MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017582	TA	3	6	641460	641465	50 %	50 %	0 %	0 %	414563584
11002	NC_017582	TAT	2	6	641508	641513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563584
11003	NC_017582	TAA	2	6	641636	641641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563584
11004	NC_017582	GCT	2	6	641735	641740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563584
11005	NC_017582	CT	3	6	641739	641744	0 %	50 %	0 %	50 %	414563584
11006	NC_017582	AGA	2	6	641818	641823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563584
11007	NC_017582	GATGG	2	10	641850	641859	20 %	20 %	60 %	0 %	414563584
11008	NC_017582	ATCCT	2	10	641890	641899	20 %	40 %	0 %	40 %	414563584
11009	NC_017582	ATC	2	6	641944	641949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563584
11010	NC_017582	TGG	2	6	641956	641961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563584
11011	NC_017582	AGC	2	6	642071	642076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563584
11012	NC_017582	TGA	2	6	642104	642109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563584
11013	NC_017582	ACCGA	2	10	642151	642160	40 %	0 %	20 %	40 %	414563584
11014	NC_017582	GGC	2	6	642170	642175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563584
11015	NC_017582	TGC	2	6	642248	642253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563584
11016	NC_017582	A	7	7	642276	642282	100 %	0 %	0 %	0 %	414563584
11017	NC_017582	GAT	2	6	642341	642346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563584
11018	NC_017582	TGA	2	6	642392	642397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563584
11019	NC_017582	AGCT	2	8	642415	642422	25 %	25 %	25 %	25 %	414563584
11020	NC_017582	CTT	2	6	642452	642457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563584
11021	NC_017582	AAT	2	6	642465	642470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563584
11022	NC_017582	TGC	2	6	642535	642540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563584
11023	NC_017582	TGC	2	6	642559	642564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563584
11024	NC_017582	CTC	2	6	642592	642597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563584
11025	NC_017582	TCC	2	6	642609	642614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563584
11026	NC_017582	T	7	7	642706	642712	0 %	100 %	0 %	0 %	414563585
11027	NC_017582	TAT	2	6	642759	642764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563585
11028	NC_017582	CTT	2	6	642835	642840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563585
11029	NC_017582	AGC	2	6	642981	642986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563585
11030	NC_017582	TGG	2	6	643006	643011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563585
11031	NC_017582	CTT	2	6	643015	643020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563585
11032	NC_017582	CTG	2	6	643124	643129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563585
11033	NC_017582	CAA	2	6	643218	643223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563585
11034	NC_017582	ATT	2	6	643256	643261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563585
11035	NC_017582	GACT	2	8	643305	643312	25 %	25 %	25 %	25 %	414563585
11036	NC_017582	TTAA	2	8	643316	643323	50 %	50 %	0 %	0 %	414563585
11037	NC_017582	TAGAGC	2	12	643368	643379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414563585
11038	NC_017582	AAAG	2	8	643385	643392	75 %	0 %	25 %	0 %	414563585
11039	NC_017582	AGA	2	6	643575	643580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563586
11040	NC_017582	AAC	2	6	643632	643637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563586
11041	NC_017582	GGT	2	6	643663	643668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563586
11042	NC_017582	A	7	7	643698	643704	100 %	0 %	0 %	0 %	414563586
11043	NC_017582	TGGA	2	8	643729	643736	25 %	25 %	50 %	0 %	414563586
11044	NC_017582	TCA	2	6	643768	643773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563586
11045	NC_017582	TGC	2	6	643875	643880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563586
11046	NC_017582	ATG	2	6	643882	643887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563586
11047	NC_017582	GTT	2	6	643888	643893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563586
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11049	NC_017582	GTT	2	6	643939	643944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563586
11050	NC_017582	TAA	2	6	643977	643982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563586
11051	NC_017582	GACG	2	8	643993	644000	25 %	0 %	50 %	25 %	414563586
11052	NC_017582	GGA	2	6	644019	644024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563586
11053	NC_017582	AGA	2	6	644028	644033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563586
11054	NC_017582	CTT	2	6	644048	644053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563586
11055	NC_017582	CAA	2	6	644112	644117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563586
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11057	NC_017582	GGA	2	6	644229	644234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563586
11058	NC_017582	GAC	2	6	644376	644381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563586
11059	NC_017582	GAT	2	6	644391	644396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563586
11060	NC_017582	ATT	2	6	644620	644625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563586
11061	NC_017582	TTG	2	6	644669	644674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563586
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11068	NC_017582	TCAG	2	8	645558	645565	25 %	25 %	25 %	25 %	414563587
11069	NC_017582	TGT	2	6	645567	645572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563587
11070	NC_017582	CAG	2	6	645575	645580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563587
11071	NC_017582	ACAGGA	2	12	645661	645672	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414563587
11072	NC_017582	CAG	2	6	645677	645682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563587
11073	NC_017582	GCTG	2	8	645762	645769	0 %	25 %	50 %	25 %	414563587
11074	NC_017582	TGG	2	6	645834	645839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563587
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11079	NC_017582	CAG	2	6	646231	646236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563587
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11081	NC_017582	TGA	2	6	646278	646283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563587
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11083	NC_017582	TGC	2	6	646416	646421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563587
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11085	NC_017582	CAG	2	6	646628	646633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563587
11086	NC_017582	GAT	2	6	646693	646698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563587
11087	NC_017582	GCGAT	2	10	646730	646739	20 %	20 %	40 %	20 %	414563587
11088	NC_017582	GCA	2	6	646747	646752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563587
11089	NC_017582	TGG	3	9	646866	646874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563587
11090	NC_017582	TCGTAG	2	12	646911	646922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414563587
11091	NC_017582	GAGAA	2	10	646957	646966	60 %	0 %	40 %	0 %	414563587
11092	NC_017582	ATG	2	6	646973	646978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563587
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11097	NC_017582	TAT	2	6	647317	647322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563588
11098	NC_017582	GGC	2	6	647396	647401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563588
11099	NC_017582	TTTTA	2	10	647422	647431	20 %	80 %	0 %	0 %	414563588
11100	NC_017582	ATT	2	6	647447	647452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563588
11101	NC_017582	ACG	2	6	647471	647476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563588
11102	NC_017582	ATC	2	6	647511	647516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563588
11103	NC_017582	GAGG	2	8	647519	647526	25 %	0 %	75 %	0 %	414563588
11104	NC_017582	T	6	6	647529	647534	0 %	100 %	0 %	0 %	414563588
11105	NC_017582	AGA	2	6	647552	647557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563588
11106	NC_017582	CAG	2	6	647680	647685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563588
11107	NC_017582	TGG	2	6	647733	647738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563588
11108	NC_017582	ATT	2	6	647782	647787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563588
11109	NC_017582	TGGTT	2	10	647802	647811	0 %	60 %	40 %	0 %	414563588
11110	NC_017582	TAT	2	6	647882	647887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563588
11111	NC_017582	ATC	2	6	647916	647921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563588
11112	NC_017582	T	7	7	647946	647952	0 %	100 %	0 %	0 %	414563588
11113	NC_017582	GTCG	2	8	647996	648003	0 %	25 %	50 %	25 %	414563588
11114	NC_017582	ATC	2	6	648044	648049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563588
11115	NC_017582	CTT	2	6	648115	648120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563588
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11117	NC_017582	ATT	2	6	648179	648184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563588
11118	NC_017582	GTT	2	6	648253	648258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563588
11119	NC_017582	TGA	2	6	648411	648416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563588
11120	NC_017582	TTA	2	6	648441	648446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563588
11121	NC_017582	AGG	2	6	648447	648452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563588
11122	NC_017582	CTAG	2	8	648467	648474	25 %	25 %	25 %	25 %	414563588
11123	NC_017582	T	7	7	648487	648493	0 %	100 %	0 %	0 %	414563588
11124	NC_017582	TGT	4	12	648553	648564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563588
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11130	NC_017582	TGAT	2	8	648750	648757	25 %	50 %	25 %	0 %	414563588
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11227	NC_017582	A	6	6	654776	654781	100 %	0 %	0 %	0 %	414563594
11228	NC_017582	AAAG	2	8	654796	654803	75 %	0 %	25 %	0 %	414563594
11229	NC_017582	GCT	2	6	654864	654869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563594
11230	NC_017582	A	8	8	654873	654880	100 %	0 %	0 %	0 %	414563594
11231	NC_017582	TGACT	2	10	654897	654906	20 %	40 %	20 %	20 %	414563594
11232	NC_017582	T	6	6	654973	654978	0 %	100 %	0 %	0 %	414563594
11233	NC_017582	GGT	2	6	654990	654995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563594
11234	NC_017582	ATC	2	6	655004	655009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563594
11235	NC_017582	A	7	7	655030	655036	100 %	0 %	0 %	0 %	414563594
11236	NC_017582	CGT	2	6	655141	655146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563594
11237	NC_017582	GCT	2	6	655201	655206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563594
11238	NC_017582	A	6	6	655208	655213	100 %	0 %	0 %	0 %	414563594
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11478	NC_017582	TTC	2	6	668775	668780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563606
11479	NC_017582	GTT	2	6	668816	668821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563606
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