MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17502

Total Repeats: 977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017572	TCA	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322373
2	NC_017572	ATTG	2	8	162	169	25 %	50 %	25 %	0 %	386322373
3	NC_017572	TTCT	2	8	184	191	0 %	75 %	0 %	25 %	386322373
4	NC_017572	ATC	2	6	221	226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322373
5	NC_017572	ATC	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322373
6	NC_017572	TCT	2	6	289	294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322373
7	NC_017572	TGC	2	6	320	325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322373
8	NC_017572	CT	3	6	336	341	0 %	50 %	0 %	50 %	386322373
9	NC_017572	CTA	2	6	343	348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322373
10	NC_017572	AGC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322373
11	NC_017572	CAG	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322373
12	NC_017572	TAA	2	6	453	458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322373
13	NC_017572	ATCTA	2	10	476	485	40 %	40 %	0 %	20 %	386322373
14	NC_017572	TTTC	2	8	585	592	0 %	75 %	0 %	25 %	386322373
15	NC_017572	TCT	2	6	601	606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322373
16	NC_017572	AATGT	2	10	647	656	40 %	40 %	20 %	0 %	386322373
17	NC_017572	T	6	6	686	691	0 %	100 %	0 %	0 %	386322373
18	NC_017572	CTT	2	6	733	738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322373
19	NC_017572	TGA	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322373
20	NC_017572	GA	3	6	769	774	50 %	0 %	50 %	0 %	386322374
21	NC_017572	TCA	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
22	NC_017572	ATT	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
23	NC_017572	CTT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
24	NC_017572	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
25	NC_017572	TCA	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
26	NC_017572	AGCC	2	8	1162	1169	25 %	0 %	25 %	50 %	386322374
27	NC_017572	ATC	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
28	NC_017572	TCTT	2	8	1203	1210	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
29	NC_017572	GTC	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322374
30	NC_017572	GTT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
31	NC_017572	CAT	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
32	NC_017572	CA	3	6	1362	1367	50 %	0 %	0 %	50 %	386322374
33	NC_017572	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322374
34	NC_017572	CAGC	2	8	1461	1468	25 %	0 %	25 %	50 %	386322374
35	NC_017572	TCA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
36	NC_017572	T	8	8	1601	1608	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
37	NC_017572	TAAA	2	8	1647	1654	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
38	NC_017572	TGA	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
39	NC_017572	TCA	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
40	NC_017572	CATT	2	8	1759	1766	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
41	NC_017572	A	6	6	1860	1865	100 %	0 %	0 %	0 %	386322374
42	NC_017572	AG	3	6	1891	1896	50 %	0 %	50 %	0 %	386322374
43	NC_017572	GACT	2	8	1952	1959	25 %	25 %	25 %	25 %	386322374
44	NC_017572	CTC	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322374
45	NC_017572	TTTC	2	8	2008	2015	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
46	NC_017572	TGA	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
47	NC_017572	GAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322374
48	NC_017572	CTC	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322374
49	NC_017572	T	6	6	2191	2196	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
50	NC_017572	CAT	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
51	NC_017572	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
52	NC_017572	AAAT	2	8	2339	2346	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
53	NC_017572	CA	3	6	2361	2366	50 %	0 %	0 %	50 %	386322374
54	NC_017572	TGG	2	6	2373	2378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322374
55	NC_017572	CAT	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
56	NC_017572	GAT	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
57	NC_017572	A	6	6	2510	2515	100 %	0 %	0 %	0 %	386322374
58	NC_017572	ATC	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
59	NC_017572	TTA	2	6	2558	2563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
60	NC_017572	TGT	2	6	2600	2605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
61	NC_017572	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322374
62	NC_017572	T	7	7	2656	2662	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
63	NC_017572	GT	3	6	2729	2734	0 %	50 %	50 %	0 %	386322374
64	NC_017572	GCT	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322374
65	NC_017572	CTA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
66	NC_017572	C	6	6	2942	2947	0 %	0 %	0 %	100 %	386322374
67	NC_017572	TGT	2	6	3078	3083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
68	NC_017572	AGT	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
69	NC_017572	A	6	6	3146	3151	100 %	0 %	0 %	0 %	386322374
70	NC_017572	T	6	6	3181	3186	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
71	NC_017572	CTAT	2	8	3220	3227	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
72	NC_017572	AATT	2	8	3272	3279	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
73	NC_017572	AAT	2	6	3289	3294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
74	NC_017572	TCATG	2	10	3371	3380	20 %	40 %	20 %	20 %	386322374
75	NC_017572	TTGTC	2	10	3392	3401	0 %	60 %	20 %	20 %	386322374
76	NC_017572	AT	3	6	3421	3426	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
77	NC_017572	AGC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322374
78	NC_017572	GACT	2	8	3595	3602	25 %	25 %	25 %	25 %	386322374
79	NC_017572	AATG	2	8	3630	3637	50 %	25 %	25 %	0 %	386322374
80	NC_017572	GAA	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322374
81	NC_017572	ATA	2	6	3758	3763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
82	NC_017572	T	6	6	3848	3853	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
83	NC_017572	TTG	2	6	3891	3896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
84	NC_017572	GGT	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322374
85	NC_017572	TAC	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
86	NC_017572	TTA	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
87	NC_017572	TCT	2	6	3937	3942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
88	NC_017572	CTT	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
89	NC_017572	GGA	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386322374
90	NC_017572	TGAA	2	8	4147	4154	50 %	25 %	25 %	0 %	386322374
91	NC_017572	TCA	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
92	NC_017572	ATG	3	9	4173	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
93	NC_017572	GCA	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322374
94	NC_017572	TAAA	2	8	4283	4290	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
95	NC_017572	GTATG	2	10	4302	4311	20 %	40 %	40 %	0 %	386322374
96	NC_017572	TCA	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
97	NC_017572	GCAAT	2	10	4417	4426	40 %	20 %	20 %	20 %	386322374
98	NC_017572	TTC	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
99	NC_017572	AAC	2	6	4498	4503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322374
100	NC_017572	TAA	2	6	4508	4513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
101	NC_017572	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
102	NC_017572	AAT	2	6	4609	4614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
103	NC_017572	TAA	2	6	4643	4648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
104	NC_017572	T	6	6	4656	4661	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
105	NC_017572	T	8	8	4667	4674	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
106	NC_017572	TTC	2	6	4740	4745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
107	NC_017572	ATA	2	6	4754	4759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
108	NC_017572	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
109	NC_017572	CAG	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322374
110	NC_017572	T	6	6	4954	4959	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
111	NC_017572	TCT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
112	NC_017572	TTG	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
113	NC_017572	ATCA	2	8	5244	5251	50 %	25 %	0 %	25 %	386322374
114	NC_017572	TGT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
115	NC_017572	T	6	6	5410	5415	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
116	NC_017572	CTTA	2	8	5430	5437	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
117	NC_017572	GAAC	2	8	5640	5647	50 %	0 %	25 %	25 %	386322374
118	NC_017572	CTG	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322374
119	NC_017572	TCT	2	6	5668	5673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
120	NC_017572	AGT	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
121	NC_017572	CTTT	2	8	5779	5786	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
122	NC_017572	CTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322374
123	NC_017572	AT	3	6	5824	5829	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
124	NC_017572	GCTT	2	8	5832	5839	0 %	50 %	25 %	25 %	386322374
125	NC_017572	GTTT	2	8	5844	5851	0 %	75 %	25 %	0 %	386322374
126	NC_017572	T	7	7	5849	5855	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
127	NC_017572	AAT	2	6	5949	5954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
128	NC_017572	TATC	2	8	5987	5994	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
129	NC_017572	AAT	2	6	6129	6134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
130	NC_017572	TC	3	6	6146	6151	0 %	50 %	0 %	50 %	386322374
131	NC_017572	CT	3	6	6183	6188	0 %	50 %	0 %	50 %	386322374
132	NC_017572	CAT	2	6	6206	6211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
133	NC_017572	TAT	2	6	6285	6290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
134	NC_017572	GGA	2	6	6306	6311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386322374
135	NC_017572	TAG	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
136	NC_017572	ACTC	2	8	6347	6354	25 %	25 %	0 %	50 %	386322374
137	NC_017572	ATC	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
138	NC_017572	TAA	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
139	NC_017572	T	6	6	6446	6451	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
140	NC_017572	TAA	2	6	6453	6458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
141	NC_017572	T	6	6	6543	6548	0 %	100 %	0 %	0 %	386322374
142	NC_017572	TTA	2	6	6568	6573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
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145	NC_017572	TCA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
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151	NC_017572	CCCA	2	8	6951	6958	25 %	0 %	0 %	75 %	386322374
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155	NC_017572	A	8	8	7238	7245	100 %	0 %	0 %	0 %	386322375
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160	NC_017572	TCA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322376
161	NC_017572	CTA	2	6	8496	8501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322376
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163	NC_017572	GGC	2	6	8663	8668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322376
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166	NC_017572	AAAC	2	8	8943	8950	75 %	0 %	0 %	25 %	386322376
167	NC_017572	ATC	3	9	8965	8973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322376
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172	NC_017572	ATG	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322376
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249	NC_017572	TA	3	6	14830	14835	50 %	50 %	0 %	0 %	386322382
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253	NC_017572	GAT	2	6	15135	15140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322383
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258	NC_017572	GCG	2	6	15927	15932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322384
259	NC_017572	GAT	2	6	15981	15986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322384
260	NC_017572	GCA	2	6	16046	16051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322384
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262	NC_017572	AAT	2	6	16183	16188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322384
263	NC_017572	AT	3	6	16237	16242	50 %	50 %	0 %	0 %	386322385
264	NC_017572	TAA	2	6	16315	16320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322385
265	NC_017572	AG	3	6	16378	16383	50 %	0 %	50 %	0 %	386322385
266	NC_017572	TTA	2	6	16418	16423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322385
267	NC_017572	TTTAT	2	10	16662	16671	20 %	80 %	0 %	0 %	386322386
268	NC_017572	TCG	2	6	16672	16677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322386
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274	NC_017572	TAT	2	6	17035	17040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322386
275	NC_017572	ATT	2	6	17096	17101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322386
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281	NC_017572	GCGA	2	8	17355	17362	25 %	0 %	50 %	25 %	386322386
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382	NC_017572	TGGTT	2	10	23982	23991	0 %	60 %	40 %	0 %	386322388
383	NC_017572	A	6	6	24030	24035	100 %	0 %	0 %	0 %	386322388
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391	NC_017572	ATAGC	2	10	24742	24751	40 %	20 %	20 %	20 %	386322388
392	NC_017572	CCA	2	6	24845	24850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322388
393	NC_017572	CTA	2	6	24911	24916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322389
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