MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 chromosome

Total Repeats: 74306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017571	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322496
2	NC_017571	CAG	2	6	134	139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322496
3	NC_017571	ATGG	2	8	173	180	25 %	25 %	50 %	0 %	386322496
4	NC_017571	GTC	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322496
5	NC_017571	ACG	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322496
6	NC_017571	AGCCG	2	10	418	427	20 %	0 %	40 %	40 %	386322496
7	NC_017571	GCT	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322496
8	NC_017571	GGT	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322496
9	NC_017571	ATT	2	6	562	567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322496
10	NC_017571	TTG	2	6	602	607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322496
11	NC_017571	AAT	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322496
12	NC_017571	GAA	2	6	719	724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322496
13	NC_017571	TAC	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322496
14	NC_017571	GAT	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322496
15	NC_017571	T	6	6	776	781	0 %	100 %	0 %	0 %	386322496
16	NC_017571	AAG	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322496
17	NC_017571	TTC	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322496
18	NC_017571	CTTG	2	8	829	836	0 %	50 %	25 %	25 %	386322496
19	NC_017571	AAT	2	6	850	855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322496
20	NC_017571	TTGG	2	8	918	925	0 %	50 %	50 %	0 %	386322496
21	NC_017571	CCA	2	6	947	952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322496
22	NC_017571	AG	3	6	994	999	50 %	0 %	50 %	0 %	386322496
23	NC_017571	CTT	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322496
24	NC_017571	CGTG	2	8	1057	1064	0 %	25 %	50 %	25 %	386322496
25	NC_017571	GCC	2	6	1113	1118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322496
26	NC_017571	TAC	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322496
27	NC_017571	TGT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322496
28	NC_017571	CG	3	6	1270	1275	0 %	0 %	50 %	50 %	386322496
29	NC_017571	TAAC	2	8	1311	1318	50 %	25 %	0 %	25 %	386322496
30	NC_017571	TGG	2	6	1348	1353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322496
31	NC_017571	CAC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322496
32	NC_017571	AG	3	6	1408	1413	50 %	0 %	50 %	0 %	386322496
33	NC_017571	AGA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322496
34	NC_017571	TCT	2	6	1457	1462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322496
35	NC_017571	GT	3	6	1533	1538	0 %	50 %	50 %	0 %	386322497
36	NC_017571	CCT	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322497
37	NC_017571	AAGT	2	8	1591	1598	50 %	25 %	25 %	0 %	386322497
38	NC_017571	TCAC	2	8	1601	1608	25 %	25 %	0 %	50 %	386322497
39	NC_017571	GAA	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322497
40	NC_017571	TAC	2	6	1685	1690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322497
41	NC_017571	GCT	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322497
42	NC_017571	AAC	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322497
43	NC_017571	ATA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322497
44	NC_017571	TGC	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322497
45	NC_017571	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322497
46	NC_017571	TTA	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322497
47	NC_017571	GC	3	6	1985	1990	0 %	0 %	50 %	50 %	386322497
48	NC_017571	CGAC	2	8	1996	2003	25 %	0 %	25 %	50 %	386322497
49	NC_017571	GAT	2	6	2112	2117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322497
50	NC_017571	AAGC	2	8	2274	2281	50 %	0 %	25 %	25 %	386322497
51	NC_017571	GTG	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322497
52	NC_017571	TAA	2	6	2366	2371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322497
53	NC_017571	GAA	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322497
54	NC_017571	ATC	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322497
55	NC_017571	ACA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322497
56	NC_017571	CAA	2	6	2468	2473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322497
57	NC_017571	GAT	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322497
58	NC_017571	GAA	2	6	2544	2549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322497
59	NC_017571	ATGT	2	8	2556	2563	25 %	50 %	25 %	0 %	386322497
60	NC_017571	CGTT	2	8	2934	2941	0 %	50 %	25 %	25 %	386322498
61	NC_017571	TAA	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322498
62	NC_017571	CGA	3	9	2975	2983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322498
63	NC_017571	GC	3	6	3015	3020	0 %	0 %	50 %	50 %	386322498
64	NC_017571	GTG	2	6	3055	3060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322498
65	NC_017571	CCG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322498
66	NC_017571	CGC	2	6	3249	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322498
67	NC_017571	CG	3	6	3448	3453	0 %	0 %	50 %	50 %	386322498
68	NC_017571	ACT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322498
69	NC_017571	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322498
70	NC_017571	ACA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322498
71	NC_017571	GAT	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322498
72	NC_017571	TCCG	2	8	3698	3705	0 %	25 %	25 %	50 %	386322498
73	NC_017571	CTG	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322498
74	NC_017571	AC	3	6	3809	3814	50 %	0 %	0 %	50 %	386322498
75	NC_017571	ATA	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322499
76	NC_017571	TTC	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322499
77	NC_017571	CGA	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
78	NC_017571	CAT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322499
79	NC_017571	AGT	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322499
80	NC_017571	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322499
81	NC_017571	GCA	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
82	NC_017571	CGG	2	6	4188	4193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322499
83	NC_017571	CGA	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
84	NC_017571	TCG	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
85	NC_017571	CGTG	2	8	4455	4462	0 %	25 %	50 %	25 %	386322499
86	NC_017571	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322499
87	NC_017571	ACA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322499
88	NC_017571	GAAT	2	8	4521	4528	50 %	25 %	25 %	0 %	386322499
89	NC_017571	ATT	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322499
90	NC_017571	TAA	2	6	4578	4583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322499
91	NC_017571	CAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322499
92	NC_017571	CAA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322499
93	NC_017571	TGG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322499
94	NC_017571	CGA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
95	NC_017571	AGTGA	2	10	4915	4924	40 %	20 %	40 %	0 %	386322499
96	NC_017571	CTG	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
97	NC_017571	TTG	2	6	5000	5005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322499
98	NC_017571	GCCCGT	2	12	5023	5034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386322499
99	NC_017571	GCG	2	6	5038	5043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322499
100	NC_017571	CGT	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
101	NC_017571	GGT	2	6	5089	5094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322499
102	NC_017571	CTG	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
103	NC_017571	TGT	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322499
104	NC_017571	AAG	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322499
105	NC_017571	CGA	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
106	NC_017571	CAT	4	12	5364	5375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322499
107	NC_017571	CTT	3	9	5424	5432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322499
108	NC_017571	ATTG	2	8	5448	5455	25 %	50 %	25 %	0 %	386322499
109	NC_017571	CCA	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322499
110	NC_017571	GCAA	2	8	5507	5514	50 %	0 %	25 %	25 %	386322499
111	NC_017571	ACCCA	2	10	5588	5597	40 %	0 %	0 %	60 %	386322499
112	NC_017571	TTG	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322499
113	NC_017571	AGC	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
114	NC_017571	ACC	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322499
115	NC_017571	TGG	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322499
116	NC_017571	AGC	2	6	5812	5817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
117	NC_017571	CTG	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
118	NC_017571	ACTA	2	8	5905	5912	50 %	25 %	0 %	25 %	386322499
119	NC_017571	CTT	2	6	5928	5933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322499
120	NC_017571	GCG	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322499
121	NC_017571	GAA	2	6	5992	5997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322499
122	NC_017571	GGC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322499
123	NC_017571	AAG	2	6	6029	6034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322499
124	NC_017571	CGT	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
125	NC_017571	TGA	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322499
126	NC_017571	TCT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322500
127	NC_017571	CAA	2	6	6418	6423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322500
128	NC_017571	TGC	2	6	6483	6488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322500
129	NC_017571	ACA	2	6	6543	6548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322500
130	NC_017571	CAT	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322500
131	NC_017571	CG	3	6	6701	6706	0 %	0 %	50 %	50 %	386322500
132	NC_017571	GCA	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322500
133	NC_017571	AGT	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322500
134	NC_017571	TTGT	2	8	7051	7058	0 %	75 %	25 %	0 %	386322500
135	NC_017571	ATGT	2	8	7288	7295	25 %	50 %	25 %	0 %	386322501
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259	NC_017571	G	6	6	15483	15488	0 %	0 %	100 %	0 %	386322509
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262	NC_017571	CAA	2	6	15598	15603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322509
263	NC_017571	TCAT	2	8	15974	15981	25 %	50 %	0 %	25 %	386322510
264	NC_017571	A	6	6	15994	15999	100 %	0 %	0 %	0 %	386322510
265	NC_017571	TGT	2	6	16112	16117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322510
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271	NC_017571	CA	3	6	16397	16402	50 %	0 %	0 %	50 %	386322510
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297	NC_017571	TA	3	6	17649	17654	50 %	50 %	0 %	0 %	386322510
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332	NC_017571	TCG	2	6	19968	19973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322512
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374	NC_017571	TGA	2	6	22571	22576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322514
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377	NC_017571	CAGA	2	8	22759	22766	50 %	0 %	25 %	25 %	386322514
378	NC_017571	GCAC	2	8	22773	22780	25 %	0 %	25 %	50 %	386322514
379	NC_017571	GTA	2	6	22884	22889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322515
380	NC_017571	GCT	2	6	22903	22908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322515
381	NC_017571	GCATC	2	10	22916	22925	20 %	20 %	20 %	40 %	386322515
382	NC_017571	CGC	2	6	23015	23020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322515
383	NC_017571	CTT	2	6	23090	23095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322515
384	NC_017571	GAT	2	6	23115	23120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322515
385	NC_017571	AAT	2	6	23142	23147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322515
386	NC_017571	TCTT	2	8	23218	23225	0 %	75 %	0 %	25 %	386322515
387	NC_017571	ACATC	2	10	23300	23309	40 %	20 %	0 %	40 %	386322515
388	NC_017571	TGA	2	6	23374	23379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322515
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390	NC_017571	GAA	2	6	23532	23537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322515
391	NC_017571	AAC	2	6	23553	23558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322515
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393	NC_017571	TTC	2	6	23701	23706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322515
394	NC_017571	TTGA	2	8	23725	23732	25 %	50 %	25 %	0 %	386322515
395	NC_017571	TCAC	2	8	23767	23774	25 %	25 %	0 %	50 %	386322515
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500	NC_017571	GAT	2	6	30533	30538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322521

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