MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 60726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017583	TCC	2	6	20024	20029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345776
502	NC_017583	GGT	2	6	20149	20154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345776
503	NC_017583	TTG	2	6	20174	20179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386345776
504	NC_017583	GAG	2	6	20369	20374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345776
505	NC_017583	CCT	2	6	20541	20546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345776
506	NC_017583	G	6	6	20574	20579	0 %	0 %	100 %	0 %	386345776
507	NC_017583	CTC	2	6	20614	20619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345776
508	NC_017583	TCCC	2	8	20647	20654	0 %	25 %	0 %	75 %	386345776
509	NC_017583	GGTC	2	8	20655	20662	0 %	25 %	50 %	25 %	386345776
510	NC_017583	CCA	2	6	20703	20708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345776
511	NC_017583	AGG	2	6	20771	20776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345776
512	NC_017583	GTA	2	6	20788	20793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345776
513	NC_017583	GAT	2	6	20815	20820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345776
514	NC_017583	GAG	2	6	20836	20841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345776
515	NC_017583	GCC	3	9	20925	20933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345776
516	NC_017583	TCG	2	6	20984	20989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345776
517	NC_017583	GAG	2	6	21007	21012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345776
518	NC_017583	AGG	2	6	21029	21034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345776
519	NC_017583	GATG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	386345776
520	NC_017583	TGT	2	6	21063	21068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386345776
521	NC_017583	GCG	2	6	21083	21088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345776
522	NC_017583	CAC	3	9	21112	21120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345776
523	NC_017583	G	7	7	21130	21136	0 %	0 %	100 %	0 %	386345776
524	NC_017583	AGG	2	6	21183	21188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345776
525	NC_017583	GAG	2	6	21196	21201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345776
526	NC_017583	G	6	6	21208	21213	0 %	0 %	100 %	0 %	386345776
527	NC_017583	TCT	2	6	21291	21296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345776
528	NC_017583	CGAGG	2	10	21482	21491	20 %	0 %	60 %	20 %	386345777
529	NC_017583	GA	3	6	21498	21503	50 %	0 %	50 %	0 %	386345777
530	NC_017583	GA	3	6	21532	21537	50 %	0 %	50 %	0 %	386345777
531	NC_017583	CGA	2	6	21542	21547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345777
532	NC_017583	TTC	2	6	21581	21586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345777
533	NC_017583	CTC	3	9	21594	21602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345777
534	NC_017583	GT	3	6	21636	21641	0 %	50 %	50 %	0 %	386345777
535	NC_017583	GAG	2	6	21693	21698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345777
536	NC_017583	TCC	2	6	21730	21735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345777
537	NC_017583	GCG	2	6	21744	21749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345777
538	NC_017583	TTC	2	6	21803	21808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345777
539	NC_017583	CTC	2	6	21822	21827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345777
540	NC_017583	TTTC	2	8	21837	21844	0 %	75 %	0 %	25 %	386345777
541	NC_017583	GGC	2	6	21902	21907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345777
542	NC_017583	TCG	2	6	21919	21924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345777
543	NC_017583	ACG	2	6	21980	21985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345777
544	NC_017583	AGG	2	6	22006	22011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345777
545	NC_017583	CGG	2	6	22054	22059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345778
546	NC_017583	CGA	2	6	22084	22089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345778
547	NC_017583	TCGT	2	8	22109	22116	0 %	50 %	25 %	25 %	386345778
548	NC_017583	TGG	3	9	22125	22133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345778
549	NC_017583	TCC	2	6	22149	22154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345778
550	NC_017583	ATC	2	6	22178	22183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345778
551	NC_017583	GA	3	6	22218	22223	50 %	0 %	50 %	0 %	386345778
552	NC_017583	GT	3	6	22247	22252	0 %	50 %	50 %	0 %	386345778
553	NC_017583	CCT	2	6	22282	22287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345778
554	NC_017583	TCC	2	6	22299	22304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345778
555	NC_017583	GAA	2	6	22331	22336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345778
556	NC_017583	TCC	2	6	22371	22376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345778
557	NC_017583	CTT	2	6	22396	22401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345778
558	NC_017583	TC	3	6	22411	22416	0 %	50 %	0 %	50 %	386345778
559	NC_017583	TCCT	2	8	22424	22431	0 %	50 %	0 %	50 %	386345778
560	NC_017583	GGT	2	6	22438	22443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345778
561	NC_017583	TGG	2	6	22446	22451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345778
562	NC_017583	CAT	2	6	22468	22473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345778
563	NC_017583	TGG	2	6	22512	22517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345778
564	NC_017583	GCC	2	6	22520	22525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345778
565	NC_017583	GTG	2	6	22556	22561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345778
566	NC_017583	CCTTC	2	10	22567	22576	0 %	40 %	0 %	60 %	386345778
567	NC_017583	TCG	2	6	22581	22586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345778
568	NC_017583	G	6	6	22617	22622	0 %	0 %	100 %	0 %	386345778
569	NC_017583	CCA	2	6	22747	22752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345778
570	NC_017583	TCA	2	6	22812	22817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345778
571	NC_017583	G	7	7	22835	22841	0 %	0 %	100 %	0 %	386345778
572	NC_017583	GTG	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345778
573	NC_017583	CTC	2	6	22934	22939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345778
574	NC_017583	CCT	2	6	22999	23004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345778
575	NC_017583	TCC	2	6	23007	23012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345778
576	NC_017583	CT	3	6	23063	23068	0 %	50 %	0 %	50 %	386345778
577	NC_017583	TCCTC	2	10	23122	23131	0 %	40 %	0 %	60 %	386345778
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581	NC_017583	GAG	2	6	23348	23353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345779
582	NC_017583	AGG	2	6	23390	23395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345779
583	NC_017583	GTA	3	9	23407	23415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345779
584	NC_017583	ATG	2	6	23420	23425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345779
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586	NC_017583	CT	3	6	23506	23511	0 %	50 %	0 %	50 %	386345779
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592	NC_017583	GAG	2	6	23789	23794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345779
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594	NC_017583	AGT	2	6	23828	23833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345779
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597	NC_017583	CCG	2	6	24048	24053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345780
598	NC_017583	GAT	2	6	24059	24064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345780
599	NC_017583	GT	3	6	24099	24104	0 %	50 %	50 %	0 %	386345780
600	NC_017583	CCG	2	6	24125	24130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345780
601	NC_017583	TCT	2	6	24139	24144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345780
602	NC_017583	GAG	2	6	24155	24160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345780
603	NC_017583	GGAGAC	2	12	24185	24196	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386345780
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605	NC_017583	CTC	2	6	24283	24288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345780
606	NC_017583	GTC	2	6	24329	24334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345780
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608	NC_017583	TGGG	2	8	24447	24454	0 %	25 %	75 %	0 %	386345780
609	NC_017583	GGA	2	6	24465	24470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345780
610	NC_017583	C	6	6	24532	24537	0 %	0 %	0 %	100 %	386345780
611	NC_017583	AGG	2	6	24538	24543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345780
612	NC_017583	TGCC	2	8	24631	24638	0 %	25 %	25 %	50 %	386345780
613	NC_017583	CTT	2	6	24647	24652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345780
614	NC_017583	CAT	2	6	24659	24664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345780
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616	NC_017583	TCC	2	6	24718	24723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345780
617	NC_017583	AGA	2	6	24727	24732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345780
618	NC_017583	TGG	2	6	24811	24816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345780
619	NC_017583	CCT	2	6	24832	24837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345780
620	NC_017583	GGT	2	6	24851	24856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345780
621	NC_017583	GGA	2	6	24859	24864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345780
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623	NC_017583	TGA	2	6	24910	24915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345780
624	NC_017583	CTT	2	6	24947	24952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345780
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627	NC_017583	TTC	2	6	25001	25006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345780
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629	NC_017583	GGA	2	6	25081	25086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345780
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