MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017582	A	7	7	1096560	1096566	100 %	0 %	0 %	0 %	414564008
19003	NC_017582	CTT	2	6	1096593	1096598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564008
19004	NC_017582	A	6	6	1096605	1096610	100 %	0 %	0 %	0 %	414564008
19005	NC_017582	T	7	7	1096762	1096768	0 %	100 %	0 %	0 %	414564009
19006	NC_017582	TGA	2	6	1096828	1096833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564009
19007	NC_017582	GTA	2	6	1096855	1096860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564009
19008	NC_017582	GAG	2	6	1096898	1096903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564009
19009	NC_017582	TACC	2	8	1096934	1096941	25 %	25 %	0 %	50 %	414564009
19010	NC_017582	T	6	6	1096943	1096948	0 %	100 %	0 %	0 %	414564009
19011	NC_017582	AAG	2	6	1096999	1097004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564009
19012	NC_017582	AGC	2	6	1097079	1097084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564009
19013	NC_017582	TC	3	6	1097098	1097103	0 %	50 %	0 %	50 %	414564009
19014	NC_017582	CAT	2	6	1097133	1097138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564009
19015	NC_017582	CAG	2	6	1097199	1097204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564009
19016	NC_017582	T	6	6	1097236	1097241	0 %	100 %	0 %	0 %	414564009
19017	NC_017582	AAG	2	6	1097246	1097251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564009
19018	NC_017582	A	7	7	1097326	1097332	100 %	0 %	0 %	0 %	414564009
19019	NC_017582	GCT	2	6	1097359	1097364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564009
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19024	NC_017582	T	6	6	1097583	1097588	0 %	100 %	0 %	0 %	414564009
19025	NC_017582	AGT	2	6	1097604	1097609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564009
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19033	NC_017582	TGC	2	6	1097983	1097988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564010
19034	NC_017582	TGGCT	2	10	1098035	1098044	0 %	40 %	40 %	20 %	414564010
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19037	NC_017582	TAC	2	6	1098159	1098164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564010
19038	NC_017582	CTAG	2	8	1098166	1098173	25 %	25 %	25 %	25 %	414564010
19039	NC_017582	TCA	2	6	1098236	1098241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564010
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19041	NC_017582	TGG	2	6	1098287	1098292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564010
19042	NC_017582	GTT	2	6	1098343	1098348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564010
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19044	NC_017582	TTTG	2	8	1098392	1098399	0 %	75 %	25 %	0 %	414564010
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19051	NC_017582	GTT	2	6	1100162	1100167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564011
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19089	NC_017582	TAA	2	6	1102367	1102372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564013
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19102	NC_017582	TAT	3	9	1102899	1102907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564014
19103	NC_017582	TAAAAT	2	12	1102934	1102945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564014
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19105	NC_017582	CTTT	2	8	1103008	1103015	0 %	75 %	0 %	25 %	414564014
19106	NC_017582	T	8	8	1103059	1103066	0 %	100 %	0 %	0 %	414564014
19107	NC_017582	TAT	2	6	1103079	1103084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564014
19108	NC_017582	T	7	7	1103143	1103149	0 %	100 %	0 %	0 %	414564014
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19115	NC_017582	TTTG	2	8	1103719	1103726	0 %	75 %	25 %	0 %	414564015
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19117	NC_017582	TCA	2	6	1103822	1103827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
19118	NC_017582	T	6	6	1103845	1103850	0 %	100 %	0 %	0 %	414564015
19119	NC_017582	ATC	2	6	1103851	1103856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
19120	NC_017582	TCT	2	6	1103903	1103908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19121	NC_017582	GTTT	2	8	1103951	1103958	0 %	75 %	25 %	0 %	414564015
19122	NC_017582	TCT	2	6	1104005	1104010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19123	NC_017582	TCT	2	6	1104058	1104063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19124	NC_017582	GCT	2	6	1104116	1104121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564015
19125	NC_017582	CAA	2	6	1104156	1104161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564015
19126	NC_017582	ATCA	2	8	1104181	1104188	50 %	25 %	0 %	25 %	414564015
19127	NC_017582	CAA	2	6	1104198	1104203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564015
19128	NC_017582	AC	3	6	1104222	1104227	50 %	0 %	0 %	50 %	414564015
19129	NC_017582	T	6	6	1104277	1104282	0 %	100 %	0 %	0 %	414564015
19130	NC_017582	CAA	2	6	1104321	1104326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564015
19131	NC_017582	ACA	2	6	1104461	1104466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564015
19132	NC_017582	AATTAG	2	12	1104480	1104491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414564015
19133	NC_017582	TTC	2	6	1104622	1104627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19134	NC_017582	TCT	2	6	1104650	1104655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19135	NC_017582	TTCC	2	8	1104664	1104671	0 %	50 %	0 %	50 %	414564015
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19137	NC_017582	ATC	2	6	1104737	1104742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
19138	NC_017582	T	7	7	1104745	1104751	0 %	100 %	0 %	0 %	414564015
19139	NC_017582	TCA	2	6	1104767	1104772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
19140	NC_017582	ATA	2	6	1104834	1104839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564015
19141	NC_017582	TTC	2	6	1104871	1104876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19142	NC_017582	TGT	2	6	1104886	1104891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564015
19143	NC_017582	ATA	2	6	1104916	1104921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564015
19144	NC_017582	TTTC	2	8	1104930	1104937	0 %	75 %	0 %	25 %	414564015
19145	NC_017582	TCT	2	6	1104944	1104949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19146	NC_017582	TATC	2	8	1105028	1105035	25 %	50 %	0 %	25 %	414564015
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19148	NC_017582	TCA	2	6	1105064	1105069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
19149	NC_017582	CTT	2	6	1105155	1105160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19150	NC_017582	TTC	2	6	1105166	1105171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19151	NC_017582	TGC	2	6	1105176	1105181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564015
19152	NC_017582	ATA	2	6	1105223	1105228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564015
19153	NC_017582	ATA	2	6	1105242	1105247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564015
19154	NC_017582	TTGTA	2	10	1105270	1105279	20 %	60 %	20 %	0 %	414564015
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19156	NC_017582	GTTT	2	8	1105302	1105309	0 %	75 %	25 %	0 %	414564015
19157	NC_017582	T	6	6	1105307	1105312	0 %	100 %	0 %	0 %	414564015
19158	NC_017582	ATC	2	6	1105327	1105332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
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19162	NC_017582	A	7	7	1105490	1105496	100 %	0 %	0 %	0 %	414564015
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19165	NC_017582	ATC	2	6	1105651	1105656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
19166	NC_017582	CT	4	8	1105692	1105699	0 %	50 %	0 %	50 %	414564015
19167	NC_017582	T	6	6	1105745	1105750	0 %	100 %	0 %	0 %	414564015
19168	NC_017582	ATA	2	6	1105783	1105788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564015
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19170	NC_017582	CAT	2	6	1105849	1105854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
19171	NC_017582	TCA	2	6	1105863	1105868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564015
19172	NC_017582	TCT	2	6	1106002	1106007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564015
19173	NC_017582	T	7	7	1106010	1106016	0 %	100 %	0 %	0 %	414564015
19174	NC_017582	ATG	2	6	1106530	1106535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564016
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19176	NC_017582	T	6	6	1106634	1106639	0 %	100 %	0 %	0 %	414564016
19177	NC_017582	T	6	6	1106650	1106655	0 %	100 %	0 %	0 %	414564016
19178	NC_017582	TGC	2	6	1106725	1106730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564016
19179	NC_017582	AGT	2	6	1106768	1106773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564016
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19182	NC_017582	AAT	2	6	1106882	1106887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564016
19183	NC_017582	AT	3	6	1106934	1106939	50 %	50 %	0 %	0 %	414564016
19184	NC_017582	CAAT	2	8	1106954	1106961	50 %	25 %	0 %	25 %	414564016
19185	NC_017582	AT	3	6	1106960	1106965	50 %	50 %	0 %	0 %	414564016
19186	NC_017582	A	6	6	1107025	1107030	100 %	0 %	0 %	0 %	414564016
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19188	NC_017582	ATTC	2	8	1107096	1107103	25 %	50 %	0 %	25 %	414564016
19189	NC_017582	TA	3	6	1107105	1107110	50 %	50 %	0 %	0 %	414564016
19190	NC_017582	TCA	2	6	1107152	1107157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564016
19191	NC_017582	AT	3	6	1107207	1107212	50 %	50 %	0 %	0 %	414564016
19192	NC_017582	GCA	2	6	1107238	1107243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564016
19193	NC_017582	T	6	6	1107285	1107290	0 %	100 %	0 %	0 %	414564016
19194	NC_017582	TA	3	6	1107321	1107326	50 %	50 %	0 %	0 %	414564016
19195	NC_017582	ATC	2	6	1107338	1107343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564016
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19199	NC_017582	TA	3	6	1107455	1107460	50 %	50 %	0 %	0 %	414564017
19200	NC_017582	ATTG	2	8	1107467	1107474	25 %	50 %	25 %	0 %	414564017
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19202	NC_017582	GTA	2	6	1107615	1107620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564017
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19204	NC_017582	ATG	2	6	1107665	1107670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564017
19205	NC_017582	TC	3	6	1107675	1107680	0 %	50 %	0 %	50 %	414564017
19206	NC_017582	CT	3	6	1107682	1107687	0 %	50 %	0 %	50 %	414564017
19207	NC_017582	ACT	2	6	1107722	1107727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564017
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19212	NC_017582	AT	3	6	1107875	1107880	50 %	50 %	0 %	0 %	414564017
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19216	NC_017582	AGT	2	6	1107986	1107991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564017
19217	NC_017582	ATCAAT	2	12	1108039	1108050	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414564017
19218	NC_017582	CA	3	6	1108053	1108058	50 %	0 %	0 %	50 %	414564017
19219	NC_017582	AT	3	6	1108138	1108143	50 %	50 %	0 %	0 %	414564017
19220	NC_017582	TGA	2	6	1108156	1108161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564017
19221	NC_017582	GAA	2	6	1108202	1108207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564017
19222	NC_017582	T	8	8	1108221	1108228	0 %	100 %	0 %	0 %	414564017
19223	NC_017582	ATT	2	6	1108229	1108234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564017
19224	NC_017582	ATA	2	6	1110082	1110087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564018
19225	NC_017582	TTA	2	6	1110163	1110168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564018
19226	NC_017582	TTCT	2	8	1110204	1110211	0 %	75 %	0 %	25 %	414564018
19227	NC_017582	CTG	2	6	1110494	1110499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564019
19228	NC_017582	CCT	2	6	1110520	1110525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564019
19229	NC_017582	TTCT	2	8	1110611	1110618	0 %	75 %	0 %	25 %	414564019
19230	NC_017582	T	6	6	1110653	1110658	0 %	100 %	0 %	0 %	414564019
19231	NC_017582	TTCC	2	8	1110688	1110695	0 %	50 %	0 %	50 %	414564019
19232	NC_017582	T	7	7	1110704	1110710	0 %	100 %	0 %	0 %	414564019
19233	NC_017582	TCA	3	9	1110784	1110792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564019
19234	NC_017582	T	6	6	1110813	1110818	0 %	100 %	0 %	0 %	414564019
19235	NC_017582	T	6	6	1110839	1110844	0 %	100 %	0 %	0 %	414564019
19236	NC_017582	GAT	2	6	1110939	1110944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564019
19237	NC_017582	TAT	2	6	1111004	1111009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564019
19238	NC_017582	CTG	2	6	1111015	1111020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564019
19239	NC_017582	GTC	2	6	1111023	1111028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564019
19240	NC_017582	TTCTTT	2	12	1111112	1111123	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414564019
19241	NC_017582	CTG	2	6	1111193	1111198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564019
19242	NC_017582	CTTT	2	8	1111201	1111208	0 %	75 %	0 %	25 %	414564019
19243	NC_017582	TATCAA	2	12	1111303	1111314	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414564019
19244	NC_017582	T	6	6	1111343	1111348	0 %	100 %	0 %	0 %	414564019
19245	NC_017582	TTC	2	6	1111381	1111386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564019
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19247	NC_017582	AC	3	6	1111704	1111709	50 %	0 %	0 %	50 %	414564020
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19249	NC_017582	ATC	3	9	1111735	1111743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564020
19250	NC_017582	TCCTT	2	10	1111756	1111765	0 %	60 %	0 %	40 %	414564020
19251	NC_017582	T	6	6	1111771	1111776	0 %	100 %	0 %	0 %	414564020
19252	NC_017582	ATG	2	6	1111788	1111793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564020
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19256	NC_017582	T	6	6	1111839	1111844	0 %	100 %	0 %	0 %	414564020
19257	NC_017582	GTT	2	6	1111867	1111872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564020
19258	NC_017582	TGT	2	6	1111971	1111976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564020
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19267	NC_017582	TATCT	2	10	1112283	1112292	20 %	60 %	0 %	20 %	414564020
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19274	NC_017582	T	6	6	1112514	1112519	0 %	100 %	0 %	0 %	414564020
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19280	NC_017582	AACA	2	8	1112772	1112779	75 %	0 %	0 %	25 %	414564020
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19337	NC_017582	TTG	2	6	1116773	1116778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564024
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19340	NC_017582	ATT	2	6	1116982	1116987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564024
19341	NC_017582	T	6	6	1116992	1116997	0 %	100 %	0 %	0 %	414564024
19342	NC_017582	ATC	2	6	1117093	1117098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564024
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19344	NC_017582	ATC	2	6	1117129	1117134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564024
19345	NC_017582	ATCC	2	8	1117155	1117162	25 %	25 %	0 %	50 %	414564024
19346	NC_017582	ACT	2	6	1117168	1117173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564024
19347	NC_017582	T	6	6	1117272	1117277	0 %	100 %	0 %	0 %	414564024
19348	NC_017582	CGG	2	6	1117345	1117350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564024
19349	NC_017582	TTAT	2	8	1117373	1117380	25 %	75 %	0 %	0 %	414564024
19350	NC_017582	TCC	2	6	1117534	1117539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564025
19351	NC_017582	T	6	6	1117560	1117565	0 %	100 %	0 %	0 %	414564025
19352	NC_017582	ATC	2	6	1117582	1117587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564025
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19477	NC_017582	TAC	2	6	1123223	1123228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564031
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