MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 60726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017583	CCA	2	6	39582	39587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345792
1002	NC_017583	ACC	2	6	39590	39595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345792
1003	NC_017583	GGGCGA	2	12	39609	39620	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386345792
1004	NC_017583	GA	3	6	39640	39645	50 %	0 %	50 %	0 %	386345792
1005	NC_017583	CCT	2	6	39656	39661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345792
1006	NC_017583	G	6	6	39710	39715	0 %	0 %	100 %	0 %	386345793
1007	NC_017583	GAG	2	6	39750	39755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345793
1008	NC_017583	GGT	2	6	39786	39791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345793
1009	NC_017583	G	6	6	39808	39813	0 %	0 %	100 %	0 %	386345793
1010	NC_017583	GGAGA	2	10	39825	39834	40 %	0 %	60 %	0 %	386345793
1011	NC_017583	GTC	2	6	39893	39898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345793
1012	NC_017583	GAG	3	9	39948	39956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345793
1013	NC_017583	GGCCG	2	10	39957	39966	0 %	0 %	60 %	40 %	386345793
1014	NC_017583	AGG	2	6	39976	39981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345793
1015	NC_017583	GGA	2	6	40019	40024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345793
1016	NC_017583	AGAAAG	2	12	40027	40038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345793
1017	NC_017583	AGAA	2	8	40072	40079	75 %	0 %	25 %	0 %	386345793
1018	NC_017583	CAT	2	6	40089	40094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345793
1019	NC_017583	CA	3	6	40183	40188	50 %	0 %	0 %	50 %	386345794
1020	NC_017583	GGT	2	6	40198	40203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345794
1021	NC_017583	GAT	2	6	40204	40209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345794
1022	NC_017583	A	6	6	40211	40216	100 %	0 %	0 %	0 %	386345794
1023	NC_017583	TGG	2	6	40241	40246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345794
1024	NC_017583	GGA	2	6	40247	40252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
1025	NC_017583	TCC	3	9	40254	40262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345794
1026	NC_017583	CTC	2	6	40331	40336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345794
1027	NC_017583	TC	4	8	40335	40342	0 %	50 %	0 %	50 %	386345794
1028	NC_017583	TTC	2	6	40401	40406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345794
1029	NC_017583	GAT	2	6	40442	40447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345794
1030	NC_017583	TC	3	6	40486	40491	0 %	50 %	0 %	50 %	386345794
1031	NC_017583	ACC	2	6	40496	40501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345794
1032	NC_017583	CGG	2	6	40552	40557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345794
1033	NC_017583	ATGTGG	2	12	40569	40580	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386345794
1034	NC_017583	CG	3	6	40610	40615	0 %	0 %	50 %	50 %	386345794
1035	NC_017583	TC	3	6	40669	40674	0 %	50 %	0 %	50 %	386345794
1036	NC_017583	CGA	2	6	40678	40683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345794
1037	NC_017583	ACCATC	2	12	40724	40735	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386345794
1038	NC_017583	G	7	7	40740	40746	0 %	0 %	100 %	0 %	386345794
1039	NC_017583	ATC	2	6	40781	40786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345794
1040	NC_017583	TTCC	2	8	40811	40818	0 %	50 %	0 %	50 %	386345794
1041	NC_017583	ATC	2	6	40844	40849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345794
1042	NC_017583	GAG	2	6	40880	40885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
1043	NC_017583	CTC	2	6	40922	40927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345794
1044	NC_017583	AGG	2	6	40948	40953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
1045	NC_017583	CTC	2	6	40955	40960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345794
1046	NC_017583	TCT	2	6	40986	40991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345794
1047	NC_017583	GAG	2	6	41015	41020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
1048	NC_017583	TAT	2	6	41048	41053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386345794
1049	NC_017583	TGG	2	6	41070	41075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345794
1050	NC_017583	TGG	2	6	41091	41096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345794
1051	NC_017583	CGG	2	6	41121	41126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345794
1052	NC_017583	GGGGA	2	10	41158	41167	20 %	0 %	80 %	0 %	386345794
1053	NC_017583	GA	3	6	41178	41183	50 %	0 %	50 %	0 %	386345794
1054	NC_017583	CAG	2	6	41207	41212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345794
1055	NC_017583	AGG	2	6	41230	41235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
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1057	NC_017583	GGA	3	9	41317	41325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
1058	NC_017583	CTC	2	6	41363	41368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345794
1059	NC_017583	GGA	2	6	41376	41381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
1060	NC_017583	GTG	2	6	41393	41398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345794
1061	NC_017583	GAG	2	6	41420	41425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
1062	NC_017583	GGT	2	6	41509	41514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345794
1063	NC_017583	TCC	2	6	41530	41535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345794
1064	NC_017583	AGG	2	6	41568	41573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345794
1065	NC_017583	TCC	2	6	41583	41588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345794
1066	NC_017583	GA	3	6	41639	41644	50 %	0 %	50 %	0 %	386345795
1067	NC_017583	TCA	2	6	41660	41665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345795
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1069	NC_017583	GAG	2	6	41704	41709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345795
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1071	NC_017583	CGG	2	6	41741	41746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345795
1072	NC_017583	GGC	2	6	41763	41768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345795
1073	NC_017583	CAGG	2	8	41804	41811	25 %	0 %	50 %	25 %	386345795
1074	NC_017583	TCG	2	6	41879	41884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345795
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1081	NC_017583	CCA	2	6	42156	42161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345796
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1084	NC_017583	TC	3	6	42238	42243	0 %	50 %	0 %	50 %	386345796
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1087	NC_017583	CCTT	2	8	42312	42319	0 %	50 %	0 %	50 %	386345796
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1092	NC_017583	GTG	2	6	42448	42453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345796
1093	NC_017583	GGA	2	6	42486	42491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345796
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1095	NC_017583	GAAG	2	8	42647	42654	50 %	0 %	50 %	0 %	386345796
1096	NC_017583	GAG	2	6	42667	42672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345796
1097	NC_017583	TAT	2	6	42739	42744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386345796
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1100	NC_017583	CTC	2	6	42857	42862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345797
1101	NC_017583	CTG	2	6	42887	42892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345797
1102	NC_017583	TGA	2	6	42922	42927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345797
1103	NC_017583	GA	3	6	42926	42931	50 %	0 %	50 %	0 %	386345797
1104	NC_017583	TGG	2	6	42993	42998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345797
1105	NC_017583	C	6	6	43044	43049	0 %	0 %	0 %	100 %	386345797
1106	NC_017583	GGT	2	6	43054	43059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345797
1107	NC_017583	CCT	2	6	43100	43105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345797
1108	NC_017583	CTC	2	6	43159	43164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345797
1109	NC_017583	TGG	2	6	43200	43205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345797
1110	NC_017583	TGG	2	6	43248	43253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345797
1111	NC_017583	GACGGG	2	12	43288	43299	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386345797
1112	NC_017583	TCC	2	6	43320	43325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345797
1113	NC_017583	TC	4	8	43330	43337	0 %	50 %	0 %	50 %	386345797
1114	NC_017583	AGG	2	6	43340	43345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345797
1115	NC_017583	TCC	2	6	43381	43386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345797
1116	NC_017583	CT	3	6	43387	43392	0 %	50 %	0 %	50 %	386345797
1117	NC_017583	GAG	2	6	43418	43423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345797
1118	NC_017583	GGC	2	6	43446	43451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345797
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1121	NC_017583	TCC	2	6	43533	43538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345797
1122	NC_017583	GGA	2	6	43546	43551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345797
1123	NC_017583	GTGTG	2	10	43602	43611	0 %	40 %	60 %	0 %	386345797
1124	NC_017583	CCAC	2	8	43614	43621	25 %	0 %	0 %	75 %	386345797
1125	NC_017583	C	7	7	43703	43709	0 %	0 %	0 %	100 %	386345797
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