MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017582	AGCT	2	8	928328	928335	25 %	25 %	25 %	25 %	414563845
16002	NC_017582	TGC	2	6	928434	928439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563845
16003	NC_017582	TGA	2	6	928527	928532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563845
16004	NC_017582	T	7	7	928577	928583	0 %	100 %	0 %	0 %	414563845
16005	NC_017582	AAC	2	6	928627	928632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563845
16006	NC_017582	AC	3	6	928631	928636	50 %	0 %	0 %	50 %	414563845
16007	NC_017582	TGA	2	6	928647	928652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563845
16008	NC_017582	AGC	2	6	928679	928684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563845
16009	NC_017582	TCTG	2	8	928689	928696	0 %	50 %	25 %	25 %	414563845
16010	NC_017582	TAA	2	6	928727	928732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563845
16011	NC_017582	AAAG	2	8	928846	928853	75 %	0 %	25 %	0 %	414563845
16012	NC_017582	GAAT	2	8	928874	928881	50 %	25 %	25 %	0 %	414563845
16013	NC_017582	GAG	2	6	928882	928887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563845
16014	NC_017582	GCA	2	6	928942	928947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16015	NC_017582	GGA	2	6	928948	928953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563846
16016	NC_017582	ACAGC	2	10	928982	928991	40 %	0 %	20 %	40 %	414563846
16017	NC_017582	CTG	2	6	929040	929045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16018	NC_017582	AGC	2	6	929143	929148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16019	NC_017582	AG	3	6	929161	929166	50 %	0 %	50 %	0 %	414563846
16020	NC_017582	A	7	7	929172	929178	100 %	0 %	0 %	0 %	414563846
16021	NC_017582	CA	3	6	929183	929188	50 %	0 %	0 %	50 %	414563846
16022	NC_017582	GATG	2	8	929272	929279	25 %	25 %	50 %	0 %	414563846
16023	NC_017582	CGT	2	6	929465	929470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16024	NC_017582	AG	3	6	929489	929494	50 %	0 %	50 %	0 %	414563846
16025	NC_017582	TTG	2	6	929496	929501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563846
16026	NC_017582	TCAA	2	8	929521	929528	50 %	25 %	0 %	25 %	414563846
16027	NC_017582	AGC	2	6	929540	929545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16028	NC_017582	G	6	6	929568	929573	0 %	0 %	100 %	0 %	414563846
16029	NC_017582	CT	3	6	929622	929627	0 %	50 %	0 %	50 %	414563846
16030	NC_017582	CTG	2	6	929646	929651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16031	NC_017582	AAC	2	6	929692	929697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563846
16032	NC_017582	CTTC	2	8	929834	929841	0 %	50 %	0 %	50 %	414563846
16033	NC_017582	AGC	2	6	929898	929903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16034	NC_017582	CAG	2	6	929942	929947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16035	NC_017582	TGC	2	6	929970	929975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16036	NC_017582	CAG	2	6	930077	930082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16037	NC_017582	TGA	2	6	930133	930138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563846
16038	NC_017582	TGT	2	6	930180	930185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563846
16039	NC_017582	TCAA	2	8	930264	930271	50 %	25 %	0 %	25 %	414563846
16040	NC_017582	TTA	2	6	930317	930322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563846
16041	NC_017582	CAGT	2	8	930337	930344	25 %	25 %	25 %	25 %	414563846
16042	NC_017582	GTC	2	6	930378	930383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16043	NC_017582	GA	3	6	930402	930407	50 %	0 %	50 %	0 %	414563846
16044	NC_017582	ATG	2	6	930414	930419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563846
16045	NC_017582	AGC	2	6	930456	930461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16046	NC_017582	TGC	2	6	930486	930491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16047	NC_017582	AAG	2	6	930513	930518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563846
16048	NC_017582	GAA	2	6	930524	930529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563846
16049	NC_017582	ATG	2	6	930540	930545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563846
16050	NC_017582	GAG	2	6	930602	930607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563846
16051	NC_017582	TGG	2	6	930709	930714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563846
16052	NC_017582	AAG	2	6	930766	930771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563846
16053	NC_017582	CAA	2	6	930775	930780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563846
16054	NC_017582	TGA	2	6	930835	930840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563846
16055	NC_017582	AGC	2	6	930869	930874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16056	NC_017582	TGA	2	6	930963	930968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563846
16057	NC_017582	GA	3	6	930997	931002	50 %	0 %	50 %	0 %	414563846
16058	NC_017582	ACTTTG	2	12	931071	931082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414563846
16059	NC_017582	TGAT	2	8	931194	931201	25 %	50 %	25 %	0 %	414563846
16060	NC_017582	AGC	3	9	931488	931496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16061	NC_017582	TGTA	2	8	931533	931540	25 %	50 %	25 %	0 %	414563846
16062	NC_017582	A	7	7	931557	931563	100 %	0 %	0 %	0 %	414563846
16063	NC_017582	CTTAGC	2	12	931636	931647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414563846
16064	NC_017582	CTA	2	6	931682	931687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563846
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16066	NC_017582	TGA	2	6	931741	931746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563846
16067	NC_017582	CAG	2	6	931758	931763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16068	NC_017582	GCT	2	6	931792	931797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16069	NC_017582	GCAG	2	8	931798	931805	25 %	0 %	50 %	25 %	414563846
16070	NC_017582	CTG	2	6	932115	932120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563846
16071	NC_017582	CAAGG	2	10	932167	932176	40 %	0 %	40 %	20 %	414563846
16072	NC_017582	T	7	7	932200	932206	0 %	100 %	0 %	0 %	414563846
16073	NC_017582	A	6	6	932282	932287	100 %	0 %	0 %	0 %	414563846
16074	NC_017582	TAT	2	6	932323	932328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563846
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16084	NC_017582	GCAG	2	8	933002	933009	25 %	0 %	50 %	25 %	414563847
16085	NC_017582	CAG	3	9	933024	933032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563847
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16087	NC_017582	TTAT	2	8	933085	933092	25 %	75 %	0 %	0 %	414563847
16088	NC_017582	TGGAG	2	10	933170	933179	20 %	20 %	60 %	0 %	414563847
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16091	NC_017582	ATGATC	2	12	933264	933275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414563847
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16095	NC_017582	TGA	2	6	933371	933376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563847
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16100	NC_017582	CTTTG	2	10	933758	933767	0 %	60 %	20 %	20 %	414563847
16101	NC_017582	GCT	2	6	933770	933775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563847
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16103	NC_017582	GTT	2	6	933795	933800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563847
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16105	NC_017582	GCAG	2	8	933866	933873	25 %	0 %	50 %	25 %	414563847
16106	NC_017582	A	7	7	933899	933905	100 %	0 %	0 %	0 %	414563847
16107	NC_017582	CAA	2	6	933910	933915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563847
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16109	NC_017582	ATT	2	6	933997	934002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563848
16110	NC_017582	GGC	2	6	934039	934044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563848
16111	NC_017582	TGG	2	6	934101	934106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563848
16112	NC_017582	TGA	2	6	934207	934212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563848
16113	NC_017582	CT	3	6	934232	934237	0 %	50 %	0 %	50 %	414563848
16114	NC_017582	TAA	2	6	934408	934413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563848
16115	NC_017582	TAGCT	2	10	934417	934426	20 %	40 %	20 %	20 %	414563848
16116	NC_017582	GCA	2	6	934452	934457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563848
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16119	NC_017582	TAA	2	6	934486	934491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563848
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16235	NC_017582	CCA	2	6	941012	941017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563855
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16477	NC_017582	GCT	2	6	953881	953886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563865
16478	NC_017582	TA	3	6	953935	953940	50 %	50 %	0 %	0 %	414563865
16479	NC_017582	TGAG	2	8	953942	953949	25 %	25 %	50 %	0 %	414563865
16480	NC_017582	CAT	2	6	954013	954018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563865
16481	NC_017582	TGG	3	9	954063	954071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563865
16482	NC_017582	AGGAT	2	10	954206	954215	40 %	20 %	40 %	0 %	414563865
16483	NC_017582	AAT	2	6	954238	954243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563865
16484	NC_017582	ACA	2	6	954263	954268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563865
16485	NC_017582	AAG	2	6	954396	954401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563865
16486	NC_017582	TTA	2	6	954526	954531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563865
16487	NC_017582	CAA	2	6	954548	954553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563865
16488	NC_017582	ATG	2	6	954653	954658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563865
16489	NC_017582	ATT	2	6	954680	954685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563865
16490	NC_017582	ATC	2	6	954698	954703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563865
16491	NC_017582	TAC	2	6	954790	954795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563865
16492	NC_017582	TGA	2	6	954831	954836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563865
16493	NC_017582	CAGC	2	8	954837	954844	25 %	0 %	25 %	50 %	414563865
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16495	NC_017582	GATA	2	8	954953	954960	50 %	25 %	25 %	0 %	414563865
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16498	NC_017582	GCT	2	6	955084	955089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563866
16499	NC_017582	GCT	2	6	955091	955096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563866
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