MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 60726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017583	GGT	2	6	214784	214789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345923
5502	NC_017583	GCC	2	6	214851	214856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345923
5503	NC_017583	GGA	2	6	214862	214867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345923
5504	NC_017583	GGT	2	6	214937	214942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345923
5505	NC_017583	GGGA	2	8	214944	214951	25 %	0 %	75 %	0 %	386345923
5506	NC_017583	GGTG	2	8	214976	214983	0 %	25 %	75 %	0 %	386345923
5507	NC_017583	AGG	2	6	214984	214989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345923
5508	NC_017583	TGG	2	6	214990	214995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345923
5509	NC_017583	TGG	2	6	214999	215004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345923
5510	NC_017583	TG	3	6	215007	215012	0 %	50 %	50 %	0 %	386345923
5511	NC_017583	G	6	6	215012	215017	0 %	0 %	100 %	0 %	386345923
5512	NC_017583	TTC	2	6	215037	215042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345923
5513	NC_017583	G	6	6	215091	215096	0 %	0 %	100 %	0 %	386345923
5514	NC_017583	GCC	2	6	215121	215126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345923
5515	NC_017583	GGAG	2	8	215147	215154	25 %	0 %	75 %	0 %	386345923
5516	NC_017583	TCC	2	6	215179	215184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345923
5517	NC_017583	CGA	2	6	215186	215191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345923
5518	NC_017583	CCCA	2	8	215208	215215	25 %	0 %	0 %	75 %	386345923
5519	NC_017583	GGA	2	6	215272	215277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345923
5520	NC_017583	CAC	2	6	215294	215299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345923
5521	NC_017583	GAG	2	6	215310	215315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345923
5522	NC_017583	TTC	2	6	215334	215339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345923
5523	NC_017583	GGTCT	2	10	215352	215361	0 %	40 %	40 %	20 %	386345923
5524	NC_017583	CAT	2	6	215432	215437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345923
5525	NC_017583	TCA	2	6	215473	215478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345923
5526	NC_017583	CTG	2	6	215517	215522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345923
5527	NC_017583	AG	3	6	215523	215528	50 %	0 %	50 %	0 %	386345923
5528	NC_017583	CAT	2	6	215548	215553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345924
5529	NC_017583	TTC	2	6	215570	215575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345924
5530	NC_017583	AGG	2	6	215620	215625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345924
5531	NC_017583	AGG	2	6	215688	215693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345924
5532	NC_017583	GGTTCC	2	12	215736	215747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345924
5533	NC_017583	TCC	2	6	215887	215892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345924
5534	NC_017583	ACG	2	6	215898	215903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345924
5535	NC_017583	GGT	2	6	215950	215955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345924
5536	NC_017583	GAG	2	6	216065	216070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345924
5537	NC_017583	CTC	2	6	216155	216160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345924
5538	NC_017583	CAC	2	6	216162	216167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345924
5539	NC_017583	GGT	3	9	216178	216186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345924
5540	NC_017583	TC	3	6	216265	216270	0 %	50 %	0 %	50 %	386345924
5541	NC_017583	AGG	2	6	216276	216281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345924
5542	NC_017583	CCG	2	6	216286	216291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345924
5543	NC_017583	TGCCG	2	10	216448	216457	0 %	20 %	40 %	40 %	386345925
5544	NC_017583	CGA	2	6	216476	216481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345925
5545	NC_017583	GGT	2	6	216512	216517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345925
5546	NC_017583	CCA	2	6	216577	216582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345925
5547	NC_017583	CAG	2	6	216615	216620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345925
5548	NC_017583	GAT	2	6	216653	216658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345925
5549	NC_017583	GT	3	6	216679	216684	0 %	50 %	50 %	0 %	386345926
5550	NC_017583	TCC	2	6	216744	216749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345926
5551	NC_017583	GGTGTC	2	12	216752	216763	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386345926
5552	NC_017583	GAG	2	6	216843	216848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345926
5553	NC_017583	GCC	2	6	216860	216865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345926
5554	NC_017583	CCTC	2	8	216877	216884	0 %	25 %	0 %	75 %	386345926
5555	NC_017583	ACC	2	6	216948	216953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345926
5556	NC_017583	GAG	2	6	216959	216964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345926
5557	NC_017583	C	6	6	216969	216974	0 %	0 %	0 %	100 %	386345926
5558	NC_017583	GT	3	6	216979	216984	0 %	50 %	50 %	0 %	386345926
5559	NC_017583	GTT	2	6	217001	217006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386345926
5560	NC_017583	CCG	2	6	217068	217073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345926
5561	NC_017583	GTCG	2	8	217085	217092	0 %	25 %	50 %	25 %	386345926
5562	NC_017583	GGA	2	6	217132	217137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345926
5563	NC_017583	G	6	6	217167	217172	0 %	0 %	100 %	0 %	386345926
5564	NC_017583	GTCCGT	2	12	217193	217204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345926
5565	NC_017583	AGA	2	6	217213	217218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345926
5566	NC_017583	GCC	2	6	217223	217228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345926
5567	NC_017583	GAG	2	6	217275	217280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345926
5568	NC_017583	TG	3	6	217287	217292	0 %	50 %	50 %	0 %	386345926
5569	NC_017583	TGA	2	6	217303	217308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345926
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5571	NC_017583	GAG	2	6	217416	217421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345926
5572	NC_017583	GAGG	2	8	217463	217470	25 %	0 %	75 %	0 %	386345926
5573	NC_017583	GGAA	2	8	217488	217495	50 %	0 %	50 %	0 %	386345926
5574	NC_017583	TCT	2	6	217602	217607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345926
5575	NC_017583	CTC	2	6	217613	217618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345926
5576	NC_017583	GCAC	2	8	217622	217629	25 %	0 %	25 %	50 %	386345926
5577	NC_017583	GAC	2	6	217649	217654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345926
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5579	NC_017583	GCAT	2	8	217724	217731	25 %	25 %	25 %	25 %	386345927
5580	NC_017583	GCA	2	6	217733	217738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345927
5581	NC_017583	ATC	2	6	217784	217789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345927
5582	NC_017583	AAGG	2	8	217793	217800	50 %	0 %	50 %	0 %	386345927
5583	NC_017583	CAT	2	6	217822	217827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345927
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5585	NC_017583	GA	3	6	217911	217916	50 %	0 %	50 %	0 %	386345927
5586	NC_017583	TGA	2	6	217926	217931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345927
5587	NC_017583	GCCACG	2	12	217946	217957	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386345927
5588	NC_017583	TGG	2	6	218010	218015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345927
5589	NC_017583	AGA	2	6	218016	218021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345927
5590	NC_017583	CG	3	6	218023	218028	0 %	0 %	50 %	50 %	386345927
5591	NC_017583	CAT	2	6	218041	218046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345927
5592	NC_017583	CTCCAG	2	12	218081	218092	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386345927
5593	NC_017583	CCG	2	6	218101	218106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345927
5594	NC_017583	TCC	2	6	218124	218129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345927
5595	NC_017583	CAA	2	6	218212	218217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386345927
5596	NC_017583	GC	3	6	218242	218247	0 %	0 %	50 %	50 %	386345927
5597	NC_017583	CGGG	2	8	218263	218270	0 %	0 %	75 %	25 %	386345927
5598	NC_017583	CATGGA	2	12	218305	218316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386345927
5599	NC_017583	TG	3	6	218425	218430	0 %	50 %	50 %	0 %	386345928
5600	NC_017583	ATC	2	6	218433	218438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345928
5601	NC_017583	GC	3	6	218542	218547	0 %	0 %	50 %	50 %	386345928
5602	NC_017583	CGGG	2	8	218562	218569	0 %	0 %	75 %	25 %	386345928
5603	NC_017583	CACG	2	8	218645	218652	25 %	0 %	25 %	50 %	386345928
5604	NC_017583	G	7	7	218652	218658	0 %	0 %	100 %	0 %	386345928
5605	NC_017583	ATC	2	6	218724	218729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345928
5606	NC_017583	GGA	2	6	218759	218764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345928
5607	NC_017583	GTAC	2	8	218881	218888	25 %	25 %	25 %	25 %	386345928
5608	NC_017583	TG	4	8	218896	218903	0 %	50 %	50 %	0 %	386345928
5609	NC_017583	TCG	2	6	218926	218931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345928
5610	NC_017583	CCT	2	6	219005	219010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345928
5611	NC_017583	GGT	2	6	219026	219031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345928
5612	NC_017583	GGT	2	6	219050	219055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345928
5613	NC_017583	GAG	2	6	219069	219074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345928
5614	NC_017583	AAG	2	6	219111	219116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345928
5615	NC_017583	TCA	2	6	219124	219129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345928
5616	NC_017583	GGA	2	6	219140	219145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345928
5617	NC_017583	CGA	2	6	219233	219238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345928
5618	NC_017583	CTC	2	6	219288	219293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345928
5619	NC_017583	GGT	2	6	219305	219310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345928
5620	NC_017583	ATC	2	6	219312	219317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345928
5621	NC_017583	CCT	2	6	219328	219333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345928
5622	NC_017583	AGC	2	6	219367	219372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345928
5623	NC_017583	CT	3	6	219399	219404	0 %	50 %	0 %	50 %	386345928
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5655	NC_017583	ATC	2	6	220407	220412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345929
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5746	NC_017583	TCA	2	6	223541	223546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345933
5747	NC_017583	GAG	2	6	223578	223583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345933
5748	NC_017583	GCGA	2	8	223642	223649	25 %	0 %	50 %	25 %	386345933
5749	NC_017583	ATG	2	6	223654	223659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345933
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5751	NC_017583	CGT	2	6	223847	223852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345933
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5827	NC_017583	GA	3	6	226803	226808	50 %	0 %	50 %	0 %	386345936
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5830	NC_017583	TGA	2	6	227002	227007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345936
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5852	NC_017583	GGT	2	6	227873	227878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345937
5853	NC_017583	CTG	2	6	227904	227909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345937
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5855	NC_017583	ATC	2	6	227983	227988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345937
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5857	NC_017583	TCG	2	6	228070	228075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345937
5858	NC_017583	ACGA	2	8	228096	228103	50 %	0 %	25 %	25 %	386345937
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5861	NC_017583	CTC	2	6	228171	228176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345937
5862	NC_017583	TCC	2	6	228220	228225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345937
5863	NC_017583	TGT	2	6	228260	228265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386345937
5864	NC_017583	G	6	6	228330	228335	0 %	0 %	100 %	0 %	386345937
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