MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 60726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017583	GAGG	2	8	575446	575453	25 %	0 %	75 %	0 %	386346227
14002	NC_017583	CAC	3	9	575476	575484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386346227
14003	NC_017583	AGG	2	6	575529	575534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346227
14004	NC_017583	AGC	2	6	575602	575607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346227
14005	NC_017583	GTG	2	6	575666	575671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346227
14006	NC_017583	GCC	2	6	575727	575732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346227
14007	NC_017583	GAT	2	6	575738	575743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346227
14008	NC_017583	G	6	6	575829	575834	0 %	0 %	100 %	0 %	386346227
14009	NC_017583	ATC	2	6	575850	575855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346227
14010	NC_017583	TGA	2	6	575895	575900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346227
14011	NC_017583	TC	3	6	575916	575921	0 %	50 %	0 %	50 %	386346227
14012	NC_017583	GCA	2	6	575953	575958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346227
14013	NC_017583	GAC	2	6	576044	576049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346227
14014	NC_017583	GCGG	2	8	576076	576083	0 %	0 %	75 %	25 %	386346227
14015	NC_017583	TCG	2	6	576087	576092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346227
14016	NC_017583	GCA	2	6	576107	576112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346227
14017	NC_017583	G	6	6	576126	576131	0 %	0 %	100 %	0 %	386346227
14018	NC_017583	AG	3	6	576172	576177	50 %	0 %	50 %	0 %	386346228
14019	NC_017583	CAGT	2	8	576194	576201	25 %	25 %	25 %	25 %	386346228
14020	NC_017583	GTG	2	6	576263	576268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346228
14021	NC_017583	GTAC	2	8	576304	576311	25 %	25 %	25 %	25 %	386346228
14022	NC_017583	GAC	2	6	576350	576355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346228
14023	NC_017583	AGG	2	6	576363	576368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346228
14024	NC_017583	AGG	2	6	576386	576391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346228
14025	NC_017583	GT	3	6	576405	576410	0 %	50 %	50 %	0 %	386346228
14026	NC_017583	CAGG	2	8	576421	576428	25 %	0 %	50 %	25 %	386346228
14027	NC_017583	TGG	2	6	576462	576467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346228
14028	NC_017583	GCG	2	6	576562	576567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386346228
14029	NC_017583	GGT	2	6	576568	576573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346228
14030	NC_017583	GAG	2	6	576654	576659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346229
14031	NC_017583	GAT	3	9	576681	576689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346229
14032	NC_017583	CT	3	6	576710	576715	0 %	50 %	0 %	50 %	386346229
14033	NC_017583	CGTG	2	8	576746	576753	0 %	25 %	50 %	25 %	386346229
14034	NC_017583	TGG	2	6	576754	576759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346229
14035	NC_017583	CCT	2	6	576785	576790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346229
14036	NC_017583	AC	3	6	576797	576802	50 %	0 %	0 %	50 %	386346229
14037	NC_017583	CCT	2	6	576805	576810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346229
14038	NC_017583	GGA	2	6	576815	576820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346229
14039	NC_017583	CTCTT	2	10	576822	576831	0 %	60 %	0 %	40 %	386346229
14040	NC_017583	GGA	2	6	576882	576887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346229
14041	NC_017583	CTC	2	6	576933	576938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346229
14042	NC_017583	CCT	2	6	576958	576963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346229
14043	NC_017583	ACC	2	6	577027	577032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386346229
14044	NC_017583	ACG	2	6	577072	577077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346229
14045	NC_017583	GAC	2	6	577093	577098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346229
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14049	NC_017583	CA	3	6	577147	577152	50 %	0 %	0 %	50 %	386346229
14050	NC_017583	CCG	2	6	577165	577170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346229
14051	NC_017583	TGGC	2	8	577223	577230	0 %	25 %	50 %	25 %	386346229
14052	NC_017583	TCCC	2	8	577271	577278	0 %	25 %	0 %	75 %	386346229
14053	NC_017583	AGA	2	6	577319	577324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386346229
14054	NC_017583	CCT	2	6	577370	577375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346229
14055	NC_017583	GTG	2	6	577395	577400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346229
14056	NC_017583	G	6	6	577405	577410	0 %	0 %	100 %	0 %	386346229
14057	NC_017583	TCCCTC	2	12	577455	577466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346229
14058	NC_017583	CCT	2	6	577528	577533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346229
14059	NC_017583	AGG	2	6	577544	577549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346229
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14061	NC_017583	GTG	2	6	577913	577918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346230
14062	NC_017583	CGC	2	6	577939	577944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346230
14063	NC_017583	GCCG	2	8	577957	577964	0 %	0 %	50 %	50 %	386346230
14064	NC_017583	GCG	2	6	577973	577978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386346230
14065	NC_017583	TGG	2	6	577981	577986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346230
14066	NC_017583	CGC	2	6	578010	578015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346230
14067	NC_017583	ATC	2	6	578048	578053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346230
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14069	NC_017583	TGG	3	9	578097	578105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346230
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14074	NC_017583	GGA	2	6	578230	578235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346230
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14080	NC_017583	TCT	2	6	578337	578342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386346230
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14083	NC_017583	GAG	2	6	578411	578416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346230
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14088	NC_017583	TCG	2	6	578805	578810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346230
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14091	NC_017583	AAGGA	2	10	578931	578940	60 %	0 %	40 %	0 %	386346230
14092	NC_017583	GCA	2	6	578977	578982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346230
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14100	NC_017583	TGA	2	6	579477	579482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346231
14101	NC_017583	CCT	2	6	579505	579510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346231
14102	NC_017583	TGG	2	6	579543	579548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346231
14103	NC_017583	G	6	6	579623	579628	0 %	0 %	100 %	0 %	386346231
14104	NC_017583	ACT	3	9	579636	579644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346231
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14108	NC_017583	GGC	2	6	579802	579807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386346231
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14110	NC_017583	GTG	2	6	579887	579892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346231
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14112	NC_017583	CTT	2	6	579934	579939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386346231
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14117	NC_017583	GGT	2	6	580054	580059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346231
14118	NC_017583	GGA	2	6	580114	580119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346231
14119	NC_017583	GAT	2	6	580122	580127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346231
14120	NC_017583	AGA	2	6	580192	580197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386346232
14121	NC_017583	AAG	3	9	580204	580212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386346232
14122	NC_017583	TC	3	6	580265	580270	0 %	50 %	0 %	50 %	386346232
14123	NC_017583	GGC	2	6	580311	580316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386346232
14124	NC_017583	AAC	2	6	580363	580368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386346232
14125	NC_017583	TCG	2	6	580430	580435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346232
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14149	NC_017583	GAT	3	9	581700	581708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346234
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14192	NC_017583	CCTG	2	8	583270	583277	0 %	25 %	25 %	50 %	386346235
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14227	NC_017583	CCCCG	2	10	584644	584653	0 %	0 %	20 %	80 %	386346236
14228	NC_017583	TGG	2	6	584658	584663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346236
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14231	NC_017583	CCT	3	9	584818	584826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346236
14232	NC_017583	CCT	2	6	584832	584837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346236
14233	NC_017583	CAGG	2	8	584870	584877	25 %	0 %	50 %	25 %	386346236
14234	NC_017583	CAT	2	6	584884	584889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346236
14235	NC_017583	GGC	2	6	584890	584895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386346236
14236	NC_017583	CAGCTC	2	12	584990	585001	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386346236
14237	NC_017583	TCC	2	6	585021	585026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346236
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14239	NC_017583	TCC	2	6	585033	585038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346236
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14350	NC_017583	AGG	2	6	589176	589181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346240
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14353	NC_017583	GA	3	6	589296	589301	50 %	0 %	50 %	0 %	386346240
14354	NC_017583	TTCCA	2	10	589338	589347	20 %	40 %	0 %	40 %	386346240
14355	NC_017583	GAG	3	9	589454	589462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346240
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14358	NC_017583	CTCC	2	8	589578	589585	0 %	25 %	0 %	75 %	386346241
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