MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_017582	AGCT	2	8	1231673	1231680	25 %	25 %	25 %	25 %	414564138
21502	NC_017582	TAA	2	6	1231762	1231767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564138
21503	NC_017582	TGCTTG	2	12	1231776	1231787	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414564138
21504	NC_017582	CCT	2	6	1231807	1231812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564138
21505	NC_017582	GTC	2	6	1231829	1231834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564138
21506	NC_017582	TCAC	2	8	1231881	1231888	25 %	25 %	0 %	50 %	414564138
21507	NC_017582	TC	3	6	1231903	1231908	0 %	50 %	0 %	50 %	414564138
21508	NC_017582	GCTTT	2	10	1232403	1232412	0 %	60 %	20 %	20 %	414564139
21509	NC_017582	TGT	3	9	1232421	1232429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564139
21510	NC_017582	A	6	6	1232433	1232438	100 %	0 %	0 %	0 %	414564139
21511	NC_017582	AAG	2	6	1232525	1232530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564139
21512	NC_017582	CAT	2	6	1232536	1232541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564139
21513	NC_017582	ATGG	2	8	1232573	1232580	25 %	25 %	50 %	0 %	414564139
21514	NC_017582	TGA	2	6	1232606	1232611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564139
21515	NC_017582	AAT	2	6	1232743	1232748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564139
21516	NC_017582	GATA	2	8	1232777	1232784	50 %	25 %	25 %	0 %	414564139
21517	NC_017582	AGGTA	2	10	1232797	1232806	40 %	20 %	40 %	0 %	414564139
21518	NC_017582	AAG	2	6	1232904	1232909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564139
21519	NC_017582	ACG	2	6	1232923	1232928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564139
21520	NC_017582	TCA	2	6	1232955	1232960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564139
21521	NC_017582	T	6	6	1232971	1232976	0 %	100 %	0 %	0 %	414564139
21522	NC_017582	CGA	2	6	1233020	1233025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564139
21523	NC_017582	ATG	2	6	1233040	1233045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564139
21524	NC_017582	TCA	2	6	1233047	1233052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564139
21525	NC_017582	TCT	2	6	1233092	1233097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564139
21526	NC_017582	CTTGA	2	10	1233109	1233118	20 %	40 %	20 %	20 %	414564139
21527	NC_017582	TAA	2	6	1233119	1233124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564139
21528	NC_017582	GAT	2	6	1233193	1233198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564140
21529	NC_017582	TC	3	6	1233241	1233246	0 %	50 %	0 %	50 %	414564140
21530	NC_017582	T	6	6	1233250	1233255	0 %	100 %	0 %	0 %	414564140
21531	NC_017582	TCT	2	6	1233329	1233334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564140
21532	NC_017582	TGG	2	6	1233354	1233359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564140
21533	NC_017582	CCTC	2	8	1233360	1233367	0 %	25 %	0 %	75 %	414564140
21534	NC_017582	ATCA	2	8	1233480	1233487	50 %	25 %	0 %	25 %	414564140
21535	NC_017582	TAT	2	6	1233498	1233503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564140
21536	NC_017582	AAT	2	6	1233524	1233529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564140
21537	NC_017582	TTTGC	2	10	1234139	1234148	0 %	60 %	20 %	20 %	414564141
21538	NC_017582	TAA	2	6	1234170	1234175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564141
21539	NC_017582	AGA	2	6	1234214	1234219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564141
21540	NC_017582	GGT	2	6	1234251	1234256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564141
21541	NC_017582	GTC	2	6	1234315	1234320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564141
21542	NC_017582	GAC	2	6	1234334	1234339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564141
21543	NC_017582	TTA	2	6	1234351	1234356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564141
21544	NC_017582	ACT	2	6	1234374	1234379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564141
21545	NC_017582	TTC	2	6	1234390	1234395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564141
21546	NC_017582	TCA	2	6	1234447	1234452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564141
21547	NC_017582	T	6	6	1234459	1234464	0 %	100 %	0 %	0 %	414564141
21548	NC_017582	CA	3	6	1234606	1234611	50 %	0 %	0 %	50 %	414564142
21549	NC_017582	ACT	2	6	1234612	1234617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564142
21550	NC_017582	ACCA	2	8	1234894	1234901	50 %	0 %	0 %	50 %	414564142
21551	NC_017582	AAG	2	6	1235072	1235077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564142
21552	NC_017582	CAA	2	6	1235113	1235118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564142
21553	NC_017582	CAT	2	6	1235119	1235124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564142
21554	NC_017582	TGGA	2	8	1235133	1235140	25 %	25 %	50 %	0 %	414564142
21555	NC_017582	ACG	2	6	1235196	1235201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564142
21556	NC_017582	TCA	2	6	1235208	1235213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564142
21557	NC_017582	CAA	2	6	1235405	1235410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564142
21558	NC_017582	AGC	2	6	1235414	1235419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564142
21559	NC_017582	GCAT	2	8	1235457	1235464	25 %	25 %	25 %	25 %	414564142
21560	NC_017582	ACAA	2	8	1235468	1235475	75 %	0 %	0 %	25 %	414564142
21561	NC_017582	GGT	2	6	1235479	1235484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564142
21562	NC_017582	AAGC	2	8	1235564	1235571	50 %	0 %	25 %	25 %	414564142
21563	NC_017582	GAG	2	6	1235594	1235599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564142
21564	NC_017582	CAG	2	6	1235608	1235613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564142
21565	NC_017582	CT	3	6	1235619	1235624	0 %	50 %	0 %	50 %	414564142
21566	NC_017582	AAT	2	6	1235717	1235722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564142
21567	NC_017582	TCA	2	6	1235724	1235729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564142
21568	NC_017582	TCA	2	6	1235733	1235738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564142
21569	NC_017582	A	6	6	1235807	1235812	100 %	0 %	0 %	0 %	414564142
21570	NC_017582	TCA	2	6	1236056	1236061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564143
21571	NC_017582	T	6	6	1236077	1236082	0 %	100 %	0 %	0 %	414564143
21572	NC_017582	CTTT	2	8	1236135	1236142	0 %	75 %	0 %	25 %	414564143
21573	NC_017582	A	6	6	1236191	1236196	100 %	0 %	0 %	0 %	414564143
21574	NC_017582	TTA	2	6	1236295	1236300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564144
21575	NC_017582	TCT	2	6	1236410	1236415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564144
21576	NC_017582	GTG	2	6	1236486	1236491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564144
21577	NC_017582	T	6	6	1236526	1236531	0 %	100 %	0 %	0 %	414564144
21578	NC_017582	ATA	2	6	1236597	1236602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564145
21579	NC_017582	TACTT	2	10	1236644	1236653	20 %	60 %	0 %	20 %	414564145
21580	NC_017582	TG	3	6	1236659	1236664	0 %	50 %	50 %	0 %	414564145
21581	NC_017582	T	7	7	1236670	1236676	0 %	100 %	0 %	0 %	414564145
21582	NC_017582	ATG	2	6	1236696	1236701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564145
21583	NC_017582	GCT	2	6	1236740	1236745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564145
21584	NC_017582	CTTA	2	8	1236818	1236825	25 %	50 %	0 %	25 %	414564146
21585	NC_017582	ATC	2	6	1236826	1236831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564146
21586	NC_017582	AAT	2	6	1236832	1236837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564146
21587	NC_017582	GTTT	2	8	1236874	1236881	0 %	75 %	25 %	0 %	414564146
21588	NC_017582	AGAC	2	8	1236897	1236904	50 %	0 %	25 %	25 %	414564146
21589	NC_017582	TAA	2	6	1237018	1237023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564147
21590	NC_017582	CCA	2	6	1237051	1237056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564147
21591	NC_017582	ATG	2	6	1237156	1237161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564147
21592	NC_017582	CAG	2	6	1237169	1237174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564147
21593	NC_017582	AAG	2	6	1237204	1237209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564147
21594	NC_017582	GCT	2	6	1237253	1237258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564147
21595	NC_017582	CTTA	2	8	1237260	1237267	25 %	50 %	0 %	25 %	414564147
21596	NC_017582	A	6	6	1237381	1237386	100 %	0 %	0 %	0 %	414564147
21597	NC_017582	CAA	2	6	1237388	1237393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564147
21598	NC_017582	CAC	2	6	1237403	1237408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564147
21599	NC_017582	AAT	2	6	1237413	1237418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564147
21600	NC_017582	AAC	2	6	1237422	1237427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564147
21601	NC_017582	A	6	6	1237449	1237454	100 %	0 %	0 %	0 %	414564147
21602	NC_017582	GAT	2	6	1237475	1237480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564147
21603	NC_017582	ATT	2	6	1237509	1237514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564147
21604	NC_017582	AAT	2	6	1237515	1237520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564147
21605	NC_017582	TAA	2	6	1237532	1237537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564147
21606	NC_017582	ACA	2	6	1237543	1237548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564147
21607	NC_017582	GCTT	3	12	1237659	1237670	0 %	50 %	25 %	25 %	414564148
21608	NC_017582	GCA	2	6	1237680	1237685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564148
21609	NC_017582	ATA	2	6	1237694	1237699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564148
21610	NC_017582	ATA	2	6	1237718	1237723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564148
21611	NC_017582	GCT	2	6	1237751	1237756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564148
21612	NC_017582	AC	3	6	1237790	1237795	50 %	0 %	0 %	50 %	414564148
21613	NC_017582	AGC	3	9	1237805	1237813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564148
21614	NC_017582	TCAA	2	8	1237850	1237857	50 %	25 %	0 %	25 %	414564148
21615	NC_017582	ATG	2	6	1237943	1237948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564148
21616	NC_017582	ACC	2	6	1237963	1237968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564148
21617	NC_017582	AAG	2	6	1237972	1237977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564148
21618	NC_017582	CAA	2	6	1237998	1238003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564148
21619	NC_017582	TAA	2	6	1238040	1238045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564148
21620	NC_017582	CCT	2	6	1238076	1238081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564148
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21622	NC_017582	AGC	2	6	1238107	1238112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564148
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21625	NC_017582	CCT	2	6	1238256	1238261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564148
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21629	NC_017582	T	6	6	1238446	1238451	0 %	100 %	0 %	0 %	414564148
21630	NC_017582	AAT	2	6	1238460	1238465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564148
21631	NC_017582	TCT	2	6	1238499	1238504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564148
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21633	NC_017582	ATT	2	6	1238533	1238538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564148
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21644	NC_017582	ACC	2	6	1239117	1239122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564149
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21648	NC_017582	TCTA	2	8	1239384	1239391	25 %	50 %	0 %	25 %	414564149
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21653	NC_017582	T	6	6	1239555	1239560	0 %	100 %	0 %	0 %	414564149
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21682	NC_017582	AAAG	2	8	1241400	1241407	75 %	0 %	25 %	0 %	414564151
21683	NC_017582	TCA	2	6	1241488	1241493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564151
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21687	NC_017582	TGC	2	6	1241950	1241955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564151
21688	NC_017582	CAA	2	6	1242074	1242079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564151
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21704	NC_017582	ATAGA	2	10	1243020	1243029	60 %	20 %	20 %	0 %	414564151
21705	NC_017582	AGCG	2	8	1243123	1243130	25 %	0 %	50 %	25 %	414564151
21706	NC_017582	GAC	2	6	1243208	1243213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564151
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21713	NC_017582	GT	3	6	1243591	1243596	0 %	50 %	50 %	0 %	414564151
21714	NC_017582	TGC	2	6	1243622	1243627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564151
21715	NC_017582	AAC	2	6	1243629	1243634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564151
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21717	NC_017582	ACC	2	6	1243782	1243787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564151
21718	NC_017582	GTC	2	6	1243870	1243875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564151
21719	NC_017582	TAAA	2	8	1243925	1243932	75 %	25 %	0 %	0 %	414564151
21720	NC_017582	AGC	2	6	1243975	1243980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564151
21721	NC_017582	ACC	2	6	1244046	1244051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564151
21722	NC_017582	CTTTC	2	10	1244077	1244086	0 %	60 %	0 %	40 %	414564151
21723	NC_017582	TGTC	2	8	1244150	1244157	0 %	50 %	25 %	25 %	414564151
21724	NC_017582	TCG	2	6	1244162	1244167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564151
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21726	NC_017582	CTGC	2	8	1244252	1244259	0 %	25 %	25 %	50 %	414564151
21727	NC_017582	T	7	7	1244294	1244300	0 %	100 %	0 %	0 %	414564151
21728	NC_017582	ATA	2	6	1244320	1244325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564151
21729	NC_017582	TGC	2	6	1244748	1244753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564152
21730	NC_017582	TCA	2	6	1244787	1244792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564152
21731	NC_017582	ATAG	2	8	1244794	1244801	50 %	25 %	25 %	0 %	414564152
21732	NC_017582	CAT	2	6	1244806	1244811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564152
21733	NC_017582	AGCTA	2	10	1245059	1245068	40 %	20 %	20 %	20 %	414564152
21734	NC_017582	AGC	2	6	1245069	1245074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564152
21735	NC_017582	ATC	2	6	1245126	1245131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564152
21736	NC_017582	TCT	2	6	1245210	1245215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564152
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21738	NC_017582	CAT	2	6	1245424	1245429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564152
21739	NC_017582	TTG	2	6	1245436	1245441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564152
21740	NC_017582	GCTA	2	8	1245560	1245567	25 %	25 %	25 %	25 %	414564152
21741	NC_017582	ATC	2	6	1245623	1245628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564152
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21744	NC_017582	CTA	2	6	1245950	1245955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564153
21745	NC_017582	ATA	2	6	1246000	1246005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564153
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21747	NC_017582	CAT	2	6	1246091	1246096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564153
21748	NC_017582	TGC	2	6	1246105	1246110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564153
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21753	NC_017582	ATC	2	6	1246443	1246448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564153
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21762	NC_017582	TTG	2	6	1246984	1246989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564154
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21795	NC_017582	ACG	2	6	1248495	1248500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564155
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21802	NC_017582	GCA	3	9	1249095	1249103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564156
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21819	NC_017582	AGA	2	6	1250232	1250237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564157
21820	NC_017582	TGATA	2	10	1250246	1250255	40 %	40 %	20 %	0 %	414564157
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21834	NC_017582	ACC	2	6	1250822	1250827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564158
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21840	NC_017582	CAT	2	6	1251167	1251172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564159
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21842	NC_017582	CTTT	2	8	1251286	1251293	0 %	75 %	0 %	25 %	414564160
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21844	NC_017582	GCA	2	6	1251341	1251346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564160
21845	NC_017582	TA	3	6	1251518	1251523	50 %	50 %	0 %	0 %	414564160
21846	NC_017582	CTTG	2	8	1251532	1251539	0 %	50 %	25 %	25 %	414564160
21847	NC_017582	AAT	2	6	1251558	1251563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564160
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21849	NC_017582	AGAT	2	8	1251758	1251765	50 %	25 %	25 %	0 %	414564160
21850	NC_017582	TCG	2	6	1251813	1251818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564160
21851	NC_017582	CAT	2	6	1251849	1251854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564160
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