MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_017582	ACCA	2	8	1906359	1906366	50 %	0 %	0 %	50 %	414564797
33003	NC_017582	GTT	2	6	1906465	1906470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564797
33004	NC_017582	TGG	2	6	1906499	1906504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564797
33005	NC_017582	GAC	2	6	1906565	1906570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564797
33006	NC_017582	CATTAA	2	12	1906634	1906645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414564797
33007	NC_017582	GTTT	2	8	1906684	1906691	0 %	75 %	25 %	0 %	414564797
33008	NC_017582	CAT	2	6	1906715	1906720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564797
33009	NC_017582	TGG	2	6	1906836	1906841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564797
33010	NC_017582	CTAT	2	8	1906873	1906880	25 %	50 %	0 %	25 %	414564797
33011	NC_017582	CTT	2	6	1906934	1906939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564797
33012	NC_017582	TGG	2	6	1907001	1907006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564797
33013	NC_017582	CAT	2	6	1907042	1907047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564797
33014	NC_017582	TAT	2	6	1907048	1907053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564797
33015	NC_017582	TAT	2	6	1907084	1907089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564797
33016	NC_017582	AT	3	6	1907088	1907093	50 %	50 %	0 %	0 %	414564797
33017	NC_017582	ATC	2	6	1907097	1907102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564797
33018	NC_017582	GTAAA	2	10	1907147	1907156	60 %	20 %	20 %	0 %	414564797
33019	NC_017582	TGT	2	6	1907199	1907204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564797
33020	NC_017582	CAT	2	6	1907210	1907215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564797
33021	NC_017582	ATCTC	2	10	1907230	1907239	20 %	40 %	0 %	40 %	414564797
33022	NC_017582	TTA	2	6	1907272	1907277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564797
33023	NC_017582	TTA	2	6	1907359	1907364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564797
33024	NC_017582	ATG	2	6	1907373	1907378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564797
33025	NC_017582	T	6	6	1907414	1907419	0 %	100 %	0 %	0 %	414564797
33026	NC_017582	ATCAT	2	10	1907428	1907437	40 %	40 %	0 %	20 %	414564797
33027	NC_017582	AAAC	2	8	1907444	1907451	75 %	0 %	0 %	25 %	414564797
33028	NC_017582	TAT	2	6	1907501	1907506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564797
33029	NC_017582	TCAGCC	2	12	1907563	1907574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414564797
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33031	NC_017582	TCT	2	6	1907716	1907721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564797
33032	NC_017582	GCT	3	9	1907767	1907775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564797
33033	NC_017582	TTG	2	6	1907781	1907786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564797
33034	NC_017582	GCT	2	6	1907863	1907868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564797
33035	NC_017582	TTG	2	6	1907898	1907903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564797
33036	NC_017582	GCT	3	9	1908001	1908009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564797
33037	NC_017582	TCA	2	6	1908112	1908117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564797
33038	NC_017582	CTT	2	6	1908179	1908184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564797
33039	NC_017582	CTT	2	6	1908197	1908202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564797
33040	NC_017582	GAT	2	6	1908241	1908246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564797
33041	NC_017582	CTGA	2	8	1908356	1908363	25 %	25 %	25 %	25 %	414564797
33042	NC_017582	TAGC	2	8	1908377	1908384	25 %	25 %	25 %	25 %	414564797
33043	NC_017582	GTT	2	6	1908418	1908423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564797
33044	NC_017582	TAG	2	6	1908428	1908433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564797
33045	NC_017582	GTT	2	6	1908445	1908450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564797
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33048	NC_017582	T	6	6	1908649	1908654	0 %	100 %	0 %	0 %	414564798
33049	NC_017582	CAT	2	6	1908685	1908690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564798
33050	NC_017582	CCTG	2	8	1908830	1908837	0 %	25 %	25 %	50 %	414564798
33051	NC_017582	ACA	2	6	1908872	1908877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564798
33052	NC_017582	GTA	2	6	1908878	1908883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564798
33053	NC_017582	TCT	2	6	1908932	1908937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564798
33054	NC_017582	TCT	2	6	1908983	1908988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564798
33055	NC_017582	TGTCT	2	10	1909021	1909030	0 %	60 %	20 %	20 %	414564798
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33057	NC_017582	CTG	2	6	1909098	1909103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564798
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33089	NC_017582	ATT	2	6	1911289	1911294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564800
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33100	NC_017582	GCT	2	6	1911719	1911724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564800
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33102	NC_017582	CAA	2	6	1911774	1911779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564800
33103	NC_017582	TTTC	2	8	1911804	1911811	0 %	75 %	0 %	25 %	414564800
33104	NC_017582	CTG	2	6	1911822	1911827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564800
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33106	NC_017582	TTGTGC	2	12	1911865	1911876	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414564800
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33112	NC_017582	CTT	2	6	1912041	1912046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564800
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33115	NC_017582	GCT	2	6	1912088	1912093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564800
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33123	NC_017582	GCT	2	6	1912437	1912442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564801
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33143	NC_017582	T	6	6	1913134	1913139	0 %	100 %	0 %	0 %	414564802
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33216	NC_017582	CTG	2	6	1917699	1917704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564809
33217	NC_017582	T	6	6	1917730	1917735	0 %	100 %	0 %	0 %	414564809
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33220	NC_017582	AGCT	2	8	1917789	1917796	25 %	25 %	25 %	25 %	414564809
33221	NC_017582	CAA	2	6	1917814	1917819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564809
33222	NC_017582	A	6	6	1917891	1917896	100 %	0 %	0 %	0 %	414564810
33223	NC_017582	CTT	2	6	1917937	1917942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564810
33224	NC_017582	AGCC	2	8	1917957	1917964	25 %	0 %	25 %	50 %	414564810
33225	NC_017582	CTG	3	9	1918249	1918257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564811
33226	NC_017582	TCT	2	6	1918339	1918344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564811
33227	NC_017582	CTG	2	6	1918405	1918410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564811
33228	NC_017582	CAC	2	6	1918469	1918474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564811
33229	NC_017582	GCT	2	6	1918491	1918496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564811
33230	NC_017582	TCC	2	6	1918550	1918555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564811
33231	NC_017582	ATA	2	6	1918584	1918589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564811
33232	NC_017582	CAT	2	6	1918714	1918719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564811
33233	NC_017582	GCC	2	6	1918775	1918780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564811
33234	NC_017582	AGC	2	6	1918809	1918814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564811
33235	NC_017582	AGC	2	6	1918868	1918873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564811
33236	NC_017582	GACA	2	8	1918910	1918917	50 %	0 %	25 %	25 %	414564811
33237	NC_017582	TTG	2	6	1918963	1918968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564811
33238	NC_017582	TCA	2	6	1918981	1918986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564811
33239	NC_017582	ATTG	2	8	1919067	1919074	25 %	50 %	25 %	0 %	414564811
33240	NC_017582	T	6	6	1919169	1919174	0 %	100 %	0 %	0 %	414564811
33241	NC_017582	CTC	2	6	1919192	1919197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564811
33242	NC_017582	GCT	2	6	1919286	1919291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564811
33243	NC_017582	GCA	2	6	1919302	1919307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564811
33244	NC_017582	TG	3	6	1919312	1919317	0 %	50 %	50 %	0 %	414564811
33245	NC_017582	CCA	2	6	1919406	1919411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564811
33246	NC_017582	TAA	2	6	1919419	1919424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564811
33247	NC_017582	GC	3	6	1919451	1919456	0 %	0 %	50 %	50 %	414564811
33248	NC_017582	TCT	2	6	1919461	1919466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564811
33249	NC_017582	TG	3	6	1919485	1919490	0 %	50 %	50 %	0 %	414564811
33250	NC_017582	TATT	2	8	1919580	1919587	25 %	75 %	0 %	0 %	414564811
33251	NC_017582	AGTC	2	8	1919629	1919636	25 %	25 %	25 %	25 %	414564811
33252	NC_017582	CAT	2	6	1919644	1919649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564811
33253	NC_017582	TGA	2	6	1919795	1919800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564811
33254	NC_017582	ACT	2	6	1919802	1919807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564811
33255	NC_017582	TCT	2	6	1920121	1920126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564812
33256	NC_017582	GAT	2	6	1920253	1920258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564812
33257	NC_017582	ATCCTC	2	12	1920270	1920281	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414564812
33258	NC_017582	ATC	2	6	1920285	1920290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564812
33259	NC_017582	TCA	2	6	1920313	1920318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564812
33260	NC_017582	TCT	2	6	1920344	1920349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564812
33261	NC_017582	TCT	2	6	1920367	1920372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564812
33262	NC_017582	TCT	2	6	1920376	1920381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564812
33263	NC_017582	TCA	2	6	1920397	1920402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564812
33264	NC_017582	TCA	2	6	1920406	1920411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564812
33265	NC_017582	ATTT	2	8	1920437	1920444	25 %	75 %	0 %	0 %	414564812
33266	NC_017582	A	7	7	1920488	1920494	100 %	0 %	0 %	0 %	414564812
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33268	NC_017582	T	6	6	1920974	1920979	0 %	100 %	0 %	0 %	414564813
33269	NC_017582	GAAC	2	8	1921020	1921027	50 %	0 %	25 %	25 %	414564813
33270	NC_017582	TGC	2	6	1921170	1921175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564813
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33300	NC_017582	AT	3	6	1922790	1922795	50 %	50 %	0 %	0 %	414564815
33301	NC_017582	CAA	2	6	1922836	1922841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564815
33302	NC_017582	GCC	2	6	1922912	1922917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564815
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33320	NC_017582	A	7	7	1924619	1924625	100 %	0 %	0 %	0 %	414564816
33321	NC_017582	TCT	2	6	1924672	1924677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564816
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33325	NC_017582	GTT	2	6	1924949	1924954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564816
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33327	NC_017582	ATC	2	6	1925036	1925041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564816
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33329	NC_017582	AGG	2	6	1925223	1925228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564816
33330	NC_017582	TGCCA	2	10	1925251	1925260	20 %	20 %	20 %	40 %	414564816
33331	NC_017582	ACC	2	6	1925408	1925413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564817
33332	NC_017582	AATT	2	8	1925414	1925421	50 %	50 %	0 %	0 %	414564817
33333	NC_017582	GAC	2	6	1925425	1925430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564817
33334	NC_017582	CAC	2	6	1925452	1925457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564817
33335	NC_017582	CATG	2	8	1925503	1925510	25 %	25 %	25 %	25 %	414564817
33336	NC_017582	AGC	2	6	1925546	1925551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564817
33337	NC_017582	GCT	2	6	1925572	1925577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564817
33338	NC_017582	GCT	2	6	1925592	1925597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564817
33339	NC_017582	TCC	2	6	1925609	1925614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564817
33340	NC_017582	GCA	2	6	1925629	1925634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564817
33341	NC_017582	TTC	2	6	1925657	1925662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564817
33342	NC_017582	TCT	2	6	1925673	1925678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564817
33343	NC_017582	GAC	2	6	1925736	1925741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564817
33344	NC_017582	TCC	2	6	1925745	1925750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564817
33345	NC_017582	CACC	2	8	1925773	1925780	25 %	0 %	0 %	75 %	414564817
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33347	NC_017582	AGA	2	6	1925825	1925830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564817
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33460	NC_017582	A	7	7	1932010	1932016	100 %	0 %	0 %	0 %	414564824
33461	NC_017582	GTT	2	6	1932049	1932054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564824
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33463	NC_017582	TGT	2	6	1938149	1938154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564825
33464	NC_017582	CAT	2	6	1938157	1938162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564825
33465	NC_017582	TGAT	2	8	1938255	1938262	25 %	50 %	25 %	0 %	414564825
33466	NC_017582	TTGG	2	8	1938375	1938382	0 %	50 %	50 %	0 %	414564825
33467	NC_017582	TAA	2	6	1938422	1938427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564825
33468	NC_017582	TCA	2	6	1938447	1938452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564825
33469	NC_017582	CCA	2	6	1938492	1938497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564825
33470	NC_017582	CAAA	2	8	1938528	1938535	75 %	0 %	0 %	25 %	414564825
33471	NC_017582	GCT	2	6	1938609	1938614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564825
33472	NC_017582	AAT	2	6	1938635	1938640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564825
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33474	NC_017582	TCA	2	6	1938705	1938710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564825
33475	NC_017582	TGC	2	6	1938750	1938755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564825
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33479	NC_017582	AGCT	2	8	1938902	1938909	25 %	25 %	25 %	25 %	414564825
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33483	NC_017582	CTC	2	6	1939196	1939201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564825
33484	NC_017582	CTC	2	6	1939238	1939243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564825
33485	NC_017582	TGGCTT	2	12	1939412	1939423	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414564825
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33487	NC_017582	T	6	6	1939610	1939615	0 %	100 %	0 %	0 %	414564825
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33490	NC_017582	CTTG	2	8	1939801	1939808	0 %	50 %	25 %	25 %	414564825
33491	NC_017582	GCT	3	9	1939827	1939835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564825
33492	NC_017582	CAT	2	6	1939948	1939953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564825
33493	NC_017582	CTT	2	6	1939974	1939979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564825
33494	NC_017582	GCC	2	6	1939992	1939997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564825
33495	NC_017582	TGC	2	6	1940082	1940087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564825
33496	NC_017582	GCTT	2	8	1940107	1940114	0 %	50 %	25 %	25 %	414564825
33497	NC_017582	ATA	2	6	1940132	1940137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564825
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33499	NC_017582	AAC	2	6	1940180	1940185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564825
33500	NC_017582	CAT	2	6	1940245	1940250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564825

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