MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_017582	GCC	2	6	1732715	1732720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564627
30003	NC_017582	GCT	2	6	1732799	1732804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564627
30004	NC_017582	ATCA	2	8	1732879	1732886	50 %	25 %	0 %	25 %	414564627
30005	NC_017582	TGC	3	9	1732976	1732984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564627
30006	NC_017582	T	6	6	1733002	1733007	0 %	100 %	0 %	0 %	414564627
30007	NC_017582	AC	3	6	1733051	1733056	50 %	0 %	0 %	50 %	414564627
30008	NC_017582	AAT	2	6	1733094	1733099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564627
30009	NC_017582	CTC	2	6	1733134	1733139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564627
30010	NC_017582	AAT	2	6	1733167	1733172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564627
30011	NC_017582	AGA	2	6	1733238	1733243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564627
30012	NC_017582	GCT	2	6	1733315	1733320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564627
30013	NC_017582	CTA	2	6	1733328	1733333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564627
30014	NC_017582	AAT	2	6	1733804	1733809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564628
30015	NC_017582	TGG	2	6	1733866	1733871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564628
30016	NC_017582	CTGC	2	8	1733913	1733920	0 %	25 %	25 %	50 %	414564628
30017	NC_017582	AGCCTT	2	12	1733939	1733950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414564628
30018	NC_017582	T	6	6	1733949	1733954	0 %	100 %	0 %	0 %	414564628
30019	NC_017582	TGA	2	6	1734013	1734018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564628
30020	NC_017582	TCG	2	6	1734033	1734038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564628
30021	NC_017582	CCT	2	6	1734040	1734045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564628
30022	NC_017582	GAAA	2	8	1734282	1734289	75 %	0 %	25 %	0 %	414564629
30023	NC_017582	GCT	2	6	1734302	1734307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564629
30024	NC_017582	GCT	2	6	1734316	1734321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564629
30025	NC_017582	A	6	6	1734359	1734364	100 %	0 %	0 %	0 %	414564629
30026	NC_017582	TGA	2	6	1734397	1734402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564629
30027	NC_017582	GCT	2	6	1734413	1734418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564629
30028	NC_017582	TGC	2	6	1734472	1734477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564629
30029	NC_017582	GCT	3	9	1734479	1734487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564629
30030	NC_017582	TGC	2	6	1734506	1734511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564629
30031	NC_017582	CTC	2	6	1734636	1734641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564629
30032	NC_017582	T	6	6	1734672	1734677	0 %	100 %	0 %	0 %	414564629
30033	NC_017582	ATT	3	9	1734803	1734811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564630
30034	NC_017582	ATG	2	6	1734817	1734822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564630
30035	NC_017582	AGC	2	6	1734886	1734891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564630
30036	NC_017582	AGC	2	6	1734938	1734943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564630
30037	NC_017582	CAAC	2	8	1734952	1734959	50 %	0 %	0 %	50 %	414564630
30038	NC_017582	TTA	2	6	1734962	1734967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564630
30039	NC_017582	TCAT	2	8	1734988	1734995	25 %	50 %	0 %	25 %	414564630
30040	NC_017582	TTG	2	6	1735057	1735062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564630
30041	NC_017582	CAA	2	6	1735084	1735089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564630
30042	NC_017582	ACT	2	6	1735093	1735098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564630
30043	NC_017582	A	6	6	1735150	1735155	100 %	0 %	0 %	0 %	414564630
30044	NC_017582	GCT	2	6	1735203	1735208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564630
30045	NC_017582	TCC	2	6	1735237	1735242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564630
30046	NC_017582	TAT	2	6	1735269	1735274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564630
30047	NC_017582	CAA	2	6	1735319	1735324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564630
30048	NC_017582	A	6	6	1735349	1735354	100 %	0 %	0 %	0 %	414564630
30049	NC_017582	AGG	2	6	1735518	1735523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564631
30050	NC_017582	TTTG	2	8	1735527	1735534	0 %	75 %	25 %	0 %	414564631
30051	NC_017582	CAG	2	6	1735545	1735550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564631
30052	NC_017582	TAA	2	6	1735611	1735616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564631
30053	NC_017582	CAG	2	6	1735661	1735666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564631
30054	NC_017582	AGA	2	6	1735707	1735712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564631
30055	NC_017582	T	6	6	1735720	1735725	0 %	100 %	0 %	0 %	414564631
30056	NC_017582	ATC	2	6	1735727	1735732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564631
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30058	NC_017582	G	6	6	1735798	1735803	0 %	0 %	100 %	0 %	414564631
30059	NC_017582	CAG	2	6	1735816	1735821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564631
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30062	NC_017582	CAAG	2	8	1735923	1735930	50 %	0 %	25 %	25 %	414564631
30063	NC_017582	CAA	2	6	1735950	1735955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564631
30064	NC_017582	CAG	2	6	1735991	1735996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564631
30065	NC_017582	TAT	2	6	1736005	1736010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564631
30066	NC_017582	GCCAA	2	10	1736073	1736082	40 %	0 %	20 %	40 %	414564631
30067	NC_017582	AC	3	6	1736093	1736098	50 %	0 %	0 %	50 %	414564631
30068	NC_017582	GCC	2	6	1736117	1736122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564631
30069	NC_017582	CAA	2	6	1736298	1736303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564631
30070	NC_017582	CAT	2	6	1736340	1736345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564631
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30072	NC_017582	AGG	2	6	1736472	1736477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564631
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30077	NC_017582	GCT	2	6	1736704	1736709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564631
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30080	NC_017582	ATT	2	6	1736816	1736821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564631
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30083	NC_017582	GCT	2	6	1736887	1736892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564631
30084	NC_017582	TAT	2	6	1736923	1736928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564631
30085	NC_017582	CAA	2	6	1736943	1736948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564631
30086	NC_017582	ACA	2	6	1737013	1737018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564631
30087	NC_017582	ATG	2	6	1737025	1737030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564631
30088	NC_017582	CTG	2	6	1737071	1737076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564631
30089	NC_017582	GAG	2	6	1737133	1737138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564631
30090	NC_017582	TTG	2	6	1737149	1737154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564631
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30099	NC_017582	GAT	2	6	1737574	1737579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564631
30100	NC_017582	ATT	2	6	1737636	1737641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564632
30101	NC_017582	AGCA	2	8	1737670	1737677	50 %	0 %	25 %	25 %	414564632
30102	NC_017582	GCT	2	6	1737698	1737703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564632
30103	NC_017582	TCA	2	6	1737707	1737712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564632
30104	NC_017582	TAG	2	6	1737718	1737723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564632
30105	NC_017582	AAC	2	6	1737733	1737738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564632
30106	NC_017582	TCCA	2	8	1737758	1737765	25 %	25 %	0 %	50 %	414564632
30107	NC_017582	CAA	2	6	1737777	1737782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564632
30108	NC_017582	ATC	2	6	1737850	1737855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564632
30109	NC_017582	TGCC	2	8	1737948	1737955	0 %	25 %	25 %	50 %	414564632
30110	NC_017582	AACCA	2	10	1738020	1738029	60 %	0 %	0 %	40 %	414564632
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30113	NC_017582	T	6	6	1738363	1738368	0 %	100 %	0 %	0 %	414564632
30114	NC_017582	TGA	2	6	1738382	1738387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564632
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30116	NC_017582	GAA	2	6	1738413	1738418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564632
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30221	NC_017582	CCTT	2	8	1745464	1745471	0 %	50 %	0 %	50 %	414564639
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30227	NC_017582	TGACC	2	10	1745687	1745696	20 %	20 %	20 %	40 %	414564639
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30229	NC_017582	TAT	2	6	1745797	1745802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564640
30230	NC_017582	TTG	2	6	1745803	1745808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564640
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30348	NC_017582	ATAC	2	8	1753480	1753487	50 %	25 %	0 %	25 %	414564646
30349	NC_017582	GCT	2	6	1753623	1753628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564646
30350	NC_017582	TAA	2	6	1753629	1753634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564646
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30352	NC_017582	GCT	2	6	1753656	1753661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564646
30353	NC_017582	GTC	2	6	1753766	1753771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564646
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30402	NC_017582	GCT	2	6	1756413	1756418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564650
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30432	NC_017582	TCG	2	6	1758599	1758604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564652
30433	NC_017582	TCA	2	6	1758622	1758627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564652
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30443	NC_017582	TA	3	6	1759118	1759123	50 %	50 %	0 %	0 %	414564652
30444	NC_017582	CTAT	2	8	1759126	1759133	25 %	50 %	0 %	25 %	414564652
30445	NC_017582	GCT	2	6	1759167	1759172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564652
30446	NC_017582	ACTT	2	8	1759192	1759199	25 %	50 %	0 %	25 %	414564652
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30448	NC_017582	GA	3	6	1759273	1759278	50 %	0 %	50 %	0 %	414564652
30449	NC_017582	T	6	6	1759329	1759334	0 %	100 %	0 %	0 %	414564652
30450	NC_017582	ACT	2	6	1759505	1759510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564652
30451	NC_017582	CAAA	2	8	1759521	1759528	75 %	0 %	0 %	25 %	414564652
30452	NC_017582	AACA	2	8	1759606	1759613	75 %	0 %	0 %	25 %	414564652
30453	NC_017582	AGTG	2	8	1759614	1759621	25 %	25 %	50 %	0 %	414564652
30454	NC_017582	ATG	2	6	1759622	1759627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564652
30455	NC_017582	AT	3	6	1759634	1759639	50 %	50 %	0 %	0 %	414564652
30456	NC_017582	AGC	2	6	1759886	1759891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564653
30457	NC_017582	T	6	6	1759910	1759915	0 %	100 %	0 %	0 %	414564653
30458	NC_017582	CTTGAT	2	12	1759968	1759979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414564653
30459	NC_017582	CTT	2	6	1760189	1760194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564654
30460	NC_017582	AAG	2	6	1760227	1760232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564654
30461	NC_017582	AAG	2	6	1760257	1760262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564654
30462	NC_017582	GCT	2	6	1760265	1760270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564654
30463	NC_017582	CA	3	6	1760283	1760288	50 %	0 %	0 %	50 %	414564654
30464	NC_017582	CCA	2	6	1760312	1760317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564654
30465	NC_017582	ACAA	2	8	1760510	1760517	75 %	0 %	0 %	25 %	414564654
30466	NC_017582	ACC	2	6	1760534	1760539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564654
30467	NC_017582	TAA	2	6	1760619	1760624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564654
30468	NC_017582	AG	3	6	1760645	1760650	50 %	0 %	50 %	0 %	414564654
30469	NC_017582	CAA	2	6	1760661	1760666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564654
30470	NC_017582	CCA	2	6	1760706	1760711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564654
30471	NC_017582	ATC	2	6	1760789	1760794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564654
30472	NC_017582	CAA	2	6	1760869	1760874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564654
30473	NC_017582	GCC	2	6	1760906	1760911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564654
30474	NC_017582	GC	3	6	1760914	1760919	0 %	0 %	50 %	50 %	414564654
30475	NC_017582	CTG	2	6	1760922	1760927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564654
30476	NC_017582	CCA	2	6	1760942	1760947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564654
30477	NC_017582	TC	3	6	1760958	1760963	0 %	50 %	0 %	50 %	414564654
30478	NC_017582	TAA	2	6	1760966	1760971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564654
30479	NC_017582	CAA	2	6	1761069	1761074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564654
30480	NC_017582	CAT	2	6	1761075	1761080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564654
30481	NC_017582	CAT	2	6	1761133	1761138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564654
30482	NC_017582	CTC	2	6	1761236	1761241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564654
30483	NC_017582	CAC	2	6	1761304	1761309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564654
30484	NC_017582	CTC	2	6	1761445	1761450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564654
30485	NC_017582	ACA	2	6	1761567	1761572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564654
30486	NC_017582	CATAAA	2	12	1761601	1761612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414564654
30487	NC_017582	ATC	2	6	1761638	1761643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564654
30488	NC_017582	CCT	2	6	1761799	1761804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564655
30489	NC_017582	GCT	2	6	1761871	1761876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564655
30490	NC_017582	CAA	2	6	1761886	1761891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564655
30491	NC_017582	CA	3	6	1761928	1761933	50 %	0 %	0 %	50 %	414564655
30492	NC_017582	GCT	2	6	1761934	1761939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564655
30493	NC_017582	A	6	6	1761964	1761969	100 %	0 %	0 %	0 %	414564655
30494	NC_017582	AGC	2	6	1761986	1761991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564655
30495	NC_017582	TCA	2	6	1762000	1762005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564655
30496	NC_017582	TCCAG	2	10	1762035	1762044	20 %	20 %	20 %	40 %	414564655
30497	NC_017582	TCA	2	6	1762053	1762058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564655
30498	NC_017582	CTC	2	6	1762181	1762186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564655
30499	NC_017582	CTCA	2	8	1762325	1762332	25 %	25 %	0 %	50 %	414564655
30500	NC_017582	GCTT	2	8	1762364	1762371	0 %	50 %	25 %	25 %	414564655

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