MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017582	TCT	3	9	1036503	1036511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563954
18002	NC_017582	CAT	2	6	1036512	1036517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563954
18003	NC_017582	CCA	2	6	1036571	1036576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563954
18004	NC_017582	AGT	2	6	1036588	1036593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563954
18005	NC_017582	TCT	2	6	1036608	1036613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563954
18006	NC_017582	TAT	2	6	1036645	1036650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563954
18007	NC_017582	A	6	6	1036658	1036663	100 %	0 %	0 %	0 %	414563954
18008	NC_017582	TCA	2	6	1036719	1036724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563955
18009	NC_017582	TGG	2	6	1036763	1036768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563955
18010	NC_017582	TGG	2	6	1036903	1036908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563955
18011	NC_017582	GAG	2	6	1036909	1036914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563955
18012	NC_017582	TTG	2	6	1036915	1036920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563955
18013	NC_017582	CTG	2	6	1037001	1037006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563955
18014	NC_017582	ATA	2	6	1037062	1037067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563955
18015	NC_017582	AT	3	6	1037128	1037133	50 %	50 %	0 %	0 %	414563955
18016	NC_017582	TTTC	2	8	1037176	1037183	0 %	75 %	0 %	25 %	414563955
18017	NC_017582	TTGCGC	2	12	1037220	1037231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563955
18018	NC_017582	AGC	2	6	1037252	1037257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563955
18019	NC_017582	TGG	2	6	1037330	1037335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563955
18020	NC_017582	TGCTA	2	10	1037444	1037453	20 %	40 %	20 %	20 %	414563955
18021	NC_017582	A	6	6	1037518	1037523	100 %	0 %	0 %	0 %	414563955
18022	NC_017582	GCT	2	6	1037577	1037582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563955
18023	NC_017582	ATCAA	2	10	1037628	1037637	60 %	20 %	0 %	20 %	414563955
18024	NC_017582	A	6	6	1037641	1037646	100 %	0 %	0 %	0 %	414563955
18025	NC_017582	T	6	6	1038190	1038195	0 %	100 %	0 %	0 %	414563956
18026	NC_017582	AATTT	2	10	1038237	1038246	40 %	60 %	0 %	0 %	414563956
18027	NC_017582	ATC	2	6	1038284	1038289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563956
18028	NC_017582	GGA	2	6	1038318	1038323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563956
18029	NC_017582	GCT	2	6	1038456	1038461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563956
18030	NC_017582	T	6	6	1038493	1038498	0 %	100 %	0 %	0 %	414563956
18031	NC_017582	TCA	2	6	1038528	1038533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563956
18032	NC_017582	GTA	2	6	1038566	1038571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563956
18033	NC_017582	GCA	2	6	1038573	1038578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563956
18034	NC_017582	CCA	2	6	1038586	1038591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563956
18035	NC_017582	CTC	2	6	1038653	1038658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563956
18036	NC_017582	TTC	2	6	1038689	1038694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563956
18037	NC_017582	T	6	6	1038706	1038711	0 %	100 %	0 %	0 %	414563956
18038	NC_017582	CT	3	6	1038762	1038767	0 %	50 %	0 %	50 %	414563956
18039	NC_017582	AGC	2	6	1038812	1038817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563956
18040	NC_017582	CTG	2	6	1038839	1038844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563956
18041	NC_017582	CTGC	2	8	1038916	1038923	0 %	25 %	25 %	50 %	414563956
18042	NC_017582	CAA	2	6	1038964	1038969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563956
18043	NC_017582	CTC	2	6	1038998	1039003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563956
18044	NC_017582	ATCTGG	2	12	1039058	1039069	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414563956
18045	NC_017582	ACC	2	6	1039086	1039091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563956
18046	NC_017582	ACG	2	6	1039124	1039129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563956
18047	NC_017582	TGA	2	6	1039195	1039200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563956
18048	NC_017582	CCG	2	6	1039383	1039388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563956
18049	NC_017582	GCT	2	6	1039539	1039544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563956
18050	NC_017582	CTT	2	6	1039616	1039621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563956
18051	NC_017582	AGC	2	6	1039622	1039627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563956
18052	NC_017582	TGC	2	6	1039649	1039654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563956
18053	NC_017582	AAC	2	6	1039676	1039681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563956
18054	NC_017582	TTTGT	2	10	1039770	1039779	0 %	80 %	20 %	0 %	414563956
18055	NC_017582	TAT	2	6	1040041	1040046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563957
18056	NC_017582	T	6	6	1040049	1040054	0 %	100 %	0 %	0 %	414563957
18057	NC_017582	GA	3	6	1040197	1040202	50 %	0 %	50 %	0 %	414563957
18058	NC_017582	CAA	2	6	1040228	1040233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563957
18059	NC_017582	TAA	2	6	1040281	1040286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563957
18060	NC_017582	GCA	2	6	1040312	1040317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563957
18061	NC_017582	ATC	2	6	1040323	1040328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563957
18062	NC_017582	TTG	2	6	1040375	1040380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563957
18063	NC_017582	CCT	2	6	1040428	1040433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563957
18064	NC_017582	CAA	2	6	1040471	1040476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563957
18065	NC_017582	A	7	7	1040525	1040531	100 %	0 %	0 %	0 %	414563957
18066	NC_017582	GCT	2	6	1040535	1040540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563957
18067	NC_017582	A	6	6	1040568	1040573	100 %	0 %	0 %	0 %	414563957
18068	NC_017582	GA	3	6	1040585	1040590	50 %	0 %	50 %	0 %	414563957
18069	NC_017582	AGA	2	6	1040595	1040600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563957
18070	NC_017582	TGT	2	6	1040603	1040608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563957
18071	NC_017582	GCT	2	6	1040682	1040687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563958
18072	NC_017582	ATC	2	6	1040707	1040712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563958
18073	NC_017582	CGC	2	6	1040742	1040747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563958
18074	NC_017582	GGT	2	6	1040768	1040773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563958
18075	NC_017582	TAGGGC	2	12	1040884	1040895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414563958
18076	NC_017582	AAAT	2	8	1040971	1040978	75 %	25 %	0 %	0 %	414563958
18077	NC_017582	TAGC	2	8	1040988	1040995	25 %	25 %	25 %	25 %	414563958
18078	NC_017582	CAT	2	6	1041018	1041023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563958
18079	NC_017582	TCA	2	6	1041108	1041113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563958
18080	NC_017582	T	6	6	1041133	1041138	0 %	100 %	0 %	0 %	414563958
18081	NC_017582	ACTG	2	8	1041144	1041151	25 %	25 %	25 %	25 %	414563958
18082	NC_017582	TAC	2	6	1041180	1041185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563958
18083	NC_017582	TAT	2	6	1041221	1041226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563959
18084	NC_017582	CTC	2	6	1041251	1041256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563959
18085	NC_017582	GCAGA	2	10	1041267	1041276	40 %	0 %	40 %	20 %	414563959
18086	NC_017582	CTA	2	6	1041340	1041345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563959
18087	NC_017582	TA	3	6	1041344	1041349	50 %	50 %	0 %	0 %	414563959
18088	NC_017582	CTC	2	6	1041395	1041400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563959
18089	NC_017582	ATTCC	2	10	1041449	1041458	20 %	40 %	0 %	40 %	414563959
18090	NC_017582	T	7	7	1041484	1041490	0 %	100 %	0 %	0 %	414563959
18091	NC_017582	AAGA	2	8	1041491	1041498	75 %	0 %	25 %	0 %	414563959
18092	NC_017582	TTGC	2	8	1041540	1041547	0 %	50 %	25 %	25 %	414563959
18093	NC_017582	CAG	2	6	1041571	1041576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563959
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18095	NC_017582	TCA	2	6	1041679	1041684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563959
18096	NC_017582	GCT	2	6	1041724	1041729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563959
18097	NC_017582	TGT	2	6	1041752	1041757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563959
18098	NC_017582	TAT	2	6	1041800	1041805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563959
18099	NC_017582	TAA	2	6	1041884	1041889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563959
18100	NC_017582	TGA	2	6	1042179	1042184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563960
18101	NC_017582	A	6	6	1042226	1042231	100 %	0 %	0 %	0 %	414563960
18102	NC_017582	CAG	2	6	1042295	1042300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563960
18103	NC_017582	A	7	7	1042357	1042363	100 %	0 %	0 %	0 %	414563960
18104	NC_017582	CT	3	6	1042386	1042391	0 %	50 %	0 %	50 %	414563960
18105	NC_017582	GTG	2	6	1042415	1042420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563960
18106	NC_017582	GGC	2	6	1042429	1042434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563960
18107	NC_017582	TTC	2	6	1042445	1042450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563960
18108	NC_017582	ATGC	2	8	1042486	1042493	25 %	25 %	25 %	25 %	414563960
18109	NC_017582	CAG	2	6	1042543	1042548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563960
18110	NC_017582	CGT	2	6	1042573	1042578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563960
18111	NC_017582	ATC	2	6	1042579	1042584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563960
18112	NC_017582	TTG	2	6	1042631	1042636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563960
18113	NC_017582	TGG	2	6	1042902	1042907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563960
18114	NC_017582	TTCTG	2	10	1042938	1042947	0 %	60 %	20 %	20 %	414563960
18115	NC_017582	GTT	2	6	1043071	1043076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563960
18116	NC_017582	TTG	2	6	1043078	1043083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563960
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