MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 60726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017583	C	6	6	527310	527315	0 %	0 %	0 %	100 %	386346188
13002	NC_017583	CCT	2	6	527341	527346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346188
13003	NC_017583	GGCG	2	8	527350	527357	0 %	0 %	75 %	25 %	386346188
13004	NC_017583	GCC	2	6	527358	527363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346188
13005	NC_017583	GTA	3	9	527399	527407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346188
13006	NC_017583	TC	4	8	527410	527417	0 %	50 %	0 %	50 %	386346188
13007	NC_017583	CGGG	2	8	527444	527451	0 %	0 %	75 %	25 %	386346188
13008	NC_017583	GCT	2	6	527501	527506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346188
13009	NC_017583	TCC	2	6	527585	527590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346188
13010	NC_017583	CCA	2	6	527608	527613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386346188
13011	NC_017583	TCC	2	6	527736	527741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346188
13012	NC_017583	TCCC	2	8	527755	527762	0 %	25 %	0 %	75 %	386346188
13013	NC_017583	CTC	2	6	527816	527821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346188
13014	NC_017583	GAG	2	6	527840	527845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346188
13015	NC_017583	AC	3	6	528253	528258	50 %	0 %	0 %	50 %	386346189
13016	NC_017583	TGAT	2	8	528265	528272	25 %	50 %	25 %	0 %	386346189
13017	NC_017583	CT	3	6	528285	528290	0 %	50 %	0 %	50 %	386346189
13018	NC_017583	TGA	2	6	528295	528300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346189
13019	NC_017583	TC	3	6	528644	528649	0 %	50 %	0 %	50 %	386346190
13020	NC_017583	AGGGCA	2	12	528661	528672	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386346190
13021	NC_017583	AGG	2	6	528878	528883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346190
13022	NC_017583	AGG	2	6	528893	528898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346190
13023	NC_017583	CCA	2	6	529064	529069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386346190
13024	NC_017583	TCTCC	2	10	529076	529085	0 %	40 %	0 %	60 %	386346190
13025	NC_017583	CAT	3	9	529160	529168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346190
13026	NC_017583	CCG	2	6	529193	529198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346190
13027	NC_017583	AGG	2	6	529321	529326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346190
13028	NC_017583	C	6	6	529370	529375	0 %	0 %	0 %	100 %	386346190
13029	NC_017583	GCC	3	9	529496	529504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346190
13030	NC_017583	GAAA	2	8	529594	529601	75 %	0 %	25 %	0 %	386346190
13031	NC_017583	CA	3	6	529658	529663	50 %	0 %	0 %	50 %	386346190
13032	NC_017583	GCT	2	6	529703	529708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346190
13033	NC_017583	CGAG	2	8	529742	529749	25 %	0 %	50 %	25 %	386346190
13034	NC_017583	GCT	2	6	529805	529810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346190
13035	NC_017583	AGCCGA	2	12	529846	529857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346190
13036	NC_017583	A	6	6	529892	529897	100 %	0 %	0 %	0 %	386346190
13037	NC_017583	CGAGAC	2	12	530154	530165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346191
13038	NC_017583	CCTT	2	8	530207	530214	0 %	50 %	0 %	50 %	386346191
13039	NC_017583	GA	4	8	530242	530249	50 %	0 %	50 %	0 %	386346191
13040	NC_017583	AG	3	6	530276	530281	50 %	0 %	50 %	0 %	386346191
13041	NC_017583	AGGA	2	8	530288	530295	50 %	0 %	50 %	0 %	386346191
13042	NC_017583	GA	3	6	530294	530299	50 %	0 %	50 %	0 %	386346191
13043	NC_017583	CCA	2	6	530439	530444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386346191
13044	NC_017583	CCT	2	6	530478	530483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346191
13045	NC_017583	TCC	2	6	530591	530596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346191
13046	NC_017583	CAT	2	6	530613	530618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346191
13047	NC_017583	CTC	2	6	530697	530702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346191
13048	NC_017583	GT	3	6	530775	530780	0 %	50 %	50 %	0 %	386346191
13049	NC_017583	CCTC	2	8	530891	530898	0 %	25 %	0 %	75 %	386346191
13050	NC_017583	GA	3	6	530899	530904	50 %	0 %	50 %	0 %	386346191
13051	NC_017583	TAG	2	6	530987	530992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346191
13052	NC_017583	TCG	2	6	531059	531064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346191
13053	NC_017583	A	6	6	531136	531141	100 %	0 %	0 %	0 %	386346191
13054	NC_017583	AGT	2	6	531214	531219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346191
13055	NC_017583	GGA	2	6	531245	531250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346191
13056	NC_017583	C	6	6	531278	531283	0 %	0 %	0 %	100 %	386346191
13057	NC_017583	GTC	2	6	531326	531331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346191
13058	NC_017583	CCA	2	6	531333	531338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386346191
13059	NC_017583	CCA	2	6	531359	531364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386346191
13060	NC_017583	CCG	2	6	531378	531383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346191
13061	NC_017583	GGAAAG	2	12	531400	531411	50 %	0 %	50 %	0 %	386346191
13062	NC_017583	GAC	2	6	531439	531444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346191
13063	NC_017583	AC	3	6	531443	531448	50 %	0 %	0 %	50 %	386346191
13064	NC_017583	GAAG	2	8	531449	531456	50 %	0 %	50 %	0 %	386346191
13065	NC_017583	ACG	2	6	531458	531463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346191
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13069	NC_017583	AGG	3	9	531880	531888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346192
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13072	NC_017583	GAAG	2	8	531968	531975	50 %	0 %	50 %	0 %	386346192
13073	NC_017583	GCT	2	6	532010	532015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346192
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13078	NC_017583	TGATGG	2	12	532156	532167	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386346192
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13081	NC_017583	GCT	2	6	532235	532240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346192
13082	NC_017583	GGA	2	6	532328	532333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346192
13083	NC_017583	CGC	2	6	532414	532419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386346192
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13085	NC_017583	GAG	2	6	532506	532511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346192
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13089	NC_017583	CTTC	2	8	532718	532725	0 %	50 %	0 %	50 %	386346192
13090	NC_017583	GAT	2	6	532998	533003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346193
13091	NC_017583	GAAG	2	8	533010	533017	50 %	0 %	50 %	0 %	386346193
13092	NC_017583	TGC	2	6	533018	533023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386346193
13093	NC_017583	GAA	2	6	533053	533058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386346193
13094	NC_017583	TGGA	2	8	533074	533081	25 %	25 %	50 %	0 %	386346193
13095	NC_017583	GA	3	6	533100	533105	50 %	0 %	50 %	0 %	386346193
13096	NC_017583	TCGTCA	2	12	533123	533134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386346193
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13100	NC_017583	CGCT	2	8	533323	533330	0 %	25 %	25 %	50 %	386346193
13101	NC_017583	CGGG	2	8	533331	533338	0 %	0 %	75 %	25 %	386346193
13102	NC_017583	GCA	2	6	533361	533366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346193
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13104	NC_017583	ATC	3	9	533386	533394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346193
13105	NC_017583	AAG	2	6	533404	533409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386346193
13106	NC_017583	CCT	2	6	533417	533422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346193
13107	NC_017583	GAGG	2	8	533475	533482	25 %	0 %	75 %	0 %	386346193
13108	NC_017583	CTA	2	6	533607	533612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346193
13109	NC_017583	CGA	2	6	533637	533642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346193
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13111	NC_017583	CCA	2	6	533657	533662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386346193
13112	NC_017583	TGG	2	6	533732	533737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346193
13113	NC_017583	AGG	2	6	533741	533746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346193
13114	NC_017583	AGGTGA	2	12	533771	533782	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386346193
13115	NC_017583	CGA	2	6	533787	533792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346193
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13118	NC_017583	CG	3	6	533954	533959	0 %	0 %	50 %	50 %	386346193
13119	NC_017583	GGCCCG	2	12	533964	533975	0 %	0 %	50 %	50 %	386346193
13120	NC_017583	GGT	2	6	533976	533981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346193
13121	NC_017583	CCT	2	6	534003	534008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346193
13122	NC_017583	AGG	2	6	534014	534019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346193
13123	NC_017583	GAA	2	6	534139	534144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386346193
13124	NC_017583	TTC	2	6	534157	534162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386346193
13125	NC_017583	TGG	2	6	534235	534240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386346193
13126	NC_017583	CGA	2	6	534267	534272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346193
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13128	NC_017583	GCA	2	6	534326	534331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386346193
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13134	NC_017583	CAAG	2	8	534570	534577	50 %	0 %	25 %	25 %	386346193
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13229	NC_017583	TGA	2	6	540623	540628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386346196
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13232	NC_017583	AGG	2	6	540671	540676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386346196
13233	NC_017583	ATC	2	6	540736	540741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386346197
13234	NC_017583	TCCT	2	8	540748	540755	0 %	50 %	0 %	50 %	386346197
13235	NC_017583	AAG	2	6	540769	540774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386346197
13236	NC_017583	CTCGT	2	10	540811	540820	0 %	40 %	20 %	40 %	386346197
13237	NC_017583	CTC	2	6	540823	540828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346197
13238	NC_017583	CTC	2	6	540870	540875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386346197
13239	NC_017583	C	6	6	540899	540904	0 %	0 %	0 %	100 %	386346197
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13483	NC_017583	AGGG	2	8	552748	552755	25 %	0 %	75 %	0 %	386346209
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