MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_017582	CACT	2	8	1260331	1260338	25 %	25 %	0 %	50 %	414564170
22003	NC_017582	TAC	2	6	1260376	1260381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564170
22004	NC_017582	ACTAA	2	10	1260400	1260409	60 %	20 %	0 %	20 %	414564170
22005	NC_017582	AAT	2	6	1260449	1260454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564170
22006	NC_017582	TAT	2	6	1261000	1261005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564171
22007	NC_017582	TCT	2	6	1261117	1261122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564171
22008	NC_017582	TTGA	2	8	1261162	1261169	25 %	50 %	25 %	0 %	414564171
22009	NC_017582	TCA	2	6	1261183	1261188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564171
22010	NC_017582	TG	3	6	1261265	1261270	0 %	50 %	50 %	0 %	414564171
22011	NC_017582	CAA	2	6	1261316	1261321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564171
22012	NC_017582	ACCTT	2	10	1261348	1261357	20 %	40 %	0 %	40 %	414564171
22013	NC_017582	AC	3	6	1261433	1261438	50 %	0 %	0 %	50 %	414564171
22014	NC_017582	TCA	2	6	1261450	1261455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564171
22015	NC_017582	AAC	2	6	1261494	1261499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564171
22016	NC_017582	ACC	2	6	1261560	1261565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564171
22017	NC_017582	TGCT	2	8	1261656	1261663	0 %	50 %	25 %	25 %	414564171
22018	NC_017582	GCT	2	6	1261666	1261671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564171
22019	NC_017582	ACG	2	6	1261686	1261691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564171
22020	NC_017582	GATAA	2	10	1261693	1261702	60 %	20 %	20 %	0 %	414564171
22021	NC_017582	CTG	2	6	1261712	1261717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564171
22022	NC_017582	CTT	2	6	1261724	1261729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564171
22023	NC_017582	CTTCAC	2	12	1261880	1261891	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414564171
22024	NC_017582	T	6	6	1261932	1261937	0 %	100 %	0 %	0 %	414564171
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22030	NC_017582	A	7	7	1262640	1262646	100 %	0 %	0 %	0 %	414564172
22031	NC_017582	TTG	2	6	1262752	1262757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564172
22032	NC_017582	TTG	2	6	1262766	1262771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564172
22033	NC_017582	T	7	7	1262792	1262798	0 %	100 %	0 %	0 %	414564172
22034	NC_017582	T	6	6	1262802	1262807	0 %	100 %	0 %	0 %	414564172
22035	NC_017582	TCA	2	6	1262810	1262815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564172
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22037	NC_017582	CAA	2	6	1263069	1263074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564173
22038	NC_017582	TTC	2	6	1263130	1263135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564173
22039	NC_017582	GCG	2	6	1263189	1263194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564173
22040	NC_017582	TAA	2	6	1263195	1263200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564173
22041	NC_017582	ATT	2	6	1263205	1263210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564173
22042	NC_017582	CTG	2	6	1263297	1263302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564173
22043	NC_017582	CTGC	2	8	1263329	1263336	0 %	25 %	25 %	50 %	414564173
22044	NC_017582	CCA	2	6	1263344	1263349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564173
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22051	NC_017582	CAAT	2	8	1263884	1263891	50 %	25 %	0 %	25 %	414564173
22052	NC_017582	TGT	2	6	1263895	1263900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564173
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22054	NC_017582	CT	3	6	1264044	1264049	0 %	50 %	0 %	50 %	414564174
22055	NC_017582	TTG	2	6	1264112	1264117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564174
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22059	NC_017582	CAG	2	6	1264268	1264273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564174
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22062	NC_017582	CTG	2	6	1264481	1264486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564174
22063	NC_017582	AGA	2	6	1264497	1264502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564174
22064	NC_017582	TCC	2	6	1264503	1264508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564174
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22086	NC_017582	CTG	2	6	1265153	1265158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564174
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22090	NC_017582	CAA	2	6	1265516	1265521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564174
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22099	NC_017582	GCT	2	6	1265796	1265801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564174
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22102	NC_017582	TGG	2	6	1265924	1265929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564174
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22105	NC_017582	T	7	7	1266052	1266058	0 %	100 %	0 %	0 %	414564174
22106	NC_017582	GCT	2	6	1266120	1266125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564174
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22117	NC_017582	TCC	2	6	1267101	1267106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564175
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22349	NC_017582	TGT	2	6	1280404	1280409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564188
22350	NC_017582	TTA	2	6	1280426	1280431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564188
22351	NC_017582	CAT	2	6	1280582	1280587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564188
22352	NC_017582	TGA	2	6	1280674	1280679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564188
22353	NC_017582	GAT	2	6	1280746	1280751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564188
22354	NC_017582	GTGA	2	8	1280783	1280790	25 %	25 %	50 %	0 %	414564188
22355	NC_017582	AGA	2	6	1280986	1280991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564188
22356	NC_017582	A	6	6	1281230	1281235	100 %	0 %	0 %	0 %	414564189
22357	NC_017582	GCTAA	2	10	1281238	1281247	40 %	20 %	20 %	20 %	414564189
22358	NC_017582	GAA	2	6	1281271	1281276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564189
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22360	NC_017582	CTT	2	6	1281378	1281383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564189
22361	NC_017582	GTC	2	6	1281433	1281438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564189
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22365	NC_017582	CAAG	2	8	1281668	1281675	50 %	0 %	25 %	25 %	414564189
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22367	NC_017582	CT	3	6	1281789	1281794	0 %	50 %	0 %	50 %	414564189
22368	NC_017582	TCA	2	6	1281923	1281928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564189
22369	NC_017582	CTG	2	6	1282118	1282123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564190
22370	NC_017582	ATA	2	6	1282177	1282182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564190
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22374	NC_017582	TCA	2	6	1282526	1282531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564190
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22379	NC_017582	ATG	2	6	1283060	1283065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564191
22380	NC_017582	AGG	2	6	1283159	1283164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564191
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22382	NC_017582	GT	3	6	1283195	1283200	0 %	50 %	50 %	0 %	414564191
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22387	NC_017582	CAGC	2	8	1283537	1283544	25 %	0 %	25 %	50 %	414564191
22388	NC_017582	ATA	2	6	1283641	1283646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564191
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22422	NC_017582	GCA	2	6	1285875	1285880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564195
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22450	NC_017582	ATC	2	6	1287008	1287013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564196
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22452	NC_017582	TCCT	2	8	1287147	1287154	0 %	50 %	0 %	50 %	414564197
22453	NC_017582	TGC	2	6	1287210	1287215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564197
22454	NC_017582	TAC	2	6	1287234	1287239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564197
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22456	NC_017582	CGGAAT	2	12	1287271	1287282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414564197
22457	NC_017582	ATT	2	6	1287284	1287289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564197
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22459	NC_017582	GTT	2	6	1287338	1287343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564197
22460	NC_017582	AGC	2	6	1287376	1287381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564197
22461	NC_017582	T	6	6	1287403	1287408	0 %	100 %	0 %	0 %	414564197
22462	NC_017582	AGC	2	6	1287442	1287447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564197
22463	NC_017582	CTTG	2	8	1287496	1287503	0 %	50 %	25 %	25 %	414564197
22464	NC_017582	TCA	2	6	1287558	1287563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564197
22465	NC_017582	CTTT	2	8	1287639	1287646	0 %	75 %	0 %	25 %	414564197
22466	NC_017582	CTT	2	6	1287724	1287729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564197
22467	NC_017582	T	6	6	1287769	1287774	0 %	100 %	0 %	0 %	414564197
22468	NC_017582	AGA	2	6	1287777	1287782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564197
22469	NC_017582	TCCC	2	8	1287795	1287802	0 %	25 %	0 %	75 %	414564197
22470	NC_017582	TGTTT	2	10	1287847	1287856	0 %	80 %	20 %	0 %	414564197
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22472	NC_017582	AAT	2	6	1287894	1287899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564197
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22485	NC_017582	TCA	2	6	1288548	1288553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564197
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22488	NC_017582	CTG	2	6	1288705	1288710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564197
22489	NC_017582	CT	3	6	1288747	1288752	0 %	50 %	0 %	50 %	414564198
22490	NC_017582	CCTTT	2	10	1288753	1288762	0 %	60 %	0 %	40 %	414564198
22491	NC_017582	CTT	2	6	1288795	1288800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564198
22492	NC_017582	ACG	2	6	1288808	1288813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564198
22493	NC_017582	CTC	2	6	1288829	1288834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564198
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22495	NC_017582	CGA	2	6	1288919	1288924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564198
22496	NC_017582	GCA	2	6	1288935	1288940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564198
22497	NC_017582	CTC	2	6	1288976	1288981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564198
22498	NC_017582	TC	3	6	1289048	1289053	0 %	50 %	0 %	50 %	414564198
22499	NC_017582	TGA	2	6	1289192	1289197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564199
22500	NC_017582	AG	3	6	1289307	1289312	50 %	0 %	50 %	0 %	414564199

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