MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_017582	GT	3	6	1315344	1315349	0 %	50 %	50 %	0 %	414564230
23002	NC_017582	CAT	2	6	1315361	1315366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564230
23003	NC_017582	AGT	2	6	1315503	1315508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564230
23004	NC_017582	TC	3	6	1315518	1315523	0 %	50 %	0 %	50 %	414564230
23005	NC_017582	AGG	2	6	1315588	1315593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564230
23006	NC_017582	TCA	2	6	1315636	1315641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564230
23007	NC_017582	A	6	6	1315665	1315670	100 %	0 %	0 %	0 %	414564230
23008	NC_017582	AC	3	6	1315754	1315759	50 %	0 %	0 %	50 %	414564230
23009	NC_017582	AAGC	2	8	1315806	1315813	50 %	0 %	25 %	25 %	414564230
23010	NC_017582	ACC	2	6	1315911	1315916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564230
23011	NC_017582	AAGC	2	8	1315934	1315941	50 %	0 %	25 %	25 %	414564230
23012	NC_017582	T	6	6	1316058	1316063	0 %	100 %	0 %	0 %	414564231
23013	NC_017582	TTG	2	6	1316066	1316071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564231
23014	NC_017582	TAC	2	6	1316085	1316090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564231
23015	NC_017582	CCA	2	6	1316174	1316179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564231
23016	NC_017582	TCA	2	6	1316182	1316187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564231
23017	NC_017582	CTCGA	2	10	1316286	1316295	20 %	20 %	20 %	40 %	414564231
23018	NC_017582	T	7	7	1316315	1316321	0 %	100 %	0 %	0 %	414564231
23019	NC_017582	GATC	2	8	1316351	1316358	25 %	25 %	25 %	25 %	414564231
23020	NC_017582	CTGC	2	8	1316390	1316397	0 %	25 %	25 %	50 %	414564231
23021	NC_017582	GCT	2	6	1316409	1316414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564231
23022	NC_017582	ATC	2	6	1316436	1316441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564231
23023	NC_017582	ACA	2	6	1316455	1316460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564231
23024	NC_017582	TAG	2	6	1316477	1316482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564231
23025	NC_017582	TCA	2	6	1316485	1316490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564231
23026	NC_017582	GTAG	2	8	1316653	1316660	25 %	25 %	50 %	0 %	414564231
23027	NC_017582	TGA	2	6	1316816	1316821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564231
23028	NC_017582	AGC	2	6	1316931	1316936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564231
23029	NC_017582	A	7	7	1316941	1316947	100 %	0 %	0 %	0 %	414564231
23030	NC_017582	AAT	2	6	1316949	1316954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564231
23031	NC_017582	A	6	6	1316958	1316963	100 %	0 %	0 %	0 %	414564231
23032	NC_017582	GAC	2	6	1316987	1316992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564231
23033	NC_017582	CCT	2	6	1317021	1317026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564232
23034	NC_017582	T	7	7	1317031	1317037	0 %	100 %	0 %	0 %	414564232
23035	NC_017582	TCAT	2	8	1317063	1317070	25 %	50 %	0 %	25 %	414564232
23036	NC_017582	TGC	2	6	1317209	1317214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564232
23037	NC_017582	CAT	2	6	1317316	1317321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564232
23038	NC_017582	GT	3	6	1317328	1317333	0 %	50 %	50 %	0 %	414564232
23039	NC_017582	AT	3	6	1317399	1317404	50 %	50 %	0 %	0 %	414564232
23040	NC_017582	TCA	2	6	1317504	1317509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564232
23041	NC_017582	GCTTT	2	10	1317515	1317524	0 %	60 %	20 %	20 %	414564232
23042	NC_017582	CAC	2	6	1317590	1317595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564232
23043	NC_017582	TGA	2	6	1317616	1317621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564232
23044	NC_017582	TCA	2	6	1317628	1317633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564232
23045	NC_017582	ATG	2	6	1317678	1317683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564232
23046	NC_017582	A	6	6	1317686	1317691	100 %	0 %	0 %	0 %	414564232
23047	NC_017582	TAA	2	6	1317739	1317744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564232
23048	NC_017582	CTA	2	6	1317763	1317768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564232
23049	NC_017582	ACC	2	6	1317789	1317794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564232
23050	NC_017582	TCA	2	6	1317807	1317812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564232
23051	NC_017582	ACT	2	6	1317975	1317980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564233
23052	NC_017582	AGC	2	6	1317987	1317992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564233
23053	NC_017582	TAAA	2	8	1318016	1318023	75 %	25 %	0 %	0 %	414564233
23054	NC_017582	TTG	3	9	1318109	1318117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564233
23055	NC_017582	TGA	2	6	1318293	1318298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564233
23056	NC_017582	ACC	2	6	1318396	1318401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564233
23057	NC_017582	GAT	2	6	1318407	1318412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564233
23058	NC_017582	A	7	7	1318482	1318488	100 %	0 %	0 %	0 %	414564233
23059	NC_017582	AC	3	6	1318520	1318525	50 %	0 %	0 %	50 %	414564233
23060	NC_017582	ACA	2	6	1318553	1318558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564233
23061	NC_017582	CAT	2	6	1318705	1318710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564233
23062	NC_017582	GCTGTT	2	12	1318789	1318800	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414564233
23063	NC_017582	T	6	6	1318807	1318812	0 %	100 %	0 %	0 %	414564233
23064	NC_017582	CTG	2	6	1318820	1318825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564233
23065	NC_017582	GGCT	2	8	1318836	1318843	0 %	25 %	50 %	25 %	414564233
23066	NC_017582	GTC	2	6	1318868	1318873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564233
23067	NC_017582	TGC	2	6	1318955	1318960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564233
23068	NC_017582	TGA	2	6	1319142	1319147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564233
23069	NC_017582	CAT	2	6	1319159	1319164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564233
23070	NC_017582	TGCTA	2	10	1319241	1319250	20 %	40 %	20 %	20 %	414564233
23071	NC_017582	GCT	2	6	1319262	1319267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564233
23072	NC_017582	GCC	2	6	1319273	1319278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564233
23073	NC_017582	GAT	2	6	1319295	1319300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564233
23074	NC_017582	GAT	2	6	1319496	1319501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564234
23075	NC_017582	TGG	3	9	1319519	1319527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564234
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23077	NC_017582	A	6	6	1319570	1319575	100 %	0 %	0 %	0 %	414564234
23078	NC_017582	TCA	2	6	1319597	1319602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564234
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23082	NC_017582	ATA	2	6	1319722	1319727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564234
23083	NC_017582	CTA	2	6	1319777	1319782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564234
23084	NC_017582	ATC	2	6	1319794	1319799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564234
23085	NC_017582	GGAC	2	8	1319802	1319809	25 %	0 %	50 %	25 %	414564234
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23087	NC_017582	TAA	2	6	1319861	1319866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564234
23088	NC_017582	AGG	2	6	1319869	1319874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564234
23089	NC_017582	AGCCT	2	10	1319949	1319958	20 %	20 %	20 %	40 %	414564234
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23092	NC_017582	TGT	2	6	1320796	1320801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564235
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23097	NC_017582	CTTA	2	8	1321234	1321241	25 %	50 %	0 %	25 %	414564235
23098	NC_017582	ATG	2	6	1321294	1321299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564235
23099	NC_017582	CAT	2	6	1321300	1321305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564235
23100	NC_017582	T	7	7	1321341	1321347	0 %	100 %	0 %	0 %	414564235
23101	NC_017582	CTG	2	6	1321455	1321460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564235
23102	NC_017582	AAT	2	6	1321471	1321476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564235
23103	NC_017582	ATT	2	6	1321489	1321494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564235
23104	NC_017582	CAC	2	6	1321512	1321517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564235
23105	NC_017582	ACG	2	6	1321528	1321533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564235
23106	NC_017582	AAT	3	9	1321603	1321611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564235
23107	NC_017582	TCA	2	6	1321649	1321654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564235
23108	NC_017582	TTA	2	6	1321712	1321717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564235
23109	NC_017582	ATTTC	2	10	1321725	1321734	20 %	60 %	0 %	20 %	414564235
23110	NC_017582	T	6	6	1321972	1321977	0 %	100 %	0 %	0 %	414564236
23111	NC_017582	TGG	2	6	1321984	1321989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564236
23112	NC_017582	TCA	2	6	1322078	1322083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564236
23113	NC_017582	GCT	2	6	1322111	1322116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564236
23114	NC_017582	GCT	2	6	1322135	1322140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564236
23115	NC_017582	ATG	2	6	1322147	1322152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564236
23116	NC_017582	TA	3	6	1322331	1322336	50 %	50 %	0 %	0 %	414564236
23117	NC_017582	GCT	2	6	1322339	1322344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564236
23118	NC_017582	CAG	2	6	1322397	1322402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564236
23119	NC_017582	AGC	2	6	1322422	1322427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564236
23120	NC_017582	CAA	2	6	1322595	1322600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564236
23121	NC_017582	ATT	2	6	1322611	1322616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564236
23122	NC_017582	GTT	2	6	1322635	1322640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564236
23123	NC_017582	CAA	2	6	1322646	1322651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564236
23124	NC_017582	T	6	6	1322703	1322708	0 %	100 %	0 %	0 %	414564236
23125	NC_017582	CTT	2	6	1322724	1322729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564236
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23128	NC_017582	ATC	2	6	1322875	1322880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564236
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23133	NC_017582	ATAGT	2	10	1323122	1323131	40 %	40 %	20 %	0 %	414564236
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23145	NC_017582	GCC	2	6	1323425	1323430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564236
23146	NC_017582	GCT	2	6	1323470	1323475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564236
23147	NC_017582	CCTG	2	8	1323548	1323555	0 %	25 %	25 %	50 %	414564236
23148	NC_017582	TCT	2	6	1323584	1323589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564236
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23204	NC_017582	ATT	2	6	1326175	1326180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564238
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23210	NC_017582	TCTGGA	2	12	1326591	1326602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414564239
23211	NC_017582	AGC	2	6	1326623	1326628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564239
23212	NC_017582	CTTG	2	8	1326637	1326644	0 %	50 %	25 %	25 %	414564239
23213	NC_017582	TTC	2	6	1326668	1326673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564239
23214	NC_017582	TAGG	2	8	1326698	1326705	25 %	25 %	50 %	0 %	414564239
23215	NC_017582	TCA	2	6	1326741	1326746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564239
23216	NC_017582	CTT	2	6	1326751	1326756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564239
23217	NC_017582	CAG	2	6	1326778	1326783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564239
23218	NC_017582	ACCAA	2	10	1326791	1326800	60 %	0 %	0 %	40 %	414564239
23219	NC_017582	CTCAAC	2	12	1326809	1326820	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414564239
23220	NC_017582	CAG	2	6	1326823	1326828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564239
23221	NC_017582	AGGTG	2	10	1326948	1326957	20 %	20 %	60 %	0 %	414564239
23222	NC_017582	GTT	2	6	1326998	1327003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564239
23223	NC_017582	TGC	2	6	1327037	1327042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564239
23224	NC_017582	TTG	2	6	1327075	1327080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564239
23225	NC_017582	TTG	2	6	1327110	1327115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564239
23226	NC_017582	GCA	2	6	1327140	1327145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564239
23227	NC_017582	GCC	2	6	1327226	1327231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564239
23228	NC_017582	AC	3	6	1327243	1327248	50 %	0 %	0 %	50 %	414564239
23229	NC_017582	TTACC	2	10	1327252	1327261	20 %	40 %	0 %	40 %	414564239
23230	NC_017582	CAT	2	6	1327274	1327279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564239
23231	NC_017582	GGT	2	6	1327324	1327329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564239
23232	NC_017582	A	6	6	1327333	1327338	100 %	0 %	0 %	0 %	414564239
23233	NC_017582	ATC	2	6	1327343	1327348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564239
23234	NC_017582	TGC	2	6	1327379	1327384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564239
23235	NC_017582	CTC	2	6	1327385	1327390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564239
23236	NC_017582	ACG	2	6	1327427	1327432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564239
23237	NC_017582	TTA	2	6	1327440	1327445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564239
23238	NC_017582	TGT	2	6	1327497	1327502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564239
23239	NC_017582	TCC	2	6	1328050	1328055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564240
23240	NC_017582	CAG	2	6	1328061	1328066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564240
23241	NC_017582	TAGCCT	2	12	1328159	1328170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414564240
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23243	NC_017582	CAG	2	6	1328270	1328275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564240
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23250	NC_017582	TCAA	2	8	1328476	1328483	50 %	25 %	0 %	25 %	414564240
23251	NC_017582	GGT	2	6	1328519	1328524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564240
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23261	NC_017582	T	7	7	1329103	1329109	0 %	100 %	0 %	0 %	414564240
23262	NC_017582	TGC	2	6	1329142	1329147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564240
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23336	NC_017582	TGA	2	6	1333511	1333516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564244
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23338	NC_017582	T	6	6	1333630	1333635	0 %	100 %	0 %	0 %	414564244
23339	NC_017582	CTG	2	6	1333636	1333641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564244
23340	NC_017582	CAT	2	6	1333654	1333659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564244
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23342	NC_017582	CCA	2	6	1333743	1333748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564244
23343	NC_017582	A	6	6	1333758	1333763	100 %	0 %	0 %	0 %	414564244
23344	NC_017582	CAT	2	6	1333789	1333794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564244
23345	NC_017582	TCA	2	6	1333812	1333817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564244
23346	NC_017582	ATT	2	6	1333823	1333828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564244
23347	NC_017582	AATT	2	8	1333847	1333854	50 %	50 %	0 %	0 %	414564244
23348	NC_017582	AAT	2	6	1333856	1333861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564244
23349	NC_017582	CCT	2	6	1333884	1333889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564245
23350	NC_017582	CTTT	2	8	1333899	1333906	0 %	75 %	0 %	25 %	414564245
23351	NC_017582	ACT	2	6	1333988	1333993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564245
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23373	NC_017582	TAAC	2	8	1335343	1335350	50 %	25 %	0 %	25 %	414564246
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23463	NC_017582	GCA	2	6	1340091	1340096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564249
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23465	NC_017582	AGGA	2	8	1340132	1340139	50 %	0 %	50 %	0 %	414564249
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23490	NC_017582	T	7	7	1341256	1341262	0 %	100 %	0 %	0 %	414564251
23491	NC_017582	ATT	2	6	1341459	1341464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564251
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