155657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345880
4049	NC_017583	AGG	2	6	155678	155683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345880
4050	NC_017583	CGT	2	6	155762	155767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345880
4051	NC_017583	ATG	2	6	155863	155868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345881
4052	NC_017583	GGT	2	6	155927	155932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345881
4053	NC_017583	GACGA	2	10	156015	156024	40 %	0 %	40 %	20 %	386345881
4054	NC_017583	GTG	3	9	156036	156044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345881
4055	NC_017583	ACC	2	6	156106	156111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345881
4056	NC_017583	C	8	8	156223	156230	0 %	0 %	0 %	100 %	386345881
4057	NC_017583	TC	3	6	156344	156349	0 %	50 %	0 %	50 %	386345881
4058	NC_017583	CCG	2	6	156435	156440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345881
4059	NC_017583	TTCGTG	2	12	156447	156458	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386345881
4060	NC_017583	GAG	2	6	156470	156475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345881
4061	NC_017583	TCC	2	6	156505	156510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345881
4062	NC_017583	GGGACG	2	12	156547	156558	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386345881
4063	NC_017583	GAG	2	6	156575	156580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345881
4064	NC_017583	GGC	2	6	156589	156594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345881
4065	NC_017583	TGG	2	6	156607	156612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345881
4066	NC_017583	GAG	2	6	156643	156648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345881
4067	NC_017583	TGGG	2	8	156661	156668	0 %	25 %	75 %	0 %	386345881
4068	NC_017583	GGT	2	6	156728	156733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345881
4069	NC_017583	ACG	2	6	156761	156766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345882
4070	NC_017583	TGG	2	6	156810	156815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345882
4071	NC_017583	GGA	2	6	156844	156849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4072	NC_017583	GAG	2	6	156869	156874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4073	NC_017583	GATC	2	8	156898	156905	25 %	25 %	25 %	25 %	386345882
4074	NC_017583	AGG	2	6	156930	156935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4075	NC_017583	GGT	2	6	156939	156944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345882
4076	NC_017583	GGGAG	2	10	156972	156981	20 %	0 %	80 %	0 %	386345882
4077	NC_017583	TCCTC	2	10	157008	157017	0 %	40 %	0 %	60 %	386345882
4078	NC_017583	GGA	2	6	157026	157031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4079	NC_017583	GAG	2	6	157061	157066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4080	NC_017583	GAG	2	6	157091	157096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4081	NC_017583	CGC	2	6	157192	157197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345882
4082	NC_017583	GAG	2	6	157238	157243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4083	NC_017583	ATG	2	6	157280	157285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345882
4084	NC_017583	GAG	2	6	157286	157291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4085	NC_017583	AGG	2	6	157317	157322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4086	NC_017583	CGA	2	6	157330	157335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345882
4087	NC_017583	GGA	2	6	157356	157361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345882
4088	NC_017583	TGG	5	15	157386	157400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345882
4089	NC_017583	GGGCA	2	10	157401	157410	20 %	0 %	60 %	20 %	386345882
4090	NC_017583	TCC	2	6	157489	157494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345882
4091	NC_017583	CGG	2	6	157533	157538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345882
4092	NC_017583	CGGG	2	8	157557	157564	0 %	0 %	75 %	25 %	386345882
4093	NC_017583	GTG	2	6	157565	157570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345882
4094	NC_017583	GGT	2	6	157586	157591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345882
4095	NC_017583	TCC	2	6	157602	157607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345882
4096	NC_017583	TGGG	2	8	157610	157617	0 %	25 %	75 %	0 %	386345882
4097	NC_017583	G	6	6	157625	157630	0 %	0 %	100 %	0 %	386345882
4098	NC_017583	GGCG	2	8	157654	157661	0 %	0 %	75 %	25 %	386345882
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4100	NC_017583	GTG	2	6	157721	157726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345882
4101	NC_017583	TGG	2	6	157749	157754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345882
4102	NC_017583	CCT	2	6	157812	157817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345882
4103	NC_017583	TTC	2	6	157826	157831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345882
4104	NC_017583	TCC	2	6	157851	157856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345882
4105	NC_017583	TTC	3	9	157862	157870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345882
4106	NC_017583	G	6	6	157930	157935	0 %	0 %	100 %	0 %	386345882
4107	NC_017583	TCC	2	6	157948	157953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345883
4108	NC_017583	CTC	2	6	157974	157979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345883
4109	NC_017583	GGT	2	6	157997	158002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345883
4110	NC_017583	TC	3	6	158026	158031	0 %	50 %	0 %	50 %	386345883
4111	NC_017583	G	6	6	158050	158055	0 %	0 %	100 %	0 %	386345883
4112	NC_017583	CTC	2	6	158082	158087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345883
4113	NC_017583	CCT	3	9	158117	158125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345883
4114	NC_017583	GTG	3	9	158181	158189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345883
4115	NC_017583	G	6	6	158192	158197	0 %	0 %	100 %	0 %	386345883
4116	NC_017583	CCGG	2	8	158217	158224	0 %	0 %	50 %	50 %	386345883
4117	NC_017583	GTG	2	6	158238	158243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345883
4118	NC_017583	CG	3	6	158249	158254	0 %	0 %	50 %	50 %	386345883
4119	NC_017583	GGGC	2	8	158261	158268	0 %	0 %	75 %	25 %	386345883
4120	NC_017583	G	7	7	158309	158315	0 %	0 %	100 %	0 %	386345883
4121	NC_017583	GT	3	6	158317	158322	0 %	50 %	50 %	0 %	386345883
4122	NC_017583	GAT	2	6	158348	158353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345883
4123	NC_017583	GAG	2	6	158382	158387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345883
4124	NC_017583	GTG	3	9	158388	158396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345883
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4239	NC_017583	GCCG	2	8	162133	162140	0 %	0 %	50 %	50 %	386345885
4240	NC_017583	TGG	4	12	162144	162155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345885
4241	NC_017583	TCGC	2	8	162164	162171	0 %	25 %	25 %	50 %	386345885
4242	NC_017583	GTG	2	6	162242	162247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345885
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4244	NC_017583	TGG	2	6	162279	162284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345885
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4247	NC_017583	G	6	6	162326	162331	0 %	0 %	100 %	0 %	386345885
4248	NC_017583	G	6	6	162347	162352	0 %	0 %	100 %	0 %	386345886
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4365	NC_017583	GA	3	6	166445	166450	50 %	0 %	50 %	0 %	386345889
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4367	NC_017583	TGGG	2	8	166510	166517	0 %	25 %	75 %	0 %	386345889
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4493	NC_017583	TGA	2	6	171831	171836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345895
4494	NC_017583	AT	3	6	171838	171843	50 %	50 %	0 %	0 %	386345895
4495	NC_017583	TCC	2	6	171900	171905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345895
4496	NC_017583	CGA	2	6	171981	171986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345895
4497	NC_017583	GAA	2	6	171988	171993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345895
4498	NC_017583	GGAG	2	8	172017	172024	25 %	0 %	75 %	0 %	386345895
4499	NC_017583	GAC	2	6	172069	172074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345895
4500	NC_017583	AGA	2	6	172208	172213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345895

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