MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 32895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017581	TGAG	2	8	244491	244498	25 %	25 %	50 %	0 %	386343848
4002	NC_017581	GATG	2	8	244537	244544	25 %	25 %	50 %	0 %	386343848
4003	NC_017581	GCA	2	6	244564	244569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343848
4004	NC_017581	GGT	2	6	244688	244693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343848
4005	NC_017581	TGG	2	6	244770	244775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343848
4006	NC_017581	ACCT	2	8	244818	244825	25 %	25 %	0 %	50 %	386343848
4007	NC_017581	CAAC	2	8	244857	244864	50 %	0 %	0 %	50 %	386343848
4008	NC_017581	TGG	2	6	244867	244872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343848
4009	NC_017581	TGA	2	6	244882	244887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343848
4010	NC_017581	AGA	2	6	245014	245019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343848
4011	NC_017581	GGT	3	9	245036	245044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343848
4012	NC_017581	TGG	2	6	245095	245100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343848
4013	NC_017581	GTG	2	6	245145	245150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343848
4014	NC_017581	AAG	2	6	245171	245176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343848
4015	NC_017581	TAT	2	6	245185	245190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343848
4016	NC_017581	ATG	2	6	245222	245227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343848
4017	NC_017581	ACT	2	6	245412	245417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343848
4018	NC_017581	AAT	2	6	245579	245584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343848
4019	NC_017581	GACA	2	8	245593	245600	50 %	0 %	25 %	25 %	386343848
4020	NC_017581	ATG	2	6	245619	245624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343848
4021	NC_017581	CAAG	2	8	245633	245640	50 %	0 %	25 %	25 %	386343848
4022	NC_017581	AAC	2	6	245957	245962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343849
4023	NC_017581	AGTTC	2	10	245977	245986	20 %	40 %	20 %	20 %	386343849
4024	NC_017581	TTC	2	6	246001	246006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343849
4025	NC_017581	TCA	2	6	246011	246016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343849
4026	NC_017581	TGA	2	6	246027	246032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343849
4027	NC_017581	TTG	2	6	246034	246039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343849
4028	NC_017581	ATTC	2	8	246279	246286	25 %	50 %	0 %	25 %	386343850
4029	NC_017581	GAA	2	6	246452	246457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343850
4030	NC_017581	TTG	2	6	246480	246485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343850
4031	NC_017581	TGT	2	6	246514	246519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343850
4032	NC_017581	GAA	3	9	246590	246598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343850
4033	NC_017581	ATC	2	6	246677	246682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343850
4034	NC_017581	AAG	2	6	246702	246707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343850
4035	NC_017581	ACA	2	6	246729	246734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343850
4036	NC_017581	GCT	2	6	246773	246778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343850
4037	NC_017581	GAT	2	6	246932	246937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343851
4038	NC_017581	GGA	2	6	246999	247004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343851
4039	NC_017581	TTTGG	2	10	247058	247067	0 %	60 %	40 %	0 %	386343851
4040	NC_017581	TTA	2	6	247105	247110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343851
4041	NC_017581	T	6	6	247122	247127	0 %	100 %	0 %	0 %	386343851
4042	NC_017581	TTA	2	6	247195	247200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343851
4043	NC_017581	T	6	6	247240	247245	0 %	100 %	0 %	0 %	386343851
4044	NC_017581	GCA	2	6	247314	247319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343851
4045	NC_017581	GGT	2	6	247344	247349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343851
4046	NC_017581	TTG	2	6	247396	247401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343851
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4048	NC_017581	CTT	2	6	247628	247633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343852
4049	NC_017581	ATA	2	6	247742	247747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343852
4050	NC_017581	AGT	2	6	247804	247809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343852
4051	NC_017581	AGA	2	6	247825	247830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343852
4052	NC_017581	CTGT	2	8	247831	247838	0 %	50 %	25 %	25 %	386343852
4053	NC_017581	TGG	2	6	247863	247868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343853
4054	NC_017581	TCA	2	6	247891	247896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343853
4055	NC_017581	CAA	2	6	247899	247904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343853
4056	NC_017581	TAA	2	6	247955	247960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343853
4057	NC_017581	GTTG	2	8	248009	248016	0 %	50 %	50 %	0 %	386343853
4058	NC_017581	AATCC	2	10	248019	248028	40 %	20 %	0 %	40 %	386343853
4059	NC_017581	AGT	2	6	248075	248080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343853
4060	NC_017581	TAA	2	6	248081	248086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343853
4061	NC_017581	TGG	2	6	248204	248209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343854
4062	NC_017581	ATC	2	6	248291	248296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343854
4063	NC_017581	TGG	2	6	248301	248306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343854
4064	NC_017581	TAA	2	6	248359	248364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343854
4065	NC_017581	CAT	2	6	248378	248383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343854
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4067	NC_017581	AT	3	6	248479	248484	50 %	50 %	0 %	0 %	386343855
4068	NC_017581	TAG	2	6	248534	248539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343855
4069	NC_017581	TCT	2	6	248569	248574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343855
4070	NC_017581	AAG	2	6	248620	248625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343855
4071	NC_017581	AGT	2	6	248672	248677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343855
4072	NC_017581	AATC	2	8	248720	248727	50 %	25 %	0 %	25 %	386343855
4073	NC_017581	CCTT	2	8	248728	248735	0 %	50 %	0 %	50 %	386343855
4074	NC_017581	A	7	7	248833	248839	100 %	0 %	0 %	0 %	386343855
4075	NC_017581	TGA	2	6	248855	248860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343855
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4077	NC_017581	TCT	2	6	248893	248898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343855
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4079	NC_017581	TCT	2	6	249009	249014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343855
4080	NC_017581	TCA	2	6	249040	249045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343855
4081	NC_017581	TC	3	6	249096	249101	0 %	50 %	0 %	50 %	386343855
4082	NC_017581	GTT	2	6	249107	249112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343855
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4084	NC_017581	ATGGG	2	10	249524	249533	20 %	20 %	60 %	0 %	386343856
4085	NC_017581	CTG	2	6	249549	249554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343856
4086	NC_017581	CAACA	2	10	249670	249679	60 %	0 %	0 %	40 %	386343856
4087	NC_017581	ACT	2	6	249687	249692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343856
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4089	NC_017581	CGGA	2	8	249813	249820	25 %	0 %	50 %	25 %	386343856
4090	NC_017581	GTG	2	6	249831	249836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343856
4091	NC_017581	GCAAC	2	10	249952	249961	40 %	0 %	20 %	40 %	386343856
4092	NC_017581	TAG	2	6	250095	250100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343856
4093	NC_017581	A	6	6	250197	250202	100 %	0 %	0 %	0 %	386343856
4094	NC_017581	GCTA	2	8	250283	250290	25 %	25 %	25 %	25 %	386343856
4095	NC_017581	GAA	2	6	250397	250402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343856
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4099	NC_017581	TTGG	2	8	250489	250496	0 %	50 %	50 %	0 %	386343856
4100	NC_017581	A	6	6	250518	250523	100 %	0 %	0 %	0 %	386343856
4101	NC_017581	CCAATC	2	12	250577	250588	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386343856
4102	NC_017581	GTC	2	6	250746	250751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343856
4103	NC_017581	TAC	2	6	250793	250798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343856
4104	NC_017581	CCT	2	6	250846	250851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386343856
4105	NC_017581	GTGG	2	8	250880	250887	0 %	25 %	75 %	0 %	386343856
4106	NC_017581	TTC	2	6	250902	250907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343856
4107	NC_017581	ACC	2	6	251025	251030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386343856
4108	NC_017581	GTG	2	6	251031	251036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343856
4109	NC_017581	CTT	2	6	251077	251082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343856
4110	NC_017581	AGCA	2	8	251109	251116	50 %	0 %	25 %	25 %	386343856
4111	NC_017581	TGG	2	6	251166	251171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343856
4112	NC_017581	GAA	2	6	251246	251251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343856
4113	NC_017581	GGAA	2	8	251257	251264	50 %	0 %	50 %	0 %	386343856
4114	NC_017581	ATTG	2	8	251488	251495	25 %	50 %	25 %	0 %	386343856
4115	NC_017581	AGA	2	6	251518	251523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343856
4116	NC_017581	CGAAAT	2	12	251608	251619	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386343856
4117	NC_017581	CGT	2	6	251620	251625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343856
4118	NC_017581	TCAAA	2	10	251626	251635	60 %	20 %	0 %	20 %	386343856
4119	NC_017581	AAG	2	6	251691	251696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343856
4120	NC_017581	AAATAA	2	12	251792	251803	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386343856
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4122	NC_017581	TAA	2	6	251923	251928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343857
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4238	NC_017581	ATAAG	2	10	258687	258696	60 %	20 %	20 %	0 %	386343863
4239	NC_017581	CTTT	2	8	258708	258715	0 %	75 %	0 %	25 %	386343863
4240	NC_017581	GTA	2	6	258725	258730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343863
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4242	NC_017581	ACC	2	6	258806	258811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386343863
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4488	NC_017581	TCG	2	6	272691	272696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343873
4489	NC_017581	CAT	2	6	272718	272723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343873
4490	NC_017581	TCT	2	6	272726	272731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343873
4491	NC_017581	TCTTA	2	10	272736	272745	20 %	60 %	0 %	20 %	386343873
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