MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017582	AGTTG	2	10	32185	32194	20 %	40 %	40 %	0 %	414562980
502	NC_017582	ATG	2	6	32211	32216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562980
503	NC_017582	GCT	2	6	32236	32241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
504	NC_017582	AGA	2	6	32296	32301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562980
505	NC_017582	T	6	6	32333	32338	0 %	100 %	0 %	0 %	414562980
506	NC_017582	TTG	2	6	32399	32404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562980
507	NC_017582	TCAA	2	8	32454	32461	50 %	25 %	0 %	25 %	414562980
508	NC_017582	TGC	2	6	32467	32472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
509	NC_017582	GAA	2	6	32474	32479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562980
510	NC_017582	GGA	2	6	32665	32670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562980
511	NC_017582	CTG	2	6	32672	32677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
512	NC_017582	ATT	2	6	32688	32693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562980
513	NC_017582	CA	3	6	32768	32773	50 %	0 %	0 %	50 %	414562980
514	NC_017582	AGC	2	6	32826	32831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562980
515	NC_017582	ACCT	2	8	32849	32856	25 %	25 %	0 %	50 %	414562980
516	NC_017582	TGA	2	6	32866	32871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562980
517	NC_017582	TGCT	2	8	32983	32990	0 %	50 %	25 %	25 %	414562980
518	NC_017582	GCT	2	6	33034	33039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
519	NC_017582	TGC	2	6	33094	33099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
520	NC_017582	TGG	2	6	33109	33114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
521	NC_017582	CAG	2	6	33227	33232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562980
522	NC_017582	AGC	2	6	33247	33252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562980
523	NC_017582	ACT	2	6	33293	33298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562980
524	NC_017582	TTG	2	6	33327	33332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562980
525	NC_017582	TGC	2	6	33364	33369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
526	NC_017582	GTG	2	6	33413	33418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
527	NC_017582	TGG	2	6	33427	33432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
528	NC_017582	TGG	2	6	33454	33459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
529	NC_017582	ATC	2	6	33469	33474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562980
530	NC_017582	GAG	2	6	33539	33544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562980
531	NC_017582	TCG	2	6	33565	33570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
532	NC_017582	TCA	2	6	33588	33593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562980
533	NC_017582	TGG	2	6	33616	33621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
534	NC_017582	TGC	2	6	33646	33651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
535	NC_017582	TGC	2	6	33808	33813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
536	NC_017582	TGT	2	6	33814	33819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562980
537	NC_017582	TTG	2	6	33873	33878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562980
538	NC_017582	TGC	2	6	33925	33930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
539	NC_017582	GTT	2	6	33935	33940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562980
540	NC_017582	GTG	2	6	33945	33950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
541	NC_017582	ACT	2	6	33974	33979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562980
542	NC_017582	TGG	2	6	34099	34104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
543	NC_017582	TA	3	6	34205	34210	50 %	50 %	0 %	0 %	414562980
544	NC_017582	GCAG	2	8	34339	34346	25 %	0 %	50 %	25 %	414562980
545	NC_017582	CTTG	2	8	34372	34379	0 %	50 %	25 %	25 %	414562980
546	NC_017582	GCTTG	2	10	34402	34411	0 %	40 %	40 %	20 %	414562980
547	NC_017582	GCC	2	6	34465	34470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414562980
548	NC_017582	GAC	2	6	34492	34497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562980
549	NC_017582	GCT	2	6	34535	34540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
550	NC_017582	TGAT	2	8	34584	34591	25 %	50 %	25 %	0 %	414562980
551	NC_017582	GAT	2	6	34597	34602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562980
552	NC_017582	AGGCA	2	10	34635	34644	40 %	0 %	40 %	20 %	414562980
553	NC_017582	GGT	2	6	34676	34681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
554	NC_017582	ATT	2	6	34682	34687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562980
555	NC_017582	CTTGCT	2	12	34694	34705	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414562980
556	NC_017582	TG	3	6	34730	34735	0 %	50 %	50 %	0 %	414562980
557	NC_017582	CAGCT	2	10	34764	34773	20 %	20 %	20 %	40 %	414562980
558	NC_017582	GGC	2	6	34775	34780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414562980
559	NC_017582	ATG	2	6	34860	34865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562980
560	NC_017582	CAG	2	6	34937	34942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562980
561	NC_017582	ACA	2	6	34973	34978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562980
562	NC_017582	TGC	2	6	34984	34989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
563	NC_017582	A	6	6	35001	35006	100 %	0 %	0 %	0 %	414562980
564	NC_017582	AACT	2	8	35044	35051	50 %	25 %	0 %	25 %	414562980
565	NC_017582	AG	3	6	35081	35086	50 %	0 %	50 %	0 %	414562980
566	NC_017582	TCA	2	6	35170	35175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562980
567	NC_017582	GGT	2	6	35198	35203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
568	NC_017582	CTG	2	6	35255	35260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
569	NC_017582	GCG	2	6	35276	35281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414562980
570	NC_017582	GGT	2	6	35303	35308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
571	NC_017582	GCT	2	6	35356	35361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
572	NC_017582	ATG	2	6	35415	35420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562980
573	NC_017582	GGTG	2	8	35494	35501	0 %	25 %	75 %	0 %	414562980
574	NC_017582	ATT	2	6	35793	35798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562980
575	NC_017582	GAT	2	6	35945	35950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562981
576	NC_017582	AT	3	6	35949	35954	50 %	50 %	0 %	0 %	414562981
577	NC_017582	GAG	2	6	35973	35978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562981
578	NC_017582	TCA	2	6	36101	36106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562981
579	NC_017582	TGC	2	6	36176	36181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562981
580	NC_017582	CTG	2	6	36205	36210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562981
581	NC_017582	TAA	2	6	36224	36229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562981
582	NC_017582	A	6	6	36312	36317	100 %	0 %	0 %	0 %	414562981
583	NC_017582	AG	3	6	36323	36328	50 %	0 %	50 %	0 %	414562981
584	NC_017582	CTT	2	6	36349	36354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562981
585	NC_017582	TCG	2	6	36383	36388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562981
586	NC_017582	TCA	2	6	36392	36397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562981
587	NC_017582	CTG	2	6	36459	36464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562981
588	NC_017582	AGC	2	6	36485	36490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562981
589	NC_017582	GTG	2	6	36549	36554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562981
590	NC_017582	ATCATT	2	12	36621	36632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414562981
591	NC_017582	GAT	2	6	36633	36638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562981
592	NC_017582	ACG	2	6	36663	36668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562981
593	NC_017582	AT	3	6	36698	36703	50 %	50 %	0 %	0 %	414562981
594	NC_017582	TGGT	2	8	36811	36818	0 %	50 %	50 %	0 %	414562981
595	NC_017582	CAG	2	6	36838	36843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562981
596	NC_017582	AAATG	2	10	36875	36884	60 %	20 %	20 %	0 %	414562981
597	NC_017582	CCAA	2	8	36923	36930	50 %	0 %	0 %	50 %	414562981
598	NC_017582	GAT	2	6	37014	37019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562981
599	NC_017582	ACG	2	6	37043	37048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562981
600	NC_017582	TGC	2	6	37060	37065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562981
601	NC_017582	CTG	3	9	37180	37188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562981
602	NC_017582	TGG	2	6	37280	37285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562981
603	NC_017582	TG	3	6	37290	37295	0 %	50 %	50 %	0 %	414562981
604	NC_017582	CGC	2	6	37321	37326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414562981
605	NC_017582	AGA	2	6	37361	37366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562981
606	NC_017582	TTG	2	6	37515	37520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562982
607	NC_017582	A	6	6	37528	37533	100 %	0 %	0 %	0 %	414562982
608	NC_017582	AGG	2	6	37576	37581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562982
609	NC_017582	TGG	2	6	37585	37590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562982
610	NC_017582	TG	3	6	37712	37717	0 %	50 %	50 %	0 %	414562982
611	NC_017582	TG	3	6	37722	37727	0 %	50 %	50 %	0 %	414562982
612	NC_017582	ATT	2	6	37736	37741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562982
613	NC_017582	GCA	2	6	37742	37747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562982
614	NC_017582	GCA	2	6	37781	37786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562982
615	NC_017582	A	6	6	37789	37794	100 %	0 %	0 %	0 %	414562982
616	NC_017582	GGT	2	6	37816	37821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562982
617	NC_017582	TGC	2	6	37855	37860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562982
618	NC_017582	CTG	2	6	37878	37883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562982
619	NC_017582	GTAT	2	8	37893	37900	25 %	50 %	25 %	0 %	414562982
620	NC_017582	TGAT	2	8	37959	37966	25 %	50 %	25 %	0 %	414562982
621	NC_017582	ATC	2	6	37989	37994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562982
622	NC_017582	TTCA	2	8	38019	38026	25 %	50 %	0 %	25 %	414562982
623	NC_017582	TCG	2	6	38044	38049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562982
624	NC_017582	GAG	2	6	38072	38077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562982
625	NC_017582	AGG	2	6	38109	38114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562982
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627	NC_017582	GGC	2	6	38204	38209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414562982
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