MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 45128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017568	CCG	2	6	227167	227172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386318216
4002	NC_017568	AGTCGA	2	12	227232	227243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386318216
4003	NC_017568	ACA	2	6	227244	227249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318216
4004	NC_017568	TGA	2	6	227250	227255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318216
4005	NC_017568	GAA	2	6	227347	227352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318216
4006	NC_017568	TTGAT	2	10	227405	227414	20 %	60 %	20 %	0 %	386318216
4007	NC_017568	AAT	2	6	227434	227439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318216
4008	NC_017568	TCGTT	2	10	227481	227490	0 %	60 %	20 %	20 %	386318216
4009	NC_017568	GAA	2	6	227572	227577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318216
4010	NC_017568	GAT	2	6	227599	227604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318216
4011	NC_017568	TAT	2	6	227684	227689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318216
4012	NC_017568	TG	3	6	227690	227695	0 %	50 %	50 %	0 %	386318216
4013	NC_017568	ATT	2	6	227718	227723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318216
4014	NC_017568	TGA	2	6	227790	227795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318216
4015	NC_017568	A	6	6	227806	227811	100 %	0 %	0 %	0 %	386318216
4016	NC_017568	T	6	6	227883	227888	0 %	100 %	0 %	0 %	386318216
4017	NC_017568	CAT	2	6	227919	227924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318216
4018	NC_017568	TAA	2	6	227925	227930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318216
4019	NC_017568	CAT	2	6	227950	227955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318216
4020	NC_017568	TGA	2	6	227987	227992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318216
4021	NC_017568	AGCA	2	8	228068	228075	50 %	0 %	25 %	25 %	386318216
4022	NC_017568	A	6	6	228097	228102	100 %	0 %	0 %	0 %	386318216
4023	NC_017568	AT	3	6	228135	228140	50 %	50 %	0 %	0 %	386318216
4024	NC_017568	TCA	2	6	228143	228148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318216
4025	NC_017568	TGA	2	6	228269	228274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318216
4026	NC_017568	GATG	2	8	228339	228346	25 %	25 %	50 %	0 %	386318216
4027	NC_017568	AAAT	2	8	228393	228400	75 %	25 %	0 %	0 %	386318216
4028	NC_017568	AGA	2	6	228447	228452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318217
4029	NC_017568	TG	3	6	228472	228477	0 %	50 %	50 %	0 %	386318217
4030	NC_017568	GGA	2	6	228486	228491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386318217
4031	NC_017568	AAG	2	6	228500	228505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318217
4032	NC_017568	GAT	2	6	228558	228563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318217
4033	NC_017568	GATTGC	2	12	228609	228620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386318217
4034	NC_017568	TTG	2	6	228664	228669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318217
4035	NC_017568	A	6	6	228807	228812	100 %	0 %	0 %	0 %	386318217
4036	NC_017568	AGT	2	6	228909	228914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318218
4037	NC_017568	AAG	2	6	228937	228942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318218
4038	NC_017568	AGA	2	6	229046	229051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318218
4039	NC_017568	AGCC	2	8	229212	229219	25 %	0 %	25 %	50 %	386318219
4040	NC_017568	TTG	2	6	229228	229233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318219
4041	NC_017568	AGT	2	6	229280	229285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318219
4042	NC_017568	T	6	6	229316	229321	0 %	100 %	0 %	0 %	386318219
4043	NC_017568	ATT	2	6	229428	229433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318219
4044	NC_017568	GCA	2	6	229464	229469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318219
4045	NC_017568	GC	3	6	229509	229514	0 %	0 %	50 %	50 %	386318219
4046	NC_017568	CAT	2	6	229548	229553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318219
4047	NC_017568	ATT	2	6	229581	229586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318219
4048	NC_017568	GT	3	6	229609	229614	0 %	50 %	50 %	0 %	386318219
4049	NC_017568	GATT	2	8	229645	229652	25 %	50 %	25 %	0 %	386318219
4050	NC_017568	CGA	2	6	229681	229686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318219
4051	NC_017568	GCA	2	6	229749	229754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318219
4052	NC_017568	ATT	2	6	229769	229774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318219
4053	NC_017568	T	6	6	229948	229953	0 %	100 %	0 %	0 %	386318219
4054	NC_017568	ATTG	2	8	230126	230133	25 %	50 %	25 %	0 %	386318219
4055	NC_017568	TGG	2	6	230189	230194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318219
4056	NC_017568	CTT	3	9	230225	230233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318219
4057	NC_017568	GT	3	6	230248	230253	0 %	50 %	50 %	0 %	386318219
4058	NC_017568	CTT	2	6	230336	230341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318219
4059	NC_017568	GTT	2	6	230400	230405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318219
4060	NC_017568	TAT	2	6	230462	230467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318219
4061	NC_017568	CTG	2	6	230897	230902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318220
4062	NC_017568	T	7	7	230918	230924	0 %	100 %	0 %	0 %	386318220
4063	NC_017568	TAA	2	6	231660	231665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318221
4064	NC_017568	CAA	2	6	231683	231688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318221
4065	NC_017568	ACA	2	6	231732	231737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318221
4066	NC_017568	TTA	2	6	231739	231744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318221
4067	NC_017568	CCAT	2	8	231804	231811	25 %	25 %	0 %	50 %	386318221
4068	NC_017568	TGT	2	6	231829	231834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318221
4069	NC_017568	ATG	2	6	231853	231858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318221
4070	NC_017568	ATT	2	6	231937	231942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318221
4071	NC_017568	CAGT	2	8	231957	231964	25 %	25 %	25 %	25 %	386318221
4072	NC_017568	GGT	2	6	231967	231972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318221
4073	NC_017568	TGA	2	6	231990	231995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318221
4074	NC_017568	ATT	2	6	231996	232001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318221
4075	NC_017568	TGA	2	6	232074	232079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318221
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4078	NC_017568	AAT	2	6	232507	232512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318221
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4080	NC_017568	TATCG	2	10	232639	232648	20 %	40 %	20 %	20 %	386318221
4081	NC_017568	AAG	2	6	232658	232663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318221
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4084	NC_017568	AGC	2	6	232797	232802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318221
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4087	NC_017568	ACT	2	6	233126	233131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318221
4088	NC_017568	GAGT	2	8	233198	233205	25 %	25 %	50 %	0 %	386318221
4089	NC_017568	CGA	2	6	233375	233380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318221
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4092	NC_017568	AGC	2	6	233576	233581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318222
4093	NC_017568	GAA	2	6	233625	233630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318222
4094	NC_017568	AT	3	6	233654	233659	50 %	50 %	0 %	0 %	386318222
4095	NC_017568	AGG	2	6	233678	233683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386318222
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4097	NC_017568	TATGGA	2	12	233761	233772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318222
4098	NC_017568	AAAC	2	8	233829	233836	75 %	0 %	0 %	25 %	386318222
4099	NC_017568	TCA	2	6	233927	233932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318222
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4103	NC_017568	CGA	2	6	234391	234396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318223
4104	NC_017568	GCG	2	6	234464	234469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318223
4105	NC_017568	AC	3	6	234504	234509	50 %	0 %	0 %	50 %	386318223
4106	NC_017568	TGA	2	6	234513	234518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318223
4107	NC_017568	AACG	2	8	234526	234533	50 %	0 %	25 %	25 %	386318223
4108	NC_017568	CA	3	6	234691	234696	50 %	0 %	0 %	50 %	386318223
4109	NC_017568	TTG	2	6	234879	234884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318223
4110	NC_017568	ATA	2	6	234885	234890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318223
4111	NC_017568	TTG	2	6	234939	234944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318223
4112	NC_017568	TGG	2	6	234967	234972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318223
4113	NC_017568	TTG	2	6	234999	235004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318223
4114	NC_017568	AAC	2	6	235126	235131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318223
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4116	NC_017568	GAGT	2	8	235306	235313	25 %	25 %	50 %	0 %	386318223
4117	NC_017568	A	6	6	235397	235402	100 %	0 %	0 %	0 %	386318223
4118	NC_017568	ATT	2	6	235420	235425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318223
4119	NC_017568	CAA	2	6	235490	235495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318223
4120	NC_017568	AACA	2	8	235509	235516	75 %	0 %	0 %	25 %	386318223
4121	NC_017568	GCA	2	6	235517	235522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318223
4122	NC_017568	GAT	2	6	235571	235576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318223
4123	NC_017568	ATT	2	6	235577	235582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318223
4124	NC_017568	AATG	2	8	235665	235672	50 %	25 %	25 %	0 %	386318224
4125	NC_017568	GTT	2	6	235707	235712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318224
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4127	NC_017568	TGC	2	6	235974	235979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318225
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4143	NC_017568	GAA	2	6	237133	237138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318225
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4148	NC_017568	A	6	6	237271	237276	100 %	0 %	0 %	0 %	386318225
4149	NC_017568	ATGA	2	8	237308	237315	50 %	25 %	25 %	0 %	386318226
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4152	NC_017568	ACACA	2	10	237612	237621	60 %	0 %	0 %	40 %	386318226
4153	NC_017568	TTGG	2	8	237643	237650	0 %	50 %	50 %	0 %	386318226
4154	NC_017568	TTA	2	6	237698	237703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318226
4155	NC_017568	TTG	2	6	237807	237812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318226
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4227	NC_017568	AT	3	6	241517	241522	50 %	50 %	0 %	0 %	386318230
4228	NC_017568	GAA	2	6	241530	241535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318230
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4230	NC_017568	ATCA	2	8	241645	241652	50 %	25 %	0 %	25 %	386318230
4231	NC_017568	TGA	2	6	241654	241659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318230
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4242	NC_017568	ACC	2	6	242943	242948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318231
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4244	NC_017568	TGAT	2	8	242991	242998	25 %	50 %	25 %	0 %	386318231
4245	NC_017568	T	7	7	243004	243010	0 %	100 %	0 %	0 %	386318231
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4361	NC_017568	ACG	2	6	250434	250439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318237
4362	NC_017568	GTT	2	6	250472	250477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318237
4363	NC_017568	GC	3	6	250626	250631	0 %	0 %	50 %	50 %	386318237
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4487	NC_017568	AAC	2	6	257231	257236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318241
4488	NC_017568	AATTT	2	10	257289	257298	40 %	60 %	0 %	0 %	386318242
4489	NC_017568	ACA	2	6	257317	257322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318242
4490	NC_017568	CAC	2	6	257399	257404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318242
4491	NC_017568	TCA	2	6	257480	257485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318242
4492	NC_017568	ATC	2	6	257501	257506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318242
4493	NC_017568	TTA	2	6	257617	257622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318242
4494	NC_017568	GTG	2	6	257691	257696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318242
4495	NC_017568	CGCA	2	8	257745	257752	25 %	0 %	25 %	50 %	386318242
4496	NC_017568	TTG	2	6	257892	257897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318242
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4499	NC_017568	CCAC	2	8	258256	258263	25 %	0 %	0 %	75 %	386318242
4500	NC_017568	GAA	2	6	258284	258289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318242

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