MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_017582	TCAGCA	2	12	1341832	1341843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414564251
23502	NC_017582	AAT	2	6	1342008	1342013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564251
23503	NC_017582	T	6	6	1342031	1342036	0 %	100 %	0 %	0 %	414564251
23504	NC_017582	TCT	2	6	1342231	1342236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564252
23505	NC_017582	AAT	2	6	1342382	1342387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564252
23506	NC_017582	TCAG	2	8	1342417	1342424	25 %	25 %	25 %	25 %	414564252
23507	NC_017582	GGTA	2	8	1342490	1342497	25 %	25 %	50 %	0 %	414564252
23508	NC_017582	TCA	2	6	1342552	1342557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564252
23509	NC_017582	TGCA	2	8	1342587	1342594	25 %	25 %	25 %	25 %	414564252
23510	NC_017582	A	6	6	1342653	1342658	100 %	0 %	0 %	0 %	414564252
23511	NC_017582	T	6	6	1342685	1342690	0 %	100 %	0 %	0 %	414564252
23512	NC_017582	A	6	6	1342800	1342805	100 %	0 %	0 %	0 %	414564252
23513	NC_017582	TCA	2	6	1342814	1342819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564252
23514	NC_017582	GCA	2	6	1342837	1342842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564253
23515	NC_017582	CAG	2	6	1342994	1342999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564253
23516	NC_017582	TCAAC	2	10	1343044	1343053	40 %	20 %	0 %	40 %	414564253
23517	NC_017582	CAT	2	6	1343149	1343154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564253
23518	NC_017582	TTC	2	6	1343210	1343215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564253
23519	NC_017582	TCATC	2	10	1343230	1343239	20 %	40 %	0 %	40 %	414564253
23520	NC_017582	CTT	2	6	1343302	1343307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564253
23521	NC_017582	GCT	2	6	1343313	1343318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564253
23522	NC_017582	TGT	2	6	1343359	1343364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564253
23523	NC_017582	ATC	2	6	1343387	1343392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564253
23524	NC_017582	CTC	2	6	1343402	1343407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564253
23525	NC_017582	AAT	2	6	1343531	1343536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564253
23526	NC_017582	ATA	2	6	1343579	1343584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564253
23527	NC_017582	TCC	2	6	1343660	1343665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564253
23528	NC_017582	AAT	2	6	1343672	1343677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564253
23529	NC_017582	CGA	2	6	1343762	1343767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564254
23530	NC_017582	ATA	2	6	1343770	1343775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564254
23531	NC_017582	AGCT	2	8	1343802	1343809	25 %	25 %	25 %	25 %	414564254
23532	NC_017582	GCT	2	6	1343835	1343840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564254
23533	NC_017582	AGA	2	6	1343869	1343874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564254
23534	NC_017582	GCG	2	6	1343888	1343893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564254
23535	NC_017582	A	6	6	1343923	1343928	100 %	0 %	0 %	0 %	414564254
23536	NC_017582	GCA	2	6	1343984	1343989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564254
23537	NC_017582	CCT	2	6	1344015	1344020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564254
23538	NC_017582	ATA	2	6	1344119	1344124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564254
23539	NC_017582	GCT	2	6	1344266	1344271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564254
23540	NC_017582	TATGCT	2	12	1344322	1344333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414564254
23541	NC_017582	ACC	2	6	1344347	1344352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564254
23542	NC_017582	CAAG	2	8	1344369	1344376	50 %	0 %	25 %	25 %	414564254
23543	NC_017582	GCT	2	6	1344429	1344434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564254
23544	NC_017582	CTTG	2	8	1344513	1344520	0 %	50 %	25 %	25 %	414564254
23545	NC_017582	CTC	2	6	1344544	1344549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564254
23546	NC_017582	AATA	2	8	1344572	1344579	75 %	25 %	0 %	0 %	414564254
23547	NC_017582	CTT	2	6	1344692	1344697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564254
23548	NC_017582	CAT	2	6	1344753	1344758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564254
23549	NC_017582	CTG	2	6	1344772	1344777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564254
23550	NC_017582	T	7	7	1344787	1344793	0 %	100 %	0 %	0 %	414564254
23551	NC_017582	ATA	2	6	1344796	1344801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564254
23552	NC_017582	GCG	2	6	1344803	1344808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564254
23553	NC_017582	TAT	2	6	1344867	1344872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564254
23554	NC_017582	TTG	2	6	1344927	1344932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564255
23555	NC_017582	T	6	6	1344973	1344978	0 %	100 %	0 %	0 %	414564255
23556	NC_017582	AATA	2	8	1345009	1345016	75 %	25 %	0 %	0 %	414564255
23557	NC_017582	CAG	2	6	1345048	1345053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564255
23558	NC_017582	CTGTG	2	10	1345072	1345081	0 %	40 %	40 %	20 %	414564255
23559	NC_017582	ATA	2	6	1345084	1345089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564255
23560	NC_017582	CAC	2	6	1345149	1345154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564255
23561	NC_017582	CTT	2	6	1345236	1345241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564255
23562	NC_017582	CTC	2	6	1345258	1345263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564255
23563	NC_017582	ATACC	2	10	1345298	1345307	40 %	20 %	0 %	40 %	414564255
23564	NC_017582	TGAC	2	8	1345403	1345410	25 %	25 %	25 %	25 %	414564255
23565	NC_017582	GAG	2	6	1345463	1345468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564255
23566	NC_017582	TC	3	6	1345556	1345561	0 %	50 %	0 %	50 %	414564255
23567	NC_017582	AG	3	6	1345601	1345606	50 %	0 %	50 %	0 %	414564255
23568	NC_017582	CA	4	8	1345620	1345627	50 %	0 %	0 %	50 %	414564255
23569	NC_017582	GAT	2	6	1345675	1345680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564255
23570	NC_017582	TGA	2	6	1345699	1345704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564256
23571	NC_017582	CCT	2	6	1345705	1345710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564256
23572	NC_017582	T	6	6	1345723	1345728	0 %	100 %	0 %	0 %	414564256
23573	NC_017582	CA	3	6	1345766	1345771	50 %	0 %	0 %	50 %	414564256
23574	NC_017582	TGA	2	6	1345826	1345831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564256
23575	NC_017582	GCT	2	6	1345861	1345866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564256
23576	NC_017582	TTG	2	6	1345883	1345888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564256
23577	NC_017582	CAA	2	6	1345900	1345905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564256
23578	NC_017582	ATA	2	6	1345913	1345918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564256
23579	NC_017582	AAT	2	6	1345949	1345954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564256
23580	NC_017582	GTT	2	6	1346000	1346005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564256
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23582	NC_017582	T	6	6	1346190	1346195	0 %	100 %	0 %	0 %	414564256
23583	NC_017582	ACC	2	6	1346220	1346225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564256
23584	NC_017582	A	7	7	1346265	1346271	100 %	0 %	0 %	0 %	414564256
23585	NC_017582	AAC	2	6	1346387	1346392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564256
23586	NC_017582	TAT	2	6	1346405	1346410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564256
23587	NC_017582	AAAG	2	8	1346432	1346439	75 %	0 %	25 %	0 %	414564256
23588	NC_017582	CTT	2	6	1346451	1346456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564257
23589	NC_017582	A	6	6	1346547	1346552	100 %	0 %	0 %	0 %	414564257
23590	NC_017582	GGT	2	6	1346561	1346566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564257
23591	NC_017582	TGA	2	6	1346570	1346575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564257
23592	NC_017582	CTT	2	6	1346583	1346588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564257
23593	NC_017582	CAG	2	6	1346805	1346810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564257
23594	NC_017582	CTG	2	6	1346811	1346816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564257
23595	NC_017582	TGA	2	6	1346825	1346830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564257
23596	NC_017582	T	6	6	1346833	1346838	0 %	100 %	0 %	0 %	414564257
23597	NC_017582	GAT	2	6	1346870	1346875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564257
23598	NC_017582	TTG	2	6	1346950	1346955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564257
23599	NC_017582	AAG	2	6	1346997	1347002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564257
23600	NC_017582	TGAT	2	8	1347065	1347072	25 %	50 %	25 %	0 %	414564257
23601	NC_017582	T	6	6	1347079	1347084	0 %	100 %	0 %	0 %	414564257
23602	NC_017582	CGC	2	6	1347128	1347133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564258
23603	NC_017582	ATC	2	6	1347140	1347145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564258
23604	NC_017582	CGC	2	6	1347164	1347169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564258
23605	NC_017582	CT	3	6	1347176	1347181	0 %	50 %	0 %	50 %	414564258
23606	NC_017582	T	7	7	1347189	1347195	0 %	100 %	0 %	0 %	414564258
23607	NC_017582	CCT	2	6	1347223	1347228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564258
23608	NC_017582	AT	3	6	1347255	1347260	50 %	50 %	0 %	0 %	414564258
23609	NC_017582	TC	3	6	1347291	1347296	0 %	50 %	0 %	50 %	414564258
23610	NC_017582	TCA	2	6	1347330	1347335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564258
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23612	NC_017582	A	6	6	1347375	1347380	100 %	0 %	0 %	0 %	414564258
23613	NC_017582	TCA	2	6	1347402	1347407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564258
23614	NC_017582	AAG	2	6	1347410	1347415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564258
23615	NC_017582	ATTG	2	8	1347421	1347428	25 %	50 %	25 %	0 %	414564258
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23617	NC_017582	TCA	2	6	1347456	1347461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564258
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23734	NC_017582	TCT	2	6	1352910	1352915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564264
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